Cellulophaga lytica DSM 7489: Celly_1196
Help
Entry
Celly_1196 CDS
T01434
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor plug
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
cly
Cellulophaga lytica DSM 7489
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cly00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cly02000
]
Celly_1196
Transporters [BR:
cly02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Celly_1196
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADY29024
UniProt:
F0RG58
LinkDB
All DBs
Position
complement(1333307..1335439)
Genome browser
AA seq
710 aa
AA seq
DB search
MILNSKYLSIYFMLFFSVFVFSQELKKDSINLNKLEEVVVTGQYNPQSIKKSVHNVIVIN
REQIENQAANNLADILNFNLNLTIVPNGQTGKSTISFFGLDAQYFNILVDNIPLVSDSGL
GNNIDLTQINLDDVERIEIVEGAMGVEYGANAVSGVINIITKKSSDSDWKVQAILQEETI
SDEYAWFNKGKHIQGLNIGHNINNNWYTRLGVNRNQFAGFYNGRQGKNYYKNDGLRGYDW
LPKTQINTNALLNYTKNNFKLFYKFEYLNEVVNYYDAAVRANIDTQSQTSNPSATDRIFT
TNRFVNNLSVNGRLNSGANYKASASYQKQKRNLNEFNNYIITNQRSNETDEVYQSSSVFF
SKGSINNLIKSDSYNFQLGYESRFIKGFDTQASGEVTEQDKEQSQSNYAVFGSSEINALD
KILLRPGLRYEYNSIFKSKLLGSLSARYLIKNGFELRANLGNSYRTPNFEELYYYFVDSN
HDVRGNENLKPENGFTSFLNLKKRSWIKNTSLLNTLKFTYIDVKDKIDLAIVNQTPLQYQ
YININEYKLWGVTLDNSLKTDNWTLNLGATIQGISQVANDEANSGDKFLYSFQLNTSSTY
QIEKWNTAVTVLLKHTGEQQNYSATGTDANGNPTFSKTTTNAYNWVDASFKKSFLENTFQ
VTLGARNLLDVTTVDVNGPVGEGTHSSASNGILLGYGRSYYLKLLYNLKF
NT seq
2133 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattctaaatagtaaatatttatctatttattttatgctttttttctctgtttttgtg
ttctcacaagagttaaaaaaagactcaataaacttaaataagttagaagaggtagttgtt
acgggacagtataatccgcaatcaataaaaaaatcggtacataatgttattgtaataaac
agagagcaaatagaaaaccaggcagccaataatttggcagatatattaaactttaattta
aacctaacaatagttcctaatgggcaaacaggaaaatctacaatttctttttttggttta
gatgcacaatacttcaatattttggttgacaatattcctcttgttagcgacagcggacta
ggtaataatatagatttaacacaaataaatcttgatgacgttgagcgtattgaaattgta
gaaggagcaatgggagttgagtatggagctaatgctgtttctggagttattaatattatc
accaaaaaatctagtgatagtgattggaaagtacaagcaattttacaagaagaaacaatt
agtgatgagtatgcttggtttaataaaggtaagcacatacaaggactaaatattggtcat
aatataaacaacaactggtatactagattaggagtaaatagaaatcaatttgcaggtttt
tataatggcaggcaaggtaaaaactattataaaaatgatggtttaagagggtatgattgg
ttgcctaaaacacaaataaacactaacgcattattaaattatactaaaaataactttaag
cttttttataagtttgaatacctaaatgaagttgttaattactatgatgcagctgttaga
gctaatatagatacacaatcgcaaactagtaacccgtctgcaacagatagaatttttaca
accaatagatttgttaataatttaagtgtaaacggaagattaaattctggcgctaattac
aaggcttctgcatcttatcaaaaacaaaagcgcaacctaaatgagtttaataattatata
attacaaaccagagaagtaatgaaactgatgaggtttaccaatctagtagtgtgtttttc
tctaaaggaagtattaacaacctaattaaaagtgattcttataattttcaattgggttat
gaatctcgttttattaaaggttttgatacccaggcttctggagaggtaacagagcaagac
aaagaacagtctcaaagtaattatgcagtatttggatcttcagaaataaatgctttagat
aaaattcttttacgccctggtttacgctatgaatacaattcaatttttaaatcaaaactt
ttaggttctttaagcgcacgctaccttataaaaaatgggtttgagttaagagcaaaccta
gggaactcctaccgtacaccaaattttgaagaattgtactattattttgtagatagcaat
catgatgttagaggtaatgaaaatttgaagccagaaaacggttttacgtcttttttaaat
ttaaaaaaacgtagctggattaaaaatacgtcgcttttaaacacattaaaatttacctat
atagacgtaaaagataaaattgatttagccattgtaaaccaaacgccattacagtatcaa
tacataaatattaatgagtataagttgtggggtgtaacattagataatagcttaaaaaca
gataattggacgcttaatttaggtgctacaatacaaggtatttctcaggttgctaatgat
gaggcaaactcaggagataaatttctttattcttttcaattaaatacaagtagtacatac
cagatagaaaaatggaatacagcagtaactgtacttttaaaacacacgggagaacaacaa
aactatagcgctacaggaactgatgctaacggaaacccaacgttttccaaaacaactacc
aatgcttacaattgggtagatgcctcatttaaaaaatcttttttagagaatacctttcag
gttactctaggagccagaaacttattagatgttactactgtagatgttaatggccctgta
ggagagggaactcattcttctgctagcaatggtattttacttggttacggacgatcttat
tacttaaaactattatataaccttaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system