Caminibacter mediatlanticus: FE773_05855
Help
Entry
FE773_05855 CDS
T05985
Name
(GenBank) TRAP transporter large permease subunit
KO
K11690
TRAP-type transport system large permease protein
Organism
cmed
Caminibacter mediatlanticus
Pathway
cmed02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cmed00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
FE773_05855
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cmed02000
]
FE773_05855
Transporters [BR:
cmed02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
FE773_05855
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DctM
CitMHS
Na_H_antiporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCT94718
LinkDB
All DBs
Position
complement(1077881..1079173)
Genome browser
AA seq
430 aa
AA seq
DB search
MTGIILFVVAFILLMIGIPVAFAFGASAIFAALIDPNIGLDVFGLLPYRIYGIMQNFTLM
AVPLFIFMGFILEKSKIAENMLESIGELFGPIRGGLAIAIIIVGAVLAASTGIVGASVVM
MTIISLPIMLKHGYSPSLASGVIAASGTLGQLIPPSIVLIILGAVMNISVGDLFKAAIIP
GIIIVGLYMLYVLIIAFIKPDIAPLIKTDKNYKQILINAIKSLIAPFVLIAIVLGSIFAG
FATPTESAAIGALGAIILTIFYRTFSFELLRYASVETVKITAMIFMILIGATAFSLVFNE
SGAGDIVTEFFTDSISNKYIFIAITMILIFILGFFIDFIEITFIVIPILLPIVEEFDIDP
LWFALLIAINLQTSFLTPPFGFSLFYLKGAAGKLIKTTDLYKGVIPFIIIQIIALLIILF
YPNLVYLLVK
NT seq
1293 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaggtattattttatttgtagttgcattcattttacttatgattggaattcctgtt
gcttttgcatttggtgcaagtgctatttttgcagcattaattgacccaaatatcggtctt
gatgtttttggacttttaccatatagaatttatggaattatgcaaaattttacactaatg
gcagtgcctttgtttatttttatgggatttattttagaaaaaagtaaaattgcagaaaat
atgctcgaatcaattggtgagctttttggtccaataagaggtggtcttgcaattgcaatc
ataattgttggagcggtattggctgcttctactggaattgttggtgcaagtgttgttatg
atgactataatttctcttccaataatgcttaaacatggatattcaccatcacttgcaagt
ggagtaattgcagcaagtgggacacttggtcaacttataccaccaagtattgttttaatt
attcttggggctgttatgaatattagtgtaggggatttgtttaaagcagctataatccca
ggtattattattgttggactttatatgttatatgtattaataattgcttttataaaacca
gacattgcacctctaattaaaacagataaaaactataaacaaatattaattaatgcaatt
aaatcactaattgctccatttgtattaattgcaatagttcttggaagtatttttgcagga
tttgcaactcctaccgaatctgcagcaattggagcacttggtgcaataatacttacaatt
ttttatagaacttttagttttgagctgttaagatatgcaagtgtagaaactgttaaaatt
actgctatgatttttatgattttaattggtgcaacagcattttctcttgtttttaatgag
tctggggcaggggatattgtaactgaattctttaccgattcaatttctaataagtacatt
tttattgctattactatgattttgatatttattttaggtttttttattgattttattgaa
attacatttattgtaataccaattttacttccaatagttgaggaatttgatatagaccct
ttatggtttgcattacttattgctataaatttacaaacatcatttctaactcctcctttt
ggatttagtttattttatttaaaaggagcagctggtaaattaattaaaacaactgattta
tataaaggtgtaattccatttattattattcaaataatagcattgctaattatacttttt
tatcctaatttggtatatttattggttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system