Cucumis melo (muskmelon): 103497038
Help
Entry
103497038 CDS
T03195
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
cmo
Cucumis melo (muskmelon)
Pathway
cmo03015
mRNA surveillance pathway
cmo03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cmo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
103497038
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
103497038
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
cmo03041
]
103497038
Spliceosome [BR:
cmo03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
103497038
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103497038
NCBI-ProteinID:
XP_008457317
UniProt:
A0A1S3C4S9
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(789554..794268)
Genome browser
AA seq
490 aa
AA seq
DB search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NT seq
1473 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggtatgtacgatcaaggaggagacgctgctccgtcttacggagcccctggaggc
ggtggagggtacggtggtggaggtggaggcggtggatacggaggcggtggtggtggtgca
ggctatggtggaaaaggcggtgatggtggttatggaggcggaggccgtggcggcggtggc
ggcggtggtagaggctatggaggacgaggtggcggcggaggcggaggctacggtggtcgt
ggcggcggtggcggatatcaaggaggagatcgcggaggcggatatcaaggaggagaccga
ggagggcgaggcgctggacgtggtggcgggggtggtcgtggcggaagcggcagagatggg
gattgggtctgccctaatcctggctgtggaaatttgaactttgctagaagagtggagtgt
aacaagtgtggtgcaccctcacctggtggtgctagcgatcgaagtggtggtggtggtggt
ggttataatagaggtggaggtgacagtggctatggtggcagtcgtaatggaagaggtggt
agtttccacggtggtagaagtggaactcatgatggaggtcgaaatgaaggagggagcaga
ggtggtaattcttatggtggtcaccagggaggagaagatagcgggtacggtcaagttccc
ccatcctcagcaccttcatctggcggtcttgctggctcttatccaccatcttaccatggt
ggaagtgcagattacgggactgatgcagttcctcctcctgcaagctatagtggaacgaca
tatcctccaacttatggtggtcccactggtggctatggtggtgacagtctaggtgatggg
cgtggtgctgctggtcgtggtgggccatcaggtggatatgatggtggctacaatgcgggt
ggtagaggtggctataatgctggtggtagaggaggaagctataatgccagtggtggtaga
ggtggtggttatggaagtacacaagcagcagagccagcacaggttaaacagtgtgatgat
aattgcgatgattcgtgtgataactctagaatctatgtatctaatttgccaccagatgtg
accattgatgaattgagggaattatttggtggaattggtcaaattggaagaatcaagcag
aagaggggctacaaggatcaatggccttggaacataaaaatatatacagatgagatggga
aataacaaaggcgatgcatgtgtatcatatgaagacccctcagcagcacattctgctggc
ggtttctataacaattatgatttgagaggttatagcatcaatgttgcaatggctgagaag
tctgcaccaagggctccacctacatataaccatggtggtggtggtagaggtggatatgga
ggtggtggagataggcgcagagatagctacagggacggaggctctggacctgatagacat
cagcatggtggaaatagatcgcgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
