Clostridium bornimense: CM240_1328
Help
Entry
CM240_1328 CDS
T03165
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
clt
Clostridium bornimense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
SWIM
SWI2_SNF2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDM68487
UniProt:
W6S2F9
LinkDB
All DBs
Position
rep1:complement(1481108..1484248)
Genome browser
AA seq
1046 aa
AA seq
DB search
MNDIKIGNIRKKAILENINKGYYFYKRDHVFDFWEREVDEFSRRLSCYVASENFDEYLIN
FVVDKGDNLLEGQCTCPYKVKTNDNCKHVVAAYLYYLNEVAKSKESYENLSVMRKFLNSI
KEDEPESIVKFDIIIAEVNKEVRGYFKIGKNKKYVIRQFKNFIFDLENSEEIVFGKEFTW
KKNHHGFNPTDRRIIKILHQYIEDENFNEKTTEGKYFIFNRTIIKDIIELLKYKEFYIEE
ENRLVKGDIVYDDIALEFICKNINGNLSLTIEKMPISIDESNIYLYDDKLYVTTIDFHEL
YSEIKSLFGDNNYIIIEDEDKDDFFKYGFSRFNSLGRVTLENTLENIIIDEPLRTEFYFD
KEERNVVLTVFFNYKNIRINPFREDYKEAVIRDIKKENRILREIYKLGFIKNDNNLLLKS
DKDILNLQINGIEVLKEFGEIYYSEAFKKMEVNSIKVKTMLSLNDDGWLNFSFGVDNYDS
IELRNILESIRVNKKFYRAKDGSFLSLESEDIKKLSHVIEVLDINNSDIDKGNVLLNKYH
SLYLKDMFINKLDKSIENLLNDVENFNLNDFKLEENVNYKLRYYQIEGVKWLSTLYQYKF
GGILADEMGLGKTIQTIAFIQNVIKKGNNQCNLIVCPTSLIFNWVQEINKFAPELKVSCL
YGDREKRSNLVESIDSSHIIITSYSILKRDIELLSKINFNLCILDEAQAIKNSSSITWKC
AKKINAKCRFALTGTPIENSLIELWAIFDFIMPGFLSNEKKFREQFQIPIMIENDKKLLK
ELQDKIVPFILRRKKKDVLGELPNKIERKVIVDLNDEQKKIYTSLVNSINEEIDNNSDKS
NLGKTKILILSTLTKLRQICCDPSSIIEGYNGGSSKIDILIDILDKSIDDGHKILVFSQF
TSILKNVRKILENLDIKSMYLDGEIKAKTRIEMVDEFNKSNIPVFLISLKAGGSGLNLTS
ADIVIHLDPWWNPAVENQATDRAHRIGQENVVEVIKLISKGTIEEKIYNLQEKKKMLISD
VIDGEEMDRSIITSMSLEDIKNIFKI
NT seq
3141 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaatgatattaagataggaaatattagaaaaaaagctatattagagaatataaataag
ggatattatttttataaaagagatcatgtttttgatttttgggaaagagaagtagatgaa
tttagtagaagattatcctgttatgtagcttctgaaaattttgatgaatatttaattaat
tttgttgtagataaaggtgataatctcttagaaggtcagtgcacttgtccttacaaggtg
aaaacaaatgataattgtaagcatgtagtagcagcttatttatactatttaaacgaagtt
gcaaaatctaaagagagttatgaaaacttatctgttatgagaaaatttcttaactcaata
aaagaggatgagcctgagagtatcgtaaagtttgatattataatagcagaagtaaataaa
gaagtaagaggatattttaaaattggtaaaaataaaaaatatgttataaggcaatttaaa
aattttatctttgatttagaaaatagcgaagaaatagttttcggtaaagaatttacatgg
aaaaaaaatcatcatggtttcaatcctacagatagaagaattattaaaatactacatcag
tatattgaagatgaaaattttaatgaaaaaactacggaaggaaagtactttatatttaat
agaacgataattaaagatattattgagctattgaaatataaagagttttacattgaagaa
gaaaatagattagttaaaggggatatagtttatgatgatattgctttagaatttatatgt
aaaaacattaacggaaatttatcattgactatagagaaaatgccaatctccatagatgag
tccaatatatatttatatgatgataagttatacgttacaactatagattttcatgagctt
tattcagaaatcaagagtttatttggtgataacaattatattattatagaagatgaagat
aaggatgatttttttaaatatggttttagtagattcaattctttaggaagggtaacatta
gaaaataccttagagaatataataatagacgagccacttagaactgaattttattttgat
aaagaagagagaaatgtagtactaacagtattttttaattataaaaatataagaataaat
ccatttagagaagattacaaagaggctgttattcgagatataaaaaaagaaaatagaatt
ttaagagaaatttataaattaggatttataaaaaatgataataatcttttattgaaaagt
gataaggatatattaaatttacaaattaatggtatagaagtgttaaaagaatttggagaa
atatattattcagaagcttttaaaaagatggaagttaattcaatcaaagttaagacaatg
ctttcattaaatgatgatgggtggttaaatttttcttttggtgttgataattatgatagt
attgaattaagaaatatacttgaatctataagagttaataaaaagttttatagagctaaa
gatggaagttttttatctttagaaagtgaagatataaaaaagttatcacatgtaattgaa
gttttggatataaataatagtgacatagataaaggcaatgttctattaaataaatatcat
agtttgtatttaaaagatatgtttattaataaattagataagtctatagaaaacttatta
aatgatgttgagaattttaacttaaatgattttaagttagaggaaaatgttaattataaa
ttaagatattatcaaatagagggtgttaaatggctttctacattatatcaatataaattt
ggtggaattctagctgatgaaatgggtttaggaaagacaatacaaacaattgcattcata
caaaatgttataaaaaagggaaataatcaatgcaatctaatagtatgtccaacatcatta
atttttaattgggttcaagaaataaataagtttgcaccagaattaaaggttagttgttta
tatggtgatagagagaaaagaagtaatttagtagaaagtattgattcttcacatatcata
ataacttcatattcaattttgaaaagagatatagagttattatcaaaaataaattttaat
ctatgtatattagatgaagcacaggcaataaaaaattcatcatctattacttggaaatgt
gcaaaaaaaattaatgctaaatgtagatttgcattaactggaactcctattgaaaattca
ttaatagaattatgggcaatctttgacttcataatgcctggatttttatcaaatgaaaag
aaatttagagaacaatttcagattccaataatgatagagaatgataaaaaattattaaaa
gagttacaagataaaatagtgccatttatattaagaagaaagaaaaaggatgtattggga
gaattaccaaataaaatagagagaaaagttatagtagatttaaatgatgaacaaaaaaag
atatacacttcattagttaattctattaatgaggagattgataataattctgataaatct
aatttagggaaaacaaaaatattaattttaagtactcttacaaaattgagacaaatttgt
tgtgatcctagcagtataattgagggatataatggcggaagcagtaaaatagatatatta
atagatatattagataaatcaatagatgatggacacaagatattagtattttctcaattc
acatctatacttaaaaatgtgcggaaaattttagaaaatttagatattaaatcgatgtat
cttgatggtgaaataaaagccaagacaagaatagaaatggttgatgaattcaataaaagt
aatatacctgtatttttaatttctctaaaagcaggaggttcaggacttaatttaacttca
gcagatatagttatacatttggatccatggtggaatcctgcagtagaaaatcaagctact
gatagagctcatagaattgggcaggaaaatgttgtagaagtgattaaattgatttctaag
ggcacaattgaagaaaaaatatataatcttcaagaaaagaaaaaaatgttgataagtgat
gttattgatggtgaagagatggatagatcaataattacgtctatgtcattggaggatata
aaaaatatatttaaaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
