Cyclobacterium marinum: Cycma_3256
Help
Entry
Cycma_3256 CDS
T01592
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain-containing protein
Organism
cmr
Cyclobacterium marinum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_14
LRR_1
LRR_8
LRR_4
LRR_ComC
fn3
DUF6443
Ig_2
Ig_3
LRR_LRWD1
I-set
RHS_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEL26984
UniProt:
G0J7N1
LinkDB
All DBs
Position
3825271..3834558
Genome browser
AA seq
3095 aa
AA seq
DB search
MKSVKKSGKQMSWPVLVTIVLFILGLATFSSARHGGMLYDLYPNLVAPSSLRALAAGHDK
VRVSWHGILPEGTDYEVERRNGSGSFVKIGETENDTTVYIDEGLSSGIEYFYRVRAVSGP
TYSPYSVESRVLLDPLTSHIPEDVKFGANGRNTYEPVESYTHTWDLLIENSDYPVFDPLS
CAMGTYYVGFELSYDLGDTDTEAIWDTGLEIRLEYDQTVLWTKPLYLNSGEQTFLGNVFH
EEAIECDQDYRFVLTQVSENGVVPDANVRLSVQLYKKFDESFSPGAPTSLSVQTNLGKAL
ISWDHSTDLTRDYELEWVFIASHEAFTGTTANEAFSYKEPVRINTRKKDFSHHLYYPEGK
VWYRVRAVGYEVDYPEHRIPGAWAYGSDAGLAVSNQEGEINWQLKTVFAEDGMHKSAVSY
MDGSLRQRQQITHLDSEELALVGESHFDFEGRPSIQVLPVPAPTADLGYREAFSPFLATT
SEITNNTSTSRIKFHYDNGGLENSPLAATSGAGQYFSPSNTVGGIHRDYIPDAEGFAYSQ
TEYTNDGTGRVRKQSGVGESFRTDGDHSTRFYYGDAAQEELIRLFGVNVGRASHYAKEMT
VDPNSQVSISYKDQEGRVVATALGGNPPKNIIDPIEIYSRNEAEMDNLAPRPAPGQDSKT
SKNTVLANNTTYDKDSIDLAETIAYVAKLDSLEEIRQAEEIEALFQLQEQTEPEAGKLSK
ETTPQLGLMNLPMPTQVEYDALMALYQSTNGANWTNNTGWRDADPMVLQSVQGWSGVTIT
GVGSVVELDLKNNNLTGTLPNEIGDLTNLKVLGIHENSLSGSIPASIGSLTELTYLNLSQ
DSLSGSIPDSLGNLTNLTYLSLRNNGFTGAIPESLGNLNKLDQLYLSTNTLTGSIPDTLA
SLINLKALYLFSNNLTGQIPSVLGDLTALEEFRVGSNSLTGSIPETFGNLINLEQLHMDK
NQLSGEIPSSIGNLENLVGMNLSTNNLTGQIPVSIGNLNKLTDLRLNVNHLSGNIPFSLG
NLDKLDRLVLDRNELIGSIPGTIGNMSTLRVLYLYNNKLTGTIPASLGNLTKLQNIAMFG
NEMEGIIPETLGNLTLLKELRLETNQFTGTLPASIGEISSLENVSFRGNNLHGPVPNTYQ
NPNLNPTTFDVRYNYFDMESLLTLKDVFPSPSNTYNPQYGIDIYQGIHLTVGDDLQLQVP
EEYQIDDPGISYRWYKYSTAVSAQGANELTYSQNALGKYDGGNFTYRIYHEDLPGFYLFS
QVKQVTMEEPGWKALTVNLDSYNRREGNEMRVNKTILNTVPGTEFNFSYALKGLGVELDS
LGCQDCELELFIQLIDPDGIPVNLGSIAGNTVNDSLSYQNNYSVSQCTVPAISLENLVTE
EIFLAELGEYTLVKKLKMLSPSVETVRSQIVASTEYIDAIATLDSMYVDYGDCLLCKDPE
VCEEQDGATKEAIQDIIAAECDNILQRIIGELDPGYTEQDIINHPDYCEYTYCLSHQEAA
EFEMRMLLVSGWEAAGQTYQLAIGPEEMDPYYNNPEMAGIGSAGDVRALLNNIQVGFYTG
TLLEVTDPDNLGMYADPAGNPDTTGYHMLYANLQQKRSELGETWYAENLDEQRWQLFRNY
YFEASRRVKVTLDSVQSCPAVLEGLSVLDELPENEEGIEAYIAASGFLAPIDSIQLLPVF
EMVLDGCGEEFSDADQDSIYVNLEAYFNANRADNIFNWILEEDLETNYYLGRVNEILSAH
SCSLEDYAQESRMVCVRDTVIYPAAQAQFWDNSLYRGDFEMTRANLLESMEAIGDSTNQS
KQKKSGMVQMMSAVFPGYSEYNALFTLYNATDGDNWYNNYGWVDADPFTPEDVTVWTPPV
TTDGNGNITGISLAHNNLTGQIPTQISTFSSLENLFLDGNNLTGSIPSSMGSLTSLINLD
LSENDFTGTLPSSFSSLTNLLYLRIYDNELQGPIPFGPPSASFNLDASLNRFTFTDLLPF
KNNFLSSASYSGQDLVDVAKNINKLAGQSHVFTTNIDRDTSPKSEYQWFKNGVALNSRDT
ASHTLNLSGLSSGDAGDYYYKIWNSDLPGLELTSRIQTLNMTQTGGVWKCLEREVLDPSM
NGSGPTVTSSASMFFYSPDWEAVLDSCMADKAARASSLKELAASKMLDRRIEEYYANFDR
SCLELTEESLSYTYIPKEYHYTLYYYDQAGSLVQTVPPAGVQPLSGEQVTSVKGGTAIHP
YHRLETRYQYNSRNQLIWQDSPDGGVSRFWYNKAGQLRLSQNAKQTVDDLYSYTRYDKQG
RVIETGEIYSTEPIDTLQVNLEELTFPDCGTYGCGDVTLTVYDRAGLPRDPTFAQEYLRS
RVSWTAMVEKNSTDTIFTYYSYDPHGNVKALLQDLPGIGPKRTEYVYDLVSGNVNQVHYQ
KGYSDQLIHRYRYDADNRLEEVQTSTDGLVWNRDAAYYYYPHGPLARVELGEYNVQGMDY
YYTLQGWLKGVNMPMEGDPGGDGVGGFRTGTDAFSFALGYYEGDYKPINPSVTISDSRDQ
LWDHYKDTRDTISATGLYNGNISWMSTDLPSLGDPDRMQAMVYGYDQLHRIVQARSLTSS
ETTGFVQRSYNPENPNKYDADYSYDPNGNLLTLQRRDETTIRDDLTYKYYDFSNKLKNVD
GTDTENYTYDEIGNLVSDNAEGIDSIAWTPYGKVRAVFKDDSSQVRFRYDASGNRIAKIT
ETDTTIYARDASGNVMAVYRNDTLTEQSIYGSSRLGLINYASKTAYRSLGGKKYELSNHL
GNVLAVVSDNIHLDQDSTWASVVNITDYYPFGLAMDGRSVQDSTYRYGFNGLEGDDEING
PKKSYTTEFRQYDPVVGRWWGVDALTGQMPDWSPYNFGFNSPLRYVDPTGLAPDDWVKDK
DGNVRWRENVNSAEDIDPLSGDTYLGKSGVGLDESSGNTQFFNSDGTIDEGVRSMAEFTV
TASATSHGKVMSNPVVKDMKANSARIRSEALPFARHMTRSTIDGIGYTGAGISAVGTAVT
PFIPHLGVGLLAVGGSVSTISGVASATMNFAEGDISGGFGDVGMMVVGKYGSTLIKNMRN
RRRIINWTEQVVLESTLESSLNIADGIRANLQDKK
NT seq
9288 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcggtaaagaaatcaggaaagcaaatgagttggccagtactagtcactattgtg
ctatttattttgggcctggctactttttcctcagctcggcatggggggatgctttatgac
ttgtatccaaaccttgttgcaccttcaagtctgagagcacttgccgcgggacatgataaa
gtaagggtttcatggcatggcatactacctgaaggtaccgattatgaagtggaacggaga
aatggaagtggtagttttgtcaaaatcggagaaaccgagaatgacactactgtttatata
gatgaaggactttcttccgggattgaatacttttaccgcgtcagagcggtttctggcccc
acttattctccttacagtgtggaatctagggttttacttgatccactaacttcacatatt
cctgaagatgtcaaattcggggcaaatggtagaaatacctatgaaccggtagaaagctat
acccatacttgggacttgttaattgaaaattcggattacccagtattcgatccgctttca
tgtgcaatgggaacgtattatgtgggctttgagctttcatatgatttgggagatactgat
acagaggccatttgggatacaggtctcgaaatccgtctggaatacgatcagacggtactt
tggaccaaaccgctttacttaaattccggagaacagacttttttggggaatgtgtttcat
gaagaagccatcgaatgtgaccaggattatcgctttgtcctgacccaggtgtctgaaaat
ggtgtcgtaccagatgcaaacgtcaggctttctgttcagctttataagaaattcgatgag
agcttcagtccaggagcacccacttccctgtcagttcagaccaatctagggaaggcattg
ataagttgggatcattctactgacctcacacgtgactatgaacttgagtgggtgtttatt
gcttctcatgaagcctttacgggaactacggctaatgaggccttttcatataaggagcct
gtccgtattaatactagaaagaaagatttcagtcaccacttatattatcctgaaggcaaa
gtctggtaccgggtaagggctgttggctatgaggtagactaccctgagcatagaattcca
ggtgcctgggcttatggttcagatgccggacttgccgtttctaatcaagaaggtgaaata
aattggcaattaaaaacagtgtttgcagaggacggcatgcataagagtgccgtttcttat
atggatggatcacttcgccaaaggcaacagataactcatttggacagcgaagaactggca
ctagtaggtgaaagccattttgattttgaaggaaggccttcaatccaagttttacctgtt
cctgctcccacggctgacttaggatatagggaagcatttagtcccttcttggctacaact
tcagaaattactaacaatacttctaccagccgaattaaattccattatgacaatggaggt
ttggaaaacagtccgcttgctgcaacctcaggtgcaggtcaatatttttccccttccaac
actgttggtggaattcaccgggattatattcctgatgccgaaggatttgcctacagtcag
actgaatataccaacgatggtacgggcagggtacggaaacagtcaggagttggagaatct
tttcgtaccgatggcgatcacagcacacgtttctattatggagacgctgcccaggaagaa
ctaattcgactttttggagtgaatgtaggcagagcatctcactatgcgaaagagatgact
gtagatcctaatagtcaagtaagtattagctataaagaccaagaaggaagagttgtagct
actgcacttgggggaaaccctccgaagaacattattgatcctattgaaatttattctcgc
aatgaagcagaaatggataatttagcacccagaccagcacctggtcaggatagcaagact
tcgaaaaatactgttttagctaacaatacaacatatgacaaagacagtatcgatctggca
gaaacaattgcctatgtagctaagttggattcactggaagaaattcggcaagcagaagaa
atagaggcattgtttcaacttcaagagcaaaccgaaccagaggcaggtaaactttcaaaa
gaaacaactccacaacttgggttaatgaatttacctatgcctactcaagtcgaatatgat
gcattgatggcattatatcagagtaccaatggagcaaattggacgaataatacaggttgg
cgtgatgccgatccaatggttttacaaagtgtgcaagggtggagtggagtgacgatcaca
ggagtaggaagtgtagttgaacttgatttaaaaaataataatttaacaggtaccttacca
aatgaaattggagatcttaccaaccttaaagtattaggaattcatgaaaattctctttct
ggaagtattccagcatcaataggaagcttgactgaattgacctacttgaatctttctcag
gactctttgtcaggttctattcccgattcgctcggtaatctgacaaaccttacctatctg
tcccttcggaataacggatttactggggctattcccgaatcgcttgggaatcttaataag
cttgaccaactctatttaagtacaaacactttgactggatccataccagacacattggca
agccttattaatcttaaggccctttacttatttagtaacaatctaactggacaaatcccc
tctgttttgggggatcttacagctcttgaggaattccgagtcggttcaaattctctgaca
ggttctattccggaaacttttggaaatttgataaatttggaacagctccatatggacaag
aaccagttaagtggagaaattcccagctcaataggtaatctggaaaatcttgttggtatg
aacttatcgaccaataacctcacaggtcaaataccagttagtattggaaatcttaacaag
cttacggatttgagattgaacgttaaccatctatcgggtaatatccccttttccttggga
aaccttgataaattggacagacttgtacttgatagaaatgaactgatagggtctattcca
ggaaccataggaaatatgtctaccctacgggttctttacctatataataacaaacttaca
ggtactattcctgcaagtttaggtaatctaaccaagcttcaaaacatcgccatgtttggc
aatgaaatggagggaatcattcctgagaccctaggaaatctcacgctattgaaggaatta
aggcttgaaaccaatcaatttactggtacattacccgcaagtattggggaaatatcaagt
cttgaaaatgtatctttcaggggaaacaatttacacggtccggtgccaaatacctatcaa
aatccgaatctgaatcctacaacttttgatgtcaggtacaattattttgacatggaatcc
ttgcttaccctaaaagatgtgtttccatctcctagtaatacttacaatccgcaatatggt
atcgatatttatcaggggattcatctgactgttggggatgatttgcaattgcaagtaccg
gaagagtaccagatagatgatcctggaatttcatacaggtggtacaaatatagcacagca
gtatccgctcagggggcaaatgaacttacctactcccaaaatgcgcttgggaaatatgat
ggtggtaactttacttatagaatataccatgaggacttgcctgggttttacctttttagt
caagttaagcaagtaaccatggaagaacccggttggaaagcccttacagttaacttagat
tcctataatcgaagggaaggaaatgagatgagggtaaacaaaaccattctcaataccgta
cctggaacggaatttaatttttcctacgccttgaaaggtttgggtgtagaattggatagt
ttggggtgtcaagattgtgaactagagttgtttatccagttaattgatccggatggaatt
ccggtaaatctgggatccatagcaggaaatacagtgaacgattcacttagctatcagaac
aattattccgtatctcagtgcactgttcctgcgattagtcttgaaaacttggtgactgaa
gaaatttttcttgctgagcttggtgaatatacgcttgttaaaaaattgaagatgctaagt
ccatcagtggaaactgtcagaagtcagatagttgcttcaacagaatacatagatgccatc
gcaacattagacagcatgtatgtggattatggtgattgtctcttgtgtaaggatccagaa
gtttgtgaagaacaagacggagcaacgaaagaagccattcaagacatcatcgccgcggaa
tgtgataatatattgcaacggatcattggcgagcttgaccctggttatactgaacaagat
atcatcaaccacccggattattgtgaatatacttattgcctttcccatcaggaagcggcg
gagttcgaaatgcgtatgttattggtgtcgggatgggaagcagctggtcaaacttaccaa
ttagcaataggcccggaagaaatggacccctattataataatcctgaaatggccggtatt
gggagtgctggtgatgtgagagcccttttgaacaacattcaagtagggttttatacaggc
acccttttggaagtaaccgatcctgacaatttggggatgtatgctgatccagctggaaac
cctgacaccacaggataccatatgctttacgccaaccttcagcagaaacgttccgaactt
ggtgaaacttggtatgccgaaaacttggacgaacagcgatggcagctgttccgaaattat
tatttcgaagcgagtcgaagggtaaaggttacattggatagtgtgcaatcctgtccagct
gtattagaaggactaagtgtattggatgaattacctgaaaatgaggagggtattgaagct
tatattgcagcatcaggttttctggcccctatagactccattcagcttctccctgtattc
gaaatggttctggatggttgtggtgaagaattcagcgatgctgaccaggattcgatttat
gtaaatcttgaggcctacttcaatgcaaatcgagctgacaatatttttaattggattctt
gaagaagaccttgaaaccaactattacctgggaagggttaatgaaatcctttcagcccat
agctgttcactggaagattatgcccaagaaagtaggatggtttgtgtgcgtgatacggtg
atttatcctgctgcccaagcgcagttttgggacaattctttgtacagaggagattttgaa
atgacccgggcgaatcttttagaatccatggaggctattggagactctaccaaccagagt
aaacaaaagaaaagtggaatggtccagatgatgtctgctgtctttccaggatattctgaa
tataatgcgcttttcacgttatacaatgctacagatggagataattggtacaacaattac
ggatgggtcgatgcagacccatttactcctgaagatgtaaccgtttggactccaccggtt
acaacggatggtaatggtaatatcacaggtatttctctagcccataacaatttgacaggt
caaataccaactcagatcagtactttttcgagtttagaaaacttatttttggatgggaat
aatcttactggttcaattccttcctctatgggtagcctgacttcacttataaacctagac
ttatcagaaaacgacttcacaggaactttgccttcgtctttcagtagtcttacaaatcta
ctttatcttagaatttatgacaacgaattacaaggaccgatcccttttgggccaccctca
gcaagttttaatttagacgcttcgctcaataggtttacttttaccgaccttctgcccttt
aaaaataattttctttcaagtgcttcctattcaggtcaggatctggtggatgtagcaaag
aatatcaataaactcgcaggtcagtcccatgtattcacaacgaacatagaccgggatacc
agtccaaaatctgaataccagtggtttaaaaatggggtagcactcaattccagagatacg
gctagtcatacccttaacttatctggcttgagttcaggggatgcgggagattattattac
aaaatctggaatagtgaccttcctggacttgaacttaccagcagaatacaaacactaaat
atgacacagaccggtggggtttggaaatgccttgagcgtgaagtacttgatccctccatg
aacggatcagggcccacggttacttcatcagcgagcatgtttttctatagcccggactgg
gaggctgtattggactcttgtatggcggataaggctgcccgggcctcatcgctaaaagaa
ctggcagcatcgaaaatgctcgatcggagaatagaagaatactatgcgaattttgacagg
agttgtttggagttgacggaggagagtttgtcttacacctatattcccaaggaataccac
tataccctttactattacgatcaggccggtagcctggttcaaactgtgcccccggcagga
gtgcagccactaagtggagagcaggttacatcggtgaaaggtggtacagctattcatccc
tatcacagactggaaacccgctaccaatacaatagccgaaatcaattgatttggcaggac
agcccggatggtggcgttagccgtttctggtacaataaggcagggcaactacgattgtca
caaaatgccaaacaaactgtggatgatttgtacagctataccagatacgacaagcagggc
agggtgatagagacaggggagatttattcgacagaacccattgataccttgcaggtgaat
ttggaagaattaacctttcctgattgtggaacctatggctgtggagatgtaaccctcacg
gtatatgaccgggcaggtttacctagggacccaacttttgcccaagaatacctgcgcagc
cgggtatcatggacagctatggtggagaaaaactcaacggatacaatatttacctattac
agctacgatccgcatggcaacgtaaaggccttactccaagacctgccagggataggccca
aaacgtacggagtatgtatatgatctggtcagtggcaacgtaaaccaggtgcactaccaa
aaaggttattctgaccaattgattcaccgctatcgttacgatgctgacaaccgactggaa
gaggtacagacaagcacagatggattggtttggaatagggatgcagcctattattactac
ccacatggaccgctggccagggtagagttgggtgagtacaatgttcaggggatggactac
tactatacgctacagggttggttgaaaggtgtaaatatgccaatggaaggagatcccggg
ggggatggagtgggtggattccgtaccggtactgatgctttttcttttgcgcttgggtat
tacgaaggggattacaaacccatcaatcccagtgtaaccatttctgattcacgagaccaa
ctctgggatcattataaagacacaagggatacaatctcagcaactggtctgtacaacggc
aatatttcctggatgagtactgaccttcccagcttgggagatccggatcgtatgcaggct
atggtttatgggtacgatcagctccaccgaatcgttcaagccagaagcctgaccagctca
gaaactaccggctttgtccaaaggagttacaatccagagaacccgaataaatacgatgcg
gattatagctatgatcctaatgggaatttattaactttacagaggcgggatgaaacgaca
atccgtgatgatttgacatataaatactatgactttagcaacaagctgaaaaacgtggat
ggtacggatactgaaaattacacctatgatgagatcggcaacctggttagtgacaatgcc
gaaggcattgatagtatcgcttggacgccatatggtaaggttagagcagttttcaaggat
gacagttcgcaggtacgtttcaggtacgatgcctccggaaaccgcatcgcgaagataact
gaaacggatacgaccatttatgcccgggatgcctctggtaatgtcatggcagtctataga
aacgataccttgactgagcaatccatttatggtagttcaagacttggccttataaactat
gcttcaaaaactgcttacagaagcctaggtggcaagaagtacgaactttccaaccacctg
ggaaatgttctggccgtcgtaagtgacaatatccacctggatcaggattccacttgggcc
agtgtggtcaatattacggactattatccttttggattggcgatggatggtcgtagtgtg
caggatagtacttaccgctatgggtttaatggacttgaaggtgatgacgagataaatgga
cccaaaaagagctatacgaccgaattcaggcagtatgatcctgttgttggaaggtggtgg
ggtgtggatgctctcactggtcagatgccagactggtctccgtataattttggatttaat
agtcctttaaggtatgttgatcctaccggactagctcccgatgattgggtaaaggacaaa
gatggaaatgttaggtggcgtgaaaacgtaaattctgccgaagatattgatcccttgtca
ggagacacctacttggggaaatcaggggtagggttggacgagtcctctggaaatacgcag
tttttcaacagcgacggaactattgacgaaggagtaaggtctatggcggagtttacagta
accgcttcggcaacctcacacggaaaggttatgagtaatcccgttgtaaaagatatgaaa
gcgaatagtgcgagaattaggagcgaagccttgccatttgccaggcacatgactagaagt
acaattgatggaattggatatacgggagccgggatatcagctgtagggacggcagtaact
ccttttatcccccatttaggagttgggttattggcagttggagggtcggtttctactatc
tctggtgtggcaagtgctactatgaattttgcggaaggggatattagtggaggttttggt
gatgttggaatgatggtggtaggtaagtatggtagtactttgataaaaaatatgagaaac
agaaggaggataataaactggacggaacaggttgttctagaatccaccctcgaatcatca
ttgaatatcgctgacggcataagggcgaatttgcaagataaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
