Caldivirga maquilingensis: Cmaq_0645
Help
Entry
Cmaq_0645 CDS
T00611
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cma
Caldivirga maquilingensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF87
AAA_10
FtsK_SpoIIIE
AAA_22
DUF815
TrwB_AAD_bind
P-loop_TraG
AAA_5
nSTAND3
AAA_16
IstB_IS21
DUF2710
INTS15
T4SS-DNA_transf
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABW01485
UniProt:
A8MCH9
LinkDB
All DBs
Position
complement(681444..683504)
Genome browser
AA seq
686 aa
AA seq
DB search
MIFTTRIRMMIAALILVMLSSLITKYALIALVPLIIIFRNDAALLALSIRHSVAPQLVVR
DNYIYDPINRLVHSFLLAEPIHDLLRLSEGKFINLVNEMLLRLNLCDKCYITFIVIGDRK
VIRVSMVDEPPFNNFKSFQSNAVNVLEDYFMVKPIKGEELRNLVNQSPYPVSSLIMVLTI
PLIILLLFGVLGIAPWLIFAIIVIKQYLSGRFTVNNGLLFSRISTRNELMMSKLTQADVY
SLAKAFHNTINEYALVISGNSELSMLATREYHKASESLVVKERGKSYPGLLYWRNVIDRL
SSGELPLRLMLLCNGGFEYVNATKSKVASYALWVPDGFLLNGLSHDAAVFIPFTGGRLRV
SEDSRVIRIGVDSLGKPVEVDLDSLPAGHMLLLGPTGMGKSWAARTILARLIKMGLRIIV
IDPHGEYSNLGLPIIDVSERFVDFLNPVGKIEGKETILRVAQSISEAFNISDLDLILSDL
GGLSNHGDFKEVFSKAAETTYNIELSYVYSIIASSLGKRGLITPEELRQGVVLSFKSILP
NPELTAFAMNQVTAYLYSMFAGKVSKLSNILAVDEAYYVMDSRLMELYVRGLRKSGLGVM
LITQTLTNVSSSLIQNIPLIIMMGGPDSYIIESMNYLKLDQNEFEWLRLGLAPHMMGNRS
RALLIEGPVRRQVLVDLDPRLKPMNN
NT seq
2061 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatattcaccacaagaattagaatgatgattgcagcattaatactagtgatgctttcc
tcactaataaccaagtacgctctaatagccttagtgcccttaataataatcttcaggaat
gacgcggctttactagccttatcaattaggcacagtgtggcgccgcagttagtggtaagg
gataattacatttatgatccgattaatagacttgttcactcattcctactggctgaacct
attcatgacctacttaggttaagtgagggtaagttcattaatctagttaatgaaatgctg
cttaggttaaacctatgcgataaatgctacataacattcatagtaattggtgataggaaa
gtaataagggtgtccatggttgatgaacccccgtttaataattttaagtcgtttcaatcc
aatgcggttaatgttctggaggattacttcatggttaaaccaataaagggtgaggaactt
aggaacttggtgaatcaatcaccataccctgtatcaagcctaataatggtgctaactata
ccattaattattctcctactattcggagtattaggtattgcaccttggttgatattcgca
ataatagtgattaagcagtacttgagtgggaggttcacggttaataatgggcttctcttc
agtaggattagtactaggaatgaacttatgatgagtaagttaacgcaagctgacgtttac
tccttggcgaaggccttccataacactattaatgagtacgcactcgtaatatcagggaac
agtgaattatcaatgctagccaccagggagtatcataaggcctcggagtcccttgtggtt
aaggagaggggtaagagttacccaggtttactatattggagaaacgtaatagataggtta
tcgtcgggtgaattaccattaaggttaatgctactatgcaatgggggatttgaatacgtt
aatgccactaagagcaaggttgcatcatacgcattatgggttcctgacggcttcctactg
aatggtttatcacatgatgctgcagtattcataccattcactggtggtagattaagggta
agcgaggatagtagggttattaggattggggttgatagtcttggcaaacctgtggaggtt
gacttggactccttaccagcaggccacatgttattactgggtcccactggtatgggtaaa
tcatgggctgcacgaaccatattagctaggttaattaaaatgggtttaaggatcattgta
attgatccgcatggtgaatacagtaacttaggcctacctattattgatgtttcagaacgt
ttcgtggatttccttaaccctgtgggtaagattgagggtaaggagactatactaagggtt
gcccaatcaatatccgaggcattcaatataagtgacctagacctaatactaagtgattta
gggggcctcagtaaccatggtgacttcaaggaagtgttcagtaaggctgcggaaaccacg
tataatattgaactctcatacgtttacagcattatagctagtagcttaggtaaaagaggc
ctaataacccctgaggagctgagacagggggtggttttatcctttaagtcaatactacct
aaccctgagttaacagccttcgccatgaaccaagtcacagcatacctatactcaatgttc
gccggtaaggtgagtaagctgagtaatatcttagctgttgatgaagcttactacgtcatg
gacagtaggttaatggagctctacgtaaggggccttaggaaatcgggcctaggcgtaatg
ctaataacccaaacgttaactaatgtgtcaagtagcctaattcagaacatacccttaata
ataatgatgggtgggcctgattcctatataattgaatccatgaattaccttaaacttgac
cagaatgaattcgaatggcttaggttaggtttagcgcctcacatgatggggaatagaagt
agagcattacttatagagggacctgtaaggaggcaagtacttgtggatcttgatccaaga
ctaaaacctatgaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
