KEGG   Condylostylus longicornis: 129609012
Entry
129609012         CDS       T09756                                 
Name
(RefSeq) DNA polymerase theta isoform X1
  KO
K02349  DNA polymerase theta [EC:2.7.7.7]
Organism
clon  Condylostylus longicornis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:clon00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:clon03400]
    129609012
Enzymes [BR:clon01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     129609012
DNA repair and recombination proteins [BR:clon03400]
 Eukaryotic type
  Other factors with a suspected DNA repair function
   DNA polymerases
    129609012
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol_A POLQ_helical DEAD HTH_61 Helicase_C ResIII DNA_pol_P_Exo HHH_5
Other DBs
NCBI-GeneID: 129609012
NCBI-ProteinID: XP_055376819
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1930 aa
MAFSESFEIGNSTLQIIEEDADFMNEGILEIVNKSPTSKVNKVKRRKPGRTNLSKKDIDK
KTILIVDSESYSDFFKSNISFQENVDQNNGEIVSQKERLCNIASQNEERCSTNESLKTNV
EKTSPIKQNMDVEDLDIFLDSFENNIDKEVIDLSVLVDESPDCEILHSTQNPSFVFVKTK
SEESIKMLNKELENGKNDLSIMDGENEQQIFMNLTSKFENLSTSEKPLLQMSISSESSED
DNPIAKEGNNKYEIVKENDVVSKLQTSTNIVLESKKLHILQESPLFDNSKKEVQKLSLDK
TTNENSKLKDISSWNLPATILEEYSRKGIKTLFDWQVECLNNPKILFENGNLVYSAPTSA
GKTLVCEIIAIKNIVERNKKVIFILPFVSVVREKTFYLQDLLCSSGYRVEGFFGGYSPPG
GFDSINLAVCTIEKANSIVNRLLELGKLASIGCIIIDEIHLISDPGRGYILELLLAKILY
MSMKLNITIQIVTMSATLPNCEILKDWLNAELYVTNFRPVELREMIKVDTKIYDNKLELI
RVIDHASLSIPEIPNDQDGIAFLCLETLLEGCSVIIFCPSKDWCENLSKNLSKTIKEIYN
SNTELGLNLQKVIVKNNLVKVNEQLKSLHYGCDKFLEMTCEYGCAFHHAGLTTEERDVVE
TNFKNGFLKIIVATSTLSSGVNLPARRVIIRSPLFAGKLMDRLTYKQMIGRAGRTGKDTL
GESILICNENNFKFGKELLQPHLRPISSCLGYDSGLHLKRAILEVISSGTAKTPSDLQAF
LNCMLFNVTKQEESLDGDCGKAKQNFDYLQDSIQFLTEFEFIRTQNESGTENIYFVPSRL
GMACLVSSLPPTDGIILFSELQRSRKCFVLESELHAVYLVTPYSVCYQLQSIDWLHYLDI
WEQLPQGMKKVAEIVGVKESFLVRAMRNQNKLDLKLLQIHKRFYIALALQELVNEVPIGC
VANKYKCNRGLLQSLQQMSSTFASIVTSFCNALNWKILGLIVSQFKERLYFGVHRDLIDL
MKLPDLNGHKARALFNAGIETLIDLANSNSLVIEKILHDCLSFESSKRQDGENENEAQKR
IYERKVFVTGKTNLTIKDAAELLIKSARKFLQYEIGVACNWDNIGNFDGSTNKEIIKVNK
NFENEIENDISEAISENLSPKCMNSDLKNKPGTRNLKENENMLQILSTTLVSPKNLIREN
ILPQVKSRNLGLIDISKSLTQKNVVNKSSDEISDISNVSIIRDPNLLNNLQNGEVKEHAK
YKEVISIIDLPHDVNSQKDYLQKIFESKKIGFSIGIEKLPTRKNDNVIIGANILINNTEK
HAAEVKEIFTIEGKYFISGISISYENCSALFINFQNEKNVNSDKFQSKLNFLKELICRED
ITLRIYDSKEHIKILYKYILKDFKSFNIIEDPKIANWLLDPDGDTSIHKLISEYLPQYLP
FLEDTVNYKGYLSLGLNYNLKISGKERSSYEASFTRSILEVQLKNLQTFADGQMMKFFYE
LEMPIQRVLACSEVIGFSINFSRIQQLTNQLFSTMKNLENKIYLLHGSRFNLGSSLTVAK
VLGLHKKINGKCSTSKQILEKMDSPLSNLILNYRKVSTILTKNIQPLQRVIQNNRIYGSS
ITTSSTGRISMREPNVQNIAKDFEITLDGNMNAMNLYNKLIKFLFISDKIIKISCRSVFL
CQPGRVLLSADFCQLEMRILAHLCQDECLKSAINSGQDIFTIIAAKWNSVEEKTISDQLR
NGTKQICYGIVYGLGIKALSENLKCTEEEASTMLEQFHTTFPGIRAYINKVIKFARQCGY
IETITGRRRYLKNINSNENMLKSQAERQSINSTIQGSAADIAKSAMLRMEKNIIKYKSKL
GVNLSDNVQSHVDLVLHLHDELIYEVPEEKVRNVAKVLKATMENCVKLSVPLKVKIKAGP
SWGEMSDLNF
NT seq 5793 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcattttcagaatcatttgaaattggtaacagcaccttgcaaattatagaggaagat
gcagattttatgaatgaaggaattttagaaatagtaaataaatctccaactagcaaggta
aataaagtaaagagacgtaagccgggaagaacaaatttaagcaaaaaagatatagacaaa
aaaactatattgattgttgattcagagagttattcagatttttttaaaagtaatattagt
tttcaagaaaatgtcgatcaaaataatggcgaaattgtttcccaaaaagaaagattgtgt
aatattgcatcacaaaatgaagaaaggtgttccacgaatgaaagtttaaaaacaaatgta
gaaaaaactagtccaataaaacaaaatatggatgttgaagatctggatatttttttagac
tcgtttgaaaataatatagataaggaagttattgatctcagcgttcttgtggatgaaagt
ccagattgcgaaattttgcattctacacaaaatcctagctttgtgtttgtaaaaacaaag
tcggaagaatctatcaagatgttgaataaggaactagaaaatggaaaaaatgatttaagt
attatggatggagaaaatgagcagcaaatttttatgaatttaacttcaaaatttgaaaac
ctaagcacatctgaaaaaccattgctgcaaatgtccattagttctgagagtagtgaagat
gataatccaatagcaaaagaggggaataacaaatatgaaattgttaaggaaaacgatgta
gtttcaaaactgcaaacaagtacaaatatagttctggaatcaaaaaaattacatatttta
caagaaagtccactattcgacaattctaaaaaagaagtgcaaaaactcagtttggataaa
acaacaaatgaaaactctaaacttaaagacatttcaagctggaatttaccggcaactatt
cttgaggaatattccaggaaaggaataaagacgttatttgactggcaagttgagtgttta
aacaacccaaaaatactttttgaaaatggaaaccttgtatacagtgctccaacatctgct
gggaaaacgttggtttgcgaaataatagcaataaaaaatatagtagaaagaaataaaaaa
gtaatattcatacttccttttgtgtcagttgttcgagaaaaaacattttatttgcaagat
cttttatgctcatctggatacagagtggaggggttttttggcggctattcacctccgggt
ggatttgattctattaatctggcggtttgtactattgaaaaagctaattcaatagttaat
cgactactagaactaggaaaactagcgagtattggttgtattataattgatgaaatacat
cttatatcagatccaggaagaggttatattctggagttgttacttgcaaagatcttatat
atgtcgatgaagttaaatattacaatacaaattgttacaatgtcagccacgttacccaat
tgcgaaattttgaaagattggttgaatgcggaattatatgtaacaaattttagacctgta
gagttaagagaaatgataaaggttgatacaaaaatttatgacaataaactggaattaatt
agggttattgatcatgcatctttatcaattcccgaaataccaaatgatcaagatggaatt
gcttttttatgtttggaaactttattagagggttgttcagtcatcatattttgtccatct
aaggattggtgtgaaaatttatcgaaaaatttgtctaaaacaataaaggaaatatacaat
tcaaataccgaacttggattaaacctacaaaaagttatagtcaaaaataatttagtaaaa
gttaatgagcaactaaaatctttacattacggctgtgataagtttttagaaatgacgtgt
gaatacggttgtgcatttcaccatgctggtttaactacagaagaacgtgatgttgttgaa
accaattttaaaaatggttttttaaaaataatagttgcaacaagtacccttagctcaggt
gttaatttaccagcaagaagagtaatcataagatctcctttatttgctggaaaactaatg
gatcgcttaacttataaacaaatgattggaagagcaggacggacggggaaagatactttg
ggagagtcgattttgatttgcaacgaaaacaattttaaatttgggaaagaacttttacag
ccccatttaagaccaatatcgtcatgtttaggttacgatagtggcttgcatttaaaaaga
gctatcttggaagttatatcatcaggcactgcaaaaactccttcagatctacaagcattt
ttaaattgtatgttatttaacgttacaaaacaagaagagtctttagatggtgactgcgga
aaagcaaaacaaaattttgattatcttcaagattctatccaattcttgaccgaatttgaa
tttatacgcacacaaaatgagtctgggacggagaatatttattttgtacctagtcgtttg
ggaatggcttgtttagtttcttctctcccacccactgacggaatcatacttttttccgaa
ttacaaagatcaagaaagtgttttgttttagaatctgagttgcatgccgtttacttggta
actccatattccgtatgttatcaattacaaagtatagattggttgcattatttggatata
tgggagcaactgcctcaaggaatgaaaaaagttgctgaaattgttggagtaaaagaatcc
tttttggtgcgagctatgcggaatcaaaacaaacttgaccttaagctacttcaaattcac
aaaagattttatatagccttagcgttacaagaacttgtcaatgaagttccgattggttgt
gtagccaataaatataaatgtaatcgcggcttgttacaaagcctacaacaaatgtcgtcg
acttttgcaagtattgtgacatcattttgtaatgcactaaattggaaaattctgggttta
attgtatctcagttcaaggaacggctttattttggggttcatcgtgatttaattgattta
atgaaattaccagatttgaatggccacaaagcacgcgctctttttaatgctggtattgaa
actttaatagatttggccaattctaatagtttggtaattgaaaaaattcttcatgattgt
ttgagttttgaatcaagcaaaagacaagacggtgagaatgaaaatgaagcgcaaaaacga
atctacgaacgaaaagtttttgtcactggtaaaacaaatttaactattaaggacgctgct
gaattgctcataaaaagtgcaagaaaatttttacaatatgaaataggagttgcctgtaat
tgggacaatattggaaatttcgatggatctacaaacaaagaaataattaaagttaataaa
aattttgaaaatgaaattgaaaacgacatttcagaagcaatttcagaaaatttgtccccc
aagtgtatgaattcagacttaaaaaataaaccaggaacaagaaatttaaaggaaaatgag
aatatgcttcaaatcttaagtactacattagttagcccaaaaaatttgattagagagaat
atacttcctcaagtcaaatcaagaaatctgggcttgatcgacatttctaaatctctcact
cagaaaaatgttgtaaacaaatcgtctgatgaaatttctgatatttcaaatgtatcaatc
ataagagatccaaatttactaaacaatttacaaaatggggaagtcaaagaacacgcgaag
tataaagaagtaatttctattattgatttgccacatgatgtaaattcacaaaaagattat
ttacaaaaaattttcgaatctaagaaaattgggttttcgataggaatagaaaaacttccg
actaggaaaaatgataacgtaattattggtgctaatattttaattaacaacacagaaaag
catgcagcggaagtcaaagaaatatttacaattgaaggcaaatattttatttcaggaata
tcaatatcctatgaaaattgtagcgcattgtttattaattttcaaaatgaaaaaaatgta
aacagcgacaagtttcaaagcaaactaaatttcttaaaggaactaatatgtagggaagat
attactttaagaatatatgattcgaaagagcatattaagattttatataaatatatatta
aaagattttaaatcatttaatataattgaagatcccaaaattgcaaattggttactggat
cctgatggagacacgagtatacataaattgatatcagaatatttgccgcaatatctacct
tttttagaagataccgtaaattataaaggatatttgagtttgggattaaattataatttg
aaaatatcgggaaaagaacgttctagttatgaggcttctttcactagaagtattttggaa
gtacaactgaaaaacttacaaacttttgctgatggccaaatgatgaaatttttttatgaa
ttagaaatgcctattcaaagagttttagcttgcagtgaagtgattggattctcgataaat
tttagcagaattcaacagcttactaatcaactttttagtacaatgaaaaatttggaaaat
aaaatttatcttttacatggatctaggtttaatttaggatctagcttaactgttgcaaaa
gttctaggtcttcataagaaaattaacggaaaatgtagtacttctaaacaaattttagag
aaaatggattcccctctgtctaatctgattttaaattatagaaaagtttcaacaattctt
acaaaaaatattcagccattacaaagagttattcaaaataaccgaatttatggaagcagt
ataacgacttcaagtacaggaagaatttctatgcgtgaacctaatgtacaaaatattgca
aaggattttgaaattacacttgatggtaatatgaatgctatgaacttatacaataaatta
attaaatttttatttatatcagataaaattataaaaatttcatgccgctcagttttcttg
tgccaacccggtcgtgttttgttatctgcagatttttgtcagctcgagatgagaatttta
gctcacttatgccaagatgaatgtttgaaaagtgcaatcaattccggtcaggatattttt
acaattatcgccgcgaaatggaattcagtagaagaaaaaacaatttctgatcaactgcgc
aatggaacaaagcaaatttgttatggtattgtttacggattaggtatcaaggctctttca
gaaaatttgaaatgcactgaggaggaagcttccacaatgttggaacaatttcatacaaca
tttccaggcataagagcgtacattaacaaagtcataaaatttgctagacaatgtggttac
atagaaacaataacggggcgaagaagatatttaaaaaatatcaacagtaatgagaacatg
ctaaaaagtcaagctgaaaggcagtcaattaattcaacaatacaaggatcagctgctgat
attgccaaaagtgccatgctaagaatggagaaaaatatcataaaatataaatctaagcta
ggtgtaaacctttcggataacgtacaaagccatgtagatttggtcttgcacctacatgat
gaactgatttatgaagtgccagaagagaaagtacgcaatgtagcaaaagttctcaaagct
actatggaaaattgtgtaaaactaagcgtaccactaaaagttaaaataaaagctggacct
tcatggggcgaaatgtctgatttaaatttttaa

DBGET integrated database retrieval system