Campylobacter lari RM16701: UPTC16701_1023
Help
Entry
UPTC16701_1023 CDS
T03550
Symbol
pepF
Name
(GenBank) oligoendopeptidase F
KO
K08602
oligoendopeptidase F [EC:3.4.24.-]
Organism
clr
Campylobacter lari RM16701
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
clr01002
]
UPTC16701_1023 (pepF)
Peptidases and inhibitors [BR:
clr01002
]
Metallo peptidases
Family M3
UPTC16701_1023 (pepF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M3
Peptidase_M3_N
Peptidase_M78
IFT52_central
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJD05057
LinkDB
All DBs
Position
1001406..1003127
Genome browser
AA seq
573 aa
AA seq
DB search
MQNWNLSTLFKDEQELNLFLQKTQDDACEFKKQYENNLHSLSNEQFLQALKNYEELILKL
SHILTYVYLNFAQDTTKGAFYAKYENLSKKIEENLLFFELEFCELKEEKSKTFITFCKDY
EFYLNNLIKHKKHNLSKKEERVILALSSTGSNAFARLFDETFSALKFNFEGQKLSEEEIL
SKLYDKDRSIRKKASKCFSKTLKKQNKLLVYIFNMIKSELASICELRSYESPETPRHIRN
QISKKSVDALISASENSFDIVSKFYNAKKKILGYKKLKDYDRYAPIGKEMQVDFDQGKDI
VLKAFEKFSKDFYRIAKEAFENNWIDVYPKEFKQSGAFSHSSTPLSHPFILLNYTNQRRD
LFTLAHELGHTIHQKLSYKVSFLNQDTPLTTAETASVFAEMLIFDYIKENLDKEELLSLY
AAKIEDIFATLYRQINFTTFERRFHAKKEELSAQELSEIWLEESRKMFQDSVVLTKNYGL
WYSYIPHFIHSPFYCYAYAYAQLLVLALYGLYKSGKCTDFTSIYTEFLSSGGSKSPKELV
AMFGFDIESDEFWNIGLEQVRILVDEFLRLSND
NT seq
1722 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaattggaacttaagtacattatttaaagatgagcaagaattaaatcttttttta
caaaaaacccaagatgatgcttgtgaatttaaaaaacaatacgaaaataatcttcatagt
ttaagcaatgagcaattcttgcaagctttaaaaaactatgaagaattaatcttaaaactt
tctcacatactaacctatgtatatttaaattttgctcaagataccacaaaaggtgctttt
tatgcaaaatatgaaaatttaagtaaaaaaatagaagaaaatcttttattttttgaactc
gaattttgcgaattaaaagaagaaaaaagcaaaacttttatcacattttgcaaagattat
gagttttatttaaataatcttatcaaacataaaaaacacaatctttctaaaaaagaagaa
agagttatcctagctctatcaagtacaggttcaaatgcatttgcaagattatttgatgag
acatttagtgctttaaaatttaattttgaagggcaaaaattaagcgaagaagaaattcta
agcaagctttatgataaagatagaagcattagaaaaaaagcttcaaaatgctttagtaaa
accttgaaaaaacaaaacaagcttttagtatatatttttaatatgattaaaagcgaactt
gctagtatttgcgagttaagatcttatgaaagtcctgaaaccccaagacacataagaaat
caaatttctaaaaaaagcgttgatgcgcttattagtgctagtgagaatagttttgatatt
gtttctaaattttacaacgcaaagaaaaaaattctaggatataaaaagctaaaagattat
gatcgatatgcgcctattggaaaggaaatgcaagttgattttgatcaaggaaaggatata
gttttaaaagcctttgaaaaattttctaaagatttttataggatagcaaaagaagctttt
gagaataattggatcgatgtttaccctaaagaatttaaacaaagtggtgctttttctcac
tcaagcacgccactaagtcatcctttcatacttttaaactataccaaccaaagacgcgat
ctttttactctagcacatgagctaggccacactatacatcaaaaactttcctataaagta
agttttttaaatcaagatacaccgctaactacagcagaaactgcttcagtgtttgcagaa
atgttgatttttgattatattaaagaaaatttagacaaagaagagcttttgtctttatat
gcagcaaagatcgaagatatttttgctactctttatagacagattaattttactactttt
gaacgcagatttcatgctaaaaaagaagaactaagcgctcaagaactaagtgagatttgg
cttgaagaatcaagaaaaatgtttcaagatagtgtagttttaaccaaaaattatggcctt
tggtattcttatataccacattttatacactctccattttactgctatgcttatgcttat
gcacaacttttagttttagcgctttatggactatataaaagtggcaaatgtactgatttt
acttcgatttatactgagtttttaagtagtgggggaagtaaaagtccaaaagaacttgta
gctatgtttggctttgatatagaaagtgatgagttttggaatataggtttagagcaagtt
agaatactagtagatgaatttttaaggctaagcaatgattga
DBGET
integrated database retrieval system
