Columba livia (rock pigeon): 102089867
Help
Entry
102089867 CDS
T02912
Symbol
IGFN1
Name
(RefSeq) immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1 isoform X1
Organism
clv
Columba livia (rock pigeon)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
I-set
Ig_3
fn3
Ig_DSCAM-DSCAML_C
Ig_2
ig
THB
Pur_ac_phosph_N
Tissue_fac
Receptor_2B4
Ig_J_second
C2-set_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102089867
NCBI-ProteinID:
XP_021147117
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2827 aa
AA seq
DB search
MTSQQAAKNFKKSAVPGVLITQFVDDIPEGCSTPDFERKPLTLTLQEGKNAVFRGVVTGV
PTPAIKWTRIQGGMDDPAKYETFFDSVTREFVLQINNLTTKDSDLYRCFAVNEYGEASCS
AGLRIIQVGFKRKAKYVPVHAADELKKKLQDSRRMLKKRTPLPKPKPLDKEAVWQLLLHA
DRRDYEKICLKYGIVDFRGMLRKLQELRKDTETEQGELIHSIKNFEHIRVNREGNATFSL
EMDLKNSKSKVYLLKDGERLRYGTGDEYRKHCLRQIGKKYNFIVNDVQPEDAGVYQVRVE
GVPVFSTELDVESIPVRFEKPLQDVRCPEEEDAVFECILRTPCYDAVWLHRTHPLEPSER
HQISATPDGLTHKLVVKNVVPADNGMYTLDTGLCSSNAWLIVEYAKGKRRQDGGDEKEPS
EWVKETSPDKDRAKKIRRRGYDGDEDHPMDTDEEKDGWYRNGQAGSQGGSVDESHIFLGK
ERLRRVEINEKTESGQVSEADLDGDAVISDGRIFGLKGGLRSVQGKNSVPGRADVDGKDG
LPVGDDMIGVSFKRAGQVGAAPGRAGLGPHAAGQLDQEGKPGLMYGPDGLPAGDGYGAGG
RLVGEMGALYGPDGLPAGAGIGGAGVAGAGGAGSPYGKDGLPVGAGLGGAGAGGFGSPYG
RDGLPAGAGTGGPGAGRVGFPYGKDGLPAGGGAGVGGFGAAYGRDGLPAGAGIGGAGTGG
AGFPYGKDGLPAGGGAGVAGVGGFGAPYGKDGLPAGADVAGAGGVGFPYGKDGLPAGAGV
GEAGAGGFGASYGKDGLPVGAGVGGAGVAGAGGVGAPYGKDGLPAGAGVGGAGAAGAGGF
GAPYGKDGLPVRAGLGGAGVTGAGGVGSPYGKDGLPAGAGIGGAGVAGVEGLGSPYGKDG
LPAGGGIGGAGSGGLGSPYGIDGLPAGAGLGGAVAGGAGFPYGKDGLPAGAGVAGAGGFG
APYGKDGLPAGAGIGGAGVAGAGGVAYPYGKDGLPAGAGIGGAGVAGAGGVGYPYGQDGL
PAGAGIGGAGVPGIGGVGSPYGKDGLPTGAGAGLAGAAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGLGG
IAGVGGVGAPYGKDGLPAGAGLGGAGVAGAGGFGFPYGKDGLPAGAGLGGAGVAGAGGFG
FPYGKDGLPAGAGLGGAGVAGAGGFGFPYGKDGLPAGAGLGGAGVAGAGGFGFPYGKDGL
PAGAGLGGAGVAGAGGVGFPYGMDGLPAGGGIGASTGVGSPYGKDGVPAGAGVGGAGVAG
AASPYGKDGLPAGAGIAGAGVAGAGGVGAPYGKDGLPAGAGLGGVAGAGGVGAPYGKDGL
PTGAGIGGVAGEGVAGIPYGKDGLPAGVGLGGAGVAGAGGVGAPYGKDGLPAGAGVGGAG
VAGAGGLGSPYGKDGLPAGAGFAGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGLGGAGVAGAGGVG
SPYGKDGVPAGAGLGVAGAGGAVASYGKDGLPAGVGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGVGA
GLAGVPGSGGAGSLYGKDGLPSAAGIAGAGVAGAGGAGAPYGKDGLPAGAAAGGAGVAGA
GGVGSPYGIDGLPAGAGGAGAGGAGASYGKDGLPAGVGVGGAGVAVAGGVGSPYGKDGLP
AGAGAGVAAAGGVGSPYGKDGLPAGAGLGSAGVAAAGGVGSPYGKDGLPTGARAGIAGAG
GVGSPYGKDGLPAGAGLGGAGVAGAGEVGSPYGKDGLPASAGVAGAAGAGGVGSAYGRDG
VPAGAGIGGAGAGGLGSPYGRDGVPAGAGAGGPGARGFGSFYGKDGLPAGSVAGAAHIPY
GGEGVMGSYPGRDFTLSRAPGYIGGAGGDGFSSEGGGVGGSAIRSAGSAYDKDSGSGGAR
AGMAGVGRLGGGDRELHSVRGKDGAAGAAGRGGERGLDSRPGKASPGDEAGMGTARDLRG
AESKGAAHDRDSVSGQDARGEGRDSGQLGSRYDKDSAWSRSHNRSVRGRSSGGVGQGPSD
YGQVSDLYAGPPSINKKKGEPSFEMKANDLLKMPESTEKRKRYCLDDPKALRCYVNKQLL
DIRVVKGEPAELSCAVSKPDVVGTWFKDGLKLTSMEGVVFEKEGLVHKLVINKVEDIHAG
KYRFEGGDIKTEASVFVEDPPQVDKVVLKNLTSVPTVAKAGQPVKIKIPFQGRLPIRATW
LKDKMELADDARIRVDKTDTFTMLSIPSSDRKDCGDYKVRLKNDSGVVEIDLKLVVVDKP
QPPAGPIKIVESSANDITIQWNPPKDDGGKPLQRYVVERQQMGKNEWETLGETPKSCTTF
TTNKVEQDMSYYFRVRAVNAEGTSDALESGEVKAVSKATPGAPDPPEIVSASKDTITIMW
KAPRKTGSSRIVGYIVQKRKKGTVTWLPVNNTPVADKKLKMTNLKRGLQYEFRVAAVNAA
GMGDASEPSQAVFARDSTKPPGQVQDLKVSSSNGTSITLTWKRPESKDGFDVKGYEVEMR
SYNNLNWTKCNALPIEATTYTIKGLQAKETYFLRVRALNDSGAGEAAELEACVKDAPPVV
APRLLIDDTVKNLLVVKAGNTIRVTIPFEASPDPVVTWLKDGLSLSNRATINTENGTTQL
LIGAAEFPDSGTYTIELQNSLGKRETFTFQVQVTDIPQPPGPIQLYENVPNTVTVAWEPS
ASEKWERDLYYTVLKRESQKGVWRVVGDLIYNNKFTFTKLIPGREYYFRVVAKNNLGASD
PSETVQPWTIKKTKVEFQVKPQQYRGVNHKQPPRFLVPLKPHVVTTGSECRMSCAVGGCP
PPKITWYKDSRDLSNDPTYFCTNDFGVCSLVVLGVTKHDEGEYMAEATNELGRTFCKAFL
TIKGNSL
NT seq
8484 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgagccagcaggcagcaaagaacttcaagaaatctgctgtcccgggagttcttatc
acacagtttgtggacgatattccagaaggatgcagcacacccgactttgagcggaaacct
ctcactctgacactgcaggaaggtaaaaatgctgttttcagaggtgtcgtcacaggtgtc
ccaacccctgccatcaaatggacgcgtatccaaggaggaatggatgatcctgccaaatat
gaaacattctttgacagcgttacaagggaatttgttctgcagataaacaatctcaccaca
aaagacagcgatttgtatcgttgcttcgctgtgaatgaatacggggaagcttcctgctct
gctggcctcaggatcatccaagttggatttaagaggaaagcgaaatatgttcctgttcat
gctgctgatgagttaaagaagaagcttcaggactccaggaggatgctgaagaaacggacc
ccactgccaaaaccaaaacccttggacaaagaagccgtctggcaactcttgctgcatgca
gatagaagggattatgaaaagatctgcttgaaatatggaatcgttgacttccgtgggatg
ctgagaaagctgcaggagttgaggaaggacacggagactgaacaaggagagttaatacac
agcatcaaaaactttgagcacatcagagtcaacagggagggaaatgctacattcagcctg
gagatggacctgaaaaacagcaagagcaaagtttatctgctgaaggatggcgagaggctc
agatacggaacaggggatgaatacagaaagcactgcctgcggcagattggaaagaagtac
aatttcattgtcaacgatgtgcagccagaagatgcaggcgtgtatcaagtccgagtggag
ggcgtccctgtgttctcaactgaactggatgttgaatccatccctgtgcgattcgagaag
ccgctccaggacgtgcgttgtcctgaggaagaagacgccgttttcgagtgtatcctgcgc
accccctgctacgatgccgtgtggctgcacagaacccaccccctggagcccagcgagagg
caccagatctccgcaacacccgacggcctgacccacaagctggttgtcaaaaacgtggtg
cccgctgacaacgggatgtacacgctggacacggggctctgctcctcaaacgcctggctt
atcgtggagtatgccaaaggaaagaggaggcaggatggaggagacgagaaagagccatcc
gagtgggtgaaagaaacatcgccagataaagacagggctaagaaaattagacgcagagga
tatgatggtgatgaagatcatcccatggacactgatgaggaaaaagatggctggtacaga
aacggtcaagccggcagtcaaggcggttctgttgatgaaagccatatatttttgggaaaa
gagaggctacgtagagttgagataaatgaaaagacagagtctgggcaggtttctgaagca
gacctagatggagacgcagtgataagcgatggtcgtatctttgggttaaaaggaggatta
aggtctgtccaaggcaagaactctgtgccaggcagagcagatgtggatggcaaggatggt
ctcccggtgggagatgatatgattggagtgagtttcaagagagcaggacaagtaggggct
gccccgggaagggctggcctgggaccccatgccgccggtcagctggatcaagagggaaag
cctggtttgatgtacggcccagatgggcttccagctggagatggatatggcgcaggaggc
agactggtaggggaaatgggggctttgtatggtccagatggtctcccagccggggctgga
attggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagctgggtctccatacggaaaggatggg
cttccagttggtgctggtcttggtggagctggggcagggggattcgggtctccttatgga
agggatggtctcccagctggagctggcactggtggacctggtgcaggcagagttggattt
ccctatggaaaggatggtctcccagctggaggtggtgctggtgtagggggatttggagct
gcttatggaagggatggtctcccagctggagctggcattggtggagctggtacaggcgga
gctggatttccctatggaaaggacggtctcccagctggaggtggtgctggtgtagctggt
gtagggggatttggggctccttatggcaaggatggtcttccagctggggctgatgtagct
ggagcagggggagttggatttccctatggcaaggatggtctcccagctggagcaggagtt
ggcgaagctggtgcagggggatttggggcttcttatggaaaggacggactcccagtcggg
gctggtgttggtggtgctggtgtagctggtgcagggggagttggggctccctatggcaag
gatggtctcccagctggagcaggagtaggtggagctggtgcagctggtgcagggggattt
ggggctccttatggaaaagatggactcccagtcagggctggtcttggtggtgctggtgta
actggtgcaggaggagttgggtctccttatggaaaagatggtctcccagctggagcaggt
attggtggtgctggtgtagctggtgtagagggcttaggatctccatatggaaaggatggt
cttccagctggaggaggtattggtggagctggttcagggggacttggatctccgtatgga
atagatggtctcccagctggggctggtctgggtggtgctgttgcaggaggagctgggttt
ccctatgggaaggatggtcttccagctggagcaggtgttgctggtgcagggggatttggg
gctccttatggcaaggatggtctcccagctggggctggaattggtggtgctggtgtagct
ggtgcaggaggagttgcgtatccatatggcaaggatggtctcccagctggggctggaatt
ggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttgggtatccatatggccaggatggtctc
ccagctggggctggaattggtggtgctggtgtacctggtataggtggagttgggtctcca
tatggaaaggatggccttccaacaggggctggtgctggtctagctggtgcagctggtgca
gggggagttgggtctccatatggaaaggatggtctcccagctggggctggacttggtggt
atagctggtgtaggaggagttggggctccttatggcaaagatggtctcccagctggggct
ggtttaggtggtgctggtgttgctggtgcaggaggatttgggtttccatatggaaaggat
ggtctcccagctggggctggtctaggtggtgctggtgttgctggtgcaggaggatttggg
tttccatatggaaaggatggtctcccagctggggctggtctaggtggtgctggtgttgct
ggtgcaggaggatttgggtttccatatggaaaggatggtctcccagctggggctggtcta
ggtggtgctggtgttgctggtgcaggaggatttgggtttccatatggaaaggatggtctc
ccagctggggctggtctaggtggtgctggtgttgctggtgcaggaggagttgggtttcca
tatggaatggatggccttccagctggaggaggtattggagctagtacaggagttgggtca
ccctatggaaaggacggtgtcccagctggagcaggagtcggtggtgctggtgtagcggga
gcggcatctccgtatggaaaggatggtcttccagctggggctggtattgctggtgctggt
gtagctggtgcagggggagttggggctccttatggaaaggacggactcccagctggggct
ggtcttggtggtgtagctggtgcagggggagttggtgcgccttatggaaaagacggtctc
ccaactggagcgggtattggtggtgtagctggtgaaggggtggctgggattccttatgga
aaggatggtctcccagctggagttggtcttggtggtgctggtgtagctggtgcaggggga
gttggggctccatatggaaaggatggtctcccagctggggctggagttggtggtgctggt
gtcgctggtgcagggggccttgggtctccatatggaaaggatggtcttccagctggagca
ggctttgctggagctggtgtagctggtgcaggaggagttggttccccctatggcaaggat
ggtctcccagctggggctggtctaggtggtgctggtgtagctggtgcaggaggagttggg
tctccatacggcaaggatggtgtcccagctggggctggacttggtgtagctggtgcaggg
ggagctgtggcttcttacggcaaggatggtctcccagctggagtaggtgctggtgtagct
ggtgcaggaggagtcgggtctccgtatggaaaggatggtcttccagctggggttggtgct
ggtctagctggtgtacctggttcagggggagctgggtctctatatggaaaggatggtctt
ccatctgcagctggtattgctggtgctggtgtagctggtgcagggggagctggggctcct
tatggcaaggatggtctcccagctggggctgctgctggtggtgctggtgtagctggtgca
gggggagttgggtctccctatggaatagatggtctcccagctggggctggtggtgctggt
gcagggggagctggggcttcttatggaaaagatggtctcccagctggagtaggtgttggt
ggtgctggtgtagctgttgctggaggagttgggtctccctatggaaaggatggtctccca
gctggggctggggctggtgtagctgctgcagggggagttggttccccctacggaaaggat
ggtctcccagccggtgctggtctaggtagtgctggtgtagctgctgcagggggagttggg
tctccttatggaaaggatggtctcccaactggggctagagctggtatagctggtgcaggg
ggagttgggtctccctatggcaaggatggtctcccagctggggctggtcttggtggtgct
ggtgtagctggtgcaggagaagttgggtcaccatatggaaaggatggtctcccagccagt
gctggtgtagctggtgcagctggtgcaggaggagttgggtctgcctatggaagggatggt
gtcccagctggggctggaattggtggagctggtgcagggggactcgggtctccctatgga
agggatggtgtcccagctggagccggtgctggtggacctggtgcaaggggctttggttct
ttctatggaaaggacggtctcccagctgggtctgtggcgggagctgctcatattccttat
ggaggtgaaggagtgatgggatcttaccctggcagggattttacgctgagcagagctcca
ggatacataggtggagcaggaggagatggcttttcctcagaaggtggtggcgttggtggc
tctgccatacggagtgccgggtctgcctatgacaaggacagcgggtccggtggagccagg
gctggtatggctggtgtgggcaggttgggaggtggtgacagggagttgcattcagtccgt
ggtaaagacggtgcggcaggtgctgctggacgaggtggtgaacgtgggctggactcgcgt
cctggcaaagcttctccgggagatgaagctgggatgggcactgccagggatctcagagga
gcagagagcaaaggtgcagctcatgacagagattcagtttcaggtcaagatgccaggggc
gagggcagagattcaggacagttaggctcccgttatgacaaagattctgcgtggagtaga
tcgcataacagatctgttcgggggaggagttcaggtggtgttggtcaaggcccatcggat
tatggtcaggtgtcagacctttacgctggacctccttcaataaacaagaaaaaaggggag
cccagctttgaaatgaaagcaaatgatttattgaagatgccggaaagtacagaaaaaaga
aaacgttattgcctggatgatccgaaagctctgcgctgttatgtcaacaagcagctgctg
gatatcagagttgtgaaaggggaaccggctgagctgtcttgtgctgtcagtaaacccgac
gtggtaggaacctggtttaaagatggattaaagttgacaagcatggaaggagttgtcttt
gaaaaggaaggtctggtccacaaactagttattaacaaagtggaagatattcatgctggg
aaatacaggtttgaaggtggtgatataaaaactgaagcttcagtctttgtggaagatcct
ccacaggttgacaaagtggtcctcaaaaacttaacgagtgttcctactgtggccaaggca
ggacagccggtcaagatcaagatccctttccagggccggttgcccatcagagccacgtgg
ctcaaggacaagatggagctggcggatgacgcccggattcgtgtcgataaaaccgacacc
tttaccatgctgtccatccccagcagtgacaggaaggactgtggggattacaaagtcagg
ctgaagaatgacagcggggtcgtggagatcgacttaaagcttgtggtagtagacaagccc
caaccacctgccggacccatcaaaatcgtagaaagctctgcaaacgacatcaccattcag
tggaatcccccaaaggatgacgggggcaaaccgctacaaaggtatgtcgtggagagacag
cagatggggaagaacgagtgggagactttgggagagacccccaagagctgcaccaccttc
acaactaacaaagtggagcaagacatgagctactacttcagggtgagagctgtgaacgcc
gagggaacgagcgatgcgctggaatcgggtgaagtgaaggccgtcagcaaagctacacct
ggtgccccggatccccctgagattgtcagtgccagcaaagacaccatcacaataatgtgg
aaagcacctcgtaagactggcagttcccgaattgtgggatacattgtgcaaaaacgcaag
aagggcaccgtgacctggctgccggtcaacaacacgcctgtagcagacaagaagctgaaa
atgaccaatctcaagcgagggctacagtacgaattccgtgtggcagctgtcaatgccgct
ggcatgggagatgccagtgaaccatcacaggctgtgtttgcaagggattccaccaaacct
ccaggtcaagtgcaggaccttaaagtgagcagcagtaatggcactagtatcaccctgaca
tggaagagacctgaatcaaaagatgggtttgatgtgaaaggctatgaggtagagatgcgg
tcgtacaacaacctcaactggaccaaatgcaatgctcttcccatagaggcaaccacttac
acgattaaaggcctccaagccaaggagacgtacttcctacgggtgagagccctcaatgac
agtggcgcaggagaagccgcagagctggaagcttgtgttaaagatgctcccccagtagtt
gctcccaggttactgatagacgacacagtgaaaaacctcctggttgtaaaagcagggaat
accatccgagttaccattccctttgaagcgtctccagatccagtggtgacctggttaaag
gatgggctttctctctcaaaccgggctacgatcaatactgaaaatggtaccacccagctg
ctcattggagcagctgagttccccgacagcggcacctacaccatcgagctccagaacagc
ttggggaaaagagaaacgttcaccttccaagttcaagttacagatatcccacaaccgcct
ggacctattcagctgtacgagaacgtgcccaatacagtgacagtcgcctgggagccgtcg
gcttccgaaaaatgggaacgagatctttactacacggtcctgaaacgcgagtcacagaag
ggtgtgtggcgcgtggtgggcgacctgatctacaacaacaagttcacgttcaccaaactg
atcccaggccgggagtactacttcagagtcgtggcgaaaaataacttgggagccagcgat
ccgtctgaaactgtgcagccttggacgattaagaaaacaaaggttgaattccaagtcaaa
ccgcagcagtacaggggtgttaatcacaagcagccccccagattcctcgtcccgttgaag
cctcacgtggtgacaaccgggagcgagtgccggatgagctgtgcggttgggggctgtccc
cccccaaagatcacctggtacaaggacagcagagacctctccaacgaccccacctatttc
tgcacaaacgactttggcgtctgctccctggttgtcctgggtgtcacgaaacacgacgaa
ggggaatatatggcagaagccaccaatgaattgggccgtacattctgcaaagccttcctc
actattaaaggtaacagtctttaa
DBGET
integrated database retrieval system
