Caldivirga maquilingensis: Cmaq_1382
Help
Entry
Cmaq_1382 CDS
T00611
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF402
KO
K22469
ribonuclease FAU-1 [EC:3.1.26.-]
Organism
cma
Caldivirga maquilingensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cma00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
cma03009
]
Cmaq_1382
Ribosome biogenesis [BR:
cma03009
]
Prokaryotic type
rRNA processing factors
Cmaq_1382
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF402
RNase_E_G
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABW02208
UniProt:
A8M8Y9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1456417..1457832)
Genome browser
AA seq
471 aa
AA seq
DB search
MTKVRVRGIYATALTKIMLEDGYDIVQATDTILSRFNILHSTEPPDVTIKDDENIPGALF
IIGKCSEVNKVLESILRRVGDVAYNKPPVPLYSVIMGVVADNGHIEVAPGVLALLEGSNY
FRPGDKLPVTMVNVTGQLRASPYIMPTTSYLRVIDSPTVRLSRHIKDPDAKMMLVRVGLS
KINQLGGLGIRWRSSAQYLSEEDAEKALDEAISLVNAIRVKIAEARDYDMLFEGECIVSV
ILDAEARWVLDDIRNTIVPTVKGHHALKITMKNTEILDYTEYLVGELKMRDELGRALANY
ALSNLSTINVHHVKVNGEHINLGPGERVHYSNGLLIIRRELKPGGTLDGLNVAKEYGDAA
YSVINIGERHLTHIYVSHDGSFKGAYVNINTPIEVTWDGVIYIDLEVDLTVDKGFNVNII
DEDKLSSIPSRRLINEAEEELSRLKGDVVNLVRNHIDTLSKLGLSIHYQGP
NT seq
1416 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactaaggtaagggttagggggatttacgccacagcactaactaagattatgctggag
gatgggtacgatattgttcaagccactgacaccatattaagcagattcaacatacttcac
tccactgaaccccctgacgtaactattaaggatgatgagaatatcccaggggcattattc
ataataggtaagtgcagtgaggttaataaggttcttgaatccatactacgtagggttggg
gacgtagcttacaataagccgcctgtcccattatacagcgtaataatgggtgttgtagct
gataatggacacattgaggttgcaccaggtgtcttagccctacttgagggttccaattac
tttaggcctggtgataagttaccggtgaccatggttaatgtaaccgggcagttgagggca
agcccatacataatgccaaccaccagttacctcagagtcatagatagcccaacggttagg
cttagtaggcatattaaggatcctgatgctaaaatgatgcttgtcagggttgggttaagt
aaaattaatcaactgggtggattaggcataaggtggaggagctcagcccaatacctcagt
gaagaggatgctgagaaggcgctggatgaggcaataagcctagtcaacgccattagggtt
aagatcgctgaggcaagggactacgatatgttatttgaaggggaatgcatagtctctgtg
atactggatgctgaggctaggtgggtgctggatgatattaggaacaccattgtacccacg
gttaagggtcaccacgccttgaagataaccatgaagaacactgagatacttgactacact
gagtacctggttggtgaattaaagatgagggatgagttaggtagagctctggctaattac
gcattaagtaatttatccacgattaatgtgcatcacgttaaggttaatggagagcacatt
aacctagggcctggggagagggttcattatagtaatgggttacttatcattaggagggag
ttgaagcctggtgggacattggatgggcttaatgtagctaaggagtatggtgacgcagcc
tatagtgtaattaatattggtgaaaggcatttaacccatatttacgtttcacacgatggc
tcattcaagggcgcctacgtgaatattaacacacccattgaggttacttgggatggggtg
atttacattgatcttgaagttgatttaaccgttgacaaggggtttaacgtgaatattatt
gatgaggataagttaagcagtataccgagtaggagacttattaatgaggctgaggaggag
ttgagtaggcttaagggtgatgtggttaaccttgttcggaaccacattgacactttaagt
aagcttggtttaagtattcattatcaaggaccatga
DBGET
integrated database retrieval system
