Catenibacterium mitsuokai: NQ499_01380
Help
Entry
NQ499_01380 CDS
T08440
Symbol
cas9
Name
(GenBank) type II CRISPR RNA-guided endonuclease Cas9
Organism
cmit
Catenibacterium mitsuokai
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cas9_REC
Cas9_PI
HNH_4
Cas9-BH
RuvC_III
DUF1524
HNH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWO54507
LinkDB
All DBs
Position
288659..292633
Genome browser
AA seq
1324 aa
AA seq
DB search
MGLDLGTGSVGWAVVDMNHRLMKRNGKHLWGSRLFSNAETAANRRASRSIRRRYNKRRER
IRLLRAILQDMVLEKDPTFFIRLEHTSFLDEEDKAKYLGTDYKDNYNLFIDEDFNDYTYY
HKYPTIYHLRKALCESTEKADPRLIYLALHHIVKYRGNFLYEGQKFNMDASNIEDKLSDI
FTQFTSFNNIPYEDDEKKNLEILEILKKPLSKKAKVDEVMTLIAPEKDYKSAFKELVTGI
AGNKMNVTKMILCEPIKQGDSEIKLKFSDSNYDDQFSEVEKDLGEYVEFVDALHNVYSWV
ELQTIMGATHTDNASISEAMVSRYNKHHDDLKLLKDCIKNNVPNKYFDMFRNDSEKSKGY
YNYINRPSKAPVDEFYKYVKKCIEKVDTPEAKQILNDIELENFLLKQNSRTNGSVPYQMQ
LDEMIKIIDNQAEYYPILKEKREQLLSILTFRIPYYFGPLNETSEHAWIKRLEGKENQRI
LPWNYQDIVDVDATAEGFIKRMRSYCTYFPDEEVLPKNSLIVSKYEVYNELNKIRVDDKL
LEVDVKNDIYNELFMKNKTVTEKKLKNWLVNNQCCSKDAEIKGFQKENQFSTSLTPWIDF
TNIFGKIDQSNFDLIENIIYDLTVFEDKKIMKRRLKKKYALPDDKVKQILKLKYKDWSRL
SKKLLDGIVADNRFGSSVTVLDVLEMSRLNLMEIINDKDLGYAQMIEEATSCPEDGKFTY
EEVERLAGSPALKRGIWQSLQIVEEITKVMKCRPKYIYIEFERSEEAKERTESKIKKLEN
VYKDLDEQTKKEYKSVLEELKGFDNTKKISSDSLFLYFTQLGKCMYSGKKLDIDSLDKYQ
IDHIVPQSLVKDDSFDNRVLVVPSENQRKLDDLVVPFDIRDKMYRFWKLLFDHELISPKK
FYSLIKTEYTERDEERFINRQLVETRQITKNVTQIIEDHYSTTKVAAIRANLSHEFRVKN
HIYKNRDINDYHHAHDAYIVALIGGFMRDRYPNMHDSKAVYSEYMKMFRKNKNDQKRWKD
GFVINSMNYPYEVDGKLIWNPDLINEIKKCFYYKDCYCTTKLDQKSGQLFNLTVLSNDAH
ADKGVTKAVVPVNKNRSDVHKYGGFSGLQYTIVAIEGQKKKGKKTELVKKISGVPLHLKA
ASINEKINYIEEKEGLSDVRIIKDNIPVNQMIEMDGGEYLLTSPTEYVNARQLVLNEKQC
ALIADIYNAIYKQDYDNLDDILMIQLYIELTNKMKVLYPAYRGIAEKFESMNENYVVISK
EEKANIIKQMLIVMHRGPQNGNIVYDDFKISDRIGRLKTKNHNLNNIVFISQSPTGIYTK
KYKL
NT seq
3975 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
attggacttgatttaggaacagggtctgtaggatgggccgttgtagacatgaatcataga
cttatgaaaagaaatggaaagcatctatggggatctagattatttagtaatgcagaaaca
gcagctaatagaagagctagtagatctatacgtagaagatacaataagagaagagagaga
attagattattacgtgctattttacaggatatggtcttagagaaagatccaactttcttt
attagattagagcatacttcttttttggatgaagaagataaagccaaatatttagggaca
gattataaggataattataatttgtttattgatgaagattttaatgattatacttattat
cataagtatcctactatttatcatttaagaaaggcattatgtgaatcaactgaaaaagct
gatccaagacttatttatttagcacttcatcatattgtgaaatatagaggaaacttctta
tatgaaggtcagaaattcaatatggatgcatctaatattgaagataaattatctgatata
ttcacacagttcacatctttcaataacattccatatgaagacgatgaaaagaagaatcta
gaaatactagaaatattaaagaagccattatcaaaaaaagctaaggttgatgaagttatg
actttaattgcaccagagaaagattataagagtgcatttaaagaattagtgactggtata
gctggaaacaaaatgaatgttactaagatgattttatgtgaacctattaagcagggagat
tctgaaatcaaacttaaattctcagattctaattatgatgatcagtttagtgaagttgaa
aaagatttaggtgaatatgttgaatttgttgatgcattacataatgtttatagctgggtt
gaactacagactattatgggtgcaacacatacagataatgcatctatttctgaagcaatg
gtgagtcgttataacaagcatcatgatgatttaaaattattaaaagattgtattaagaat
aatgttcctaataaatattttgatatgttcagaaatgatagtgagaaatcgaagggatat
tataattatattaatcgtccatctaaagcacctgtagatgagttctataaatatgttaag
aaatgtattgagaaggttgatacaccagaagcaaagcaaattttaaatgatatagaacta
gaaaacttcttattaaaacagaattcacgtactaatggatctgtaccttatcagatgcag
cttgatgaaatgattaagataattgataatcaggcagaatactatccaatattaaaggaa
aagagagaacagttattatcaattctaacatttagaattccatattattttggaccatta
aatgaaaccagtgagcatgcatggataaaacgattagaaggtaaagaaaatcagagaata
ttgccatggaactatcaagatattgtagatgtggatgcaactgctgaaggatttattaag
cgtatgagaagttattgtacgtatttcccagatgaagaggttctacctaagaattcactt
atagtatctaaatatgaggtttataatgaactgaataagattagagtagatgataaacta
cttgaagtagacgttaagaatgatatttataatgaacttttcatgaaaaataagacagtt
actgaaaagaaattaaagaactggttagtgaataatcaatgttgtagtaaagatgcagaa
ataaaagggttccagaaagaaaatcaattctcaacttcattgactccatggattgatttc
acaaatatctttggaaagattgatcagtctaattttgatcttatcgaaaacattatctat
gatttgactgtatttgaagataagaaaatcatgaagcgtagattaaagaaaaaatatgct
ttgccagatgataaagtaaaacagatattaaagttaaagtataaggattggtcaagatta
tcaaagaagctacttgatggtatagttgctgataatagatttggtagtagtgtaactgta
ttagatgtcttagaaatgtctcgtttgaacttaatggaaatcatcaatgataaagatttg
ggctatgcacagatgattgaagaagcaacttcttgtcctgaagatggtaaattcacttat
gaagaagttgaaagattagcaggatcaccagcactaaagagaggtatttggcagtcttta
cagattgtagaagaaatcactaaagtaatgaaatgtagacctaagtatatctatattgaa
tttgaaagatccgaagaagctaaagagagaacagaatctaagataaagaaattagaaaat
gtgtataaagatttagatgagcagacaaagaaagaatataagagtgtgttagaagaatta
aaaggcttcgataatactaagaagatttcttctgatagtctattcttatatttcactcag
ttaggtaagtgtatgtattctggtaaaaaactagatattgattcgttagataagtatcag
attgaccatattgttcctcagtctttagttaaagatgatagttttgataacagagtttta
gtagtgcctagcgagaaccagagaaaattagatgatttggttgttccttttgacattcgt
gacaagatgtatagattctggaaattattgtttgatcatgaattgattagtccaaagaaa
ttctattctttaatcaaaactgaatatacagaaagagatgaagaaagatttattaataga
cagttggtagaaacaagacagattacaaagaatgttactcagattattgaagaccattat
tctacaactaaagttgcagctattcgagcaaacttatctcatgaatttagagtcaagaat
catatttataagaatagagatattaatgattatcaccatgcacatgatgcttatattgtg
gcattaattggtggatttatgcgtgatagatatcctaatatgcatgattctaaagctgtt
tattctgaatacatgaagatgtttagaaagaataagaacgatcaaaagagatggaaagat
ggatttgtgattaatagtatgaactatccatatgaagtagatggtaaacttatctggaat
ccagatcttattaatgaaatcaagaaatgtttctattataaagattgttattgtacaact
aaattagaccagaagagtggacagttgtttaatttaacagttctgtctaatgatgcacat
gcagataagggtgtaacaaaagcagttgtaccagttaataagaaccgtagtgatgttcac
aaatatggtggatttagtggattacaatatactattgttgcaatagaaggacagaagaaa
aagggtaagaaaactgaattagtcaagaaaatatcaggtgttcctttacatttaaaagca
gcttctattaatgaaaaaattaattatatagaagaaaaagaaggcttaagtgatgtaaga
attattaaagataatattccagttaaccagatgattgaaatggatggaggggaatactta
ttaacatcaccgactgaatatgtgaatgctagacaacttgttttaaatgaaaaacagtgt
gcattaattgcagacatatataatgcaatctataaacaagattatgacaatctggatgat
attttgatgattcaattgtatattgaattaacaaataaaatgaaagtattatatcctgca
tatcgaggtattgcagaaaagtttgaaagcatgaatgagaattatgttgttatttctaaa
gaagaaaaggcaaatattataaagcaaatgcttatcgtaatgcatagaggaccacagaac
ggtaatattgtatatgatgattttaaaataagtgatagaatcggaagattaaaaactaaa
aatcataatttaaacaatattgtgtttatctctcagtcaccaacaggaatatacactaaa
aaatacaaattatga
DBGET
integrated database retrieval system