Condylostylus longicornis: 129614614
Help
Entry
129614614 CDS
T09756
Name
(RefSeq) nucleoporin Nup188
KO
K14311
nuclear pore complex protein Nup188
Organism
clon
Condylostylus longicornis
Pathway
clon03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clon00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
129614614
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
clon03019
]
129614614
Messenger RNA biogenesis [BR:
clon03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
129614614
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nup188_N-subdom_III
Nup188_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129614614
NCBI-ProteinID:
XP_055385303
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1923 aa
AA seq
DB search
MTSTLDDKSKRLKNIKEISELDVTDWKRVWQLVSGIHYSTSESLVKESLFEKSKEIQDGL
FQFKKPKTFNNDDLEKLLKSLKQEKLLPFTTKLQYILDLEPAQCWDVLCYYLAKEFRGTA
NSLPLLTATESNMTKFLDDIWRYYTLQRMVFLKLVKNLLEFYQNQYHPYHEQYKEILDKI
TLEKLKTSYLKQLEFLIKETPPLKLTGGEFWNYQAKLCDWNERNCKETIEILHILILIVH
FVGVTVEEVTQLMEYFKMHSFGRQQRFLNESNELHLQLIRKIGYSEIILFMKCIDVSQKD
TDSAWIYNVIKNLDESITSIKHGPSSSQLCPEHGPLLLSWMLFNFRVIDSETDDIATRKF
RQYGGKAVQLDVFNSFKNIVTHQMFEDDSLISRVARKTVYNYLNHLCELFDDGSIGKHNG
VYDLLSELLHTPLIAKHFVQNEDCGIRSLYTGLLENFPIDFYSISKIFLALSKAGKYNFV
KEQFQQLPIYTEFYDECKHKLMPLGNDEYITTQPYTPFKGIDYVIPIKTSAAILSHDNGA
FVHFRIPVNYFDVLQNEMNNLLSYVTQYVEIDVNRFKNINAGVEYLSFVISKIEKPQDIA
PEMVFPTEMCIDILNKFKNIFNPPIELLANCLNVCTSLLSNFKNEISSRIANLNILPSVT
SENLDFIKYAQGVSFDSNIVGTYLINYERKIEKYDFLISYINFLKEYSNINMEQVVPNNL
FVFEIPGLIFLLREVFPHLHSWRFRSSFERNRIYKETLEYFCEILNIHIKNSEITNQNSK
KILKDICIYNLLNSDNGIALLKFIAIGNPFLQMSMEMEANWLSSSSCGVIRLVRLSMKIL
MHLLRLKSSLFNQNGLSPLESLIYAQPKQRDTLRIIPVVTSYINNIFDRSLPILSCRLLR
RIALEFNMSLLACLDMEPDQIRLIFLQSLPDDLESDDLKIAILEFVEACIEKQPGLTEAF
FKINNEKEKRIFAPKKEFNIADSIVFFMEIYLSSVLETPEIIENDIPTRIMSLFHSLWKS
GRQILVKNLLEQKTFWNSLCSPLFAKQFKPKIKAYNQILNILGMEIFISSSENNVDESLQ
KVIDKFFEKSFFEKWTKFVFDLPKICVEDYIADETPDWLCRLQSFKEFIVIILKKNLKDF
EIPNSQKKFLAMKTLEILVQRSEYTDDLRPFVILSELYLIVLNSFNHTYTQNLHEDQEML
TFTTKLLNNLSICYEDLHIRAKMSCLAITIKAADLLATELTKDIHNALNFLYPIVNIICY
ELSDLEKTVRIELHDKTAGYNRKENQETQSQKCNFNDENTPLILSLNLLKTIASIFHDEG
PSNWDTPFHSNRVFNRLLSCTAWIIQLNSKHKLSIELLDVLIVFAKGNCSHEFLYCDIGD
YLWLKLIPPKELTENNYMMQQNLMKPNQNRWLVENWWPIYSRGIELVTILLEKHRYQFLK
DVLLFVGIHEEYLMDCIFLAKQSLEPRAMALIKNVIYMICLLSEYESEWQLDHQQSLYNL
KKSVQFLLGHLISLFNQQRNLRRLMQGVNVQIDPIKELNNTYFPDDIVIILNELVEIVAV
CAKCLLNFSPNLLNFICEPQFLISKWEFIFDIQFGPPKLNDYSNQLTFGTVLNIVGILTK
SLNLQNSYGFNEIPLNEIPENITETQSTRSVSSSEKNCSTRVHFNKSMSIASVTSSVTAP
PNEILSNLDGELCQMALEKVLTLIACQTFLALRNTNLSNREKQLIRREITTELITFHEFV
RKKVLNDFRDHRDIWHRKKRGIMMMQINTTSNNGEEKSSTKKKSSASTKISSSGTSKPSM
RVDVVRRQHLQHHLQNLNSGKQKQTFDMSVNLSPIIQKSDKLSNPSSSTPHIGKSTVRKT
SFDDSSIKVICTERPTHDEENEEEIQYIEPIEPRYTPLSYVQLVEEDYLHFLSNIFHVIC
QND
NT seq
5772 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacttctaccttagacgataaatctaaacgcttaaaaaatattaaagaaatatctgag
ctggatgtcaccgattggaaaagagtttggcaattagtatctggtattcattatagtaca
tcagaatctttagttaaagaatcactatttgaaaaaagtaaagaaatacaagatggatta
ttccaatttaaaaagccgaaaacttttaacaatgatgacttagaaaaacttttaaaaagt
ttgaaacaagaaaaattattgccgtttacaactaaactgcaatatattttggacttagaa
cctgcacaatgttgggatgtcttatgctattatttggccaaagagtttcgtggcacagct
aattcgttaccactgctgacagccactgaatcaaatatgaccaaatttttagatgacatt
tggcgatattatacactgcaaagaatggtctttctgaaattagttaaaaatcttttggaa
ttttatcaaaatcaatatcacccgtatcatgaacaatacaaagaaattttagataaaatt
acattagaaaaattaaaaacgtcctatttaaagcaacttgaatttctaattaaagaaaca
cctccgttgaaattaacagggggagagttttggaattatcaagcaaaattatgtgattgg
aatgaaagaaattgcaaagagactattgaaatacttcatatacttatattaattgtacat
ttcgttggagttacagtggaggaagttacgcagttgatggaatactttaaaatgcattca
tttggaaggcaacagcgcttcttgaatgaatcaaatgaattacatttacaactaataaga
aaaattggatatagtgaaataattttatttatgaagtgtattgatgtatcacagaaagat
actgattcagcttggatatataatgttataaaaaatttagatgaaagtataacttctata
aaacatggaccatcctcaagtcaactttgtccagaacatggtcctcttttattatcatgg
atgctatttaattttcgtgttattgattctgaaacagatgatatcgcaacgaggaaattc
aggcaatatgggggaaaagctgttcagttagatgtttttaatagttttaaaaatatagtc
acacatcaaatgtttgaagatgacagtttaataagtagggttgctagaaaaacagtttac
aattatttaaatcatttatgtgaattattcgatgatggttcaattggaaaacataatgga
gtttatgatttattgagtgagcttttgcacacgccgttgatagcaaaacattttgtgcag
aatgaagattgtggaattagatcgctatatactgggttactggaaaattttcctattgat
ttttacagtattagcaaaatatttttagccctttcaaaagccgggaaatataattttgtt
aaggaacaatttcagcagttgccaatttatacagaattttatgatgaatgtaaacataaa
ttaatgccattaggtaatgatgaatatataactactcaaccgtatacgccatttaaagga
attgattacgttattccaattaaaaccagtgcagcgattttaagccacgataatggtgct
tttgttcatttcagaatccctgtcaattattttgatgtcttacaaaatgaaatgaataat
cttttgagttacgttacacaatatgttgaaattgatgtaaatcggtttaaaaacattaac
gctggggtcgaatatttatcttttgtgataagtaagattgaaaaacctcaagatatagca
ccagaaatggtatttccaacggaaatgtgtattgatattttaaataaatttaagaatata
tttaatcctcctatcgaattattagcaaattgtctaaatgtgtgtacatctttacttagc
aatttcaaaaatgaaatttcatctcgtattgctaatttaaatattttgccatcagtgacg
agtgaaaatttggattttatcaaatatgcacaaggagtcagttttgattcaaatatagtt
ggaacatatttgatcaattatgaacgcaaaattgaaaaatacgattttttaatatcttat
ataaactttcttaaagaatattctaacataaatatggaacaggttgtcccaaacaatttg
tttgtatttgaaattccgggtttaatatttcttttgcgggaagtgtttcctcatttgcat
tcatggagattcagatcatcttttgaaagaaatcgaatttacaaagaaacattggaatac
ttctgtgaaattttgaacatacatataaaaaactcagaaataacaaaccagaattcaaag
aaaattttgaaagacatttgcatatataatcttctaaattcagataatggaatagcatta
cttaaatttattgcaataggcaatcctttcttacaaatgtctatggaaatggaagcaaat
tggttaagttcttcctcttgtggggtaatacgtttagttagattatcgatgaaaatctta
atgcatttacttcgattaaagtcttcattgtttaatcaaaatggattatctccacttgaa
agcttgatatatgcgcaacctaaacaaagggatacccttagaatcataccagtcgttaca
agttatattaataacattttcgacagatccttaccaatactgtcctgtcgattgttgaga
cgaatcgctcttgaattcaatatgtctttattagcatgccttgatatggaaccagatcaa
atacggttaatatttttacaaagtttgccagatgatttagagtcagacgatctaaaaata
gcaatattggagtttgttgaagcatgtattgaaaagcaaccaggtttaacagaagcattt
tttaaaattaataatgaaaaagaaaaaaggatttttgctccgaaaaaggagtttaacatt
gcagatagtatagtgttcttcatggaaatttatctttcgagtgttctagaaactccagag
ataattgaaaatgatattccaacaagaataatgtcattatttcattctctttggaaaagt
ggaagacaaattttagtgaaaaatttgttagaacagaaaactttttggaattcattgtgt
agcccgttgttcgcaaaacaattcaaacctaaaataaaagcttacaaccaaattttaaac
attttgggtatggaaatatttataagttcatcagaaaataatgttgatgaaagtttacag
aaagttattgataaattttttgaaaaatctttcttcgaaaagtggactaaatttgttttt
gatttgccaaagatttgtgttgaggattatattgccgacgaaaccccagattggctgtgt
cgtcttcagtcatttaaggaattcattgtaattattctaaaaaaaaatctaaaggatttt
gaaattccaaattcacaaaaaaaatttttagctatgaagactttggaaattttagttcaa
aggtcggaatatactgatgatctcaggccgtttgtcattctttcagaactgtatttaata
gttttaaatagttttaaccacacttatactcaaaatttacacgaagatcaggaaatgctt
acatttacaacgaaattacttaacaatttatctatttgctacgaagatttgcacattaga
gctaaaatgtcctgtttagcgataaccatcaaagcagcagatttattagctactgaattg
acaaaggatattcacaatgctttaaatttcctttatcctatagtcaatataatatgttat
gagcttagtgatttagaaaaaactgtgagaattgagttgcatgataaaacggccggctac
aaccggaaagagaatcaagaaacgcagtctcaaaagtgtaattttaatgatgaaaataca
cccttaatattgagtttaaatttattaaagacaattgcaagtatttttcatgatgaaggt
ccttcgaactgggatactccatttcattcaaaccgcgtgttcaataggttgctgagttgc
actgcatggattattcaactaaattctaaacataaattatcaattgaactcttggatgtt
ttaatagtatttgctaaaggaaattgttcacacgaatttttatactgtgacattggagat
tacttatggttaaaacttattccaccaaaggaactcacagaaaataattatatgatgcag
cagaacctaatgaaaccgaatcaaaacagatggctggttgaaaattggtggccaatatat
tctagaggaattgaattagtgactatattattagagaaacaccgttatcagtttttaaaa
gatgttttattgtttgttggaattcacgaagaatacttaatggattgtatttttttggcg
aaacaatctttggaaccaagagctatggcattgattaagaatgtgatttacatgatatgc
cttctatcagaatatgaaagtgaatggcagttagatcaccagcaaagtttatataattta
aagaaaagtgttcagtttctgttaggacatttaatatcactgtttaatcaacaaagaaat
cttagaagactgatgcaaggtgttaacgtacaaatagatccaatcaaagaacttaataac
acatactttcctgacgacatagtaattatattaaatgagcttgttgagatagtagcagtt
tgtgccaaatgtttattaaatttcagtcccaatttattgaatttcatatgtgaaccgcaa
tttttaatatcaaagtgggagttcatatttgacatacaatttggaccacccaagttgaat
gattacagcaatcaattaacttttggtacggttttaaatattgttggaattttaacaaaa
tcactaaacttacaaaacagttatggtttcaatgaaattcctttgaatgaaatccccgag
aatatcacggaaactcaatcaacacgatctgtatcttctagtgaaaaaaattgttcaact
agggtacactttaacaaatccatgtctatagcatcggttacatcatctgttactgctcca
ccgaatgaaattctttcaaatttagatggagaattgtgtcaaatggctttagaaaaagtt
ctaactttaattgcttgtcaaacttttcttgcattaagaaatacaaatttatctaataga
gaaaaacaattaatacgacgtgaaataacaactgaattaataacttttcatgaatttgta
agaaaaaaagttttaaatgattttcgtgaccatcgcgatatatggcatcgtaaaaaacga
ggaataatgatgatgcaaataaatacaacaagtaacaatggagaagaaaagtcttcgaca
aagaaaaaatcaagtgcttcaacaaaaatttcttcaagtggtacatcaaaaccatcaatg
agagttgatgttgttcgacgacaacatttacaacatcatttacaaaatttgaattctgga
aaacaaaaacaaactttcgatatgtcggtaaatttaagtcctataattcagaaatcagat
aaattaagtaacccaagttcttcaactccccatattggtaaatctacagtacgtaaaaca
tcttttgacgatagttctattaaagtaatttgtacagaaagaccaacacatgatgaagaa
aacgaagaagaaattcaatacattgaaccaattgaacctcgatatacaccattatcatat
gttcaattggttgaagaagattatttgcatttcctttcaaacatttttcatgtaatttgt
caaaatgattag
DBGET
integrated database retrieval system