Condylostylus longicornis: 129614332
Help
Entry
129614332 CDS
T09756
Name
(RefSeq) dorsal-ventral patterning protein Sog
KO
K04657
chordin
Organism
clon
Condylostylus longicornis
Pathway
clon04350
TGF-beta signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clon00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
129614332
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
VWC
CHRD
VWC2L_2nd
PRC2_EED_ins
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129614332
NCBI-ProteinID:
XP_055384862
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1017 aa
AA seq
DB search
MSPYISKLYLLIKFTTIFTTLILIKNVETRRHSPLLVEDDGAARRNNRPAVSECQFGKSL
KELGSTWYADLGPPFGVMYCIKCECIAVPKKRRIVARVQCRNIKNECPPADCDDPVLLPG
RCCKICPGDETETEIPQDYPVQVNADEEERNMKHFAALLTGRTSAFLKLEEMKSMYSINN
PQNAIATARFTFHKKNLYYSFYLSSKIVRPRAIQFIDNIGNILEEHNLMTPLNGLLSSYQ
NSTGKICGVWRRIPRDYKRLLRDEKLFVILLWDRKFQSELALAGRIARYTALSTELFSSL
LEPGIGTIPEQMNGSGGTAIVSTTSGAASSVHLTIVFNGIFGPDDTFDVPINIRIESPER
KEIILDEIQKIKKPSPEINILEISSPISIQNLRLLGRGKLILTVESRKYLNLKIQGHIIT
RATCELFQTLLTPSNQNSNSIVRTNSGLAWVYLNTDGSLAYNIQTNELRESERPNITLTD
DNGRKKGILEDLSANFNYNQAIGTVDKLGPRVLEALYSGDLGVNIALENNTQVIRGRLTS
RYVADARDSSEPILLKHHKSLAHPSNTYYMGMAWIAIDNECNLHYEVTISGINNNQQIFQ
IYLEEKPIEAIGAPISRKLLEEFSGTHLEGFVLNMPYNELAKLESSVCYLEIYSKASKEL
LLRGKLKSTKVPSHCYPVFTDNNVPNVNVIPNDHNDNMLLSHETKCFHSGRFYDEAEQWR
STREICTMCTCQYGRVICDAIKCPNPKCKPNEHLVTREGECCPTCISTKFLQDTAIISNF
NNSNKGCQLGNEIYLPGATWHPYLPPMGFDICTTCVCDPNTLQVQCPRIVCPQLDCPEKI
AYRPDKKACCKICPESRSLNNVEKNSSNAENNNNQNYLRDEGSIRSFQKRNEEILANGGC
KVINVFYENGQEWHPIIASHGEQKCVNCRCKDGKVTCGRKKCLRALCNNNNRGTGKRKGQ
KKDIMNNNEIDECCTAMQCRRERRHGGHRKLHRDREDKNTLEIEKTTTSRSTHTKRS
NT seq
3054 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaccgtatatttccaaattatatttattaataaaatttacaacaatatttacaaca
ttaattttaattaaaaatgttgaaacaagacgtcattcaccacttcttgtcgaagatgac
ggtgctgcacgtagaaataatcgaccagctgtttcagaatgccaatttggcaaatcattg
aaggagctaggatcgacatggtatgcagatttgggacctccttttggtgttatgtattgc
atcaaatgtgaatgtattgcggtaccaaaaaaacgtagaatagtcgcaagagttcaatgt
cgaaatattaaaaatgaatgtccaccagctgattgtgacgatccagttttattacctgga
agatgttgtaaaatttgtcctggagacgaaactgaaacggaaatacctcaggattatcct
gtccaggtaaatgcagatgaggaagagcgcaacatgaaacatttcgccgctctattaact
ggaaggacatcggcatttttaaagcttgaggaaatgaaatcaatgtattccataaataat
cctcaaaatgctattgcaacagcaagatttacgtttcataagaaaaatctttattattca
ttttatttgtcaagtaaaatagttcggcctagagctatacaatttattgataatattgga
aatatattagaggaacacaatttaatgacacctttaaatggacttttaagtagttatcaa
aattcaactggtaaaatttgtggtgtatggagacggataccacgtgactacaagagactt
ttaagagatgaaaaattatttgttatattactatgggatagaaaatttcaatcagaatta
gcattggcaggtagaatagcacgttatactgctttatcaacagaattatttagttcatta
ttggaacctggaattggaactataccggaacaaatgaatggatctggtggtacagctatt
gtttcaactacaagtggtgctgcatcttcagttcatttaacaattgtatttaatggtata
ttcggtccagatgatacttttgatgtacccataaatatcagaattgaatcaccagaaagg
aaagaaattatattagatgaaattcaaaaaattaaaaaaccttctccagaaataaatata
ttagaaatatcatctccgatttcaatacaaaatttaagacttttaggtcgtggaaaatta
attttaacagttgaatctcgaaaatatttgaatttaaaaatccaaggtcatattataaca
cgggcaacctgtgaacttttccaaacacttttaactccatcaaatcaaaattcaaatagc
attgtaaggacaaacagtggtcttgcatgggtttatctaaacacagacggttcattagcc
tataatattcaaacaaatgaattaagagaatcagaacgaccaaatattacattaactgat
gataatggacgaaaaaaaggaatactcgaggatttgtcagcaaattttaattataatcag
gctattggtactgtcgataaattaggaccaagagttttagaagctttatattcaggtgat
ttgggtgtgaatattgcattagaaaacaacacacaggtaattcgaggacgactaacatca
cgatatgtcgccgatgctagagattcatcagagccaatattgttaaaacaccataaatca
ttagctcatccatccaatacttattatatgggtatggcttggattgcaatagataatgaa
tgtaatcttcattatgaagtaaccataagtgggattaacaataatcaacaaatatttcaa
atatatttagaagagaaacctattgaagctatcggtgcaccaatttcaaggaaattactt
gaagaattctctggaacacatttagaaggatttgttttgaatatgccatataatgaatta
gctaaattagaatcaagtgtttgttatttagaaatttattcaaaagcttcaaaagaatta
ctattgcgtggtaaattaaaatcaacaaaagttccaagccattgttatccagtttttact
gacaataatgttccaaatgttaacgtaataccaaatgatcataacgataatatgctattg
tcacatgaaacaaaatgttttcactcaggtcgcttttacgatgaagcggaacaatggaga
agtacccgtgaaatttgtacaatgtgcacttgtcaatatggtcgtgtaatatgtgacgct
attaaatgtcctaatccaaaatgtaaaccaaatgaacatttagtaacacgtgaaggagaa
tgttgtccaacatgtatttcaaccaaatttcttcaagatacggccataatatcaaatttt
aataattcaaataaaggttgtcaattaggtaatgaaatatatttacctggtgcaacctgg
catccatatctaccaccaatgggtttcgatatttgtacaacatgtgtatgtgatccaaat
acattacaagttcaatgcccaagaattgtatgcccccaattagattgtccagaaaaaatt
gcttaccgaccagataaaaaagcttgctgtaaaatttgtcctgaatcaagatcattaaat
aacgtagaaaaaaattcatcaaatgcagaaaataataataatcaaaattatttacgcgac
gaaggatcgatcagaagttttcagaaacgtaatgaagaaattttagcaaacgggggttgc
aaagtaataaatgtgttttatgaaaatggacaggaatggcatccaattatagcatcacat
ggtgaacagaaatgtgttaattgcagatgcaaggatggaaaagtaacttgtggtagaaaa
aaatgtttacgagcattatgtaataataataatcgtggaacaggtaaaagaaaagggcaa
aaaaaggatataatgaataataatgaaatcgatgaatgctgtacagcaatgcaatgtcgc
agagaacgaagacatggaggacatcgaaaattacacagggatcgagaggataaaaacaca
ttagaaatagaaaaaacaacaacaagtcgatcgacacatacgaaaagaagctga
DBGET
integrated database retrieval system
