Condylostylus longicornis: 129607009
Help
Entry
129607009 CDS
T09756
Name
(RefSeq) GATOR complex protein Iml1 isoform X1
KO
K20404
SEA/GATOR complex protein SEA1/DEPDC5
Organism
clon
Condylostylus longicornis
Pathway
clon04150
mTOR signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clon00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04150 mTOR signaling pathway
129607009
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
clon04131
]
129607009
Membrane trafficking [BR:
clon04131
]
Autophagy
Other autophagy associated proteins
SEACIT/GATOR1 complex
129607009
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
vWA_IML1
DEPDC5_CTD
IML1_N
IML1_small
IML1_N_fung
DUF7001
DUF6775
LPD16
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129607009
NCBI-ProteinID:
XP_055373671
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1507 aa
AA seq
DB search
MKLYKLYVHQKSFSSADLVINPKDLPEAKIGDVVEVYHPEDEGSRLLLQITLLSDEVKSR
EETISIESTVAQAFNLRTFSDVIMRIVNPSAVALDSVEITFKDQYMGRSEMWRLKTYLTN
TCIYMNKKVEFCDGCIRCQIYEMWSQGERVTCGVISEDTKVVFRSSTSGVYLFIQMSSEM
WDFDIYGDLYFEKAVNGFLSDLFMKWKKLVSNHEVTIVLFSRTFYTAKSLEEFPDHMRDC
LQKDYKGRFYEDFYRVAIQNERNDDWNTVLVQLRKLFTSYQASVLRYHDREHVYVPPAIN
STAAQGNFLEVLNISLNAFEKHYLDRSFDRTGQLSVVISPGVGVFEVDRELTNITKQRVI
DNGVGSDLVCVGEQPLHAVPLLKFHNKETNLAADDYSLPHWINLSFYSTNKKVAYSTFIP
RIKLPPLVPTNDNENDKENSKIKFLSCNQSDYIHNSLFDYDAYDAQIFQLPPAQGTCSLQ
RVIRAKKTSVPSLETTSSHDWDISTTPKFSALRRKMSDPDIHFGVSGVLSTLVDSTNLSE
SLISEKNVRRTIIASKNPIIRPGRALINPFDPSHVTIKLTSNRRRWTHIFPKGPTGVLIQ
QHHYQAIPAANNYQQISDSKSFSSGFNSSEYEHTATCFSNCSDDILNDSSRRKMNILNTS
ATLPQTNSVSSKALTYLWGATGEQEWTPALTTVLSQKRNKKISQEESKKLEPSKTKGEVI
IGVDWKSLTIPACLPITTDYFPDKRSLDNDYVISDYTLLPDDVNADFANCRAVYRKPLTT
EEVFKEIVSQRLAQGFQLIVLEDNKNTSPPQAPCCGGKKQVPTSVLKIKPPTEKTMEYLL
SIGRIFHKISLSGSVITVTGYRPRHPYPPIKVDYRYRFHAPQHDTYEISGANFTTEKLEN
FNWNFMDHYICTRGDTDYPLFDALKYWRYRMYLLPKEHLAMKKILEGGSQRCDIYTEISN
EDPKQQIEEFIKFLETHLNKLKRVQCRKTRESSSTQSHLTRRRHSTSIITRAPPNQGLAN
SPFRERVGSNRLPDRRPSILTRAGSKPLERGRISPAAEASTITLTSEMTNSNEDNDDAFF
MESKLKSTATLTEIFEAFKHPISGVGFLMSVPSLPSGTFVSLDAVNWLKNKIEGNLRDPL
DILENMRKERMICHASGNWEKPIIVGFYLYYVVIQDKTSKDYTPPLGDLNAFENEWMEVE
VKGYDCGETVKSSIPNFLKDKPASKNWSKDRNSIVYKHSHLEIDSTKKSDRIEWGHVKYH
SIMMPGNAFEIVVQWVTASGPIVNDLISGWTRKAPMCGFQLVPIPADPLAEPFTEKSDPL
RGPIFIPLNTDCLKQRDYLFEEFNEETRSERMLLFQEAILARFGFMPCVLQNKSGFQKDI
PKEYQYVHCSGNMFVLIRCLTSNNVPTEFPNNSQESYVTRLVYGHTYNTNIPKKVGFLWS
WNHMIANKKWKSLIINCSQEGELFQLRMLKDFKEFCSNQDQRLKNFWDKCWDMRKNSVII
ENDEETN
NT seq
4524 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagttgtacaagttgtacgttcatcaaaaatcttttagctcggctgatttggtgata
aatccgaaagatttaccagaagcaaaaattggagatgtggttgaagtatatcatcctgaa
gatgaaggttccagacttcttttacaaatcacattattaagtgacgaagtaaagagtcgc
gaggaaactattagtattgaatcaactgttgctcaagcttttaatttgagaaccttttct
gatgtcattatgagaattgtgaatccatcagccgtggctttggattcagttgaaataaca
tttaaagatcaatatatgggacgatctgaaatgtggcgcttgaaaacatacttgacaaac
acttgtatatacatgaataaaaaagtggaattttgtgatggttgtatacgatgtcaaatt
tatgaaatgtggtcccaaggagagcgtgttacatgtggagtgatcagcgaggatacaaaa
gttgtgtttcgcagtagtacatcaggcgtttatttgtttattcaaatgtcttccgaaatg
tgggactttgacatttatggtgatttatattttgaaaaagctgttaatggttttttaagt
gatttgtttatgaaatggaaaaaattggtatcaaatcatgaagttacaattgtattgttc
tcaagaacattttatacagcgaaaagtttagaagaatttcctgatcatatgagagactgt
cttcaaaaagattataaaggaagattttacgaagatttttatcgtgttgcaatacaaaac
gaaagaaatgatgattggaataccgttttagtacagttaaggaaattatttacgtcgtat
caggcaagcgtactgcgttatcacgatagagaacatgtttatgtccctccagccataaat
tcaactgcagcccaaggaaattttttagaagttttgaatatttcattaaatgcttttgaa
aaacattatttagacagaagttttgacagaactggtcaattatctgttgttataagccct
ggcgtaggagtatttgaagtggatagagaattaacgaacataacaaagcaaagagtgatt
gataacggtgttggaagtgacttagtttgtgtaggagagcaaccattacatgcagttcct
ttgttaaagtttcataataaagaaacaaacttagctgctgatgactattctttaccacat
tggataaatttaagtttttattctacaaataagaaggtagcctactccacatttattccc
cgcatcaaacttcctccattggttcctacaaacgataatgaaaatgacaaggaaaattca
aaaatcaaatttttaagttgcaatcaatcagattacattcacaattccctatttgattat
gatgcatatgatgctcagatatttcaattaccaccagctcaaggcacttgttcgctacag
agagtaatccgagctaaaaaaacatcggttccaagtttagaaactacttcctcacatgat
tgggatatttctacaacacctaaattttctgctttacgtagaaaaatgtcagatccagat
attcattttggtgtttctggagtattatcaacattagtagattcaacaaatttatcagaa
tctttaatatcagaaaaaaatgttcgtagaactattatagctagtaaaaaccccattata
agaccaggacgtgccttaattaatccttttgatccatcacatgttactattaaattaaca
tcaaatcgaaggaggtggactcatatatttccaaaaggacctaccggagttttaatacaa
cagcatcattatcaagctattccagcagctaataattatcaacaaatttccgattcaaaa
tcatttagctctggattcaattcttctgaatatgagcacactgcaacatgtttttcgaat
tgttccgatgatatattgaacgattcttcccgaagaaaaatgaatattttgaacacgagt
gcaactcttcctcaaacaaattcagtttcatcaaaagctttaacatatctttggggagct
accggtgaacaagaatggactccagctcttacgactgtactcagccaaaagcgtaataaa
aaaatttctcaagaagaatctaaaaaattggagccttcaaaaactaaaggagaagtaatt
ataggagttgattggaaatctttaacaataccagcttgtttaccaatcacaaccgattat
tttcctgataaacgatctttggataatgattatgttatatcagattatacacttttacca
gatgatgttaatgctgattttgcaaattgtcgggcagtttatcgaaaaccacttacaact
gaagaagtttttaaagaaattgtttcacaacgtttagcacaaggttttcaattgattgtt
ttagaagataataaaaatactagtccaccacaagctccgtgttgtggtggaaaaaaacaa
gtgccgacatcagtattgaaaataaaaccacctacagaaaaaacaatggaatatttgcta
tcaattggaagaatttttcataaaatatctttaagtggctcagtaattacagtaactggt
tatagaccaagacatccgtatccgccaattaaagtcgactaccgttatcgattccatgcc
ccgcaacatgatacatatgaaatatctggagctaattttacaacagaaaaattagaaaat
tttaattggaattttatggatcattacatatgtacccggggagacactgattatccatta
tttgatgcacttaaatattggcgttatagaatgtatttgttaccaaaagaacatttggca
atgaaaaaaatattagaaggtggttcacaaagatgtgatatttatacagaaatttcaaat
gaagatccaaaacaacagattgaggaattcataaaatttttagaaactcatttaaataaa
ttaaaaagagtacaatgtcgtaaaacaagagaaagttcgtcaacacaatcgcatctaact
agaagaaggcacagtactagcattattacgagagctccgccaaatcagggattagcaaat
tcaccatttcgtgagcgagtcggaagcaatcgtttaccagatagaaggccaagtatttta
acaagagctggttcaaaaccattagaacgtggtagaatatcaccagcagctgaagcatct
acaataacattaacatctgaaatgacaaattcaaatgaagataatgatgatgcattcttt
atggaaagtaaattaaaatcaacagcaacattaacagaaatatttgaagcattcaaacat
ccaattagtggtgttggatttttaatgtcggtaccaagtttaccatctggaacatttgtg
tcactagatgctgttaattggttaaaaaataaaatagaaggaaatttaagggatccatta
gatatattagagaatatgagaaaggaaagaatgatttgtcatgcatctggaaattgggaa
aaacctataattgtaggattctacctatactatgttgttattcaagataaaacttcaaaa
gattatactccaccactgggagatttaaatgcattcgaaaatgaatggatggaagttgaa
gtaaaaggttatgattgtggagaaacagtaaaatcatcgattccaaattttcttaaagat
aaaccggcatcaaaaaattggagcaaagatagaaattccattgtttataagcattctcat
ttagaaatagattctactaaaaaaagtgatagaatcgaatggggtcatgttaaatatcat
agtattatgatgcctggaaatgcttttgagattgttgtacaatgggttacagcttccggt
ccgatagttaatgatttgatatcagggtggacacgtaaggcaccaatgtgtggctttcag
ttggtccctataccagcagatcctttagctgaaccatttacagaaaaatctgatccactt
agaggaccaatttttattcccttgaataccgattgtttaaaacaaagagattatcttttt
gaagaatttaatgaggaaacacgctctgaaaggatgttactgttccaggaggcaatatta
gcgagatttggttttatgccttgcgttttgcaaaataaatctggttttcaaaaagatata
cctaaagaatatcagtatgttcattgttctggtaatatgtttgttttaataagatgtttg
acatcaaataacgtaccaacagaatttccaaataattctcaagagtcatacgttacacgt
ttagtttatggccacacttacaatacaaatatacctaagaaagttggatttttgtggtct
tggaatcatatgattgctaataaaaagtggaaatctttaataatcaactgctcacaagaa
ggagaattatttcaactacgaatgttgaaagattttaaagaattctgttcaaatcaagat
caaagacttaaaaatttttgggataaatgttgggatatgagaaaaaattctgtaataatt
gaaaacgacgaagaaactaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
