KEGG   Condylostylus longicornis: 129613956
Entry
129613956         CDS       T09756                                 
Name
(RefSeq) probable helicase with zinc finger domain
  KO
K25168  helicase with zinc finger domain [EC:5.6.2.-]
Organism
clon  Condylostylus longicornis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:clon00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:clon03019]
    129613956
Messenger RNA biogenesis [BR:clon03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   5'-3' decay
    Other 5'-3' decay factors
     129613956
   3'-5' decay
    Other 3'-5' decay factors
     129613956
SSDB
Motif
Pfam: AAA_12 AAA_11 ResIII PhoH zf-CCCH AAA_19 AAA_22 PAM2 AAA_18 DUF4187 AAA_5 Helicase_RecD
Other DBs
NCBI-GeneID: 129613956
NCBI-ProteinID: XP_055384279
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 2227 aa
MSTASQSQQLTISPNIAEKENQAHEFVRKHIWSEALTLYDQILEENRKHDTGTTTEAFGK
PGPNSPINDQTIICFLGRYECLFELSKYDKCIVEGKNILTILSDKSLECSTTISRVRRRL
VYALCRLKKFTEAEDALNDWIQEISLQPSFNDISKTLERYKTHVKYANGSLVFNSKAPIS
SISEIAEIIDTEIIKIDTKLEHWATNNLPLDKYSKHLTLKGVKNNINSISNNNNSNNTNN
NSNNINNNSNNTINNNIKQQQRGDNNGNSSNNNSSNGNIASKSGSSNNITGVISVLQKPK
TNTVSSASELISNLKLNEKASENSDGTVTCSYCAITFQDKNELRQHCQTETHQNVIMSDE
GRDWKWRPPPRGYTIDSYSLCESFSESQSCHYGNQCVEAHGLDELNEWKERFEYRKMRLQ
KACEKELYGKSYTEELLEKWGQASSPDKVMCEKIDGVEEQCSNELVTSMSSKVSKREWVF
ILKSRKHLKAVALLQDAHRNHFSIKSICPGENKINFINNCKKSNNSGSKNSNNEVELKSD
QEWISNTFDKTFVNLTKFSEILEHKIKITFNTEIFGTFRQSVCFDFGTEPVLVKHLCVDV
LPVGDAEKIQEIKKDIISSTAQRWDETNCNLVKFETTIGSHLKTDSYLHDQKLEKELLER
YPCPRAATFTLTQSTIIEKRLTKNNYRSRIHELLYVEEIARYEQVARYNLTTKLRITSSY
MLTPSGMATSTAKYSHSGELFGLMTLDKDISEDTSAGRLILSNCLSVYLSPTPKDEHLKK
KRDVFEALIEDKGKNMMYLKLSAKCVQGMSLKSDTDVQVDIQFQLNRLSYCEWHNAVDKI
TDFKIIFPDTFIEPNIPWTPKKQWSEVCDPKLNAKQKEAVNAITTPINCSLPPILLIGPF
GTGKTFTLAQAIKQLLTQPESRILICTHSNSAADLYIKEYLHPWVEKGMKEAVPLRVYYH
KRWVATVNQVVQKYCIIDPSSGNFRRPSVEDIVKHRIVVVTLNISMQLALLGLPKGFFTH
IFLDEAAQAMECEAIMPLALAGENTRIVLAGDHMQMSPELFSNFAKERRLHISLLERLYD
HYPSNFPCKILLCENYRAHEAIIRFTSELFYEQKLIASGKQPRHDRFYPLTFFTTRGEDV
QDKNSTAFYNNSEVYEVVERVCELRKKWPSSWGKINDSSIGIMTPYADQVFRIRSELRKR
RMPGISVERVLNVQGKQFRAVFLSTVRTRRTCLPSNSLNNTVINTDDADYGFLSNSKLLN
TAITRAQSLVAVVGDPVALCSIGRCRKVWERFIDICNQNKSLFGITWSFLRSQLDGVELK
RSYILNPLAPEFIPRALQPEAYLNKQAAMYLMSSGTVGGHQSSHQMQQQQQHHHYQQQQQ
QHHHHHHHSMHSQQSQQQSNQISSMYGTNHHYGMMNQNNVSIPPQQHIVQKGSHQQLNNN
NHQMPIRPPPTAGQPPPQQGYNLHGPQNNINNAQQYSSYMMWSQQQQQQQQQQQQQHSTN
QMIRPNYVPPQHPNQSQPQSIHPAHPVSNQQNQGNNPNASLWGPPPQNNPWVVPKTSVNQ
PPSMRGPPGLNNTGGVMPQATTQLGQNSAPQPINMNLNIRPSGSSGGPPMLGPSQQASNH
LSSVNPATSTNQSNSLRNSHDLSAMNKYMYQNSSNHIGPSSSFQSNQNSLVINQLRNQLQ
THQQTNGPASPAAMQAAAVALLAAQQQQQQQQQNHLDNLLRPNHISQTTVGNTLLNKEKD
YQFLNNVHNIPMNLNNTTPQIANQQHLHQQNLPQYHDYSFLLPPNMNFYDMAFEAKESQY
KWYLRLLEMHGQEAANKFTEILKQVMCYTHNKTNSIPAVTSSSSNNFVNQRQAGLMNTTN
MSNHGANIVNNSNNSSAINANDSTNPNFYQQIDLVFNSLMNGNEISQPILRDLLGMTGND
SNNQNNSVNTSIPNMKNYSQPQSVVQQNQKNIGISMYSNNANYLMNGTELGLSTTTSREQ
SVPLYRRHALGSSNSSGIAGSNSSTSSIGTISNNSSTSTDYHSSTSSNNQSISSSTPDNL
LENNNLANCANNLTAGSNLYEALFNTTDISPYSNVNSIQKLFYNYSFKNECDLLLANNVS
ASGHTRNTLTVSNQIQHQNQQSHQSQQQQQQQQQHQQQQQQQQQQQQQQQHHNQNQQLPH
PPQQHTTYAAVLSQGAVATQQPQQSSQQTSQQQNHNNTNNTVSEEKDPFAAIRELGQRSN
GFYNYFQ
NT seq 6684 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcaactgcatcacaatcgcagcagttgacaatttctccgaatattgccgaaaaggaa
aatcaagctcatgaatttgtacgtaaacatatttggtcagaagctcttactttgtacgat
caaatattggaagaaaacagaaaacatgatacaggaacaacaacggaagcttttggtaaa
cccggaccaaattctccaataaacgatcaaactattatatgttttcttggacgttacgaa
tgtctttttgaattatcaaaatatgataaatgtattgttgaaggaaaaaatatattgaca
attctaagtgataaaagtttggaatgtagtactacaatttcaagagttagaagacgtttg
gtgtacgcattatgtcgtttaaaaaaatttacggaagctgaagatgctcttaatgattgg
attcaagaaatttcactccaaccgtcttttaatgatatatctaaaactctagaacgttat
aagactcatgtcaaatatgcaaatgggtctttagtgtttaatagtaaagcgccaattagt
tcaatcagtgagattgctgaaataatagacaccgaaattataaaaatagatacaaaatta
gaacattgggctacaaataatttaccgttagacaaatatagtaaacacttaactttaaaa
ggtgttaagaataatattaatagcataagtaataataataacagtaataatacaaataat
aatagtaataatattaataataatagtaacaatactattaataataacattaagcaacaa
caacgtggtgataataacggaaactctagtaataataatagctccaatggtaacattgca
agtaaaagtggtagttcgaataacattactggtgttataagtgtactgcagaaacctaaa
acaaatactgttagttcagcttctgaattaattagcaatcttaaattaaatgaaaaagca
agtgaaaacagtgatggaacagttacatgttcatattgcgcaataacttttcaggacaaa
aatgaattaagacaacattgtcaaactgaaacacaccaaaacgtaattatgtcagacgaa
ggacgagattggaaatggcggcctccaccaagaggctacacaatagactcttatagttta
tgtgaaagcttttcagaatcgcaaagttgtcattatggtaatcaatgtgttgaggcacac
gggttagacgaactaaatgaatggaaagaacgtttcgaatatagaaaaatgaggcttcaa
aaagcttgtgaaaaagagctatacggaaaaagttatacggaagaattattggaaaaatgg
ggccaagcctcatctccagacaaagtaatgtgtgaaaaaattgatggggtagaagaacag
tgctcaaatgaacttgtcacaagtatgagttcaaaagtatccaaacgggaatgggttttt
atcctgaaaagccgaaaacacttaaaggctgttgcattgctacaagatgcccataggaac
catttttcaatcaaatcaatatgtcctggcgaaaataaaataaatttcataaataattgt
aaaaaatccaataattcaggttcaaaaaattcaaataacgaagttgaacttaaatcagat
caagaatggatttcaaacacatttgacaaaacatttgtaaatctaacaaaattcagcgaa
atattggaacataaaataaaaataacctttaatacagaaatattcggcacatttcgtcaa
tcagtgtgctttgattttggtacagagccagtgctggtcaaacatttatgtgtagatgtt
cttccagtaggtgatgccgaaaaaattcaagaaattaaaaaagatataataagctctaca
gcgcaaagatgggacgaaaccaattgcaatctagtaaaattcgagaccaccattggctca
catttaaagactgactcttatttacacgatcaaaaactggaaaaagagttacttgaaagg
tatccatgtccccgtgctgctacttttacattaacgcaatcaactataatagaaaaacgt
ttaactaaaaataattatcgttcgcgtattcatgaactgttatatgttgaagaaatagcg
cgatacgaacaagtagcaagatataacttaacgactaaactaagaataacgtctagttac
atgttaactccaagtggtatggcaaccagcactgcaaaatattcacattcaggggaactc
tttggcttaatgactttagacaaagatatatctgaagatacgtccgctggtcgcctaatt
ttgtcgaattgtttgagcgtgtatctttctccaactccaaaggacgagcatctaaagaaa
aaacgtgatgtttttgaagccctcatagaagataaggggaaaaacatgatgtatttaaaa
ttgtcagccaaatgtgtgcagggaatgagtttaaaatcggacactgacgttcaagtggat
attcaatttcaattgaacagattatcatattgtgaatggcacaatgctgttgacaaaatc
actgatttcaaaattatatttccagacacatttatagaacctaatatcccatggactccg
aaaaagcaatggtctgaggtctgcgatccaaagttaaacgctaaacaaaaggaagctgtt
aatgctataactactccaataaattgtagtttaccaccaattttattaattggaccattt
ggtacaggaaaaactttcacattggcgcaagcgattaagcaattattgacacaaccggag
tcaagaattttgatatgcacccattctaattcagccgctgatttatatatcaaagagtat
ttgcatccttgggtagaaaaggggatgaaagaagctgtaccattaagagtttattatcat
aaacgatgggtagctacagtaaatcaagttgttcaaaagtattgtataatagatccatct
tctggtaattttagacgtccttctgtggaagatattgtaaaacatcgtatcgttgttgtc
acactgaatatttcgatgcaactagctcttttagggttaccaaaaggtttttttactcat
atatttttagatgaagctgcccaagcaatggagtgcgaagctattatgcctctggctttg
gcaggagaaaataccagaattgttttagctggtgatcatatgcaaatgagtccagaactt
ttttctaattttgcaaaggaaagaagacttcatatatctttgctggaacgactgtatgat
cattatccgtcaaattttccgtgtaaaattttactatgtgaaaattatcgtgctcatgaa
gcaataatacgatttacctctgaattgttttatgaacagaagttgatagcatctggaaag
caaccaagacatgacagattttacccacttacgttttttacaactcgtggggaagatgtt
caagataaaaattctacagcattttataacaattccgaagtatatgaggtagtggaaaga
gtgtgcgaattacgaaaaaaatggcccagctcttggggcaaaataaatgattctagtatc
ggtataatgacaccatatgctgaccaggtatttcgaattcgatctgagctgagaaaaaga
cgcatgcccggtatttcagttgaaagagttctcaatgtacaaggtaaacaatttcgagcc
gtgtttttatcgacggtacgtactaggcgaacatgtttgccatcaaactccttaaacaac
accgtaattaatactgatgatgctgattatggatttttgagcaattctaagctcttaaac
acggcaataaccagggctcaaagtcttgtagccgtcgtaggtgatccagtagcgctttgc
tctattggacgatgccgtaaagtttgggaacgttttatagatatatgcaatcaaaataaa
tcattattcggaataacatggtcattcttacgatctcaactagatggtgtggaattaaaa
agaagttacattttaaatcctttagctccagaatttattccaagagctcttcaaccagaa
gcgtatcttaacaagcaagcagcaatgtatttaatgtccagtggtacagtaggcggtcac
caatcttcccatcaaatgcaacaacaacaacaacatcaccactatcaacagcaacaacaa
caacatcatcatcatcatcatcattctatgcattcgcagcagtcacaacagcaaagtaac
caaatttcttcgatgtatggaacaaatcatcattatggaatgatgaatcagaataatgtt
tcgattcctccacaacagcatattgtgcaaaaaggatcccaccaacaattgaataataat
aatcatcaaatgccaattcgtccgccaccgactgctggtcaaccccctccacaacaggga
tacaatttacatggtcctcaaaataatataaataatgcccaacaatattcatcttacatg
atgtggtctcaacaacaacaacaacagcagcagcagcagcaacaacagcactccactaat
caaatgattcggccaaattatgttcctcctcaacatccaaatcaatcccagcctcaatcc
attcacccagctcatcctgtttcaaatcaacaaaatcaaggtaataatccgaacgcttcg
ctttggggaccaccccctcaaaataatccttgggtagtgccgaaaacatcggtcaatcaa
ccaccaagtatgcgtggtccacctggattaaataatacaggcggtgtaatgccacaagca
acaacccaattaggtcaaaattctgcgccacaaccaatcaacatgaatttgaatatacgt
ccaagtggaagttccggaggtcctcctatgttgggaccatctcaacaggcttcaaatcat
ctctcgtctgttaatccggcaacttctactaatcagtcaaattcattgcgaaattcacat
gatttaagtgctatgaataaatatatgtatcagaattcttcaaatcatattggaccatct
tcaagttttcaaagtaaccaaaattctttagtcattaaccagttgcgaaatcaattacaa
actcatcagcaaactaatggtccggccagtcccgctgctatgcaggccgctgctgtagct
ttattggctgctcaacaacagcagcaacaacagcaacaaaatcacttagacaacctttta
agacctaatcatataagtcaaacaacagtcggtaacactttactcaacaaagaaaaagat
taccagtttttaaacaacgttcacaatattccaatgaacttaaataatacaactccacag
atagcaaaccaacaacatttacatcaacaaaatttacctcaatatcatgattacagtttc
ttactaccacctaacatgaatttttatgacatggcctttgaagcaaaagaatcacagtac
aagtggtatttgagacttctagaaatgcatggccaagaagctgctaataaatttacagaa
attttaaagcaagtaatgtgttatacccacaataaaactaattcaataccagcagtaaca
tcatcatcatccaataattttgttaatcaaagacaagctggattaatgaatacaacaaat
atgagtaatcacggagcaaatatagtaaacaactccaataattcttctgcaatcaatgcc
aatgatagcaccaatcccaatttttatcaacaaatcgatttggtatttaattcattgatg
aacgggaacgaaatcagtcagccgattttaagagacctcttaggaatgactggcaacgat
tcaaacaaccaaaacaatagtgttaacacgagtattccaaatatgaaaaactactcacag
ccacaatctgttgtgcagcaaaatcaaaaaaatattggaatttctatgtattcaaataat
gcaaactatttgatgaacggcaccgaattaggactatctacaacaacaagtcgtgaacag
tcggtgccattatatcgaagacatgccttggggagcagtaacagcagtggtattgctgga
agtaatagcagtaccagtagtatcggaactataagtaataatagcagcacaagcacggat
taccatagctcaacatcatctaataaccaatcaatatcttcttcaacaccagataattta
ttagaaaacaataatttagcaaattgtgctaataatttaactgctggatcgaacttatat
gaagcattattcaatacgactgatatttcgccgtatagcaacgtgaattcaatacaaaaa
ctattttataattattcttttaaaaatgaatgcgatttattactagcaaataatgtgtcg
gcttctggccatactaggaatactttaacagtttcaaatcaaatacaacaccaaaatcaa
caatcacaccaatctcaacagcaacaacaacagcaacaacaacatcaacagcaacaacag
cagcaacaacagcaacagcaacaacaacaacatcataaccaaaatcaacagcttcctcat
cctccgcaacagcatacaacttatgcagcagttctaagccaaggtgccgttgctacacaa
caaccgcagcagtcatcacaacagacatctcagcaacaaaatcataataatactaataat
actgtttcagaagaaaaagacccattcgctgcgattcgagagcttggtcaaaggtctaat
ggattttataattactttcaataa

DBGET integrated database retrieval system