Clostridium manihotivorum: C1I91_00835
Help
Entry
C1I91_00835 CDS
T08006
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cmah
Clostridium manihotivorum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Bact_surface_Ig-like
Lectin_legB
Bact_lectin
CarboxypepD_reg
HYR
InlK_D3
Big_1
Big_3
CarbopepD_reg_2
Invasin_D3
MG4
Gram_pos_anchor
bMG3
Big_3_3
NOMO_3rd
Hac8_like_N
EMC7_beta-sandw
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QAA30343
UniProt:
A0A3R5QR57
LinkDB
All DBs
Position
complement(177541..183942)
Genome browser
AA seq
2133 aa
AA seq
DB search
MKKRLKPISFLLSFLFAFQIILSNANTVAYALTNQLISFAYQDFNALAMNNMLTLQSDAA
LVNGQIRLTRNSGNLAGSAFYKQKVSVASDKSFSSFFTFQMKSTGSRADGIVFVLDTNTN
SIGSTGAAIGYGGIQNSIGIEFDTYQNTGYYDVTKTANMNDPDNNHIGINVNGSPVSVAS
KSLKPLGIDLADGATKYAWVDYKGDTNQLEVRISNINSRPELPTLAYTINLSQTLGSNEV
YSGFTAATGGSYEEHDIVSWYFDSKYNPIDTTKNTYISAPTTVSVSAAPSTEVTNNSTVN
INVKNADGSNAANIPVTLTTDYGTLDRYNVITDGNGNAAVTFNNSNYSPGNAVVKAVAQG
GAYNSCTINYVGVPRISNFTKNGVGDALMNFTKSDFLVTYTSMFSNLASVIIKSRPDNGV
LAYDGVPVGVSQEIPISYIDKLTFIPNKYWHGNTSFDWAARSSIGAISNTATETLSISAV
NHAPSTPGGFTTSLFDQHHKAGDVITPKWAASVDPDNDKLTYVLEYGADDNWTTIYSGND
LEYTYTLPSGYSSPHSAFRVKAVDPGKLESGYTYSEPFAQDSEKPVIRLIGMQSRTIQVG
LTYTEEGATAFDNFDGDLNDKLVKTGSVDTSKVGDYAITYTVSDAAGNTSTVVRDVHVVD
ITKPIIALKGDSDETLEVNHDYVEKGATATDNYNGDISKDIVISGTVDTHKLGDYVISYD
VKDSSNNSADTVKRTVHVVDTTKPVITINGDSEVTLEVHNEYVDAGAIASDNYDPEIASR
LSVTGTVDKDKLGDYTIYYNVKDISNNTADTVKRTVHVVDTTKPVLSINGKEDITVEVHN
NYLDEGVTAKDNYDQDIESKAIKSGEVNTDKLGDYVISYDVKDSSNNVAATVKRNIHVVD
TTKPNISLVGKSDITLEVHSLYVDLGAVASDNYDENLSSAIDVNGNLNTDKLGDYTIAYN
VKDSSGNKADTILRTIHVVDTTKPVIKLKGEESQTIEVHKNYEEAGFTANDNYDNDLTSK
VSVSGAVNTDKLGDYTLSYDVKDSSNNTAITLKRTVHVVDTTKPVITLKGDSDINVEVHK
GYTDEGVSAADNYDNDITSNVTVSGKVNTDKIGQYIISYDVKDSSGNVADTVKRTIHVLD
TTKPIISLKGETDKTIEVHASYVDPGAIATDNYDEDITSKIIKSGEVNTDKVGDYSINYD
VKDNSNNAADTAKRVIHVVDTTNPIIALKGDSDETLEVNHDYVEKGATATDNYSGDISKD
IVISGNVDTHKLGDYVITYNVKDAANNSASTVKRTIHIVDSTKPVIALKGDAEQTIEVHS
KYVDPGVALSDNYDNDINSKLVVSGAVNTDKLGDYTIVYNVKDGSGNAADTIVRTIHVKD
TTKPVINIVGDSVVTVEAQNIYTDGGATATDNYDSNLTDSIKTKGVVDTNKIGEYTISYD
VSDLSGNKADTAKRIVKVVDTKKPIIEMKGDSDITLEVGTEYKDQGAVAKDNYDGDITGK
IAMDSNVNTNVKGNYFVKYNVMDASGNAAKEVVRNVHIIDKIESISLSGEVVKQEDNSLI
AGADISLYDLEGKLIYKTTSDSKGVYSLPNVKLGQYILEAHDSNNNVTSVQIDAKPNSVL
DPTMKKDIALVNYNIEMDSNPNTIVGDGVSTTKLSVVVKDKNGNTLKGLKVDFDASKGSF
PNGNSAVTDNNGTAYVDYKSDKIESTTSEVIPVKATITDAKNGLSTSRQILVTFEPGSIQ
GIVVDNETGKPVSGAAIVVSKDFNNDGIVDFYSKMVTDETGKYKIAVPKGNIGYDVNITK
PVKIGDAVQLKTFKQNCVAGDITGDKKETYASNNTVAGLLLTKDTNGKTSVLTSFSGLNM
AVFDSSKTDIKKGQDISNVKPEMLATMDNNQNEGGFQADGLSVGKQYVLAVYYTFASGQK
IIVGTANVNVAESGQINITNVLIDPYGTITDSATGKVIDGVHVVLYYANTARNIAKGIKP
DSIVNLPEVKGFKPSDNANPQESNVDGEYAFMVFPSTDYYVKADKEGYDTFKSPTISVDN
EIVRFDVTMNRTAKPVVPVTPDKTEVVKATPNTVVTDKVGTGKTITPVNAPDKTIKQTNL
PKTGSLISSNLLLVIGIIVIIIGGIVLARRKRR
NT seq
6402 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaagacttaagccaataagttttcttttaagttttttatttgcctttcagatt
attttatcgaatgcaaataccgttgcttatgcacttacaaatcaattgataagctttgct
tatcaagatttcaatgccttagctatgaacaatatgcttaccttacaaagtgatgcagca
cttgtgaatggacaaataagacttactagaaactctggcaatttagcaggaagtgctttt
tataagcaaaaggtttcggtagctagtgataaatcctttagctcattcttcacttttcag
atgaagagcactgggtcaagagcagacggaatagtattcgtacttgatacaaatacaaat
agcataggatctactggagcagctataggatatggaggtattcaaaatagtataggtatt
gaatttgatacttatcaaaatactggctattatgatgtaacaaaaactgcaaacatgaat
gatcctgacaataatcatataggtataaatgtcaatggtagccctgtatcagtagcttcc
aagagcttaaaaccattggggatagatttagctgatggtgctaccaagtatgcttgggtt
gactataaaggagatactaatcagttggaggtcagaataagtaacattaattcaagacca
gaactaccaacactagcttatacaataaatctatctcagactctaggttctaatgaagtt
tattctggctttacagcagctactggtggaagctatgaagaacatgacatagtatcgtgg
tattttgattcaaaatataatcctatagatactacaaaaaatacatatatatcagcacct
acaacggtctctgtatctgcggcaccttctacagaagttactaataatagtactgtaaat
ataaatgtaaagaatgcagatggaagtaatgctgccaatatacctgttacccttacaact
gactatgggacattagatagatataatgtaataacagatggcaatggaaatgctgcggta
acatttaacaacagtaattatagcccaggaaatgctgtagttaaggctgtagctcaaggt
ggggcatataattcttgtactattaattatgttggagttcctagaataagtaacttcacc
aaaaatggcgttggtgatgcattaatgaattttactaaatctgattttttagtaacatat
acttcaatgtttagcaatttagccagtgtaattattaaatcacgtccggataatggggtc
cttgcttatgacggggtacctgtaggagtatcacaagaaatacctatttcatatatagat
aagttaacttttataccgaataagtattggcatgggaacacatcatttgactgggctgct
agaagttctataggggctatctctaatacagctacagaaaccttatctatttcagcggta
aatcatgcgccttcaacaccaggaggatttacaactagtctttttgatcagcatcataaa
gctggtgatgtaataacgcctaaatgggcagcttctgttgacccagataatgataaattg
acctatgttttagaatatggtgctgatgataactggaccacaatatactctggtaatgat
ttagagtacacttatacattacctagtggatattcatcaccacattcagcatttagagta
aaagctgtggatccaggtaagttagaatctggttatacttattcagaaccatttgctcaa
gatagcgaaaaacctgttattagactaataggaatgcaatctagaacgatacaagttggg
ttaacctatactgaagaaggtgcaactgcctttgataattttgacggagatttgaatgac
aagcttgtcaaaacaggatcagtagataccagcaaggtaggtgactatgctatcacatat
actgtatctgatgctgcaggaaatacttctactgtagtaagagatgttcatgtagtagat
ataactaagcctataatagccttaaagggtgattcagatgaaactttagaagttaatcat
gattacgtagaaaaaggtgcaactgctactgacaactataatggagatatttctaaggat
atagttattagtggaacggttgatactcataagctaggtgattatgttatatcttatgat
gttaaagattcatcaaataacagtgccgatacggttaaaagaactgtacatgttgtagat
acaactaagcctgtgataactatcaacggtgactcagaagttactttagaagttcataat
gaatatgtagatgcaggtgctatagcaagtgataattatgacccggaaattgcttcaaga
ctttcagtaacaggaactgttgacaaggataagcttggagattatacgatttattacaat
gtaaaagatatatcaaataatactgctgatacagtaaaaagaacagtacatgtagtagat
acaactaaacctgtactaagcataaatggtaaggaagatattactgtagaagttcataat
aattatttagatgaaggtgtaacagctaaagataattatgatcaagatatagaatcaaag
gcaataaaatctggcgaagttaatacagacaagcttggagattatgttatatcctatgat
gttaaggacagctcaaataatgttgctgctacagtaaagagaaacatacatgtggtagat
actacaaaacctaatattagtttagtaggaaagtcagatataacattggaagttcatagt
ttatatgtagatctaggggctgttgcaagtgataactacgacgagaacttaagctcagca
attgatgtaaatggaaacttaaatacagataagcttggagattacactatagcttataat
gttaaagatagttcgggaaataaagctgatacaatattaagaaccatccatgtagtagat
acaacaaaacctgttataaagttaaaaggtgaggaaagccaaactatagaggttcataag
aattatgaagaagctggattcacagctaatgataattatgacaatgatttaacatccaag
gtttcagtttcaggagcagttaacactgataagcttggtgattatactttaagttatgac
gttaaagacagctcaaataacactgctattactttaaaaagaacagtacatgtagtggat
actactaagcctgtaattaccttaaagggtgattctgatataaatgttgaagttcacaaa
gggtatactgatgaaggggtaagcgcagctgataactatgataatgatataacttcaaat
gtaactgttagtggaaaagttaatactgataaaattggacaatatattataagctatgat
gttaaagatagctcaggtaatgtggctgatacagtaaaaagaactatacatgtattagat
actactaaacctatcataagcttaaagggagaaacagataaaactattgaagtacatgct
tcttacgtagatccaggtgctattgcaactgataactatgatgaggatataacttctaag
ataattaagtctggagaagtaaatactgataaggttggagattatagtataaactatgat
gttaaggataattcaaataatgctgcagatacggctaaaagagttatacatgtagttgat
actaccaatcctataatagccttaaagggcgattcagatgaaactttagaagttaatcat
gattacgtggaaaagggtgcaactgctactgacaactatagtggagatatttccaaggat
atagttattagcggaaatgttgatactcataagctaggtgattatgttataacttataac
gtaaaagatgctgctaataatagtgctagtactgtaaaaagaacaatacacatagtagac
tcaactaaaccagttattgccttaaagggtgatgctgaacaaacaatagaagttcatagt
aagtatgtagaccctggcgttgctttaagtgataattatgataatgacataaattcaaaa
ttggttgtttcaggagcagttaacactgataagcttggagattatacaatagtttacaat
gttaaagatggatcaggaaatgctgctgatacaatagtaagaacaattcatgtaaaagac
acaacaaagccagttataaatatagtaggggattcagttgttacagttgaagctcagaac
atttatactgatggtggtgctactgcaactgataactatgacagtaatcttacagatagt
attaaaactaagggagtagttgatactaataaaataggtgaatacactatatcatacgat
gtgtctgacttatctgggaataaagctgatacagctaagagaatagtaaaagttgtagat
acgaaaaagcctatcatagagatgaagggtgattctgatataacattagaggtaggaaca
gaatataaggaccaaggtgctgttgctaaagataactatgatggtgatatcactggtaag
atagctatggatagtaatgttaacactaatgttaaaggcaactattttgtaaagtataat
gttatggacgcaagtggcaatgctgccaaagaggttgttagaaacgttcatattatagat
aagatagagagcattagtctatcaggtgaagtagtgaaacaggaagataattcattaatt
gcaggagcagatataagcctttatgatctagaaggaaaacttatatacaaaactacttct
gattcaaagggagtttactcattacctaatgttaagttaggtcagtatatattagaagct
catgatagcaataacaacgttacatcagtacagattgatgctaaacctaatagtgtctta
gatcctactatgaaaaaagatatagctctagttaattacaacatagagatggattctaat
ccaaatacaatagttggagatggcgtttcaacaacgaagcttagcgtagttgttaaggac
aagaatggaaacactctaaagggactaaaggttgattttgatgcgtcaaagggtagcttc
cctaatgggaattcagctgtgacagataataatggtacagcttatgtagattataaatct
gataaaatagaaagcactacaagtgaagtaatacctgtaaaggctactatcacagacgct
aaaaatggcttaagcacaagtaggcaaattcttgtaacctttgaacctggaagtatccaa
ggtatcgttgtggataatgaaactggaaagcctgtaagtggagcagcgattgtggtttct
aaggactttaacaatgatggaatagtagacttctattctaagatggttactgatgaaact
ggaaagtataagattgcagtacctaaaggtaatattggttatgatgttaatattacaaag
ccagtaaagataggtgatgctgtacaattaaagactttcaaacagaactgtgtagcagga
gatataactggagataagaaggaaacttatgcctcaaataataccgttgctggactatta
cttactaaagatactaatggaaaaacaagtgtacttacatcatttagtggtttaaatatg
gctgtatttgatagctctaagactgacataaagaaaggacaagacatatcaaatgttaag
ccagagatgctagcaactatggataataaccaaaatgaaggtggtttccaggctgatgga
ctttcagttggaaagcaatatgttttagctgtttattatacttttgcaagtggtcaaaag
ataattgttggtactgcaaatgttaatgtagcagaaagtggccagattaatataactaat
gtattaattgacccatatggaacaatcactgatagtgctacaggaaaagtaattgatgga
gtacatgtcgttctttattatgctaatacagctagaaatatagctaaaggaataaagcca
gatagtatagtaaatctaccagaagttaagggatttaaaccatctgacaatgccaatcct
caagaaagcaatgttgatggtgaatatgcatttatggtattcccaagtacagactattat
gtaaaagcagataaagagggctatgatacatttaagagtcctactatatctgtagataat
gaaatagtaagatttgatgtgaccatgaatagaaccgctaaacctgtggtaccagtaaca
ccagataagactgaagtagttaaagctaccccaaatacagttgtaactgacaaagttggt
acaggtaaaaccataacaccggttaatgcaccagataaaactattaagcaaactaacctt
cctaagacaggtagtttaatatcttctaatctactattagttatagggataattgttatt
attatcggtggaattgtactagccagaagaaaaagaaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
