Clostridium sp. AWRP: DMR38_02145
Help
Entry
DMR38_02145 CDS
T07742
Name
(GenBank) cell wall-binding repeat-containing protein
Organism
clos
Clostridium sp. AWRP
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CW_binding_2
Big_5
BTRD1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZV55501
UniProt:
A0A3Q9S5E7
LinkDB
All DBs
Position
467562..470894
Genome browser
AA seq
1110 aa
AA seq
DB search
MKRNAIKAISTTAVLSLLLSPALPVTSAKAAAGEVTKLSGADCYETAAIVATQNWTSTDN
VILASGGGYSDAISSAVLAKQLKAPVLLTEAGSLNSNAKSALDKLKPKNIYIIGGTASIC
QKTRDDLKSQGYNLIELSGKNRYETNLAVAKQLVKLGVNADNVMMVGGEGFADALSAAPV
AAAKGEILLLGVNNTQAMSPIENFIKNNNSKVTVISTQTLINDNTYKSIGAVNRISGGAD
RFATNLNILNQFDSELKADKLYIANATGDKYADALIAASVAGTSAAPLVLIDGQDDSGTA
NAMNYIKNKAAKTTDLNLIEENGTVSDKTISDINAAASGSGVESATVGSVTTNGLNQIKV
VFNTDVDKDSAERSANYQIDGGDLGSTVQTQATATLQEDNRTVFVTFSHPFTLNKSVTFT
VKSAVNTKNLGTTVPKYDKQVTFSSISTPTFDSITAIGGNKLRVKFSEPIRMDSSNLSSF
RINRQSITAFGINTSDSVTKFRDKSLDGVWADGVDLYFNSPLPVGKNTFTVPNGESGGKF
SDAANLPISSTSKDFTVNSVSGNPQVQSVTSNNVDTIYVKYNRPMDEQTALEPSNYKING
TTVNVDDSYVTFDTGSGDTVVKITKVSDMLKQGENAVTIKGNVTDTFGNYINESNMSLYV
GGDTTKPTISTASIFDEKTIRIKFNKDVSTSYAENKGNYTVLDSTGANITYKIDTINDIT
VDGNSKRTFDIKFKEDDLKGSKYTLTVKNIIDTEASPNIMDNYTTTLSGMDNEGTNVTEI
LRRVDNSHAVAIFFSKAMDQDSLENSSNYMFKDGQGNTRSLPSSAMITPSIDGKSVTVEF
NSDYTIGSGSSGSSVIQMGVKNLKDVDGKPLDLGSYMGDITIDDNNDGPRLVAGTAQMSF
ANNDIYVKVSLSKPLDVLSFNDFRVAGYAPDTGSTSGNDVTLIFKSGIKNNQKINAIKNA
GSMTNVSIENTSSVDAAGRNIKSGSTAVYVPPIAMQDLWSASPNSGMNVVNVVFNQEIDD
DIVTSYNDDFLFTDEETGQQLIPTSVWVDNRTLVYRFNNGTFSRGDRILVRANSDSSKIN
VRSESHNTSGYTIYSPSDSDISGKIITVGE
NT seq
3333 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaaatgctataaaggcaataagcaccacggctgtattatcgttgttgctttca
ccggcacttcctgttacttctgctaaagcggcagcaggggaagttacaaaattatctgga
gcagattgctatgaaacagcagctatagttgctacacaaaattggacaagtactgacaat
gtaatacttgcttcaggtggaggatattcagatgctataagttctgcagtacttgcaaaa
caattgaaggcacctgtacttttaactgaggcaggatctcttaattctaatgcaaaatct
gcactggataagttaaaaccaaaaaatatatatataataggtggaactgcatcaatatgc
cagaaaacaagagatgatctaaagagtcaaggttataatttaattgagttaagtgggaaa
aatagatatgaaactaaccttgcagtagctaaacagcttgtaaagctgggggtaaatgca
gacaatgtaatgatggtagggggagaaggctttgcagatgctttatctgctgcacccgta
gcagctgctaaaggtgaaatattattacttggagtgaataatactcaagctatgagccct
atagagaattttataaagaacaataattccaaagttactgttataagtacgcaaacttta
ataaatgacaatacatataaaagtataggtgctgtaaacaggatatctggaggggcagat
agatttgccactaacttaaatatattgaatcaatttgacagcgaactaaaggcggataaa
ctctatattgcaaatgctactggtgataaatatgcagatgcattaattgcagcttctgtg
gctggaacaagtgctgcacctcttgtacttattgatggtcaggatgacagcggtactgca
aatgcaatgaattatatcaaaaataaagcagcaaaaactactgatttaaatcttatagag
gaaaatggaacggtttctgacaaaactatctctgatataaatgcagcagcttcaggcagt
ggggttgaaagtgccacagtagggtctgtaactacaaatggacttaatcagataaaagtt
gtatttaatacggatgtagacaaagattctgcagagaggtctgcaaattatcaaatagat
ggtggagatcttggctcaactgtgcaaactcaagctacagcaacacttcaggaggacaat
agaactgtttttgttacattttctcacccctttactttaaataagagtgtgacttttact
gttaaaagtgctgtaaatacaaaaaatttgggaactactgtaccaaaatatgataagcaa
gttactttttcgtctataagtactccaacttttgattctataacagctataggtggaaac
aagttaagggtgaaattttcagagccaattagaatggacagcagtaatctgtcttcgttt
agaataaataggcagagtataactgcttttggaataaacacatctgattctgttactaaa
tttagggataaatccttagatggggtatgggctgatggtgtagatttatactttaattct
ccgcttccagtaggtaaaaatacttttactgtgccaaatggagaatctggaggtaaattc
agtgatgcagctaatttgccaataagtagtacttctaaagattttactgtaaattctgtg
tctggaaacccacaagttcaaagcgtaacaagtaacaatgtagatactatttatgtaaag
tacaatagacctatggatgagcagactgcccttgaaccgagcaattacaaaataaatgga
actacagtaaatgtggatgattcctatgtaacttttgatacagggtcaggagatactgta
gtgaaaatcacaaaagtgagtgatatgcttaagcagggagaaaatgcagttacgataaaa
ggaaatgttacagatacctttggaaactacataaatgaatccaacatgagtctttatgtt
ggaggagacaccactaaacctacaatatctacagctagtatttttgatgaaaagactata
aggataaaatttaataaggatgtttccacaagttatgctgaaaataagggaaattacact
gtacttgattctacgggagcaaatataacttataaaattgatactataaatgatataact
gtagatggaaatagtaaaaggacttttgacataaagtttaaagaggatgatcttaaaggt
tcgaaatatactttgactgtaaaaaatataattgatacagaggcaagtcctaacataatg
gataattatactactaccttatctggaatggacaatgaaggtacaaatgtaacggaaata
ttgagaagggtagataattcccatgctgtggcaatattttttagtaaggctatggatcaa
gattctttagaaaattcatctaattatatgtttaaagatggtcagggaaatacaagaagt
ttaccatccagtgctatgattactccaagcattgatggcaagagtgtaactgtggaattt
aattctgattatactataggctcaggaagtagtggctccagtgtaattcaaatgggagta
aaaaatcttaaggatgtagatggaaaacctctagatctcggatcatatatgggagatata
actatagatgataataatgatggaccaagacttgtagcaggtactgcacagatgagtttc
gcaaataatgatatatatgttaaagtgtcactatcaaaaccgctggatgtgctgtctttt
aatgattttcgagtagcaggttatgcaccggatactgggtctacaagtgggaatgatgta
acactcatatttaagtctggaattaaaaacaatcagaagataaatgccataaaaaatgca
ggcagtatgactaatgtaagtatagaaaatacaagttctgtagatgcggcaggacgtaat
ataaaatctggttctacggcagtgtatgtaccacctatagccatgcaggatttatggtct
gccagccctaattctggtatgaatgttgtaaatgtagtatttaatcaagaaatagatgat
gatattgttacttcttataatgatgacttcttgtttacagatgaagaaacaggacagcaa
ctgatacctacttcagtatgggtagataatagaactcttgtttacaggtttaacaatggg
acattcagcagaggtgatcgcattctagtaagagctaatagtgatagctctaagataaat
gtaagaagtgaaagtcataatacttcaggatatacaatctattctccatctgatagtgat
atttcaggtaaaattataacagtaggagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
