Cucurbita maxima (winter squash): 111492756
Help
Entry
111492756 CDS
T05246
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
cmax
Cucurbita maxima (winter squash)
Pathway
cmax03015
mRNA surveillance pathway
cmax03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cmax00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
111492756
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
111492756
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
cmax03041
]
111492756
Spliceosome [BR:
cmax03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
111492756
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111492756
NCBI-ProteinID:
XP_022997960
UniProt:
A0A6J1KBD1
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
479 aa
AA seq
DB search
MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGGYGGGGYGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGGGRG
YGGRGGGGGYGGRGGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANVNF
ARRVECNKCGTPSPGGASDRSGGGGGGGYNRGGADGGYGGNRNGRGGSYHGGRSGNHDGG
RYEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSFHGGSANYGTDAVPPP
ASYSGSTYPPTYGGPTGGYGGDGIGDGRSATGRGGPSAGYDGAYNAGGKGGGYNAGGRGG
GSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDESCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGG
IGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGH
SINVAMAEKSAPRAPTYNHGGGGRGGYGGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
NT seq
1440 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggtatgtacgatcaaggaggagacgctgctccttcgtcttacggagcccctgga
ggcggtggaggaggatacggcggcggagggtatggaggcggatatggtggaaagggcggc
gatggtggatatggcggcggaggccgaggaggcggcggtggcggcggtggcggtagagga
tatggaggacgaggtggtggaggaggctacggtgggcgaggaggcggtggtggtggtggc
tatcaaggaggagatcgtggaggacgaggtggtggacgtggtgggggaggtggtcgtggt
ggaagcgggagagatggcgattgggtctgccctaatcctggctgtgcaaatgtgaacttt
gctagaagagtggagtgtaacaagtgtggtacaccatcacctggtggtgccagtgaccga
agtggtggtggtggtggtggaggatataatagaggtggagctgatgggggttatggtggt
aatcgtaatggaagaggcggtagttaccatggtggtagaagtggaaatcatgatggtggt
cgctatgaaggagggaacagaggtggtaattcttatggtggtcaccagggaggagaggat
agtgggtacagtcaggttcctccatcatcagcccccccatctggtggtgttggtggctct
tatccaccatcttttcatggtggaagtgcaaattatggtacggatgcagttcctccgcct
gcaagctacagtggaagtacctaccctccaacttatggtggtcccactggtggctatggc
ggtgatggtataggtgatggacggagtgcaactggtcgtggtgggccgtcagctggatat
gatggtgcttacaatgcaggtggtaaaggtggtggttacaatgctggtggtagaggaggt
ggaagctataatgctggtggtggtagaggtggtggttatggaagtacaccagcagccgag
ccagcacaggtgaaacagtgcgatgaatcttgtgatgattcttgtgataattcaagaatc
tatgtttcgaatctgccaacagatgtgaccattgatgaattgagagaactatttggtggc
attggccaaattggaagaatcaagcagaagaggggctacaaggatcagtggccttggaac
ataaaaatatatacagatgagatgggaaataacaaaggcgatgcatgtgtatcatatgaa
gatccctcagcggcacattctgctggcggtttctataacaattatgatttgagaggtcat
agcatcaatgttgcaatggctgagaagtctgcaccgagggcgcctacatacaaccatggt
ggtggtggcagaggtggatatggaggtggtggtggtgatagacgtagagatagctatagg
gacggaggctctggacctgatagacatcagcatggtggaaatagatctcgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
