Caldivirga maquilingensis: Cmaq_1347
Help
Entry
Cmaq_1347 CDS
T00611
Name
(GenBank) Radical SAM domain protein
KO
K22226
Fe-coproporphyrin III synthase
Organism
cma
Caldivirga maquilingensis
Pathway
cma00860
Porphyrin metabolism
cma01100
Metabolic pathways
cma01110
Biosynthesis of secondary metabolites
cma01240
Biosynthesis of cofactors
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cma00001
]
09100 Metabolism
09108 Metabolism of cofactors and vitamins
00860 Porphyrin metabolism
Cmaq_1347
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Radical_SAM
SPASM
Fer4_12
AP_endonuc_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABW02173
UniProt:
A8M8V4
LinkDB
All DBs
Position
1424116..1425270
Genome browser
AA seq
384 aa
AA seq
DB search
MIPVSVMVTGSGTVSVKIKGRFGVNHPSEFSSPIRPVVSWNITRRCNLKCLHCYISAGDA
DENELTTEEAMNLVEQFSELKVPLILFTGGEPLMRGDLIKLAHYARDKGIRIALSTNGTL
ITREMASKLAEAGFSYIGVSLDSINSEFHDKFRGVGGAFAKTILGIRNAIDAGLDVGLRF
TLTSMNINEVSSYIEFALSLGVRRITFYHLSASGRAQRLSRDWWYTPSQYVKFMNDLIKY
AKDYSGKIEIETTLGSFDGVYIALKLAKNKEELDNYLRFVESTGGCGRKIISIYPNGDVY
PCQFIDFIKLGNVREKRLADILMESNLDLFVNTEKYLKGPRCSACQFKKYCKGGDRARAY
YLTGDVYGDDPLCPIPSIINNPQD
NT seq
1155 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatacccgtaagcgtcatggttacaggctcaggaacagtatcagttaagattaagggt
agattcggggttaatcaccccagtgaattctcaagcccaattaggcccgttgtctcatgg
aacataaccaggaggtgtaatttaaagtgcctgcactgttacataagtgctggtgatgct
gatgagaatgagttaactactgaggaggcaatgaacctggtggagcagttcagtgaatta
aaggtcccattaatactattcactggtggtgaaccattaatgaggggtgatttaattaag
ctggctcactatgctagggataagggtattaggattgccttatccactaatggaacatta
ataactagggaaatggcctctaaactggctgaagcaggcttctcatacattggagtctcc
ctggattcaataaacagtgagtttcatgataaattcaggggggtggggggtgccttcgct
aagactatcctgggtattaggaatgccattgatgctgggttagatgttggcttaaggttc
accttaacctcaatgaacattaatgaggtttcatcgtacattgaattcgcgttatcactg
ggtgttaggagaataacattttatcacctatcagcctcaggtagggctcaaaggttaagt
agggattggtggtatacaccgtcgcagtacgttaaattcatgaatgatttaatcaagtac
gctaaggattactcaggtaaaattgaaattgaaacaaccctaggttcattcgatggagta
tacatagccctaaaactagctaagaataaggaggaattagataattacctcaggttcgtg
gagtcaacgggaggctgcggtaggaagataatatcaatataccctaacggtgacgtttac
ccatgccaattcatagacttcattaagctcggtaacgttagggagaagagactagcagac
atattaatggaatcaaacctagacctattcgtaaacactgaaaaataccttaagggacct
aggtgctccgcatgccaatttaagaagtattgtaagggtggggatagggcgagggcatat
tacctaacaggtgacgtttacggtgacgaccccctctgcccaataccaagcataattaat
aacccgcaggattaa
DBGET
integrated database retrieval system
