Cucumis melo (muskmelon): 103499446
Help
Entry
103499446 CDS
T03195
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
cmo
Cucumis melo (muskmelon)
Pathway
cmo03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cmo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
103499446
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cmo03019
]
103499446
Messenger RNA biogenesis [BR:
cmo03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
103499446
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103499446
NCBI-ProteinID:
XP_008460677
UniProt:
A0A1S3CDG3
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(6077243..6080214)
Genome browser
AA seq
461 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLKDYFSNYGEVMHTVVMRDKITSRPRGFGFVVFSDPSVL
DRVLQDKHTIDGKTVEAKRALSREEQQTPARASNSNGRNSGGSGGGNMRTKKIFVGGLPP
TLTEEGFKEYFEAYGHVTDVVVMYDQNTRRPRGFGFISFDSEEAVDRVLHKTFHDLNGKQ
VEVKRALPKDANPGAGGRSMGGGAGSGGYQGYGSSGGVNSNSYDNRMDSNRYMQSQGSSG
GFPPYGSSGYSNPAYGYGSSNNGMGYGGYGNYSGSNTGFGAPAAVAYGNPNVANAGYGSG
PQGGPRNSWSGQAPSGYGAMGYGNAAPWGGAPGGNAGAGSGGPGSAPTGHSPGGAAAGYG
NQGYGYGGFGNQGYGYGGGDGSYGSQSGYGTTGGRTGSASNSNVGGGSGGELQGNNAYMG
NGYGDANGNTGYGNAAWRSDGGQVGYTGGYAGGQARQAQQQ
NT seq
1386 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaagggaagctttttattggtgggatttcatgggagacttctgaggat
aagctaaaggactacttcagcaactatggtgaagttatgcatacggtcgttatgagggat
aagatcactagcagacccagagggtttggctttgttgtcttttcagatccctctgttctc
gatcgagttcttcaggataagcacactatcgatggtaaaacggttgaggccaagagggcc
ttatcacgggaggaacagcagactcctgccagagcaagcaattccaatggtagaaactcc
ggcggcagtggtggtggaaacatgagaaccaaaaaaatttttgttgggggattgcctcca
acattgaccgaagaaggatttaaagagtactttgaggcttatggccatgtaactgatgta
gtagtcatgtatgatcaaaatactaggcgtccacgaggatttggttttatatcttttgat
tctgaagaagctgttgacagagttttgcacaagacgtttcacgatttgaatggtaaacaa
gtagaagttaagcgtgcccttcccaaggatgccaatccaggtgcaggtggccgttcaatg
ggtggtggtgctggtagtggtggttatcaaggttatgggtcatctggtggtgtcaattca
aattcttatgataatcgtatggattccaataggtacatgcaatcacagggctctagtgga
ggtttcccaccttatggttcctctggatacagtaatcctgcgtatggttatggttcatcg
aataatggtatgggatatggtggttatggaaattacagtggttcaaatactgggtttggt
gcccctgcagcagtagcctatggcaacccaaatgttgccaatgctggttatgggagcggt
cctcaaggtggacctagaaattcatggtcaggtcaagctccctctgggtatggagccatg
ggttatgggaatgcagctccttggggtggtgctcctggcggcaatgctggggctgggagt
ggaggacctggatctgcacccacaggtcattctcctggtggagctgctgctgggtatggc
aatcagggttatggatatggtgggtttggtaatcaaggttatggttatggtggaggtgat
ggctcgtacggtagtcaatctggttatggtacaactggaggacgaactggtagtgcatca
aatagcaatgttggaggtggaagtgggggagaattacaggggaacaatgcttacatgggt
aatggctatggggatgctaatggaaacactggttatggaaatgctgcatggagatctgat
gggggacaagtaggttatacaggtggttatgccggtggacaagctcgacaagcccaacaa
cagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
