Cyclobacterium marinum: Cycma_4408
Help
Entry
Cycma_4408 CDS
T01592
Name
(GenBank) Ig domain protein group 1 domain protein
KO
K13735
adhesin/invasin
Organism
cmr
Cyclobacterium marinum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cmr00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
Cycma_4408
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
IgGFc_binding
Big_1
MG4
CarboxypepD_reg
Big_3_5
bMG3
Por_Secre_tail
TTR_TEN1-4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEL28110
UniProt:
G0IYW5
LinkDB
All DBs
Position
complement(5348116..5352573)
Genome browser
AA seq
1485 aa
AA seq
DB search
MKQTYSVLNLIFLLFILPMGLVYSQNGIPDNKGKEFWLMFNRNFNNSSATNLDLFITSDL
ATNGQVILPDETVIDFSVTPGTVTTVNLPSTLLATLSDGVENKGVNIIADSEITIYGLNQ
YNATTDAFLGLPLDVLGTEYIVMSYITLSATPSTASAFGVVATMDGTVVTIVPSIGTNTR
PSGVPYEVNLNKGETYQLIASVTNGDLTGSFITSNNPVAVFTGHTCAYVPQNISACDHLI
EQAPPVTSLGESFVTIPLASRRAGDIYRIVATKDGTSVSINGTGGFTENFTLNAGDFHEL
SIPSDVYTKIESDQAILVAQFSKGQSSDNVTSDPFMMLIPPFEQFQNSYTVSTPATGFSK
HFINLAVPTSQKDKIELDGAFLDPSIFTDIPGSTFAGAQVEVSQGTHNISGNLAFGAFMY
GFGSYDSYGYPGGQALASVEQVRNINLDIEQEIQQGTTYCFNSSVTDDEGVPIFGVRVDF
EVEGVNEKIGFALTDEQGIANFCFDAINEGTDKIIASVGSTTAEATVSTTIPRPDQVLLN
SLPESVTLGEEICLTSQILDQFDNPMEGEMLFIEYMGNVIYSGESDENGMIEYCFTPEEG
GDLLFTSYYEGGDKTETTVMVAVPDSMPTSISIDAASNEINLGQQVCVTATVKDQFGKVM
EGVEVQLEINGVDAGSEMTDENGVAEFCKTAEEEDGELLIFVVNYVGGGSPASTSITVLN
SGGGGDGGGGGGLIASAISITNISAEVNLGEEACVESLVLDQNGDPLPNTEVTIEVNGEI
VATLMSDEDGIVAYCIVTESMGDLSFAVNYDGGTPATGTVKIIQVVLVATTISVEPSEGE
VSIGTETCLEVEVLDQLDNPFGVIEVFITKNGEPAGSMMTNEDGVLNYCFNPDMEGEFEF
GFYYTVENTVTAMITVTDNVPIPTIISFEENEVEVVLGEEVCLAATILDQFGMPLAGVEV
SFDVNGVFYGKGITDENGRVELCGTPDELGDLMVTASYEGGEDTEAIIKVVTESDDLEIE
SFWLVDAGTNTIIREIMNGDIIPYSEVKDKMINMMVITDPEKVGSVKLELESLTLCPTCS
PDMRSTTENVVPYAVFGDINGDYTGKNILPGVYEFAATPFEMKHLSGNQGVKSMVNFEVM
FEGTIDSFTLVNATDDTDIIKIMDGDVIDLSAFKDKKFNIRSNVPEDQQGGIDMMIEGPV
NFSMFEKVMPFALFGDNLGDYAGRDLPEGSYTMSATAYPFKSTVNRGIGGATVTINFEVI
HNSKIDKFTLVNADTDEDIMELMEGSYIDLNQYKNVKLNIRADGKGDNIAAMTFQLSGAK
DYNWTERKAPYAIFGDLPANDYAGKYLNEGKYKLMVTPYNADNTMGESMTVNFIAGFDGG
DNLRIENASLNQLEANTSEGEVNNGNMVEDLKVYPQPSQNVVNFLYPSSLSEDATVMIYK
GNGQLIHGSQMGNTPSFNFGRFGSGLYLIHVSNGDRIISKKVFIY
NT seq
4458 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcaaacctacagtgttttaaacttgatttttctgctgtttatacttcctatggga
ttggtatattctcagaatggtattcccgataataagggaaaggaattttggttaatgttt
aaccgaaattttaataatagtagtgctacaaatttggatttatttattactagtgattta
gctactaatggtcaagtaatattgccagatgaaactgtaatagatttttctgtaacacct
ggaactgttactacggtaaatctacccagtacacttctggctactcttagtgatggtgtt
gaaaataaaggggttaatattatagcagatagtgagattactatatatgggttaaatcaa
tataatgctacaactgatgcttttcttggtttaccgcttgatgtgttgggaaccgaatat
atagttatgtcctatataacactatcggcaaccccttctacagcatctgcatttggggtg
gtagcaacaatggatgggacagtagttaccatagtaccttcaataggtacaaatacaaga
ccgtctggcgtaccctatgaagtaaacttaaataaaggtgagacttaccagttaatagca
tcggtaacaaatggtgatttaacgggtagttttatcacttctaataatcctgtcgcagta
tttactggccatacctgtgcctatgtgccgcagaatatttccgcatgtgatcatttgatt
gaacaagcacctcctgtaacttccttgggtgaaagttttgtcactattccactagcctct
agaagagcaggtgacatttatagaattgttgccaccaaggatggaaccagtgtttcgata
aatggtacaggtggctttacagaaaacttcacattaaatgcaggtgactttcacgaatta
agtatccctagtgatgtgtatactaaaattgaatcagatcaagccattttagttgcacag
ttttcgaaaggtcaaagttctgataatgttacatctgatccgtttatgatgttaatacct
cctttcgagcaatttcaaaatagttatactgtcagcactccagcaactggttttagtaag
cattttataaacttggcagtgccaacttctcaaaaggataaaattgaactggacggtgcc
tttttggacccttctatttttacagatatacccggatctacctttgccggagcacaggta
gaagtttctcaaggaacacataatatttctggaaacttggcttttggggcttttatgtat
ggctttggtagctatgattcctatggatacccgggtggtcaggcactggctagcgtggaa
caagttcgcaatattaatttggatattgaacaagaaattcaacagggaactacttattgt
ttcaattcttcagtgacagatgatgagggcgtaccaatttttggtgttagggtggatttt
gaagtggaaggggtcaatgagaaaattggttttgcattaactgatgaacaagggatagcg
aatttctgctttgatgctattaatgagggaactgataaaataatagcatctgtaggaagt
acaactgcagaagctaccgtttctacaaccattcctagaccggatcaggtgctgcttaac
tccctgcctgaatcagtgactttgggagaggaaatatgccttaccagtcagattttggat
caatttgataacccgatggaaggtgagatgttatttatcgaatatatgggcaatgtaatt
tacagtggtgaatctgatgagaatgggatgatagaatattgtttcacaccggaagaaggt
ggagacctcttatttacgagttattatgagggaggggataaaaccgaaactaccgttatg
gtcgctgttccggattcaatgcctacctcaataagtatagatgccgcatccaatgagatc
aatttgggacaacaggtatgtgtgactgccacggttaaagatcagtttggcaaagtaatg
gaaggtgttgaagttcaattggaaatcaatggggtggatgcaggatctgaaatgaccgac
gaaaatggagtggctgaattttgcaaaacagcagaggaagaagatggcgagcttctaatt
tttgttgttaattatgttggaggcggaagcccggcttctacgagtattactgtccttaat
tccggaggcggcggagacggaggcggtggtggtggccttatagctagtgccatttcaata
accaatatatctgctgaggtcaaccttggtgaggaagcctgtgtagaatccctagtgttg
gatcaaaacggtgatccacttcccaatacagaagtaactatagaagtcaatggagaaatt
gtggccaccttaatgagtgatgaagatggaatagttgcctattgtattgttaccgaaagc
atgggtgatctaagctttgctgttaattatgatggtggaactcctgccacaggtacggta
aaaatcattcaagttgtattggttgctactactatttcagttgaaccttctgagggtgaa
gtaagtattggaacagagacttgtttggaagtagaggtattggatcagttagacaatcca
tttggtgtcattgaagtgtttattaccaaaaatggagaacccgccggttctatgatgacc
aatgaggacggagtattgaattattgcttcaatccggatatggaaggtgagtttgagttc
ggcttttattatacagtcgagaacactgttaccgccatgatcactgttacagacaatgtc
ccaatccctaccattatttcatttgaagaaaacgaagtggaagtagttcttggtgaagaa
gtatgtttggcagccactatattggatcaatttggaatgcctctagcaggggtagaagtt
tcttttgatgtgaatggtgtattctatggtaaaggcatcaccgatgaaaatggtagggta
gaactctgtggaactcctgatgagttaggtgatttaatggtgactgcttcatatgaagga
ggagaggacacagaagcaatcattaaggtagtaacagaatctgatgacttagaaatcgaa
agcttctggcttgtagatgcaggaaccaataccattatcagagaaataatgaatggtgac
attataccttattctgaagtcaaagataaaatgatcaatatgatggtaatcactgatcct
gaaaaagtgggtagtgtgaaattagaattggaatcattaaccttatgtccaacctgttct
cctgacatgcgaagtacaactgaaaatgtggtaccgtacgcagtatttggtgatatcaac
ggagattatacagggaaaaacatattgcctggggtatatgaatttgctgccacaccattt
gaaatgaaacatctttccggtaatcagggagtgaaatccatggtaaactttgaagtgatg
tttgaaggaaccattgacagtttcactttagtcaatgctacagatgatacggatattata
aaaataatggatggtgatgtgatagatttatcagcattcaaagataaaaagtttaatatc
agatcaaatgttcctgaagaccaacaaggtggaattgatatgatgattgaggggccagtt
aatttctccatgtttgagaaagtgatgccatttgcgctctttggtgacaatttaggtgac
tacgctggaagagacctccctgagggaagttataccatgtctgctacagcttatccattc
aagtctactgtgaatagaggcataggtggagccactgttacaattaattttgaagtaatt
cacaatagcaaaattgataaatttactctggtaaatgcggatacggacgaggacattatg
gagcttatggaaggtagttacatcgacctgaatcagtacaaaaatgttaagttgaatatc
agggctgatggcaaaggtgataatatagctgccatgacttttcaactatctggtgctaaa
gattacaattggacagagagaaaagcaccatatgcgatcttcggagatttacccgccaat
gattatgcaggcaagtacctgaatgaaggtaagtataaattgatggttacgccttacaat
gctgacaataccatgggagaaagcatgacagtcaattttattgcaggttttgatggtggc
gacaatttgaggattgaaaatgcatctttgaatcaattagaggccaatacctcagaaggt
gaagtcaacaatggtaacatggtggaagacttaaaagtctatcctcaaccttctcaaaat
gtagtgaatttcctatatccttcttctttgagcgaagatgctacggtaatgatttacaaa
ggcaacgggcaattgattcacggttcacaaatgggcaatacacctagtttcaactttgga
cgatttggttcaggcttgtacttgattcatgtgtccaatggtgataggataatttccaaa
aaagtatttatctattaa
DBGET
integrated database retrieval system