Clostridium bornimense: CM240_3053
Help
Entry
CM240_3053 CDS
T03165
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K18889
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
clt
Clostridium bornimense
Pathway
clt02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clt00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
CM240_3053
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
clt02000
]
CM240_3053
Transporters [BR:
clt02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
CM240_3053
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
ABC_ATPase
RsgA_GTPase
AAA_29
DUF87
KAP_NTPase
MMR_HSR1
AAA_18
FtsK_SpoIIIE
AAA_22
nSTAND3
DUF4315
Sigma54_activat
MeaB
AAA_16
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDM70170
UniProt:
W6SK42
LinkDB
All DBs
Position
rep2:complement(381104..382840)
Genome browser
AA seq
578 aa
AA seq
DB search
MNRIIKYVLKHKLKLSIGTISMFIVIAADLCIPYMQKEFLDGGIIKGNHTVIIYTIAGIL
LMSLIKATFGYCKEYYYDLISSDVHEDIKNDLFNHLQKLEFKYFDGMNTGELMSRIGEDA
ENIWQTIGYGLRLFVENIIYFVFSTIILFSLNWELTLACIVVMIPIGIIEVKLEKVFGNC
YGKISDKTAEINTTAQENIAGVRLVKAFAREKYEISKLLKMNREYYDLNMEQGKAIGRFF
PPIEFLTNMSLIIMITLGGYLVMKKTITLGVLVAFSGYIWNLIWPMRMLGELTDMISRTI
ASAKKIFNIIDRLPVIKSNENCYNPEKVDGTIEFKNVCFKYDNENVLEDISIKIAKGSTV
AIMGTTGSGKSTLVNLIGRYYDVHSGEIFIDGVNIKDYDLQVLRSNMSIVPQESFLFSDT
IFNNITFSNNIATFDDVKDACTVSCCINFIENLPDGFNTEIGERGIGLSGGQKQRISIAR
ALVRKAPIMILDDATSALDMETEHTLLQNLKSNKRTCTTFLIAHRISAVKDADMILYLED
GKIKENGTHKELLDLKGAYYNVYCEQFKDFKDTEIEVV
NT seq
1737 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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ggaaagataaaagaaaatggtacacataaagaattattagatctaaaaggtgcttattat
aatgtttattgtgaacaatttaaagattttaaagatacagaaatagaggtggtataa
DBGET
integrated database retrieval system
