Cucurbita maxima (winter squash): 111498928
Help
Entry
111498928 CDS
T05246
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
cmax
Cucurbita maxima (winter squash)
Pathway
cmax03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cmax00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
111498928
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cmax03019
]
111498928
Messenger RNA biogenesis [BR:
cmax03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
111498928
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111498928
NCBI-ProteinID:
XP_023006071
UniProt:
A0A6J1KWS0
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
460 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLKDYFSNYGEVMHTVVMRDKITSRPRGFGFVVFSDPSVL
DRVLQDKHTIDGKTVEAKRALSREEQQTPARASNSNATRNSGGGGGGNMRTKKIFVGGLP
PTLTEEGFKEYFEAYGHVTDVVVMYDQNTRRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKTFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPGAGGHSMGGSGYQGYGSSGGVNSNSYDSRMDSSRYMQSQGSGGGFP
PYGSSGYSNPGYGYGSSNNGMGYGGYGSYSSSNTGYGAPAAVAYGNPNAANAGYGSGPQG
GPRSSWSTQAPSGYGAMGYGNAAPWGGAPGGNAGAGSGGPGSAPTGHSPGGAAGYGNQGY
GYGGLGNQGYGYGGGDGSYGSQSGYGAGGGRSGSASNSNVGGAPSGGELQGNSGGYMGNG
YGDANGNNTGYGNAAWRSDGGQVGYTGGYAGGQARQAQQQ
NT seq
1383 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaggggaagcttttcattggtggaatttcatgggaaacctccgaggat
aagcttaaggactactttagcaactatggtgaagtgatgcatacggtggtgatgagggat
aagatcactagcagacctagagggtttgggttcgtcgttttctcagatccctctgttctc
gatcgagttcttcaggataagcacaccatcgatggtaaaacggttgaggccaagagggcc
ttatcacgggaagaacagcagacccctgctagagcaagcaattctaatgctactaggaat
tctggtggtggtggtggaggaaacatgaggactaaaaaaatttttgttgggggattgcct
ccaacattaactgaagaaggatttaaagagtactttgaggcgtatggccatgtaaccgat
gtcgtagtcatgtatgatcaaaatactaggcgtccacggggatttggatttatatcgttt
gatactgaagaagctgttgacagggttttgcataagacatttcatgatttgaatggtaaa
caagtagaagttaagcgtgcccttcctaaagatgctaatccaggtgcgggtggtcattca
atgggtggcagtggttatcaaggttatgggtcttctggtggtgttaattcgaattcttat
gatagtcgtatggattcgagtaggtatatgcaatctcagggctctggtggagggttccca
ccttatggttcctctggatatagtaatcctgggtatgggtatggttcatcgaacaatggc
atgggatatggtggttatggaagttacagcagttcgaatactgggtatggcgcccctgca
gctgtagcctacggtaacccgaatgctgctaatgctggttatgggagtggtcctcaaggt
ggaccgagaagttcatggtccactcaagctccctctgggtatggagccatgggttatggt
aatgctgctccttggggtggtgctcctggaggcaatgctggagctggcagtggaggacct
ggatctgcacccactggtcattctcctggtggagctgctgggtatggaaaccagggttat
ggatatggtgggcttggaaatcaaggttatggttacggtggaggcgatggctcgtatggg
agtcaatctggttatggtgcaggtggaggacggtctggtagtgcctcaaatagcaacgtc
gggggtgctccaagtgggggagagttacaagggaacagtggtggttacatgggaaatggc
tatggggatgctaatggaaacaacactggttatggaaatgctgcatggagatctgatgga
ggacaagtaggttatacaggtggttatgctggtggacaagctcggcaagcccaacaacag
taa
DBGET
integrated database retrieval system
