Cucurbita moschata (crookneck pumpkin): 111456459
Help
Entry
111456459 CDS
T05248
Name
(RefSeq) ABC transporter C family member 4-like
Organism
cmos
Cucurbita moschata (crookneck pumpkin)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_16
AAA_29
AAA_21
RsgA_GTPase
DUF87
nSTAND1
MeaB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111456459
NCBI-ProteinID:
XP_022954091
UniProt:
A0A6J1GPX3
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1492 aa
AA seq
DB search
MGSASWLSSFSCTVVQSSKGAYPSTISQWLQFIFLSPCPQRALLSSIDLLFLLLVILFAA
QKLYSKFTAQERPGSDLNKLLIEKNRARLETTIWFKLSLILSVLFALICIVFCVLAFTTS
KQSQWKLTNGLFWLVHAVTHSVIAILIIHEKRFEAARHPLPLRIYWAANFVIVCLFTASG
IIRLVSAKETGEPNLRFNDIVFIVFLPLSMVLLYIAIDGLTGITMTRTVQDGEEFEPSNE
LNVTVYASASALSKLFWFWMNPLLKKGYVAPLVTDQVPSLSPEHRAAARLAIFESKWPKL
HERIEHPVRTTLIRCFWKDILFTGFLAVIRISVMFMGPALIQSFIDYTSGKRSSPYEGYY
LILSLMFAKFFEALTTHHFNFHSQKLGMLIRCTLITSIYKKGLKLSSSARQAHGIGQIVN
YMAVDAQQLSDMMLQLHAIWLTPFQVAITFALLYAYLRAAVAAAAVGLLAVFLFVFLTTK
NNNRFMMQLMMGRDSRMKATNEMLNNMRVIKFQAWEKHFQKRVLTFRGIEFKWLTKFMYS
VSATMLVMGSSPAVISTITFGFAILLGIRLDAGTVFTALSLFRLVQEPIRTFPQSLISLS
QAVISLGRLDRFMMSGELKEDSVEREEVCNNGIAVEVRDGSFSWEDEEGVVLKDLNFNVR
KGELTAVVGIVGSGKSSLLASVLGEMHKLSGRVRVCGTTAYVAQTSWIQNGTIEENILFG
LPMDRNRYREVIRVCCLEKDLEMMEFGDQTEIGERGINLSGGQKQRIQLARAVYQDCDVY
LLDDVFSAVDAHTGSEIFKECVRGILRDKTVMLVTHQVDFLHNVDLILVMRDGMIVQSGK
YSDLLSSGTDFEALVAAHETSMESVENSSAETVENRPLLRKSSSIDDENNAVDKPSPDKG
SSKLIQDEERETGRVGWEVYKVYCTEAFGWWGVAVVLGLAFAGQLSSMSSDYWLSYETSD
ENAESFDPSLFITVYAILACVSLVLVAFRSFGIILLGLRTATVFFSQILNCILHAPMSFF
DTTPSGRILSRASNDQTNIDLFIPIFMESSLVLYFAVFGIIVVICQYSWPTAFFLIPLGW
LNVWYRGYFLSSSRELTRLDAITKAPIIHHFSESITGVTTIRSFRKQELFCDENIKRVNA
NLCMDFYNNGSKEWLGFRLELLGSIFLCISALFMILLPSSIINPATVGLSLSYGLSLNSA
LFWAIYVSCFIENKMVSVERIKQFSIIPSEAAWRVEHKLPPPNWPTRGDVHLQDLLVRYR
PNTPLVLKGITLSIHGGEKIGVVGRTGSGKSTLVQVFFRLVEPSGGKIIVDGIDIGTLGL
HDLRSRFGTIPQEPVLFEGTVRSNVDPIGQYTDEEIWQSLERCQLKDVVAAKPDKLDASV
VANGDNWSVGQRQLLCLGRVMLKRSQLLFMDEATASVDSQTDAVIQKIIREDFATCTIIS
IAHRIPTVMDCDRVLVVDAGLAKEFDKPSKLLERPSLFGGLVQEYASRSTDL
NT seq
4479 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggttctgcttcgtggttatcatcgttctcttgcactgtggttcaatcttcaaaaggg
gcttatccttcaaccatttcccaatggctgcaattcatttttctatctccatgtcctcaa
agagcacttttatcctctattgaccttctatttctactccttgtcatattatttgcagct
caaaagctttattctaagtttactgcccaagaacggcccggctctgatttgaacaaactt
ctcatcgagaagaatagagctcgtctcgaaactacaatctggttcaaactctcattgatt
ttgagtgttctatttgccttgatttgcattgttttttgtgttctagcttttactacaagt
aaacaatcgcaatggaaattaaccaatggattattttggttagttcatgctgtaactcat
tcagtgattgctatcttgatcattcatgaaaagagatttgaagctgctaggcacccgtta
ccactccgcatttattgggctgcaaatttcgttatcgtttgtctctttactgcatctggg
attattcgtctcgtttctgccaaagaaactggggaacccaacttgaggttcaatgacatt
gttttcatagttttcttgccattgtcaatggttcttctttatattgccattgatggattg
accggcattacgatgacccgaacagtgcaagacggcgaggaatttgaaccctcaaacgaa
ttgaatgtgactgtctatgcttcagcttctgcactgtccaaattattctggttttggatg
aaccctttgcttaaaaaagggtatgtggcccctttagttactgaccaagtaccatccctt
tctccagaacacagggctgcagccaggctagcaatatttgaatcaaaatggcctaaacta
cacgagagaatcgagcatcctgtgcgaaccacattgattcggtgcttctggaaggacatt
ctcttcactggctttcttgcagttatccgtattagtgtcatgtttatgggacctgccctt
atccaaagttttattgattatacttctggaaaaagaagctccccttatgaagggtactac
ctcatattatccctcatgtttgctaaattttttgaagcgttaactactcatcacttcaac
ttccactcccagaagcttggaatgcttattcggtgtacccttattacttcgatatacaag
aaaggcctaaagctatcatcatctgccaggcaggctcatgggattggacagattgtaaac
tatatggctgtagatgcccagcaactttcagatatgatgctgcaattacatgctatatgg
ttgacaccatttcaagtagctataacctttgcgctcttgtatgcctatcttcgagctgcg
gttgctgctgcagcggtcggacttttggctgtctttttgtttgtttttcttactaccaag
aataacaataggttcatgatgcaattgatgatgggccgggattcaaggatgaaggcaaca
aacgagatgcttaacaatatgcgtgtgattaagttccaagcatgggagaaacattttcaa
aagcgagtcctaacttttcgtggtatagagtttaaatggcttaccaagttcatgtattca
gtatctgctactatgttggtgatggggagctctccagcggtgatatcaactattaccttt
ggctttgcaatcctcttaggcattcgactcgatgccgggacagtgtttacagctttgagt
ctcttcaggcttgtgcaggagcctattagaaccttccctcagtctttgatttcactgtca
caagcagtaatatcacttggaaggttagatcgtttcatgatgagtggggagttgaaggag
gattcagtggagagggaagaagtatgtaacaatggcatagcagtcgaggttcgagatggg
tcgtttagctgggaggacgaggagggtgtagttttgaaagatttaaattttaatgttagg
aaaggagagctcacagctgttgttggcattgtgggatctggaaaatcttctcttctggct
tcagttctaggcgagatgcataaactatctggaagggttcgggtatgtgggacaacggct
tacgtcgcccaaacttcatggatacagaatgggactattgaagagaacatattgtttggt
ttgccaatggacaggaacagatatagggaagtaatccgagtttgttgcctggaaaaggac
ttagaaatgatggaattcggagatcaaacggagattggtgaacgaggtattaatctaagt
ggcggtcagaaacagaggatacaacttgccagagctgtatatcaagattgcgacgtttat
ctccttgatgatgtgtttagtgctgtcgatgctcacacggggtcggaaatattcaaggag
tgtgtgagaggaattctcagagacaagactgtcatgcttgttactcaccaagttgatttc
ttgcacaatgtggatcttatcttagtaatgcgtgacgggatgattgtgcaatcggggaag
tatagtgatttattaagctccggaacagatttcgaggcgttggttgctgcacacgaaacc
tccatggaaagtgtggaaaacagcagtgctgaaacagttgaaaaccgtcccctactacga
aaatcttcatcgattgatgatgaaaacaatgctgttgataagccaagcccagataagggt
tcttctaagctcatccaagatgaagagagggaaacaggaagagttggttgggaagtctac
aaagtttactgcacagaggcctttggatggtggggtgtggccgtcgtgttgggactagct
ttcgcagggcaattgtcgtctatgtctagtgattactggctctcatacgaaacttcggac
gaaaatgccgaatcatttgatccctcgcttttcattaccgtctatgccatactcgcttgt
gtttcattggtgttggtggctttcagatcctttggcattatattgttggggcttaggaca
gccactgttttcttctcacaaattctcaattgcattctacatgctcccatgtcgtttttc
gacactacaccttcaggaaggatactaagtcgggcatcaaatgatcagaccaacatcgat
ttgttcatccccattttcatggaaagtagtctggtcctgtactttgctgtgttcggtata
atcgtcgttatatgtcaatattcttggcctacagctttcttccttattccacttggctgg
cttaacgtgtggtaccggggctatttcctttcatcatctcgtgagctaactcgcctggac
gccatcacaaaagcacctattattcaccacttttcagaaagcataaccggagtaacgacg
atacgttcttttagaaaacaagagctattttgcgacgagaatatcaaacgggtcaatgcc
aatttatgcatggatttctacaataatggatctaaggagtggttgggtttccgtttggag
ctgcttggaagtatcttcctctgtatatctgctttgttcatgatcttattaccaagcagt
attataaatccagcaactgttggtttatcactttcatatggattatccttgaatagtgcg
ttgttctgggccatttatgtgagttgcttcattgagaacaaaatggtttctgttgagaga
ataaagcagttctccataataccctctgaagcagcatggagggttgaacacaaacttcct
cctccaaactggcctacccgtggtgatgttcatctgcaagacctgctggtgcgatatcgc
ccaaacactccgttggttctcaagggtatcactctaagcattcatgggggagaaaagatt
ggagttgttggcagaacaggaagtggaaaatcaactctagtccaagtcttctttaggctt
gttgaaccttcgggagggaaaataatcgtcgatggcatcgacataggcacgcttgggctt
catgatcttcgctcacggttcgggaccattccccaagaaccggttctttttgaaggaact
gtgagaagcaacgtcgatccaattggccagtataccgatgaagaaatatggcagagtctt
gagagatgccaacttaaagacgttgtagctgcaaaacccgacaaactcgatgcatcagtg
gttgctaatggagacaattggagtgtggggcagagacagcttctctgtttaggaagggtc
atgttaaagcgtagccagcttttgttcatggacgaggcgacagcttcagttgattcacaa
accgacgctgtgattcaaaagatcatccgagaggacttcgcgacgtgtacgattatcagc
attgctcacagaattccaacagttatggactgtgatagagttttggttgtagatgcagga
cttgctaaagagtttgacaagccatctaagctgctggagaggccgtcgctattcggggga
ttggttcaagagtatgctagccgctccactgacttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
