Cucurbita moschata (crookneck pumpkin): 111452003
Help
Entry
111452003 CDS
T05248
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
cmos
Cucurbita moschata (crookneck pumpkin)
Pathway
cmos03015
mRNA surveillance pathway
cmos03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cmos00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
111452003
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
111452003
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
cmos03041
]
111452003
Spliceosome [BR:
cmos03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
111452003
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111452003
NCBI-ProteinID:
XP_022948284
UniProt:
A0A6J1G9F8
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
480 aa
AA seq
DB search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 seq
1443 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggtatgtacgatcaaggaggagacgctgctccttcgtcttacggagcccctgga
ggcggtggaggaggatacggcggcggagggtatggaggcggtggtggcggatatggtgga
aagggcggcgatggtggatatggcggcggaggccgaggcggcggcggtggtggtagagga
tatggaggacgaggtggtggcggaggctacggtgggcgaggaggcggtggtggtggtggc
tatcaaggaggagatcgtggagggcgaggtggtggacgtggtgggggaggtggtcgtggt
ggaagcgggagagatggcgattgggtctgccctaatcctggctgtgcgaatgtgaacttt
gctagaagagtggagtgtaacaagtgtggtacaccatcacctggtggtgccagtgacaga
agtggtggtggtggtagtggaggatataataggggtggagctgatgggggttatggtggt
aatcgtaatggcagaggcggtagttaccatggtggtagaagtggaaatcatgatggtggt
cgctatgaaggaggcaacagaggtggtaattcttatggtggtcaccagggaggagaggat
agcgggtacagtcaggttcctccatcatcagcccccccatctggtggtgttggtggctct
tatccaccatcttatcgtggtggaagtgcagattatggtacggatgcagttcctccgcct
gcaagctacagtggaactacctaccctccaacttatggtggtcccactggtggctatggc
agtgatggtataggtgatggacggagtgcgactggtcgtggtgggccgtcagctggatat
gatggtgcttacaatgcaggtggtaaaggtggtggttacaatgctggtggtagaggaggt
ggaagctataatgctggtggtggtagaggtggtggttatggaagtacaccagcagcagag
ccagcacaggtgaaacagtgcgacgaatcttgtgatgattcttgtgataactcaagaatc
tatgtttcgaatctgccaacagatgtgaccattgatgaattgagagaactatttggtggc
attggccaaattggaagaatcaagcagaagaggggctacaaggatcagtggccttggaac
ataaaaatatatacagatgagatgggaaataacaaaggcgatgcatgtgtatcatatgaa
gatccctcagcggcacattctgctggcggtttctataacaattatgatttgagaggtcat
agcatcaatgttgcaatggctgagaagtctgcaccgagggcgcctacatacaaccatggt
ggtggtggcagaggtggatatggaggtggtggtggtggtgatagacgtagagatagctat
agggacggaggctcaggacctgatagacatcagcatggtggaaatagatctcgtccttac
tga
DBGET
integrated database retrieval system
