Condylostylus longicornis: 129609872
Help
Entry
129609872 CDS
T09756
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC129609872 isoform X1
KO
K05702
afadin
Organism
clon
Condylostylus longicornis
Pathway
clon04517
IgSF CAM signaling
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clon00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04517 IgSF CAM signaling
129609872
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RA
DIL
PDZ
FHA
RA_2
PDZ_6
RA_3
RASSF8-10_RA
PDZ_2
Yop-YscD_cpl
Cas9_PI2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129609872
NCBI-ProteinID:
XP_055378004
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2170 aa
AA seq
DB search
MEMPIQDKKMLERKAVQTVIQQWNTNRIDLFALSEPDENLLFHGVMRFYFQDAGQKVATK
CIRVASDATVSDVIETLVEKFRPDMRMLSVPNYALYEVHANGEERRLNPDEKPLLVQLNW
HIDDREGRFLLRNIDQKTTTIESTDNNFKRKLSKREKKEQKKKEKLAKLNSESGSISGVG
GGNNIGNGSNDANHVAEKLYTELPETSFTRSISNPEAVMRRRRQQKLEKKLQQFRSRDGG
PDTGGTLKIYGESLCRDVPYKTLLLSIRDCAQAVVREMLTKYGLEKADPLHYCLVQVNSD
GTEYILDDDECPLSILMNHPTSRGSIMFHVRRRPADSQPRRRKKKPLGVPNGTNNICERE
GPMLVEVTHSGDGGRRIKLGSDPVEVGSANTNSLQLFGPSIQARHCLISLLEGVCTVTPL
HTDALTFVNGHHITQPTILHNGSVVMFGRVSSYRFIDSPSDGRYNLALSQSQLDSACLYE
SRSPTSPQSWNDDDRSPNIKTDIDKIHQTSGMGGTTGVSSIVNGPLSSTDKSMGTGGSVN
SAMGTNSNENDKVRGPIKETDFAYDPDGNIETETKSISSIKSGGSNNQESRNSKISMAEM
QQGQEPILPAVLEFPETHQENFLRQVITELDVNAPNFKLSPVYTLYLCARYRASTHYRPE
LQPTERAHKLTIFLHHVANLIYSIIQDQYNDPRVLAFWMANSSEFLHFLKSDRHISAFSV
QAQEVLAESVQSAFRNLVNCFRVELSQTLNQFLSENIDHESAAGFVLTVLGSAMALLRRC
RVNAALTIQLFSQLFHYINVICFNTIVANSHMCTAEWGKVMLERLQLLELWAERQGLELA
ADCHLAKINQCAQFLQAPKTTVEEIQKLACSCFRLNSLQMAALLQQEQIPRNLIDTAIRM
AESVADELTRADGREVRLEESPELHLALLLPDDGFSCDVVRGIPSGLVDFLNPLQAAGMC
RLAAQPTSIGLWTVYMHQFNTRSPSSMSNKLPQPEVQVIKLHKNSNGMGLSIVAAKGAGQ
ERLGIYIKSVVPGGAADADGRLQAGDQLLRVDGQSLIGITQERAADYLVRTGPIVTLEVA
KQGAIYHGLATLLQQPSPVIQRDSDDIIPVIPPYPTNLNYGSGSDESIHSVAGINTARYE
TFPIIYSNYPHRRRSSSSLQEELCARGEKLHIDPRYRDTRPIARSSSSLILAAEYNSPLR
SNWDVGPAPSIFIEQYNDDAVTTQSDNLSNESLTQLNITQIEAHQPLNEDSLASCSGEKL
DQIPFIDDGTPPEEEKPYVPPDSKEFFRRSRSSISSVASAGGGGIIKEARSNSGCRKTVS
FDLIDDKLNSTSFDGENTKFSKKSYTFDTISTIKPMSGDNNCNIKKSENLDQKDDVEKEK
ENVLKSYKSNTYSIEQFDDLDLDLSELKSTSSSSRSSCIGSKDIENGTRNSDIKLAKYNK
NKNSKKCSKIFKFKVPLRKSNSSFEVRSFMSNSNSDKTPILESFEKKTTNKEVNRTEILD
VPDVDDLIPQFGQGKVKVITEFFEFGAPKGFLEYRAKSRSNPELNFLNTENTERDDYRNK
NIYLKQNEVRQYQDKPCNLSKDEKERILNQLKEWSLYGTKGKENYNEDNFIIDKQIKFHE
KCENFDKVNYEEISNNHYDKSPHCHKHYHHRHHHHHNHRNELIFLAADTSETEIVEKSKR
IDDKYCHDHQHDHLFQKSHYISFVDPLEQIDKTFINNSKKIEDQHVPGNNKNACNFWSSE
PNLIENDECDFSNINFFLNTKSNHHNIHNDPNNVCLTYKGNSEKSNNITLTNITDSNSDR
DKMQDEQIILKNINNNENNLQCKIDNFVSNSNLSVCKFCDNYYYKKFNPNNENNSLSNTI
CLHKCPLCSSISNNNTLMLNSPSNISSSAISDSQLCYKSYPNLMSSSLYSSCNFASNNNS
DNNNSNNVNGSEINYSDDKNKITPRIVKESQDHTNLCEVQNITIDEYETCTVNFHHCINL
PTLPNKSLKSPTLTSRPKNFMTVRKLKIKNIIQQQKQQQYQQQNSSSNSNSNKLNDIIYN
KCTQLSNYSPANANSSNSLNINKSNINKSTTITKIITPITPMLFNKDFKSNNSEYIRLAK
NTISPIIRCIIDNKNNCTRNYSHIFKKYSSMNPTIEKCCCELNTKGSSSSSLDYQSTNDK
ITSDDVVEPR
NT seq
6513 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaatgcctatacaagataaaaagatgttagaacgcaaagccgttcaaacagtgata
caacaatggaatacaaatcgcatagatttatttgcactctctgagccagatgagaatcta
ttatttcatggtgttatgcgattttattttcaagatgctggacaaaaggtagcaacaaaa
tgtattcgagtagcatcggatgcaactgtttcagatgtgatagaaactttagttgaaaaa
tttcgtccggatatgagaatgctttcagtaccaaattatgccctctatgaggtacatgca
aatggtgaggagagacgattaaatccagatgaaaaaccattattagtacaactgaattgg
catattgatgatagagaaggacgatttcttttaagaaatatagatcaaaaaacgacgaca
attgaaagtacagacaataattttaaaagaaaactatcgaaaagggagaaaaaggaacaa
aagaagaaagagaaattagcaaaattaaactctgaatcaggtagtatatctggtgtagga
ggtggcaataacattggtaatggtagtaatgatgcaaatcatgttgcagaaaaattatat
actgaattaccagaaacatcatttacacgttcaatatcaaatccagaagctgtaatgaga
cgtcgtagacaacaaaaattagagaaaaaattacaacagtttcgttcgagagatggtgga
ccagatactggtggaacattaaagatatatggagaaagtttatgtcgtgatgtgccttat
aaaactttattattatcgatacgagattgtgcgcaagcagttgttagagaaatgttaaca
aaatatggtttagaaaaagctgatccgctacattattgtttagttcaagttaatagtgat
ggtacagaatatatattagatgatgatgaatgtcctttatcaattttaatgaatcatcca
acatctagaggttctatcatgtttcatgtaagacgacgtccagccgattcacagccaaga
agaagaaaaaagaaacctcttggtgttccaaatggaacaaataacatatgtgagagagaa
ggaccaatgcttgttgaagtaacgcatagtggtgatggaggtagacgtattaaattagga
agtgatccagttgaggttggatcagcaaatacaaattcattgcaattatttggaccatca
atacaagcacgacattgcctgatatcattgttagagggtgtgtgtactgttacaccattg
catacagatgcattaacatttgtaaatggtcatcacataacacagccaacaatactacac
aacggctctgtagtaatgtttggacgtgtttcatcttatcgctttattgattcaccatca
gatggacgatacaatttagcattatcacaatcccaattagattcagcatgtttatatgaa
agtcgatcacctacgtctcctcaatcttggaatgatgatgacagaagtccgaatataaaa
actgatattgataaaatacatcaaacgagcggtatgggtggaacaaccggagtgagtagt
atagtaaatggcccactaagttcaactgataaatctatgggaactggaggtagtgttaat
agtgcaatgggaacaaattctaatgaaaatgataaagtacgaggacctattaaagaaact
gattttgcttatgatccggatggaaatattgaaacggaaaccaaatctatatcaagtatt
aaatcaggtggatctaataatcaagaatcaaggaattcaaaaatttcgatggccgaaatg
caacaaggtcaggaaccaatattaccagcagtcttagagtttcctgaaacacatcaggag
aatttcttaagacaagtcatcacagaattagatgttaatgcaccaaattttaaactatca
cctgtttatactttatatctatgtgccagatatcgtgcttcaacacattaccgtcccgaa
cttcagccaaccgaacgagctcataagttaacaatatttttacatcatgttgccaattta
atatattcaataatacaagatcagtacaatgatccacgagtattggcattttggatggca
aatagttcagaattcttacattttttaaaatcagatcgtcatataagtgcatttagcgta
caagcacaagaagttttagctgaaagtgtacaaagtgcttttcgtaatttagtcaattgt
tttcgagtagaattatcccaaacattaaatcaatttctatcggagaacattgatcatgaa
tcagcagctggttttgtgttaactgtattaggttcagctatggcgcttttacgtcgttgt
cgagtaaatgctgctcttacaattcagttgttttcgcaattatttcattatattaatgtg
atttgttttaacacgattgttgcaaactcccatatgtgcacagcagaatggggtaaggta
atgcttgaaagacttcaattgttagaactatgggctgaacgtcaaggtttagaattagct
gcagattgtcatttagccaaaattaatcaatgtgctcaatttttacaagcacctaaaaca
actgttgaagaaatacaaaaattagcatgctcatgtttccgattgaattctttacaaatg
gcagctttgctacaacaagaacaaattccaagaaacttaattgatacagcaattcgaatg
gcagaatctgtagcagatgaattaacaagagcggatggtcgagaagtaaggcttgaggaa
tcacctgaattgcatttagcacttctcttacctgatgatggctttagttgtgatgtggta
cgaggtattccatctggtttggttgattttttaaatccactacaagcagcgggaatgtgc
cgattagcagctcaaccaacaagtattggtctttggactgtgtatatgcatcagtttaat
acgcgttctccaagctccatgtctaacaagttgcctcagcctgaagttcaagttatcaaa
ctacataaaaactctaacggaatggggctatcaatcgtagcagcgaaaggtgctggtcaa
gaacgtttaggcatttatataaaatcagttgttccaggtggggcagctgatgcagatgga
cggttacaagctggtgatcaattattaagagtagacggacaaagtttaattggaataacc
caagagagagctgctgattacttggttcgtactggtccgattgttactttagaagtagct
aagcaaggagcaatttatcatggattagccacattgttgcaacaaccaagccctgtgatc
caacgtgattctgatgatataattcctgttattccaccttatccgacaaatttaaattat
ggatccggttctgatgaaagtatacatagcgtcgctggtataaatactgccagatacgaa
acttttcctataatatatagcaactatccacacaggcgtagaagttcatcctctcttcaa
gaagaactatgtgctcgaggggaaaaacttcacatcgatccaaggtacagagatactaga
ccaatagctagaagttcctctagtttgattttagcagccgaatataacagtccattgcgt
tcaaattgggatgttggaccagcaccttcaatatttatagagcagtataacgatgatgca
gttactacacaatcagataacttatcaaatgaatcgcttacccaattgaatataacgcaa
attgaagcgcatcaaccgttgaatgaggatagtttagcttcttgctctggcgaaaagctt
gaccagatcccatttattgacgacggaacgccaccagaagaagaaaaaccgtatgttcct
ccggatagtaaagaatttttcagaagaagtcgctcaagtatatcttctgttgcaagtgcc
ggcggtggtggtattattaaggaagcgcgctcgaattcgggttgtcgtaaaaccgttagt
tttgatttaatagatgataaattaaatagtacaagttttgatggggaaaatacaaaattt
tcaaaaaaatcttacacatttgacacgataagtactataaaaccaatgagcggtgataat
aattgcaatataaaaaagagtgaaaatttggatcaaaaagacgatgtggaaaaagaaaaa
gaaaatgttttaaaatcttataaaagtaatacatattcaatagagcaattcgacgatctc
gatttagatttatctgaactaaaatcaacttcatcttcatccagatcatcttgcattgga
agcaaagatattgaaaatgggaccagaaactcagatataaaactcgccaaatataataaa
aataaaaattcaaagaagtgtagtaaaatctttaaatttaaagttcctttgcgcaaatca
aatagttcctttgaagtacgtagctttatgtcaaattctaacagtgataaaacaccaatt
ctagaaagttttgaaaagaaaacaacaaataaagaagtgaatcgaactgaaattttggat
gtaccagatgttgatgatctaatcccacaatttggtcaaggaaaggtaaaagtaataaca
gaattttttgagtttggtgcacctaaaggctttttagaatatcgtgctaaatctcgctca
aatcctgaattgaatttccttaatactgaaaatactgaacgcgatgactatagaaataaa
aatatttatttaaaacaaaatgaagtgagacaatatcaagataaaccatgtaacttatca
aaagatgaaaaagaacgcattttaaatcagttaaaagaatggagtttgtatggtaccaaa
gggaaagaaaattataatgaggataattttataattgataaacaaataaaatttcatgaa
aaatgtgaaaattttgataaagtaaattacgaagaaatatcaaataatcactatgataaa
tcaccacattgtcataaacattatcatcacagacatcatcatcaccataatcatcgtaat
gaacttatatttcttgcggcggatacttccgaaacagaaattgtagaaaaatcaaaacga
attgatgataaatattgtcatgatcatcaacatgaccatttatttcaaaagagtcattac
atttcttttgttgatccactagaacaaatcgacaaaacctttataaataattcaaaaaaa
attgaagatcaacatgttcctggaaataacaagaacgcttgtaatttctggtcaagcgaa
ccaaatttaatagaaaacgatgaatgtgatttttctaacataaatttttttttaaatact
aaatcaaatcatcacaatattcacaatgatccaaataacgtttgtttaacatataagggg
aattcagagaaaagcaataatataacattaacaaacattaccgatagtaattcagataga
gataaaatgcaagatgaacaaatcatacttaaaaatattaataataatgaaaataatctt
caatgtaaaattgataattttgtgtcaaattccaatttaagtgtttgtaaattttgtgat
aattattattataaaaaatttaatccaaataatgaaaacaactctttaagtaatacaata
tgccttcataaatgtccgttgtgtagtagtattagcaataataacactttaatgttaaat
tcaccgagtaatatttcatcatctgcgattagtgattcacaattatgttataaaagttat
cctaatttaatgtcatcatctttatactcctcatgtaattttgctagcaataacaatagt
gataataataatagtaataatgtaaatggttctgaaattaattactctgatgataaaaat
aaaatcacgccaagaatagtaaaggaatctcaagatcatactaacttatgtgaagttcaa
aatataacaatagacgaatatgaaacatgtaccgtcaattttcatcattgcattaattta
cctacattaccaaataaatcattaaaaagtccaacattaacatcgagaccaaagaatttt
atgactgtaagaaaattaaaaataaaaaatataattcaacaacaaaagcaacaacaatat
caacaacaaaatagtagtagtaatagcaatagcaataaattaaatgatataatttataac
aagtgcactcaattaagtaattatagccctgcaaacgcaaatagttcaaattctttaaat
attaataaatctaatataaataaatcaactacaattacaaaaattataacaccaattaca
ccaatgttatttaataaagactttaagtcaaataattctgaatatataagattagctaaa
aatacaatatcaccaattattcgttgtattatagataataaaaataactgcacaagaaat
tattctcacatctttaaaaaatatagttcaatgaatccaacaattgaaaaatgttgttgc
gaattaaatactaaaggatcatcatcatcatctttggattatcagtcaactaatgacaaa
ataacgtcggatgatgttgttgaacctagatga
DBGET
integrated database retrieval system
