Condylostylus longicornis: 129606754
Help
Entry
129606754 CDS
T09756
Name
(RefSeq) probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 isoform X1
KO
K10615
E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 [EC:
2.3.2.26
]
Organism
clon
Condylostylus longicornis
Pathway
clon04120
Ubiquitin mediated proteolysis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clon00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
129606754
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
clon04121
]
129606754
Enzymes [BR:
clon01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.26 HECT-type E3 ubiquitin transferase
129606754
Ubiquitin system [BR:
clon04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
HECT type E3
129606754
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HECT
RCC1
RCC1_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129606754
NCBI-ProteinID:
XP_055373244
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1062 aa
AA seq
DB search
MAIYCWGNTSHGELGLGGIEDELIYSPREMPWSLSSQLVQAACGSTHTLLLTSQGTVYSC
GNNDYGQLGHELSRKRPRMSAIFKPVKNLENYIITQVACGCDHSLALNEWGQIFSWGSDN
NGQLGHDNGLPSQSSPKIIKLLATRNVIQIACGKYHSLALTNNGDLYAWGGNSYGQIGNG
VTSEKVTKPTLVSSLSGLPISFIGCGGFHSFILSKSGAVYGWGKNTFGQLGINDETSKNH
PTQLKTLRSLRVRYISCGEDFSVFLTADGGVFTCGAGQFGQLGHGSLSNEILPRKVLELM
GSTITQISCGNRHTLALVSSRGRVYGFGLGSSGQLGNKSVISANVPQVILGPWVSPNGTL
IQDEVKQDKMGSSVTVTRIFCGGDHCLVSTAEFLKKIPAYDCRHYPKTTQILSLTTEMTE
ECAKAPKDISVDLDLITNIESIFVSQTCINASFLLSDGDHSCCTSKHHGVDVPAVIKAFD
FIRKIENESLKQIIWDSITNTLLNTLKPSPPDVETLRIYLILPMYHEFVNAKNCNSLHTP
FSNAIGRLTSNASKVLFKWWGIVPIEYFEILVDNFKSVVVYIISFKFKPERESGKKKITY
ESNLQAALNMLVFLHLVNVRSRQGKQKIPARHFHIPEVTDEIDIQNDYIRWIIDKSQNSF
YLCKYPFLFDAKAKLSILETDQAFQMHTAMQNAAAQGVFAFLNFPIVPPEVTQFLYITVS
REHLVVDTLREIAHCTQKDLKKPLKVKFCGEEAEDAGGVRKEFFMLLLREIIDPKYGMFK
EFEETRTIWFSDCSFEVDDMYLLIGIICGLAIYNFTIIDLPFPLALYKKLLKEPVNLSDL
RDLSPTMANSLQQLLDYTEDDLQDIFGLNFEITRDIFGEVKVFPLKPDGENIPVTQQNKD
EFVNLYIDFIFNKSVEKQYEAFHTGFIKVCGGPVLSLFEPEELMAVVVGNEDYDWHVLQS
EAEYKNGYASSDQTVQWFWEVFHELPLTEKKKFLLFLTGSDRIPIKGMKGIKIFIQPTSD
DKRLPVAHTCFNLLDLPRYQTKERLKYKLLQAIQQTHGFSLV
NT seq
3189 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaatatattgttggggtaacacaagtcatggagaacttggtttggggggcatagaa
gatgaattgatatattcaccacgtgaaatgccatggtctttatcttcgcaattagttcaa
gctgcttgtggcagcacacatactttattattaactagtcaagggactgtttattcctgt
ggaaataatgattatggacaacttggtcacgagttatcacgaaaaaggccacgtatgtca
gccatatttaaaccagtaaaaaatttggaaaactacataattacacaagtagcttgtgga
tgtgatcattctttagcattaaatgaatggggacaaatttttagttggggatcagataac
aatggtcaattaggacacgataatggattaccgagtcagtcaagtccaaaaataattaaa
ttattagccactagaaatgttattcaaatagcatgtgggaaatatcattctttggcctta
acaaataatggggatttatacgcgtggggtggcaacagttacggtcaaattggtaatggt
gttacatcagaaaaagttacaaagccaacattagtaagttccttatccggtctgccaatt
tccttcattggttgcggaggatttcatagttttattctatcaaaatctggagctgtatac
ggttggggtaagaacacttttggtcaacttggaataaatgatgaaacttcaaaaaatcat
ccgacgcagttaaaaacacttcgatctttgagagttcgatacataagttgtggcgaagat
ttctcagtttttctaacagctgatggtggagtttttacttgtggtgctggacagtttgga
cagctgggtcatggtagtctgtctaatgaaattttaccaagaaaagttttagagctgatg
ggaagtacaattacacaaatatcttgtggaaatcgtcataccttagctttagtttcatca
aggggacgtgtttatggtttcggtttaggtagttctggtcagctaggtaataagtctgtt
attagtgcaaacgtaccacaagtaattttaggaccatgggtatctcctaatgggacatta
attcaagatgaagtaaaacaagataaaatgggatcttcagtaactgttacaagaatattt
tgtggaggtgatcattgtttggtatctacagctgaatttctgaaaaaaattccagcctac
gattgcaggcactatccaaaaacaacacaaattctttctttaaccaccgaaatgacagaa
gaatgtgctaaagctccaaaagatatatctgttgatttagatttaattactaatattgaa
tcgatatttgttagccaaacgtgcattaatgcttcttttttactatcggatggagatcat
tcgtgttgtacttcaaaacaccacggtgtggatgttccagctgttataaaagctttcgat
tttattaggaaaattgaaaatgaatctttaaaacaaattatttgggacagtatcacaaat
actctactaaacacattgaaaccttctccacctgatgtggaaactttaagaatatattta
atattaccaatgtatcatgaatttgttaatgcaaaaaattgtaattctttgcatacacca
tttagcaatgctattggtcgtttaacatccaacgccagtaaagtgttatttaaatggtgg
ggaattgtaccaatcgaatattttgaaatattggtggataactttaaatcagttgttgta
tatattattagtttcaaatttaaaccggaaagagaatctggaaaaaagaaaataacttat
gaatcaaatttacaagcagcattaaatatgctggtatttttacatttagtaaatgttaga
agtagacagggaaaacaaaaaattccagcaagacattttcatattccagaagttacagac
gaaatcgatattcagaacgattatatacgttggataatagataaaagtcaaaatagcttc
tatttatgtaaatatccctttttatttgacgcaaaagcaaaattatcaattttagagact
gatcaagcttttcaaatgcatactgcaatgcaaaatgctgcagctcaaggtgtatttgcc
tttttgaactttccgatagtgcctccagaagttacgcaatttctttatataaccgtttca
cgtgaacatttagtggttgacactttaagagaaattgcgcattgtacacaaaaagattta
aagaaaccattaaaagtaaaattctgtggtgaagaagcggaagatgctggtggagtacgt
aaagaattctttatgttgcttttaagagaaataatagatccgaaatatggtatgtttaaa
gaattcgaagagaccaggacaatatggttttctgattgctcgtttgaagttgatgatatg
tatttattaattggaataatttgtggtttagctatttataattttactatcatagattta
ccattcccactagcactttataaaaaacttctcaaggaaccagttaatttatcagatttg
cgtgacttatcacctaccatggcaaattctctacaacaattattagattatactgaagat
gatttacaagatatttttggtttaaattttgaaataacacgagatatattcggcgaagta
aaagtgtttccattaaaacctgatggagaaaatatacctgttacacaacaaaataaagac
gaatttgttaatttatatatagatttcatttttaataaatccgttgaaaaacaatacgaa
gccttccacaccggattcataaaagtttgtggtggtccagttttatcattgtttgaacca
gaagagttaatggctgtagttgtaggaaatgaagattatgactggcatgtattacaatct
gaagcagaatataaaaacggatatgcttcaagtgaccaaacggtacaatggttttgggaa
gtatttcatgaattacctttaacggaaaagaaaaaatttttattatttttaaccggaagt
gatagaataccaattaaaggaatgaaaggaattaaaatatttatacagcccacaagtgat
gacaaacgtttgccggtagctcatacctgtttcaatttattagatctacctcgttaccag
acaaaagagagattaaagtataaactcctgcaagcaattcaacaaactcatggttttagc
cttgtataa
DBGET
integrated database retrieval system