Campylobacter lanienae: CLAN_0568
Help
Entry
CLAN_0568 CDS
T05075
Symbol
mfd
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
KO
K03723
transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
clx
Campylobacter lanienae
Pathway
clx03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clx00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
CLAN_0568 (mfd)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
clx03400
]
CLAN_0568 (mfd)
Enzymes [BR:
clx01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
CLAN_0568 (mfd)
DNA repair and recombination proteins [BR:
clx03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
TRCF (transcription-repair coupling factor)
CLAN_0568 (mfd)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
TRCF
CarD_TRCF_RID
UvrB_inter
ResIII
SNF2-rel_dom
SLFN-g3_helicase
AAA_16
TsaE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARQ97317
UniProt:
A0A1X9SM46
LinkDB
All DBs
Position
559132..562074
Genome browser
AA seq
980 aa
AA seq
DB search
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NT seq
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NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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tga
DBGET
integrated database retrieval system
