Chamaesiphon minutus: Cha6605_4103
Help
Entry
Cha6605_4103 CDS
T02414
Name
(GenBank) WD40 repeat-containing protein
Organism
cmp
Chamaesiphon minutus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
WD40
ANAPC4_WD40
NBCH_WD40
RMC1_N
Ge1_WD40
eIF2A
PROPPIN
Nup160
WDR54
NB-ARC
AAA_22
ATPase_2
Nucleoporin_N
AAA_16
Cytochrom_D1
NACHT
IstB_IS21
IKI3
Pentapeptide
Dpy-30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY95054
UniProt:
K9ULH5
LinkDB
All DBs
Position
complement(4309598..4313263)
Genome browser
AA seq
1221 aa
AA seq
DB search
MDTQQALAVVDALVFTKKGKYLSDVQRLLLDSSLSDPRLRYDDIAKTHGYSLNYLKQDVG
PKLWQMLSEVCGEKVSKTNFRAALERQCDRVNLQSIAVVSPIAATDKLVETPAASTQTIV
KASPIVRPNPIVEPHRYRDWSDAPDVSIFYNRIEELATLERWIVSDSCRLVVLLGMGGIG
KTHLSIKLAERIDRHFQYSIWRSLLPAPPLSELVLDLLRSLTQGTNDTLPIRLEEQISLL
INIFKQTRCLLILDNADTLLRSGTIAGQYQEDYENYRTFFQRVGECNHQSCLLLTTREQP
QEIALMQGDVLPVRSMRLAGLTFQAGQQLLQLRGCFLESESSLQATIDNYGGNPLALKIV
SAIAADLYNGNISEFIKSKSLICREISDILDQQFNRLRDSEKTFLYWLALEQRSLEKSEF
CLGSYPGNSTSKTIETIQSLLHRSLLEKKNNKFFLQPVVREYLQNKTIEQIIEEIEHESI
LLLNLYPLLKSKAKEYLKQIQIKLIIKPLLARLLTRYKSADKIYLKFQKILVSLREHQTL
EPGYAAGNIINLLCQLQVEIAGADFSYLIVRSGCLQKTNLQNVNFAHADLTESVFAKQLT
SILALAYSPNGKLLATGDVNGQIYLWDIATGEPILCCTGHAGWVHGLAFSHDGKMLASAS
SDLTVKLWDTFDGSCLRTFTGHHQRVRAIAFSPDSQSIASGSSDATIRLWDTRSGKCLKI
LSGHQSYIWSVAFSPDGTTIASGSEDKSVRLWNLATGECRQIFAEHQLWVRTIAWSPDGK
LIASGSGDRTVKVWEIETGKCVSTLTGHTQRVRSIAFSPDGKLLASGSGDRTVRLWSVTD
GQCLKTLHGHNSLLTSVAFSPDGTNLATGGEDRSVRLWEVSTGSCIDIWQGYGSWIQSIA
FSPDGKTLANGSEDKTIRLWQLADARTSATSRNSLTLTGHQGWVCSVAFSPDGKYLASGS
SDYTIKLWDVGTGQCLKTLQGHTRWVGAVAFSPSGLTLASCGGDCTIVLWDIITGNCIQV
LEGHTGWLWSVQFSPDGRLLASASEDKTIKLWDLQSGKCTHTLSGHTSWVQGISFSPDGK
LLASASCDCTIRLWDVATGECVNSLQGHTSWVQSVAFSPDSKILASGSCDRTVKLWNPNT
GKCQQTIPAHQSWVWSVVFSPNGKIVASGGQDETIQLWDLKLGKCIERLRTKRPYEGMCI
TGAKGLTAMQREALKFLGAVE
NT seq
3666 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacacccaacaagctttagctgttgtagacgctttggtgtttacaaaaaaaggtaag
tatctgagcgacgtgcaaaggctcttgctggattcgtctttatcagatccgcgtctgcgc
tacgatgatatcgccaaaacccacggttattcgctcaattatctcaagcaagatgtgggt
ccgaaattatggcagatgctgtcggaagtgtgtggtgaaaaagtgagtaaaactaatttt
cgagcggctttggagcgacaatgcgatcgcgtaaatctgcaatcgatcgccgtagtatcg
ccgatcgctgctaccgataaactagtagaaacgccagcagcatcgactcagacaatagtg
aaggcatcgccaatcgtccgcccaaacccgatcgtggagccacacagataccgagattgg
agcgatgcacccgacgtgtccattttctacaatcggattgaggaattggcaaccttagaa
cgatggatcgtcagcgatagctgtcgattggtggtgttattaggcatggggggaattggc
aaaactcatttgagcatcaagttagccgaacgaatcgatcgccattttcaatattcgatc
tggcgatcgctactacccgcaccacctttatcagaactggtactcgatttgctcagatct
ttgactcaaggaacgaacgatactttacccatcagactagaagagcaaatttcgctactg
attaatattttcaaacaaactcgatgtctattaattttagataatgccgatacactttta
agaagtggtacgattgccggacaatatcaagaagattacgaaaattaccggacatttttt
caacgagtcggcgaatgtaaccatcagagttgcttgctgctaaccacccgcgaacagccg
caagaaatcgctttaatgcagggtgatgtattgcccgtgcgctctatgagattagctggc
ttaacttttcaagccggacagcagctactacagttgcgaggctgctttctagaatcagaa
tcatctttacaagcgacgatcgacaactatggcggcaatcccctagctctgaaaattgtt
tcagcgatcgccgcagatttatataatggcaatatttccgaatttattaaaagcaaatca
ttaatttgtcgagagattagtgacattttagaccagcaatttaatcgattgcgagactct
gaaaaaacattcttgtactggttggcattagaacaacgatcgcttgagaagagtgaattt
tgtttaggaagctatccaggaaactcaactagcaaaacaattgaaactattcaatcactg
ttgcatcgttctttattagaaaagaagaataacaaattctttttacagcctgtagttaga
gaatatttgcaaaataagacgatcgagcaaattattgaagagatagagcatgagagcatt
ttgcttttaaatttatatcctttgctaaaatctaaagccaaagaatatctcaagcaaatt
caaattaaactaattatcaaaccattattagcacgactgctaactagatataaaagtgct
gataaaatttatcttaaatttcaaaaaattctggtgagtttgcgagaacatcaaacctta
gagccagggtatgcggctggaaatattatcaatctcttatgtcagcttcaagtcgagatc
gctggcgcagacttttcctatctaattgtccgctctggctgtctccaaaaaactaatctc
caaaatgtcaactttgctcatgcagatctaaccgaatcggtatttgctaagcaattaact
agcattttagccctagcgtatagtcccaacggcaaattactagccacaggagatgtgaat
gggcaaatttatctgtgggacattgccacaggcgagccgatcctctgttgtacgggacat
gcaggctgggtacatggcctcgcgttcagtcacgatggcaaaatgctcgctagtgctagc
agcgacctgacggtgaaattatgggatacattcgatgggagttgtttgcgaaccttcacc
ggacaccatcaacgagtccgagcgatcgcctttagtcccgatagccaatcgatcgccagc
ggcagcagcgacgccacaattcgactgtgggatactcgcagtggtaaatgtctaaaaatt
ttgtcaggacatcaaagctatatctggtcggtggctttctccccggatggcactactatc
gccagcgggagtgaagataagagcgtaagactgtggaatctagccacgggtgaatgtcgg
cagatatttgccgaacatcaactgtgggtgcggacgatcgcctggagtcccgatggtaag
ctcatcgctagtggcagtggcgatcgcacggtcaaagtttgggagatcgaaacgggtaaa
tgtgtgagtaccttgaccggacatactcaaagagtgcgctcgatcgcctttagtcctgat
ggtaaactactagctagcggtagcggcgatcgcacggtcagactgtggagtgtcaccgac
ggacaatgcctcaaaacgctccacggtcacaatagcctcttaacctcagtcgcttttagt
cccgatggcacaaatctagccactggcggcgaagatcgctccgtgcgcttgtgggaagtc
agcacgggtagctgcatcgatatttggcaaggttatggtagctggattcaatcgatcgcc
tttagtcccgacggcaaaacgctcgccaatggtagcgaagataaaaccatccgcctctgg
cagcttgcagacgcacgaacttcggcaacttcgcgtaattccctgaccttaaccggacat
caaggttgggtatgttcggtggcatttagcccagatggtaaatatctagccagtggcagt
agcgattatacgatcaaattatgggatgtcgggacgggtcaatgtctcaaaaccttgcag
ggacatacccgttgggttggtgccgtggcatttagtccatcgggactcaccctcgcaagc
tgtggcggcgactgtacgatcgtcttgtgggatatcattaccggaaactgcatccaagtt
ctggagggacacacggggtggttgtggtctgtccagtttagccctgacggtcgcctgcta
gctagtgcttctgaagacaaaaccattaaattgtgggatttgcagagcggtaaatgcacc
cacaccttaagcggacatactagctgggtgcaaggaatttcgtttagtcctgatggcaag
ctgttagctagtgccagttgcgattgtacgattcggttgtgggatgtggcgacgggagaa
tgtgtgaatagcttgcagggacacacgagctgggtgcaatcagtcgcatttagccccgat
agcaaaatcttagctagcggtagttgcgatcggactgtgaaactgtggaaccccaatacg
ggcaaatgtcaacaaacaattcccgctcatcagagttgggtgtggtcggtggtatttagt
cccaatggcaaaatagtcgctagcggcggtcaagatgaaaccattcaactatgggatctc
aaactcggcaaatgtatcgagcgattgcgaaccaagcgaccttatgaagggatgtgtatc
actggtgccaaaggtttgacggccatgcagcgagaagctttgaagtttttaggtgcggta
gagtag
DBGET
integrated database retrieval system