KEGG   Cyclobacterium marinum: Cycma_4034
Entry
Cycma_4034        CDS       T01592                                 
Name
(GenBank) PKD domain containing protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
cmr  Cyclobacterium marinum
Pathway
cmr02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cmr00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    Cycma_4034
SSDB
Motif
Pfam: SprB PKD_4 CHU_C PKD ChitinaseA_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: AEL27742
UniProt: G0J7A9
LinkDB
Position
complement(4877419..4883106)
AA seq 1895 aa
MKINSKYIILSIILFLIFGLQIFKIKGELINPFASITIQDQIETEVMFDGDLTLSLDMLS
INYSGDRSKLQLEVQAGNGYALSGKTISPSIQYAEDWEAKGKEIIVNLQVTDGVDHSQVF
PFKVLVIPPILPLAYSENSCKGIISLTLSAYKPNQRHEESFPFTFKLIDDLGDTLRVVTV
NNTAPFQSSATATFGQDYELNRDIEYQIYAIDNLGREYLRDSGPLGQAYSLDFELNFAGL
LCPEDQTGLVEFIIFNATLPVNNFIVIDSEGKQKQTDFEIVSDSDGFIVIQAKDLEPGTY
TIEIEDRFQCNGSESFEIVIPEPMDEVETVKHVTCFGNNDGEISLIIDGGWSSPFPKSHR
NEWANYEVTWFDDKENEVKTVNNSFVSLAGTIIGMESKINNLPPGDYYAKIKDKGRLFDI
TGAAPLVCEKTTGWITIEGPEPLTLSETIENISCNGMADGSISINPLGGSPEYTIEWFKG
NFANLNSPEPGELTSFPLNSEESELSRQHLDPGEYAVLITDQNGCIVANNYTINEPTPLI
LKELSELRQDVRCFGEEAGTIAIQLYENTPTPFSIEVFRNGSTFKSIGPINKVDSDTLYF
SNLKAGSYDFRIEDENGCDYLLEGIIIDEPETGLLIQDTLVSNFNGYQISFPGASDGSIS
LEIVGGKGDYKFEWNGPNGFEANTKDISNLSPGDYTFIVTDDNNCTARLASITLEAPQPL
TLTPYIPEVNGFQISCNGAATGSIKPNPAGGTGNYTYSWSGPNNFSSTNSNIENLSAGYY
SLTLADDNGAIIQATYKISEPNELILSEPEDLRVPVACFGERNGAFTLMIAQGSMAPYSL
TVGIMGDTEAIRTIINFNSDEYTFDQLVGNQYWVTVEDANGCIKKIDNILVDQPETGLQL
SNLQLSDFNGYQITCAGGTDGAISFNITGNQGNLTYNWTGPNGFTSTKTQLEGLEAGNYH
VLITDQNGCTLQRDFDLKSPFPLEVKEDVSDYNGFGVHCNGGNEGYIYLDISGGSGNTEI
KWKGPNGFSSDTDSLKNIFPGIYQATITDINGCEITKSYTLTEPQGLEIEELADQRINIS
CFGQETGVLAASITRSSAGPYRYELSNLNGDILETSPPTVQQEWFFRNLPANTYRIKVID
ANNCFKEIDQLEITQPQAGLSIDKVEVSSFNGYNISCFEAADAWIEVTTSGGSGNLKFDW
SGPGNFKANGPTIENLIPGDYHLTIIDQNGCEALTEIISIKQPDPLLFTPLVKVKNGFEI
SCNGANDGQVSLNITGGSGVYRIVWSGPDGFTSNAGDIKDLSPGNYQVNIIDENGCEISE
HFNIREPEPLTIRLNNKTDVSCHGAPTGSLSFIVSGGITGSYQYQWEKDGLAINLNSPKA
DNLLSGTYKVSVIDANGCVASSSAITISQPTAPLEVSMVQTEVSCYGANDANLSIAIKGG
IKPYQIEWNTGDNQSSFKGIGPGLYQVTVTDATGCVVFKETTIKEVPVFKVEPVVNPISC
FGAKDGSIQLNLEGGKAPVTATWEHGPEQSAIYNLSPGVYKVFLKDANNCTIERTFNLVE
PEPLEAVGQVQDASSCQNGQSGKILLEVSGGRAPYNYKWSNGENSPSLSNLTNGSYTVNI
TDQSGCYVSKTFKVNRPAPLNISLTNTVSSQCEPKEILEINELKIEGGVAPYSIQWSSGE
VYEDGYRMEASAPGNYQVTVTDSKGCVQTQSFSVQNNVILVKGEYLSESFPQYGENLVNF
DVKFTNKSNGNIGLYYWDFGDGNNSYEASPTYRYKLPGTYQVTLIATDIWGCETSSSFSI
KITDFFLETPNVFSPNGDGLNDYFFPKFLNINSLSLIIMNTWGEILYQSSDIKDPGWDGT
FRGQKSAPGNYVYKLNYTTADGRNFSSTGAFMLLE
NT seq 5688 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgaaaataaatagtaaatatattattctcagtatcattttatttttaatttttggactt
caaatttttaaaattaaaggtgaactaataaatccttttgcatccattacaattcaggat
caaattgaaacagaggttatgttcgatggggatttgactttgtcacttgacatgctgtcc
atcaattattccggagatagatctaaactacaattggaggtgcaagctggaaatggttat
gctctctcaggtaaaaccatttctccttccattcaatacgctgaggattgggaagcaaaa
ggcaaggaaattattgttaaccttcaagtaactgatggtgtggaccacagtcaggtattc
ccgtttaaagttctggtgatccccccaattttacctttggcctattcagaaaacagctgt
aagggtataatctcacttaccttaagcgcttataaacccaatcaacgacatgaagaatct
ttcccctttacctttaagctaatcgatgatctgggggataccttaagggtggtgactgta
aataatacggcgccatttcaaagctcagctaccgcaacatttggtcaagattatgaatta
aacagagacatagaataccaaatatatgcaattgataatctaggaagggaatatttaaga
gactcaggtcccttaggtcaggcttattctctggattttgaattgaattttgccggtttg
ctttgcccggaagaccaaacaggcctcgttgaattcattattttcaatgctacacttccg
gttaacaattttattgtaattgatagtgaaggcaagcaaaagcaaacagattttgaaata
gtttcagattcggatggttttattgtaattcaagccaaagacttggaacccggtacatac
accatcgaaatcgaagatagatttcaatgcaatggtagcgaaagttttgaaattgtcatt
cctgaacctatggacgaagttgaaactgtaaaacatgtcacctgctttgggaacaacgat
ggtgagataagtcttattattgatgggggttggtcatctcccttcccaaaaagccatcgc
aatgaatgggccaattatgaagtaacatggtttgacgataaagaaaacgaagttaaaaca
gtaaacaactcatttgtaagtttggcaggtactattattggaatggaaagtaaaattaac
aacttgcctccaggtgattattatgccaaaattaaagacaaaggaaggttatttgatatt
accggtgctgctccgctggtttgtgagaaaacaaccggttggataactattgagggaccg
gaaccattaaccctttcagaaaccattgaaaatatatcttgcaatggtatggctgatgga
agtattagcataaacccgctgggaggttctccggaatatactattgaatggtttaaagga
aattttgcaaacctaaactccccagaaccaggagagttgacctctttccctctcaactcg
gaggaaagtgaattatcaaggcagcacttagacccgggagaatatgctgttttaataaca
gatcaaaatggatgtattgtagcaaataattacaccatcaacgagcctacaccactgata
cttaaagaattgagtgagctaagacaagatgtaagatgttttggtgaagaagcaggtacc
atagccattcaattgtatgaaaacacccctacaccattttcaatagaggtttttagaaat
ggatctactttcaaatcaataggccctatcaataaggtcgattcggacaccctttatttt
tcaaatttaaaagcaggaagctatgattttagaattgaggatgaaaatggatgtgattac
ttgttggaaggaataataattgatgaaccggaaacaggtttacttattcaggataccctt
gtttccaattttaatggatatcaaatctcttttcccggagcaagcgatggtagcatttct
ttggaaattgttggagggaaaggtgattataaattcgaatggaatgggccgaatggcttt
gaggcaaacaccaaagacatcagtaatctctcccccggagattatacttttattgtaaca
gatgacaacaattgtaccgcacgattggcttccataacgctagaagccccacaaccattg
acattgactccctacatacctgaagtgaatggctttcagatcagttgcaatggagctgcc
accggtagcattaaaccaaatccggcaggaggaacaggtaattacacctacagttggtcc
ggtcctaacaacttctcttcgacaaatagtaatatagaaaacctatctgcaggctattat
tcattgacactagctgatgataatggcgcaatcatccaagcaacttataagatttccgaa
cccaatgaattaatcctatctgagccagaagatttaagggttccggtagcttgttttggt
gagcgcaatggtgcttttacgttaatgatagcccaaggttccatggctccttatagcctc
actgtagggattatgggagatacagaagcaatccgaactattattaactttaacagtgat
gaatatacctttgatcaactcgtcggtaaccaatattgggtaactgtagaagatgccaat
ggctgtattaaaaaaatagataacattttagtggatcaacctgaaaccggcttacaactc
agcaatttacaattgtcagattttaatggataccaaatcacttgcgcgggaggaacagat
ggagctatttcattcaacatcaccggaaaccaaggcaatctaacttataactggacaggt
cccaatggatttacatctacaaaaacccaattggaaggcctagaagcaggaaattaccat
gtcttaataacagatcaaaacggctgtacattgcagagggactttgacctgaaatctcct
tttccactggaagttaaagaggatgtatctgactacaatggatttggggtgcattgtaat
ggtggaaatgaaggttacatttatttggatatttccggaggatctggaaatactgaaata
aaatggaaagggccaaatggcttcagttcagacactgacagcttaaaaaatatttttcct
ggcatttaccaagctacaataacagacataaatggttgcgaaataaccaaaagctacacc
cttacagaacctcaaggcctagaaattgaagaattagcagatcaaagaattaatatttcc
tgtttcggtcaagaaactggcgtattggctgcaagcataacacgaagttcagcagggcca
tataggtatgaattgtcaaaccttaatggagacattttagaaacttcaccccctactgta
caacaagaatggtttttcagaaaccttcctgccaacacttacaggataaaggtaatcgat
gccaataactgttttaaagagatagaccaactcgaaatcacccaaccacaagccggattg
agtattgataaggtggaagtttcttcatttaacggatataatattagttgttttgaagca
gcagatgcctggattgaggtaacaacttccggaggttccgggaatttgaaatttgattgg
tcagggccggggaatttcaaagccaatggtcctactattgaaaatttaattcccggtgat
taccaccttaccattattgatcaaaatggctgtgaagcccttacagaaataataagtatc
aaacaacctgatcctttgctgttcactcccctagtaaaagtcaagaatggttttgaaata
agttgcaatggggccaatgatgggcaagtttcgctaaatattaccggaggcagtggggtt
tatagaatagtttggtcaggacctgatggttttacttctaatgccggggatataaaggac
ctttcaccgggaaattaccaagtaaatataattgatgaaaacggttgtgaaataagtgag
catttcaacattagggagcctgaacctttaaccatcaggctaaataataaaacagatgtc
tcctgccatggagcccccacaggcagcttatcttttattgtctcaggaggaattaccggc
agctatcaataccaatgggaaaaagacggtttagccattaatttaaattcccctaaggca
gataaccttttatcaggtacttacaaagtatcggtcattgatgccaatggttgtgttgcc
agcagctcagccattaccatttcacaacccactgctcctttggaagtatcgatggtacaa
acagaggtttcctgttatggggccaatgatgccaatttatccattgctataaaaggaggt
atcaaaccttaccaaatcgaatggaataccggtgataatcaaagttcttttaaaggtata
ggacccggcctataccaagtcacggtaacagatgccactggctgtgtagtcttcaaagaa
accaccattaaagaagttccagtatttaaggtggagcctgtggtaaatccgatttcttgc
tttggtgctaaagatggtagcatacaattaaaccttgaaggaggtaaagcacctgtgaca
gccacctgggaacatggacctgagcaatcagccatttataatttaagcccgggagtttat
aaggtttttttaaaagatgccaataactgtaccattgaaagaacttttaatttggttgag
cctgaacctttggaagcagtgggccaagtacaagatgcatcctcctgccaaaatggtcag
agtggaaagatattgcttgaggtatcaggtggcagagccccttataactacaaatggagc
aatggcgaaaacagcccttccctatccaatctaaccaatggttcttacaccgttaatatt
acagatcaatcaggatgctatgtaagcaaaacatttaaagtgaaccggcctgccccttta
aatattagcttgaccaatacggtaagttcccaatgtgagcccaaagaaattttggaaata
aatgaactaaaaattgaaggaggagttgctccctactccattcagtggagtagtggagag
gtatatgaggatggttatcgaatggaggcgagcgcacccggcaattatcaagtgacagtt
accgacagcaagggctgtgtgcaaacccaaagtttttctgtacaaaacaatgtaatatta
gtaaaaggagaatatttatctgaatcatttccgcaatatggggaaaacttagtcaatttt
gatgtaaaattcaccaacaaaagcaatggaaatataggtttatattattgggattttggt
gatggaaacaattcatatgaagcctcacctacctaccgctacaaacttcccggaacttat
caagtcactttaattgcgactgatatttggggatgtgaaaccagctcttctttttcaata
aaaatcactgattttttcttagaaacgcctaacgtatttagtcctaatggtgatggtctc
aatgattattttttccccaagtttttaaatatcaatagcctatcacttataataatgaac
acctggggagaaatattgtatcaatcttcggacattaaagacccaggttgggatggtact
ttccgtgggcaaaaatccgctcccggcaattacgtatataagttaaactacaccactgca
gatggaagaaattttagtagcaccggtgctttcatgcttttggaatga

DBGET integrated database retrieval system