Cucurbita moschata (crookneck pumpkin): 111461191
Help
Entry
111461191 CDS
T05248
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At5g16860
Organism
cmos
Cucurbita moschata (crookneck pumpkin)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
DYW_deaminase
PPR_3
E_motif
PPR_long
Eplus_motif
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111461191
NCBI-ProteinID:
XP_022960463
UniProt:
A0A6J1H912
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
822 aa
AA seq
DB search
MSFLKQCRTLIDAKLVHQQILVNGFTDLVTHAIGGYIECNAFGQAVSLLERLVPSHSTVF
WWNALIRRSVRLGFLDDALCFYRQMQRLGWWPDHYTFPFVLKACGEKLSFRCGTSVHAMV
CAYGFESNVFICNSVVAMYGRCGALDDARQVFDEVLERKIDDIVSWNSILAAYVQGGESK
AALRIAFQMAKHYNFKLRPDAITLVNVLPACASTFATQHGRQVHGFAVRSGLVDDVFVGN
ALVDMYAKCSKMNEANKVFEQMKEKDVVSWNALVTGYSQIGSFDDALSLFKRMQEEDIEL
NVVTWSAVIAGYSQRGHGCEALDVFRQMQHCGLEPNVVTLVSLLSGCASVGALLHGKQTH
AYAIKNILNLDWSDPGDDMMVFNGLIDMYAKCKSSRVARNIFDSIIGKDKNVVTWTVMIG
GYAQHGEANDAVELFSQMFKQETSLKPNAFTLSCALMACARLGALRLGKQIHAYALRHEN
ESEVLHVANCLIDMYSKSGDIDAAQIVFDNMKVRNAVSWTSLMTGYGIHGRGEEALRVFN
QMRQVGLSVDGVTFLVVLYACSHSGMVDQGMNYFHGMVKYFGVAPGAEHYACMVDLLGRA
GRLNEAMELIKSMPMEPTPVVWVALLSASRTHANVELGEYAASKLMESGAENDGSYTLLS
NLYANARRWKDVARIRRLMKHTGIKKRPGCSWVQGKKSTTTFFVGDKSHPQSDQIYNILS
DLIQRIKDMGYVPQTSFALHDVDDEEKGDLLFEHSEKLAVAYGILTSAPGQPIRINKNLR
ICGDCHSALTYISMIIEHEIILRDSSRFHHFKKGSCSCRGYW
NT seq
2469 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccttcctgaaacaatgtagaacgttgatcgatgcaaagcttgttcaccagcaaatt
ttggttaatggcttcactgatttggttacacacgccattggaggctacattgagtgcaat
gcatttggacaagctgtatcgctccttgaacgtctcgttccatctcattccaccgttttt
tggtggaatgcgctgattcgacgctctgtgaggcttggttttcttgatgatgcattgtgt
ttttatcgtcagatgcagagacttgggtggtggcctgaccattacacctttccatttgtt
ctcaaagcttgtggtgagaaattgtcatttagatgtggtacctcagttcacgccatggtt
tgtgcttatgggtttgagtcaaatgtatttatttgtaattctgttgtggcaatgtatggg
agatgtggggcattggatgatgcacgccaagtgtttgatgaggtgcttgaaagaaagata
gatgacattgtgtcttggaattcaattcttgctgcttatgtacaaggtggggagtcaaaa
gctgccctcagaattgcctttcaaatggctaagcactacaatttcaaacttcgcccagat
gctattacgcttgtcaatgttcttcctgcatgtgcatcaacatttgcgactcaacatggc
aggcaggtacatggatttgcggttcggagtggattggtggatgatgtgtttgtaggcaat
gctcttgtggatatgtatgctaaatgctcgaagatgaatgaggcaaacaaggtgtttgag
cagatgaaggagaaggatgtggtttcttggaatgctttggtaactggctattctcagatt
ggtagctttgatgatgctctctccttgtttaagaggatgcaagaggaagatattgagtta
aatgtggtaacatggagtgctgtgattgctggctattctcaaagggggcatggttgtgaa
gcccttgatgtattcaggcaaatgcaacactgtgggttggagccaaatgttgttactctt
gtgtctcttctttcaggttgtgcttctgtgggagcattgcttcatggaaagcaaacacat
gcatatgccataaaaaatattctcaacttggattggagtgatcctggagatgacatgatg
gtttttaatggcctaattgatatgtatgctaaatgcaaaagctcgagagttgctcgcaat
atttttgactcgataataggaaaggacaagaacgtggtgacttggactgtcatgattggt
gggtatgctcagcatggcgaagccaatgatgcagtagaacttttctctcagatgttcaag
caggagacctctttaaagcctaatgccttcactctatcttgtgccttgatggcttgtgca
cgtttgggtgcattaaggcttggaaaacaaatccatgcctatgctttgcgtcatgaaaat
gagtctgaggttttacatgtagctaattgccttatagacatgtattccaaatcaggggac
attgatgctgctcagatcgtattcgacaacatgaaggtacgaaatgctgtttcttggaca
tccttgatgacaggttacggtatccatggtcgtggtgaagaagctctacgtgtttttaat
caaatgcggcaagttggtctttcagttgatggggtaacctttcttgtcgttctttatgct
tgtagccactctggaatggtggatcaaggcatgaactacttccatggtatggtcaagtac
tttggggttgcacctggagccgaacattatgcatgtatggttgatctcttgggccgtgca
ggtcgtctcaatgaagcaatggaactcattaaaagcatgccaatggaaccgaccccagtt
gtatgggtggctctactaagtgccagcagaacccatgctaatgtcgagcttggggaatat
gcagcaagcaaattgatggaatctggggcggagaatgatggttcatacacattactttcg
aacttgtatgcgaatgcgcgacgttggaaagatgtagctagaatccgaagattgatgaaa
catactgggatcaaaaagaggccgggatgtagttgggtacaaggcaagaaaagcactaca
accttctttgtgggtgataaaagtcatccacaatcagaccaaatatacaacattctctcc
gatttgattcaacgcatcaaggacatggggtacgttcctcaaacaagctttgctcttcat
gacgttgacgacgaggagaaaggcgatctcttgtttgagcatagcgagaagttggctgtt
gcatatgggatcttaacatcagctccaggacaacccattcgaataaacaagaacttgcgc
atatgcggtgattgccacagtgccttaacctacatttccatgattattgaacacgagatc
atattgagagattccagtaggtttcatcatttcaagaaaggctcctgctcttgtagaggc
tattggtga
DBGET
integrated database retrieval system
