Campylobacter lari RM16701: UPTC16701_0672
Help
Entry
UPTC16701_0672 CDS
T03550
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
clr
Campylobacter lari RM16701
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
clr02000
]
UPTC16701_0672
Transporters [BR:
clr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
UPTC16701_0672
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJD04712
LinkDB
All DBs
Position
642663..644765
Genome browser
AA seq
700 aa
AA seq
DB search
MNKYKIVVLLYASVMFLSAHSEEANINLEQSIAIAEIEEDIDNGLKNMIVLDKKWISKNG
FNSITQALEKIPEVNFVNFGLGSSIDIRGQGNKSNTAVKIMVDGKSINTLDSSHNIAPIN
SIDINNIERIEVIPGGGSILYGNGAKGGVVNIVTQKAKKEYFSFNTNFQSQRSGIDGGNF
GFNMSKMIKDGVFFGLNMQAYNKNGFVQGYHEKGYYTNANIFTYVGDNGTLLLDYNYFQN
TDTNKGYLTYSQINSKQDTINQDENIVKTTMPQLGIKYDLFFQDNLEFSLETFLQRQKIQ
YLKDTVSLMGVKAYQDGSEFEDDLFGVKFKAKYYYLHNSNIISGYEFLNHNAKRKSLLQY
NVPNIILYHNMTTLMDMNKQSHSFFTLNSHSFNDVFTLLSGFRYEWSGYKTNRSFRNQMD
VNFPSANFPKDELLEFSSQSNSSNFALELTPSIKYSDTGIIYFKYEKGFISPNPSQLVNK
EQKNQKYYSTDLNSEIFNSFEIGFNDLLWNFYGINLKMFYTQSKDEISYIGNPHSISGSW
WKYYNIEETRRFGMELNTEQKIIKDTLIFKEGLTYIDAKISKGINNGMKIPYVSKIKTFF
GIDYYLNSNLNTFIDLSYYSKAKEGGIVDENSGKIIKSNWIKDYMVTNIGLSYNYKNFQM
SAGIRNLFDEKYFTYQDSINDQYLLGKRRNYYAEFRYILD
NT seq
2103 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaataaatataaaattgttgttttattatatgcaagtgttatgtttttaagtgcacat
agtgaagaagcaaatataaatttagaacaatctattgcaatcgctgaaattgaagaagat
attgataatggattaaaaaatatgattgttttagataaaaaatggatttctaaaaatgga
tttaattctattactcaagctttagaaaaaataccagaagtgaattttgttaattttggt
ttagggtctagtattgatataaggggtcaaggtaataaatcaaatacagctgtaaaaatt
atggtagatggaaaatctattaacactttagatagttctcataatatagcacctattaat
agtattgatattaacaatattgaacgaatagaagtgattccaggtggtggttctatatta
tatggaaatggtgccaaaggcggtgttgttaatatagttactcaaaaagcaaagaaagag
tatttttcatttaatacgaattttcaaagccaaagaagtggaatagatggtggaaatttt
ggttttaatatgagtaaaatgataaaagatggtgtattttttggtttaaatatgcaagct
tataataaaaatggttttgtacaaggatatcatgaaaaagggtattatactaatgcaaat
atttttacctatgttggcgataatgggactttattgcttgattataattattttcaaaat
acagacacaaataaaggatatttaacgtattctcaaatcaactctaagcaagatacaata
aatcaagatgaaaatatagtcaaaacaactatgcctcaattaggtattaaatatgattta
ttttttcaagataatttagaattttcccttgaaactttcttacaaagacaaaaaattcaa
tacttaaaagatacagtctctttaatgggtgttaaagcatatcaagatggaagtgaattt
gaagatgatctttttggggtaaaatttaaagctaaatattattatttgcataattcgaac
attatttctggttatgaatttttaaatcataatgctaagcgtaaaagtttattgcaatat
aatgtcccaaatatcattttatatcacaatatgacgacattgatggatatgaataagcaa
agccattcattttttactttaaattctcactcttttaacgatgtttttaccttattgagt
ggttttagatatgaatggagtggttataaaacaaatagatcttttagaaatcaaatggat
gtaaatttcccatctgctaatttccctaaagacgagttattagagtttagttctcaatca
aatagtagtaattttgctttagagttaacacctagtattaaatattcagacactggaatt
atatattttaaatacgaaaaaggttttatttctccaaatccatcccaactagtaaataaa
gaacaaaaaaatcaaaaatattattccactgacttaaattctgaaattttcaatagcttt
gaaattggatttaatgacttattgtggaatttttatggcataaatttgaaaatgttttat
actcaaagtaaagatgaaatttcatatattggaaatccgcactcaatctctggttcatgg
tggaaatactataacatagaggagacaagacgttttggtatggagttgaatacagaacaa
aaaatcataaaggatactttaatatttaaagaaggattgacttatattgatgcaaaaatt
tctaaaggcataaacaatgggatgaaaattccttatgtgtctaaaataaaaacatttttt
ggtattgattattatttgaattcaaatttaaatacttttattgatttgagttattactca
aaagctaaggaaggtggtattgttgatgaaaatagtggaaagataattaaaagtaattgg
attaaagattatatggtaactaatattgggttgagttataattataaaaattttcaaatg
tctgctggcatacgtaatttatttgatgaaaagtattttacatatcaagatagtataaat
gatcaatatttattaggcaagcgtagaaattactatgctgagtttaggtatatccttgat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
