Condylostylus longicornis: 129615477
Help
Entry
129615477 CDS
T09756
Name
(RefSeq) ribonuclease Z, mitochondrial
KO
K00784
ribonuclease Z [EC:
3.1.26.11
]
Organism
clon
Condylostylus longicornis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clon00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
clon03016
]
129615477
Enzymes [BR:
clon01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.26 Endoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.26.11 tRNase Z
129615477
Transfer RNA biogenesis [BR:
clon03016
]
Eukaryotic type
3'processing and CCA adding factors
3'processing factors
129615477
Prokaryotic type
129615477
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Lactamase_B_4
Lactamase_B_2
Lactamase_B
Anti-Pycsar_Apyc1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129615477
NCBI-ProteinID:
XP_055386700
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
846 aa
AA seq
DB search
MFRNIKIALQTSIPLNVNKFRVSTLSNSKLKLNKLLISMPKEREHIAEAQKQRQKIKEKS
SKYIPGTVNLQVLGNGSSSAPAVVYLFTDQNRYLFNCGEGTQRLAHEHKTKLSRLEHIFM
TRTSWDRLGGLPGLTLTVQDSGVPNLTLHGPPGLDEIFRGMERFVVLKDLKVSTVNYENG
GDFEDQVMTVKCIPLKIDKYENNNDAKSSDLKEEIPEIDDTDYYEYENKKKDERQSPISI
NVKNISSENYQRREEFMTCAYICKLKPKPGSLNLEKCVDKGVPPGPLLGQLKNGFDVELP
DGTIVKSDDVRAPTDPGPVFIFIDVPNEDYLVALEKQANCFEDYQAKSENEDNKAILIIH
FTPQNIIQTEAYKKFMMKFPNTTQHLILNSSNRFSGYVATHRIQYQLNQIHSGIFPLLKE
SIDLNIDQLERPTKKLKLLPDNINSQIKIIEKENSLNCIPDVITLTSFNLRPKKSLDRSY
EPQFTPDEYIEETHAVEGFLESLHNFKNIYNKINSEENDDSITKLNYPKILFLGTGSCIP
NKTRNVSSILLNINSSSCILFDCGEGTWGQIIRFYGENEALEILHNLKAIFVSHLHADHH
IGLIGLLKARQLLKIETPILLFAPAQIKNWLNFYDRRIEKLSTEYSLIPNADLITTPYNT
LYTEEMGIKSISTCLVRHCPHAFGIAIELIEEFNMKPIKITYSGDTMPCDELIKLGMNST
ILIHEATMEDELQHEAIYKMHSTVSQAISQGERMQSQYTILTHFSQRYAKLPRIENDIGQ
KVGLAFDNMEICLKDIKYLPLMYPTLKIMFTEHCEELEQKAVKRALKKERKRQSIPENKN
FKEITR
NT seq
2541 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaggaatatcaaaattgctcttcaaacctccattccattaaatgtaaataagttt
cgtgtttccaccttaagtaattcaaaattgaaattaaataaacttctaataagtatgcca
aaagaacgtgaacatattgctgaagcgcaaaagcagaggcaaaaaattaaggaaaaaagt
tcaaaatatatacccggcacggttaatttacaagttcttgggaatggatcaagttcagca
ccagctgttgtttatttatttactgatcaaaatagatatttgtttaattgtggagaaggt
acacaaagattagctcatgagcataaaacaaaattatcacgtttagagcatatttttatg
acacgtacaagttgggatcgtttaggtggtttaccaggtttaacattaacagttcaagat
tctggtgtaccaaatttaacattacatggaccacccggtctggatgaaatttttcgtgga
atggaacgttttgttgtcctaaaagatttaaaagtaagtactgtaaattatgaaaatggt
ggagattttgaagatcaagttatgacagtaaaatgtattccattaaaaattgataaatat
gaaaacaataatgatgccaagtcaagtgatttaaaagaagaaattccagagattgatgat
acagattattatgaatatgaaaataaaaagaaggatgaaagacaatcaccaatttcgatt
aatgttaaaaatatttcatcagaaaattatcagcgaagagaagaatttatgacttgcgcc
tacatatgcaaattgaagcctaaacctggatcattaaatctagaaaaatgtgttgataaa
ggtgtaccacccggaccattactgggtcaacttaaaaatggttttgatgtagaattaccg
gatggaacaattgtaaagtctgatgatgtacgggctccaactgatcctgggcctgtattt
atatttatcgacgttccaaatgaagattatctagtcgcattagagaaacaagcaaattgt
tttgaagattatcaagcaaaatcagaaaatgaagataataaggctattttaataattcat
tttacaccacagaatattatacaaacagaagcatacaaaaaattcatgatgaaatttcca
aatacaactcaacatttaatattgaattcttctaatagattttctggttatgtagctact
catcgtattcaatatcaattaaatcaaattcacagtggaatctttccattgcttaaggag
agcatagatttaaatatagatcaattagaaaggccaacaaaaaagttgaaattattacca
gacaatattaattcacaaattaaaattatagaaaaagaaaattctcttaattgtatacca
gatgtaattactttaacttcttttaatttaagaccaaaaaaatcattagatagatcatat
gaacctcaatttacaccagatgaatatattgaagaaacccatgcggtagaaggattttta
gaatcacttcataatttcaaaaatatttataataaaataaattctgaagagaatgatgat
tctattacaaaattaaattatccaaaaattttatttctgggaacaggttcatgtattccc
aataaaacacgcaatgttagttcaatacttttaaatataaattctagttcttgtatatta
tttgattgtggtgaaggtacttggggtcaaataataagattctatggagaaaatgaagca
ttagaaattttacataatttaaaagcgatatttgtttcacatttacatgcagatcatcac
ataggtctaataggattattaaaggctcgccaattgttaaaaattgaaacacccatactt
ctatttgcccctgcacaaattaaaaattggttaaatttttatgatagacgaatcgaaaaa
ctttctacagaatattctttaattcctaatgctgatttgattacaaccccctataataca
ttatatacagaagaaatgggtattaaatctatatcaacttgtctagtacgacattgtcct
catgcatttggtattgcaattgaattaattgaagaatttaatatgaaaccaataaaaatt
acatatagtggtgatacaatgccatgtgatgaattaattaaattaggaatgaattcaact
attttaatacatgaagcaacaatggaagatgaattacagcatgaagcaatatataaaatg
catagtacagtttcacaagctataagtcaaggtgaaagaatgcaatcacaatatacaatt
ttaacacattttagtcaaagatatgcaaaattaccaagaattgaaaatgatattggacaa
aaagttggtctagcttttgataatatggaaatatgtttaaaggatattaaatatttacct
ttaatgtatccaactttaaaaattatgtttacagaacattgtgaagaattagaacaaaaa
gctgttaaacgtgccctcaaaaaagaaagaaaacgtcaatcgataccagaaaataaaaat
tttaaagaaattactagatga
DBGET
integrated database retrieval system
