Cellulophaga lytica DSM 7489: Celly_2436
Help
Entry
Celly_2436 CDS
T01434
Name
(GenBank) cadherin
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
cly
Cellulophaga lytica DSM 7489
Pathway
cly02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cly00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
Celly_2436
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Big_13
TSP3_bac
BslA
Big_3_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADY30253
UniProt:
F0RHI7
LinkDB
All DBs
Position
complement(2758414..2766768)
Genome browser
AA seq
2784 aa
AA seq
DB search
MIKLNTKFFHINRVKLITLIAFIFFTQLFFAQTSGVWSDAGGGKWTSVSSDGLVRIEVTV
TGYVDILGGDTMLCSPDAFSDPTITGTPSLALEVNGSNGTISFEFYDTRTNALADIQNPI
LHVDKVGATGVLGSNTTGTFYLQDGYTWDELSATDRLDSDSVFFKGENLFEILGGTGECA
NTAGGSLQITNLINTINLNTLLERNSTPLTNNAPNRDEVEFAFSNLVINPCTSGAIVGTP
TENDTDGDGVNNSCDLDDDNDGILDTDEGSCTPVQSGAWTIAGKTASFDYGNGVIANVTT
TNSTNFVSGNFTNPGVDFWTEDLQGDISLAATYDSGVTVTVEFVDATNNPVFVDKPRLHL
DRIGGNDTSNNQTSAEISLLNGLTWSELAGTFDFVSTVTTVKDGGTGLPSDGYDPESSLK
DSDGSAAGTLQINQRVSTFTLQLVQTSSTGVEDEIELILFACKDRDSDIDGVPDLLDLDS
DNDGIFDVIEAGHNQPHTNGILGTAVSEDGIFDALQTSSGVNNGTVDYTLADSEATPNGT
PDYLELDADGDGCNDVLEAGFTDQNNDGILGGLPTTVNATNGTVTASMVIDGYTTPKNAD
SGSGNTDFDFQQIGQAPAITNTANQPQDILTNGTNPETFVVTATGEALTYQWQVNRLDGN
GFVDINDANTVDIYTGSTTNTLTLTGITASYDGFLYQVIINDETFSCATLTSSSATIIFD
DTPPDAPIVVITEDINNDGFLNTSELVGDVNVTITLPANAAENDILTVNGTNQTLTATDI
ANGEVLLTFTPPAEDGSLTVTATITDPVGNTSNPSSDSVLVNTAATSAPVVVITEDINND
AIINSTELVGDINVTITLPAEAVENDILTVNGTNQTLTATDITAGTVTASFASPGEGNTI
TVTASITDTAGNTSTNGSDSATIETVATSAPTVVITEDINNDAIINSTELVGDIDVTITL
PAEAVENDILTINGTNQTLTATDISNGTVTTSFVSPGEDNTITVTASITDASGNTSPEAS
DSATVNTTSTSAPVVVITEDTNNDAIINSTELVGDIDVAITLPAEAVENDILTVNGTNQT
LTAADITAGTVTTSFASPGEGNTITVTASITDTAGNTSTNGSDSATIETIATSAPTVVIT
EDINNDGIISNSELSSNIDVTITLPAEAVENDILTINGTNQTLTATDISTGTVTTSFVSP
GEGNTITVTASITDASGNTSTNGSDSAVIDTAATSAPAVVISEDINNDAIINSTELVGDI
DVIITLPTEAVENDILTINGTNQTLTAGDITAGTVTTSFASPGEGNTITVTASITDAAGN
TSTNGSDSATIETIATSAPTVVITEDINNDGIISNSELSSNIDVTITLPAEAVENDILTI
NGTNQTLTATDISTGTVTTSFVSPGEGNTITVTASITDASGNTSTNGSDSAVIDTAATSA
PVVVISEDINNDAIINSTELVGDIDVTITLPAEAVENYILTINGTNQTLTATDIGNGTVT
TSFVSPGEGNTITVTASITDAAGNTSTNGSDSATIDTTLPIPTLAINDVTADNVVNTTEA
ASTVTITGSVGGDFNTGDTVTLVINGVTSTGTTNATGNFSISVNGSDLATDTDTTINGSV
STTDTAGNIGTATAIKTYNVDVTAPTPTLTINDVTADNTVNSAEAAGSITITGTVTGEFN
TGDSVTLLINGISSTGNVDASGNFSIPVSGSNLADDADTTIDASITTTDNSGNTNTVNTT
KTYSVDVTAPTPTLTINDVTADNIINTTESTSTITLTGTVTGEFNTGDNVTLVINGVSST
GSVDASGNYSIPVNGSDLAVDSDTTINASIITTDNSGNTNTINATKTYNVDVTAPTPTLT
INDVTADNTINATEAASNITITGTVSGEFNTGDTVTLVSNGVSSTGTVDASGNFSISVNG
SNLAADTDTTIDASITTTDSSGNGNTVNATKTYNVDVTAPTPTLTINDVTADNVVNANEA
ASTITITGTVGGDFNIGDLVTITINGNSYFNGVDASGNFSIPVSGSDLAADADFTINGVV
NTLDMAGNVGTATNSKIYNVDTTLPMPVITINNITADNTINTTEATTTITVIGNISGDFL
TGDVVTLVVNGISYTNAIDALGNFSMPIPGTELTADADLTVNGSVSTTNTAGNTGTGTTN
KTYNVDVTAPTPTLTINDVTADNIINTAESTSNITITGTATGEFNNGDTVTLLINGVSTT
GTVNASGIFSITVSGGDLLADADVTINASLVTTDSVGNSNTINATKIYALDITAPTPTII
IDDVTTDNTINAIEASQNITITGSATGEFNTGDTVTLLINGVSTTGTVSNTGTFSIIVSG
NNLALDADTTIDANLTTTDSAGNNNTVAATKLYNVETATIATPVISSSSIDTNIPDDAIT
SDNTLSIFGTSEPNRIIDIYIDGVIIGTTTANATGNWTLDHSATILPDGNYDITAVASDA
FGNISFSSAAYPIVIDTVAPIVNDEITDNLTPVITGTGSANETLTIAIDVDADGTPEVTY
TVTTDAAGNFSLDTNTATPISGTLPSLGFPSTLDITVSDAAGNTNTAVIFITDDFDNDGL
TNEDEAALGTDPNDADTDDDGVTDGQEVADNTNPLDDCDSLNGTPLGTSDCDADGLTNAE
ENAIGTDPEDPDTDKDGILDGQEVTDNTDPLDACDSVGGTPPLGVACDIEIQNENITPGT
TDGTFVIVNIEAFPDNTVEIFNRWGVKVYSTKSYDNASRAFTGISNGRAVVKSSSTLPAG
VYYYIINYVKKGDPKTKNGYLYLN
NT seq
8355 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaattgaatacaaaattctttcatataaacagagtaaaattaattactcttata
gcttttatattttttactcaactattttttgctcaaacctctggcgtatggtcagatgct
ggtgggggaaaatggacatctgtaagttctgacggtttagtacgaattgaagttaccgtt
actggttatgtagatattttaggcggagatacaatgttgtgctctcctgatgcttttagt
gacccaactattacagggacaccatctctagctttagaagttaatggtagtaatgggaca
atttcttttgagttctatgacaccagaacaaatgcattagcagacatacaaaaccctatc
ttacacgttgataaagttggagcaacaggggtattaggatctaatactactggtacattt
tatttacaggacggatacacttgggatgaactaagcgctactgatagattagatagtgat
tctgttttttttaagggagaaaatttatttgaaatattaggaggcactggtgaatgtgct
aataccgcaggaggtagtctacaaataacaaacttaataaacactataaatttaaataca
cttctagaaaggaactcaacaccattaaccaataatgctccaaacagagacgaagtagaa
tttgccttttctaacttagtgataaatccttgtacttctggagctatagttggcacacct
acagagaacgacacagatggtgacggtgtaaataatagttgcgatttagatgatgataat
gatggtattttagatactgatgaaggtagttgtactcctgtacaatctggtgcttggact
attgctggcaaaactgcttcttttgattatggcaacggagttattgctaatgtcacaact
acaaactctaccaactttgtaagcggtaattttacaaatcctggtgtagatttttggact
gaagatttacaaggagatatttctcttgctgctacttatgatagcggagtaacagttact
gttgagtttgtagatgccactaacaaccccgtttttgtagataaacctaggcttcatctg
gatagaattggtggcaatgatactagtaataatcagacctctgcagaaataagcctttta
aacggtttaacgtggtcagaacttgccggtacattcgactttgtttctactgtaactaca
gtaaaagatggaggtacgggtttaccatcagatggttatgaccctgaaagctcattaaaa
gatagcgatggttctgccgcaggaacattacaaattaaccaaagagtatctacttttaca
ttgcaattggtacaaacttcttccacaggtgtagaagatgagatagaacttatattattt
gcttgtaaagacagagattctgatattgatggtgtgccagatttattggatttagattct
gataacgatggtatttttgatgttattgaagccggacataaccaacctcataccaatggt
attttaggtactgctgttagtgaagatggtatttttgatgccttacaaactagtagcggt
gttaataatggcactgtagattatactttagcagattctgaggcaacaccaaacggaaca
ccagattatttagagctagatgcagatggcgatggttgtaatgatgttttagaagctggg
tttacagaccaaaacaatgacggtattttaggaggcttacccacaactgtaaatgctaca
aacggtactgtaactgctagtatggttatagatggttatactactcctaagaatgcagat
agtggttctggaaatactgactttgactttcaacagataggacaagcaccagcaataact
aatactgcaaaccaacctcaagatattttaaccaatggcacaaacccagaaacttttgta
gttacagcaactggcgaagctttaacttatcaatggcaagtaaaccgtttagatggtaat
ggttttgtagatataaatgatgccaacactgtagatatttatacaggcagcacaactaac
acacttacactaactggaattacagctagttatgatggctttttatatcaggttattatt
aatgatgaaaccttttcttgtgccactcttacttctagtagcgctacaattatttttgat
gatacaccaccagatgctccaattgttgttattactgaagatattaataatgatggtttt
ttaaatacaagcgagttagttggagatgttaatgtaaccattacattaccagcaaatgct
gcagagaatgatattttaactgtaaacggtacaaaccaaacattaaccgctacagatatt
gcaaacggagaagttcttctaacatttactcctccagcagaagatggttctttaactgta
acagctactattacagatcccgtaggtaatacaagtaatcctagttcagattcggttttg
gttaacactgctgctacttctgctcctgtagttgtaattactgaagatattaataacgac
gctattataaacagtacagaattggtgggtgatattaatgttaccattactttacctgct
gaagctgtagagaacgatattttaaccgtaaatgggactaatcagactttaactgctaca
gatattactgctggtactgtaactgctagttttgctagtccgggtgaaggtaataccatt
actgttactgcatcaataactgatacagcaggaaatacaagtacaaacggaagcgattct
gctaccatagaaactgttgctacttctgctcctacggttgtaattactgaggatattaac
aacgacgctattataaacagtacagaattggtgggtgatattgatgttaccattacttta
cctgctgaagctgtagagaacgatattttaaccataaacggaactaatcagactttaact
gctacagatattagtaatggtactgtaactactagttttgttagtccgggtgaagataac
accattactgttacagcatcaattactgatgcctcaggaaacacgagtccagaagctagt
gattctgctacagtaaatactacctcaacttctgctcctgtagttgtaattactgaagac
accaataacgacgctattataaacagtacagaattggtaggtgatattgatgttgccatt
actttacctgctgaagctgtagaaaacgatattttaaccgtaaatgggactaatcagact
ttaactgcagccgacattactgctggtacagttacaactagttttgctagtccgggtgaa
ggtaataccattactgttactgcatcaataactgatacagcaggaaatacaagtacaaac
ggaagcgattctgcaaccatagaaactattgctacttctgctcctacggttgtaattact
gaagatattaataatgatggaatcataagtaattctgagctttctagtaatattgatgtt
accattactttacctgctgaagctgtagaaaacgatattttaaccataaacggaactaat
cagactttaactgctacagatattagtactggtactgtaactactagttttgttagtccg
ggtgaaggtaataccattactgttacagcatcaattactgatgcctcaggaaacacaagc
acaaacggaagcgattctgctgtaattgacactgctgctacttctgctcctgcagttgta
attagtgaagatattaataacgacgctattataaacagcacagaattggtgggtgatatt
gatgttatcattactttacctactgaagctgtagaaaatgatattttaactataaacggt
accaatcaaactttaactgcgggcgacattactgctggtactgtaactacaagttttgct
agtccgggagaaggtaataccattactgttactgcatcaatcactgatgctgcaggaaac
acaagcacaaacggaagcgattctgctacaattgaaactattgctacttctgctcctacg
gttgtaattactgaagatattaataatgatggaatcataagtaattctgagctttctagt
aatattgatgttaccattactttacctgctgaagctgtagaaaacgatattttaaccata
aacggaactaatcagactttaactgctacagatattagtactggtactgtaactactagt
tttgttagtccgggtgaaggtaataccattactgttacagcatcaattactgatgcctca
ggaaacacaagcacaaacggaagcgattctgctgtaattgacactgctgctacttctgct
cctgttgttgtaattagtgaagatattaataacgacgctattataaacagtacagaattg
gtgggtgatattgatgttaccattactttacctgctgaagctgtagagaactatatttta
actataaacggtaccaatcaaactttaactgctacagatattggtaatggtactgtaact
actagttttgttagtccgggtgaaggtaataccattactgttacagcatcaatcactgat
gctgcaggaaatacaagtacaaacggaagcgattctgcaacgatagatactacactacca
atacctacactagcaataaatgacgttactgcagataatgtagttaataccactgaggca
gcatcaaccgtaactattacaggttctgttggtggtgattttaatacaggtgatacggtt
actctggtaattaatggtgttacaagcactggaactacaaatgctactggtaactttagt
atttctgttaacggtagtgatcttgctactgatacagatacaaccataaatggtagtgtt
agtacaacagatactgcaggtaatataggaacagctacagcaattaaaacttataatgta
gatgttactgcgcctacgcctacgctaacaattaatgatgttactgcagataataccgta
aactcagcagaggctgcgggtagcataactattacaggtactgttacaggagaatttaat
actggagacagtgtaactcttcttatcaatggtatttctagtacaggaaatgtagatgcc
tctggtaactttagtatacctgttagtggtagcaacttagcagatgatgcagatacaaca
atagatgcatcaattacaactacagacaattctggaaacacaaacacagtaaatacaact
aaaacttatagtgtagatgttactgctcctacacctacactaacaataaatgatgttact
gcagataatattataaacacaacagaatcaacatcaaccataactcttacgggtactgtt
acaggagaatttaatactggagacaatgtaacccttgttattaatggtgtttcaagcact
ggaagtgtagatgcttctggcaactatagtattcctgttaatggtagtgatcttgctgta
gattcagatacaactataaatgcttcaattataactacagataattctggtaatacaaat
accataaatgcaactaaaacatataatgtagatgttactgctcctacacctacactaaca
ataaatgatgttactgcagataatactataaatgccacagaagcagcatcaaacataacc
attacaggtactgttagtggcgaatttaacactggtgataccgttactcttgttagtaat
ggtgtttcaagtactggaactgtagatgcctctggtaattttagtatttctgttaacggt
agtaatcttgctgcagatacagacacaacaatagatgcatcaattacaactacagatagc
tctggaaatggtaataccgtaaatgcaactaaaacatataatgtagatgttacagctcct
acacctacactaacaataaatgatgttactgcagacaatgtagtaaatgccaatgaggca
gcatcaactataactattacaggtactgttggtggcgattttaatattggagatcttgtg
actattactataaatggaaattcatattttaatggtgtagatgcttctggtaattttagc
attcctgttagtggtagtgatcttgctgcagatgcagatttcactataaatggcgtggta
aataccttagacatggctggtaatgttggtactgctacaaacagtaaaatttataatgta
gatactactttgcctatgcctgttattacaattaacaatattacggcagacaatactatt
aatactactgaagctacaaccacaataacagtaattggtaatattagtggcgacttttta
actggtgatgtggttactttagtagtaaacggcatatcatacaccaatgcaatagatgct
ttaggcaactttagtatgcctattccggggacagagcttactgcagatgcagacctaact
gtaaatggtagtgttagtacaacaaacacagcaggaaacacaggtactggaacaacaaac
aaaacatataatgtagatgttactgctcctacacctacgctaacaattaatgatgttact
gcagataatattataaataccgcagaatcaacatcaaacataactattacaggtactgct
acaggagaatttaataacggagatacagttacactattaataaacggtgtctctacaaca
ggtactgttaatgcttctggtatttttagcattaccgttagtggtggagatcttcttgca
gatgcagatgtaacaataaacgctagcttggttaccacagatagtgttggtaatagtaat
acaattaatgcaacaaaaatatatgctttagatattacagctcctacaccaacaattatt
attgatgatgtaactactgataataccattaatgctattgaagcttctcaaaatataaca
attacaggttctgctacaggagaatttaataccggagatacggttacattattaataaac
ggtgtttctacaacaggtactgttagtaataccggaacgtttagtataatagtgtctgga
aataatttagctttagatgcagatactactatagatgctaatttaactactacagactct
gcaggcaataacaatacagttgctgctactaaactatacaatgtagaaactgcaactatt
gctacacctgttattagtagcagtagtattgatacaaatattcctgatgatgcaattaca
tctgacaatacactatccatttttggaacatctgaaccaaatagaattatagatatttat
attgatggtgtaataataggtactacaactgctaatgctacaggtaattggactttagac
cacagtgcaactattttaccagatggaaactatgatattactgcagtagcaagtgatgct
tttggcaacattagtttttcttctgcagcataccctattgttatagataccgtagctcct
attgtaaacgatgaaataacagataaccttactcctgttattactggtactggtagtgca
aatgaaactttaactattgctattgatgttgatgctgacggtacaccagaagttacttat
acagttacaacagatgctgcaggtaactttagtttagatacaaacacggctactccaatt
agtggtactttacctagtttaggttttcctagtacattagatattactgtttctgatgca
gcaggtaatacaaatacagctgttatttttattacagatgattttgataatgatgggtta
actaatgaagatgaagctgcacttggcacagaccctaatgacgcagatacagatgatgat
ggtgttacagacggacaagaggttgcagataacaccaatcctttggatgactgtgattct
cttaacggaacacctttaggtacgtctgactgtgatgctgacggcttaactaatgcagaa
gaaaatgcaattggcacagatcctgaagatcctgatacagataaagacggaattttagat
ggacaagaagttacagataacacagacccattagatgcttgtgactcggttggtggtaca
cctcctttaggtgttgcttgtgatatagaaatacaaaatgaaaatattacacctggtact
acagacggcacgtttgttatagtaaacatagaagcttttcctgataatactgtagaaata
tttaacagatggggtgtaaaagtatatagcacaaaatcttatgacaatgcctcaagagca
tttacgggtatttctaatggtagagccgtagttaaatctagtagtacattacctgctggt
gtgtattattacatcattaactatgtgaaaaaaggagaccctaaaactaaaaatggctac
ttataccttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
