Cucurbita maxima (winter squash): 111494753
Help
Entry
111494753 CDS
T05246
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
cmax
Cucurbita maxima (winter squash)
Pathway
cmax03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cmax00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
111494753
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cmax03019
]
111494753
Messenger RNA biogenesis [BR:
cmax03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
111494753
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111494753
NCBI-ProteinID:
XP_023000503
UniProt:
A0A6J1KMT7
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
460 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLKDHFNSYGEVMHTVVMRDKITSKPRGFGFVVFADPSVL
DRVLQDKHTIDGKTVEAKRALSREEQQTPARAGNLNATRNSGGGNMRTKKIFVGGLPPTL
TEEGFKEYFETYGDVTDVVVMYDQNTRRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKTFHDLNGKQVE
VKRALPKDANPGAGGRSMGGSASSGGYQTYGSSGGVNSNSYDSRMDSNRYMQSQGSSGGF
PPYGSSGYNNPGYGYGSSNNGMGYGGYGNYSGSNTGYGAPSAVAYGNPNVANAGYASGPQ
GGPRSSWSAQAPSGYGAMGYGNAAPWGGAPGGNAGAGSGGPGSAPTGHSPGGAAGYGNQG
YGYGGFGNQGYGYGGGDGSYGSQSGYGTGGGRSGSASNSNVGGGPSGGELQGNSGGYMNS
GYGDANGNTGYGNAGWRSDGGQVGYTGGYGGGQARQSQQQ
NT seq
1383 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaggggaagctttttattggtgggatttcatgggagacctctgaggat
aagttaaaggaccacttcaacagctatggtgaagtgatgcataccgttgttatgagggat
aagatcactagcaaacctagagggtttggattcgttgtctttgcagatccctctgttctt
gatcgagttctccaggataagcacactatagatggtaaaacggttgaggctaagagggcc
ttatcacgagaggaacagcagacccctgcgagagcgggcaatttgaacgctactagaaat
tctggtggtggaaatatgagaaccaaaaaaatttttgttgggggattgcctccaacattg
actgaagaggggtttaaggagtattttgagacttatggcgatgtaactgatgtagtagtc
atgtacgatcaaaatactaggcgtccacggggatttggatttatatcttttgatactgaa
gaagctgttgacagagttttgcacaagacatttcatgatttgaatggtaaacaagtagaa
gttaagcgtgcccttcccaaagatgccaatccaggtgcaggtggccgctcgatgggtggc
agtgcaagcagtggtggttatcaaacttatgggtcatctggtggtgtcaattcaaattca
tatgatagtcgtatggattcgaataggtacatgcaatctcagggctctagtggaggtttc
ccaccttatggttcctctggatataacaatcccgggtatggttatggttcatcgaacaat
ggtatgggatacggtggttatggaaactatagtggttcaaatactgggtatggtgcccct
tctgctgttgcttatggtaacccaaatgtcgccaatgctggttatgcaagcggtcctcaa
ggtggacctagaagttcgtggtccgctcaagctccctctggatatggagccatgggctat
gggaatgcagccccgtggggaggtgcccctgggggcaatgctggagctggcagtggtggg
cctggatctgcacccacaggtcattctcctggtggagctgctgggtatggcaatcagggt
tatggatatggtgggtttgggaatcaaggttatggttatggtggaggtgatggctcgtat
gggagtcaatctggttacggtacaggtggaggacgttctggtagtgcctcaaatagcaat
gtcgggggtggtccaagtgggggagaattacaagggaacagtggtggttacatgaatagt
ggctatggcgatgctaatggaaacactggttatggaaatgctggttggagatccgatggc
ggacaagtaggttataccggtggttatggtggtggacaagctcgacaatctcaacaacag
taa
DBGET
integrated database retrieval system
