Entry |
|
Name |
(GenBank) glycoside hydrolase family 9 protein
|
Organism |
cmor Caldicellulosiruptor morganii
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
complement(2210023..2215743)
|
AA seq |
1906 aa
MRRFRKVSAMVVALIFILVMFTGVMPLQKAQAGAYNYGEALQKAIMFYEFQMSGKLPSWI
RNNWRGDSGLKDGQDNGLDLTGGWYDAGDHVKFNLPMSYTAAMLSWAVYEYKDAFVKSGQ
LDWILKQIEWANDYFVKCHPSKYVYYYQVGDGSKDHAWWGPAEVMQMERPSFKVTQSSPG
SAVVAETAASLAAASIVLRDTNPTKAATYLQHAKDLYEFAEVTKSDAGYTAANGYYNSWS
GFYDELSWAGAWLYLATNDSTYLSKAESYVQNWPKLQGSTTVDYKWAHCWDDVHNGAALL
LAKITGKDTYKQIIESNLDYWTTGYNGQRIRYTPKGLAWLDQWGSLRYATTQAFLAFVYS
DWSGCPASKKDTYRKFGESQIDYALGSAGRSFVVGFGTNPPKRPHHRTAHSSWADSMSIP
SYHRHTLYGALVGGPGSDDSYTDDISNYVNNEVACDYNAGFVGALAKMYLLYGGNPIPDF
KAIETPTNDEFFVEAGVNASGTNFLEIKAVVNNQSGWPARATDKLKFRYFVDLSELIKAG
YSASNVTLSTSYNQGAKVSGPYVWDASKNIYYVLVDFTGTLIYPGGQDKYKKEVQFRMAY
PQNVTWDSSNDFSYQDIRSVTSGQVVKTKYIALYDGDVKVWGLEPGAATSTPAPTATATP
TPTPTPTVTVTPTPTPTATPTPTVSVTPTPTPTPTGAPGTGSGLKVLYKNNETSASAASI
RPWFKIVNGGSSSVDLSRVKIRYWYTVDGDKPQSAVCDWAQIGASNVTFKFVKLSSAVSG
ADYYLEVGFSSGAGQLQPGKDTGDIQVRFNKNDWSNYNQADDWSWMQSMTNYGENTKVTL
YVDGVLVWGQEPGGATPAPTSTATPTPTPTVTSTPTPTPTPTATATPRPTSTPTPTPTPT
VSVMPTPAPTASPAGGSYWTPSESYGALKVWYANGNLSSTTNVLNPKIKIENVGTTAVDL
SRVKVRYWYTIDGEATQNVSVASSINPAYIDVKFVKLRANAGGADYYVEVGFKSGAGVLA
AGQSTKEIRLSIQKGSGSYNQSNDYSVRSVTSYIENEKVTGYIDDVLVWGKEPSRNAQIK
VWYANGNLSSTTNVLNPKIKIENVGTTAVDLSRVKVRYWYTIDGEATQSVSVASSINPAY
IDVKFVKLGANAGGADYYVEVGFKSGAGVLAAGQSTKEIRLSIQKSSGSYNQSNDYSVRS
VTSYIENEKVTGYIDDAIVWGKEPSRGTKPAGGVTPTPAPTPTATPTPTPTITPTPTPTP
TATTTPTPTPTPTSSSGLGVYGQRFMWLWNKIHDPANGYFNQDGIPYHSVETLICEAPDY
GHLTTSEAFSYYVWLEAVYGKLTGDWSKFKTAWDTLEKYMIPSAEDQPMGGYNPSKPATY
AGEWETPDKYPSPLEFDVPVGQDPLHSELVNTYGTQMMYGMHWLMDVDNWYGYGRRGDGV
SRASFINTFQRGPEESVWETVPHPSWETFKWGGPNGFLDLFIKDQNYAKQWRYTNAPDAD
ARAIQATYWAKEWAKQQGKLNEISSYVAKAAKMGDYLRYAMFDKYFKPLGCQDKYAAGAT
GYGSAHYLLSWYYAWGGALDGTWSWKIGCSHAHFGYQNPMAAWVLANDSDMKPKSPNGAN
DWAKSLKRQVEFYRWLQSAEGAIAGGATNSWNGRYEKYPAGTATFYGMAYEPNPVYHDPG
SNTWFGFQAWSMQRVAEYYYVTGDRDAGALLEKWVSWVKSVVKLNSDGTFAIPSTLDWSG
QPDTWNGTYTGNPNLHVKVVDYGTDLGITASLANALLYYSAATKKYGVFDEAAKNLAKEL
LDRMWNLYRDDKGLSAPEKRGDYKRFFEQEVYIPAGWTGKMPNGDVIKSGVKFIDIRSKY
KQDPDWQKLVSAYNAGQAPEFRYHRFWAQCDIAIANATYEILFGNQ |
NT seq |
5721 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgagacgtttcagaaaagtaagtgcgatggtggtagcgctcatttttattctggttatg
tttacgggcgttatgccattgcagaaggcacaggcgggtgcctacaattatggtgaagct
ttgcaaaaggctataatgttctatgaattccagatgtcaggtaaactgccaagctggata
agaaacaactggcgtggtgactctggacttaaagatgggcaagacaatggacttgattta
acaggtggctggtatgatgctggtgatcatgttaagtttaatttgccaatgtcatacaca
gcagcaatgttgtcgtgggcagtatatgaatacaaagatgcatttgttaaaagcggacaa
ttggactggatattgaaacagattgaatgggcaaacgactattttgtaaaatgtcatcca
agcaaatatgtttactactatcaagttggtgatggtagtaaagatcatgcgtggtgggga
ccggctgaagtaatgcagatggaaagaccttcattcaaagtgacacagagcagtcctggt
tcagcagtggttgctgaaacagcggcatcactggcggcagcgtcaatagttttaagggat
accaacccaacgaaggctgcaacatatttgcaacatgcaaaagatttatatgaatttgca
gaagtaacaaagagtgatgctgggtatactgctgcaaatggatattataactcatggagc
ggattttatgatgaactttcgtgggcaggcgcatggctgtatttagcaacaaatgatagc
acatatttaagtaaagctgagtcatatgttcaaaattggcctaaattacaaggtagcacc
actgtagattacaagtgggcacactgctgggatgatgtgcacaatggagctgcgctttta
ctggcaaaaataacaggcaaagatacttataaacagataattgagagcaatctggactac
tggacaacaggctacaacgggcagaggataagatatacacctaagggattggcatggttg
gatcagtggggttcattgagatatgccacaacacaggcatttctggcgtttgtatacagt
gactggagtggctgtccagcaagtaaaaaggatacttatagaaaatttggagaaagtcaa
atagattatgcactgggttctgctggaagaagctttgtagttggatttggcacaaatccg
ccaaagagaccacatcatagaactgcgcatagctcatgggcggatagcatgagcattcca
tcataccatagacatactctatatggtgctttggtaggtggacctggttctgatgacagt
tatacagatgacattagcaattatgttaacaatgaggtggcatgtgactacaacgcaggc
tttgttggtgcgcttgcaaagatgtatctattgtatggtggcaatcctattcctgatttc
aaagcaatagagacgccaacaaatgacgaattctttgtagaagcaggagttaatgcaagt
ggaactaacttccttgagataaaggctgttgttaacaatcagagtggttggccggcaaga
gcaacagacaaacttaaattcagatatttcgtagatttgagtgagctaattaaggctgga
tacagtgcaagcaatgtaactcttagcacaagctacaatcagggtgcaaaggtcagcgga
ccatatgtatgggatgcaagcaagaatatttactatgttctggttgactttacgggaaca
ctgatttatcctggtgggcaggacaagtacaagaaagaagttcaatttagaatggcatat
ccacaaaatgttacatgggattccagcaatgacttttcatatcaggatataagaagtgta
acatcgggtcaggttgtaaaaaccaagtatattgcactttatgatggagatgttaaggta
tggggtttagagccgggtgctgcaacatccacacctgcaccaacagcaacagcaacacca
actccgaccccaacaccgacggtgacagttaccccaacaccaacgccaaccgcgaccccg
acaccaacagtaagtgtaactccgacaccgaccccgacaccgacgggtgcacctggtacg
ggaagtggattgaaggtactgtacaagaacaatgagacgagtgcgagtgcggcatcaata
aggccatggtttaagatagtgaatggaggcagcagcagtgttgatcttagcagggttaag
ataagatactggtacacggtggatggtgacaagccgcagagtgcggtatgtgactgggca
cagataggagcaagcaatgtgacattcaagtttgtgaagctgagcagcgctgtgagtgga
gcggattattacttggaggtagggtttagcagtggagctgggcagctgcagcctggaaag
gacacaggggatatacaggtaaggtttaacaagaatgactggagcaattacaatcaggca
gacgactggtcatggatgcagagcatgacgaattatggagaaaatacgaaggtaacgctg
tatgtagatggagttctggtatgggggcaggagccgggaggagcgacacctgcaccgaca
agcacagcaacaccaacgccaacgccgacagtaacatcgacaccaactccaacacctaca
cctacagcgacagcaacgccaaggccgacatccacaccaacgccgaccccgacaccgaca
gtgagtgtaatgccaacaccagcaccgacggcatcaccggcaggtgggagttactggaca
ccgagtgagagttacggtgcgctgaaggtatggtatgcgaatggtaatttgagtagtacg
acgaatgtattgaatccgaagataaagatagagaatgtagggacgacggcggtagatctt
agcagggttaaggtaagatactggtacacgatagatggagaggcgacgcagaatgtaagt
gtagcaagcagcataaatcctgcatatatagatgtgaagtttgtgaagcttagggcgaat
gcaggcggagcggactattatgtagaggtaggttttaagagtggagcaggtgttttggca
gcgggtcagagcacgaaggagataaggctaagcatacagaagggcagcggcagctacaat
cagtcgaatgactattcggtaaggagtgtgacgagctatatagagaacgagaaggtaaca
gggtatatagatgatgtacttgtatggggcaaagagccgagcaggaacgcccagatcaag
gtatggtatgcgaatggtaatttgagtagtacgacgaatgtattgaatccgaagataaag
atagagaatgtagggacgacggcggtagatcttagcagggttaaggtaagatactggtac
acgatagatggagaggcgacgcagagtgtaagtgtagcaagcagcataaatcctgcatat
atagatgtgaagtttgtgaagcttggggcgaatgcaggcggagcggactattatgtagag
gtaggttttaagagtggagcaggtgttttggcagcgggtcagagcacgaaggagataagg
ctaagcatacagaagagcagtggcagctacaatcagtcaaatgactattcggtaagaagt
gtgacgagctatatagagaacgagaaggtaacagggtatatagatgatgcgatagtatgg
ggcaaagagccgagcaggggtacaaagccggcgggtggagtgacaccaaccccggcaccg
accccgacagcaacgccaactccgacacctacaattacaccaaccccgacaccgacgccg
acagcaacaactaccccaacacctactccgacaccgacatcgagcagtggacttggtgta
tacgggcagagatttatgtggttgtggaacaagatacatgatccggcaaacggctatttt
aaccaggacgggataccatatcattcagtggagacgttgatatgtgaggcacctgattat
ggacatttgacgacaagtgaagcattttcgtactatgtatggcttgaggcggtatatggg
aagttgacaggtgactggagcaagttcaagacggcatgggatacgcttgagaagtatatg
ataccatcagcagaggatcagccgatgggaggatacaatccgagcaagccagcgacatat
gcaggagaatgggagacaccggacaagtatccatcaccgcttgagtttgacgtaccggtt
gggcaggatcctttgcacagtgagctggttaacacatatggtacacagatgatgtatggg
atgcactggttgatggacgtagacaactggtatggatatggcaggagaggagatggagta
agcagagcatcatttatcaacacgttccagagagggccggaggagtctgtatgggagaca
gtgccacatccgagctgggagacatttaagtggggcggaccgaatggatttttggatctg
tttatcaaggatcagaattatgcgaagcaatggagatatactaatgcaccggatgcagat
gcgagggcaatacaggcgacatactgggcgaaggaatgggcaaagcaacagggcaagctc
aatgagataagcagctatgtagcgaaggcagcgaagatgggcgactatttgaggtatgcg
atgtttgacaagtatttcaagccattggggtgccaggacaagtacgcagctggtgcaaca
ggatatggaagtgcgcactatctgctgtcatggtactatgcatggggtggagctcttgac
gggacatggtcgtggaagataggttgtagccatgcgcactttggatatcaaaatccgatg
gcagcatgggtgttggctaatgatagtgatatgaagccgaagtcaccgaacggggcgaat
gactgggcgaagagcttgaagaggcaggtagaattttacagatggctgcaatcagctgag
ggagcgatagcaggcggagcgaccaattcatggaatggtagatatgagaagtatccggca
gggacagcgacattttatggtatggcatatgagccgaacccggtataccatgatcctggc
agcaacacatggtttggattccaggcatggtcgatgcagagggtagcagagtactactat
gtaacaggagacagggatgcaggagcattgcttgagaagtgggtaagctgggtaaagagt
gtagtgaagcttaacagtgatggtacatttgcgataccgtcgacacttgactggagcggc
cagccggatacatggaatgggacatatacgggcaatccaaatctgcatgtgaaggtagtg
gattatggaacagatttaggaataactgcatcacttgcgaatgcgcttttgtactacagt
gcggcgacgaagaagtacggagtatttgatgaagcagcgaagaatttggcgaaagagctg
cttgacaggatgtggaacttatacagggatgacaaaggtttgtcggcacccgagaagaga
ggggattacaagaggttctttgagcaagaggtatacattccagcgggctggacagggaag
atgccgaacggggatgtaataaagagtggagtgaagtttatagacataaggagcaagtac
aaacaggatcctgactggcagaagctggtttcagcatacaatgccgggcaggcaccggag
ttcaggtatcacagattctgggcacagtgtgacatagcaatcgccaatgcaacatatgaa
atcctgttcggtaatcagtaa |