Caloenas nicobarica (Nicobar pigeon): 136002582
Help
Entry
136002582 CDS
T11056
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
cnic Caloenas nicobarica (Nicobar pigeon)
Pathway
cnic04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cnic00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
136002582 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
cnic00536
]
136002582 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
cnic00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
136002582 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
TB
hEGF
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
136002582
NCBI-ProteinID:
XP_065513840
LinkDB
All DBs
Position
Z:complement(47169973..47339630)
Genome browser
AA seq
2899 aa
AA seq
DB search
MGRRRWLWVQPCFMWLGCLALWAQGAAGQQKPPPPVRPAGGAGGIHPAAAYRHDGAGSAA
AAGRVRRRGQQDVLRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNM
CTCANGQISPTCGSKSIQQCSIRCMNGGTCADDRCQCQKGYVGTYCGQPVCENGCQNGGR
CIGPNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPCFTQVNNQMCQGQLTGIVCTKTLCCATIGRAWGH
PCEMCPAQPQPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGVCQGGNCINTVGSYECKCPTGHKQ
NEATQKCDDIDECSIIPGICEGGECSNTVGSYFCICPRGHVISTDGSRCIDQRTSTCFSN
IVNGRCAQELPGRFTKRQCCCESGQCWAIASVPEMCPVRGSDEHRRLCVDAARAGSGSRG
GGTGGNGFLPSGNGHGYGPGGAGFIPFPGSNGFSPGVGGAELGTGGQSPTGNGPIITGLT
ILNRTIDICKHHPNLCLNGRCIPILSSYRCECNMGYKQDTNGDCIDVDECTSNPCSNGDC
VNTPGSYYCKCHAGFQRTPTKQACIDIDECIQNGVLCKNGRCVNTEGSFQCICNAGFELT
TDGKNCVDHDECTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFILAPNGRYCTDIDECQTSGICM
NGHCINTEGSFRCECPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGACVRPFPGAVTKSECC
CASPDYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGIGITVDGRDINECALDPDICYNGICENLRG
SYRCNCNSGYEPSPSGRNCVDIDECSVNGLLCDNGLCRNTPGSYTCTCPKGYVFSTETDT
CEDINECESSPCVNGACRNNLGSFNCECSPGSKLDSTGLICIDSLKGTCWLNIQDSRCEV
NINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDTACSRGFARVKGVTCEDVNECEVFPGVCLNG
RCINSGGSFHCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEPCYLKWDEDECVHSVPGKFRMDACCCAV
GAAWGSDCEECPKPGTKEYKALCPRGPGFSNRGDILTGRPFYKDINECKVFPGMCMNGKC
RNTIGSFKCRCNNGFTLDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVNTPGSFECECFDGYESG
FMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFRCDCPLGHELSPSHEACIDVNECSLSDN
LCRNGKCMNMIGTYQCSCNSGYQATRDRQGCVDIDECMIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCS
DGYALMPDVRTCADIDECENIPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMKTCIDVNEC
DLNSNICMFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDMNALCVNVPG
IFKCSCREGWVGNGIKCIDLDECSNETNQCSVNAQCVNTPGSYRCACAEGFTGDGFTCSD
VDECAENVNLCENGQCLNVPGAYRCECEMGFTPASDSRSCQDIDECSFQNICVFGTCNDL
PGMFHCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDFQLNPTGV
GCVDNRVGNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPVNSTEY
NTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPKGYYLSEETRI
CEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSYNGTSC
ENELPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPTPGTAEFKNLCGNIPGFTFDIHTGKAVDI
DECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRNADCIN
SPGSYRCECAAGFKLSPNGACVDRNECLEIPNVCSHGLCVDMQGSYQCVCHNGFKASQDQ
TMCMDVDECERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMDVDECSSFFGQVCRNGQ
CFNEIGSFKCLCNEGYELTPDGKNCIDTNECVALPGSCSPGTCQNLEGSFRCICPPGYEV
KSESCIDINECNEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPTGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTNFE
NGKCSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQDLCPYGHGTIPGIDDTR
EDVNECLESPGICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDYTGVHCIDTDECSFGNPCGNGTCT
NVIGSFECNCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFYECTCPVGYELREDQ
KMCKDLDECAEGLHDCKSRGMMCKNLIGTFMCICPPGMTRRPDREGCTDENECHTKPGIC
ENGRCMNVIGSYRCECNEGFLSSPSGIECLDNRQGFCFAEVLQTMCQMASSSRNLVTKSE
CCCDGGRGWGNQCELCPLPGTTQYKKLCPHGPGYTTDGRDIDECKVMPNLCRNGQCINTM
GSFRCFCKVGYTTDISGTSCIDLDECTQSPKPCNFICKNSEGSYQCSCPRGYILQEDGKT
CKDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQPLLCGSKGICQ
NTPGSFTCECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNILGGYRCGCPQGYIQHYQW
NQCVDENECSNPNTCGSASCYNTLGSYKCACPSGFSYDQFSSACHDVNECSSTKNPCNYG
CSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPLDGDADEENALSPEACYECKING
YSKKDNRKKRSANDIIKQISLESLDMDSPLKMRVNISRLDNKEHILELMPAIEPLTNHVR
YIISHGNNDGIFQIHQRDGLSYLHTVKKKSVPGSHTLEITSIPLYKKKELKKLENSSEDN
YLLGELGEALRMRLWIDLY
NT seq
8700 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggagacggcggtggctctgggtccagccctgcttcatgtggctgggttgcctggcg
ctctgggcgcagggagcagccgggcaacaaaagccgccgccgccggtccgtcctgcggga
ggagcgggcggcatccatcctgctgccgcgtaccggcacgatggggccggcagcgccgcc
gccgccggccgggtccgcaggcgaggacagcaggacgtgctccgcgggccaaatgtgtgt
ggctctagattccattcgtattgttgccctggatggaaaacactccctggaggaaaccag
tgcattgttcccatttgtagaaatagctgtggtgatggattttgttcccgtcctaacatg
tgtacttgtgcaaatggacaaatatcacctacttgtggatcaaaatctatacaacagtgc
agcatcaggtgcatgaacggtggcacatgcgcagacgaccgctgccagtgccagaagggc
tacgtgggaacttactgtgggcagcctgtctgtgaaaatggctgccagaatggaggacgg
tgtattggacctaatcgctgtgcatgcgtctatggatttactggccctcagtgtgaaaga
gattacagaacaggcccctgtttcacacaagttaacaaccagatgtgtcagggacagcta
actggaattgtttgcacaaaaaccctctgttgtgcaaccattgggcgtgcatggggtcac
ccatgtgaaatgtgccctgctcagcctcagccatgccgtcgtggcttcatccctaatatt
cgcactggagcttgtcaagatgttgatgaatgccaggctatccctggagtctgccaagga
ggaaactgcattaatacagtaggttcatatgagtgcaagtgtcctactggtcacaaacag
aatgaggcaactcaaaaatgtgatgatattgatgaatgcagcatcatcccaggaatctgt
gaaggcggtgaatgctctaacactgtgggaagttatttctgcatctgcccacggggtcat
gtcatatccacggatggctcacgctgtattgatcagaggacaagtacatgtttctccaac
atagtgaatggccgctgtgcgcaagagcttcccggtaggttcacaaaaaggcagtgctgc
tgtgagtctggccagtgctgggccattgcgtctgttccagagatgtgtcctgtgagagga
tctgacgaacaccgcagactttgtgtggatgccgctcgtgctggaagtggttccagaggt
ggtgggacaggaggaaacgggttccttcccagtggcaatggccatggctatggcccagga
ggagcaggattcattcccttccctggaagcaatggtttctccccaggtgtaggcggagca
gagctagggacaggtggtcaaagtcccactggaaatggcccaataattacagggctaaca
atactcaatcggacaatagacatctgtaagcaccatcccaacctttgtttaaatggacgt
tgtataccaatcctttctagttaccgatgtgagtgcaacatgggatataagcaggacaca
aatggggattgtattgatgttgatgaatgcacatcaaacccatgctctaatggcgactgt
gtcaacacacctggttcctattactgcaagtgccatgcaggtttccagagaactcctacc
aagcaagcttgcatcgacatagatgagtgcatccagaatggtgttctctgtaaaaatggc
cggtgtgtaaacaccgagggaagtttccagtgtatttgcaatgctgggtttgagctaact
acagatggaaaaaattgtgtggaccacgatgagtgtaccactacaaacatgtgtttaaat
gggatgtgcataaatgaggatgggagttttaaatgcatctgcaaaccaggatttattctg
gctccaaatgggcgttactgtactgatattgatgaatgtcagacatcaggaatttgcatg
aatggtcattgcataaatactgaaggatcctttcggtgtgagtgtccacctggcttggct
gttggggttgatggtcgtgtgtgtgtagatactcatatgcgtagcacatgctatggaggc
atcaaaaaaggagcatgtgttcgtcctttccctggtgctgtgacaaagtctgaatgttgc
tgtgccagtcctgactatggttttggagagccatgtcacccctgccctgctaaaaactca
gccgaattccatggcctgtgtagcagtggaattggtattactgtggatggacgagatatt
aatgagtgtgcattggatcctgatatttgctataatggaatttgtgaaaacttacgtggc
agctatcgttgtaactgtaacagtggctatgagcctagtccttctggaagaaattgtgta
gacattgatgaatgttcagtgaacgggctgctgtgtgataatggactctgtcgaaacacc
cctggaagctacacctgcacttgtccaaagggttatgtgttcagcactgagacagacaca
tgcgaagatataaatgaatgtgaaagcagcccatgtgtcaatggtgcctgtaggaacaat
cttggatctttcaattgtgaatgttcacctggcagcaagttggactctacaggactgata
tgtattgatagcctgaaggggacttgctggcttaacatccaagacagtcgctgtgaagtc
aacatcaatggtgctacactgaaatctgaatgctgtgctaccttaggagcggcttggggc
agcccatgtgagcgatgtgaattagacacagcttgctcaagaggatttgccagagtgaag
ggtgtaacctgtgaagatgtaaatgagtgtgaggttttcccaggggtctgtctcaacggg
cggtgcattaacagcggaggctcattccactgcgagtgccccgaagggctaacactggat
ggaacagggcgagtgtgtttagatattcgcatggagccgtgctacctgaagtgggatgaa
gatgagtgcgttcactctgtgcctggcaagttccgtatggatgcctgctgctgtgcggtg
ggggctgcctggggctccgactgtgaggagtgtcctaagcctggcaccaaggaatacaag
gctctgtgccccagaggtcctggcttttccaacaggggagatattctaactggcaggcca
ttttataaagatatcaatgaatgtaaagtgttccctggtatgtgcatgaatggtaaatgc
agaaacacaattgggagtttcaaatgtagatgtaacaatggatttactttagatatggag
gaaagaaactgtacagacatcgatgagtgccggatctccccagacttatgtggaagtggt
acttgtgtcaacactcctggaagctttgagtgtgagtgctttgatggttatgaaagtgga
tttatgatgatgaagaactgtatggatattgatgaatgtgaacgcaaccctctgctgtgt
agaggtggcacatgtgtgaacaccgaagggagttttcggtgtgactgtcctttgggacat
gagctgtcgccatcacatgaggcatgcatagatgtaaatgagtgctcattaagtgacaat
ctctgcagaaatggcaagtgtatgaatatgatcggaacataccagtgttcctgcaactct
gggtaccaggccactcgtgacagacaaggctgcgtagatattgatgaatgtatgataatg
aatggaggatgtgacacccactgcactaactcagaaggcagctatgaatgtagctgcagt
gacggctatgctctaatgccagatgtcaggacatgtgcagatattgatgaatgtgaaaac
attccagatatctgtgatggtgggcaatgtaccaatattccaggggagtatcgctgtctc
tgttatgatgggtttatggcctctatggacatgaagacttgtattgatgtgaatgaatgt
gatttgaattccaacatctgtatgtttggggagtgtgaaaacactaaaggttccttcatt
tgtcactgtcagctaggatattcagtcaagaaaggaaccactggatgcacagatgtggat
gagtgcgaaatcggtgctcacaactgtgacatgaatgctttgtgtgtcaatgtaccagga
atttttaaatgtagttgcagagaaggatgggttggaaatggcattaaatgtattgatctt
gatgaatgctccaatgagaccaaccaatgcagcgtgaatgcccagtgtgtgaacaccccg
ggatcataccgctgtgcctgtgcagagggattcactggggatggatttacttgttctgat
gttgatgagtgtgcagaaaatgttaatctgtgtgaaaatggacagtgtttgaatgtccct
ggtgcctatcgctgcgagtgtgagatgggattcactcccgcctcggacagcaggtcatgc
caagatatcgatgaatgctccttccagaacatatgtgtatttggtacctgtaatgatcta
ccaggaatgtttcattgtatctgtgatgatggctatgaactagatcgaactgggggaaac
tgtacagatattgatgaatgtgccgatcccattaattgtgttaatggtctttgtgtaaat
actcctggaagatacgagtgtaattgccctccagacttccaactgaatcctactggagtg
ggttgtgtagataaccgtgttggcaattgctacctgaagtatggaccacgaggggatggg
agcctatcctgcaatactgaaattggggtcggagtcagtcgttcctcatgctgctgctct
ttgggaaaggcttgggggaacccctgtgagacgtgtccccctgtaaacagcacggaatat
aatactctctgtccaggaggagaaggattcagaccaaatcccatcactattattttagaa
gacattgatgaatgtcaggaactgccaggtctctgccaaggtgggaattgcatcaatact
tttggcagtttccagtgtgaatgtccgaaaggctactacctcagtgaagagacaagaatc
tgtgaagatattgacgagtgtgttgcacatcctggtgtgtgtggtcctggcacctgctac
aatacactggggaactacacctgcatttgcccacctgaatatatgcaagtgaatggagga
cataactgcatggacatgaggaaaagcttttgctacagaagctataatggaacctcctgt
gagaatgaactgcccttcaatgtgaccaaaagaatgtgttgctgcacatacaatgttggg
aaagcctggaacaaaccttgtgaaccatgtccaactccaggaacagctgaattcaagaac
ttatgcggcaatattcctggcttcacttttgacattcatactggaaaagctgttgacatt
gatgaatgtaaggaaatcccaggaatctgtgcgaatggtgtttgcatcaatcagattggc
agcttccgctgtgaatgccctactggattcagctacaatgacctgctcttggtctgtgaa
gatattgacgagtgcagcaatggagacaatctctgtcagagaaatgcagactgtatcaac
agtcctggtagttaccgctgtgaatgtgctgctggttttaaactttcacccaatggcgcc
tgtgttgatcgcaatgaatgtctggaaattcctaatgtttgcagtcatggtttatgtgtg
gacatgcaaggaagttaccagtgtgtatgtcacaatggttttaaggcatcccaagaccag
actatgtgcatggatgttgatgaatgtgaacgccatccatgtggaaatggaacttgtaaa
aacacagttggatcgtataactgtctgtgttatccagggtttgaattaactcataataat
gattgtatggatgttgatgagtgcagttccttttttggtcaggtgtgcagaaatggacag
tgtttcaatgaaattggttccttcaaatgtttgtgtaatgaaggatatgaacttactcca
gatggcaagaattgcattgatactaatgagtgtgtggcactacctggttcatgctctccg
ggtacctgtcaaaatttggaaggatcattcagatgcatctgtccaccaggatatgaagta
aaaagtgaaagttgtattgatattaatgagtgtaatgaggatcccaacatctgtctcttt
ggctcttgcacaaacactccaggaggtttccagtgcatctgtcctacaggttttgtgctg
tctgataatggacggagatgttttgatactcgccagagcttctgtttcactaactttgag
aatgggaaatgctcagtgccaaaggctttcaacaccacaaaggcaaagtgttgctgcagt
aaaatgccaggagaaggatggggtgatccttgtgagctctgtccaaaggaagaagaagtt
gcctttcaggacctttgtccatatggtcatggaactattcctggaattgatgatacacgt
gaagatgtcaatgaatgccttgaaagtccagggatttgctcaaatggtcactgcatcaat
actgatggatcgttccgctgtgagtgccccatgggatacaacttagattacactggagta
cattgcatcgatactgatgaatgttcatttggcaacccatgtggaaatggtacgtgcact
aacgtgattggcagttttgagtgcaactgtcatgaaggatttgaaccaggcccaatgatg
aactgcgaagatataaatgagtgtgctcagaatcccttgctgtgtgcttttcgttgtatc
aacacttatggtttttatgaatgcacatgtccagttggctatgaactaagagaagaccaa
aagatgtgcaaagacctagatgagtgtgctgaaggtctccatgactgcaaatcaagaggc
atgatgtgcaaaaatttgattggtaccttcatgtgcatttgtcctcctggaatgacccgg
agacctgacagagaaggctgcacagatgaaaatgaatgccataccaagccagggatctgt
gaaaacggtcgttgcatgaatgttattgggagctaccgatgtgaatgtaatgaaggattc
ctgtcaagtccatcaggcattgagtgtcttgataatcgccaagggttttgctttgctgaa
gttttacagacaatgtgccagatggcttcaagcagccggaatcttgtcactaaatctgaa
tgctgctgtgatggaggccggggctggggtaaccagtgtgagctctgtccactgcctgga
accacccagtataagaaactgtgtccacatggaccaggctatactacagatggaagagat
attgatgaatgtaaggtcatgccaaatctgtgtagaaatggacagtgtattaacactatg
ggctccttccgatgcttttgtaaagttggctacaccactgatataagcggtacatcttgt
atcgatcttgatgagtgcactcagtctcctaaaccatgcaattttatctgcaagaactcc
gaaggaagctatcagtgctcgtgtcctcggggctacatccttcaagaagatggaaagaca
tgtaaagatcttgatgaatgtcaaacaaaacaacataattgtcagtttctttgtgtcaac
acacttggaggcttcacatgcaaatgtccacctggttttacacaacatcacacagcttgt
attgataacaatgaatgtggttctcagccattgctttgtggatcaaaaggaatttgccaa
aatacccctggaagttttacctgtgaatgtcaaaggggattttctctggattcgactgga
ttaaactgtgaagatgtggatgaatgtgatggaaaccacaggtgccagcatggctgtcaa
aatatcctgggtggatacagatgcggatgcccacaaggatatattcagcattaccagtgg
aatcaatgtgttgatgaaaacgaatgctccaatcctaacacatgtggctctgcttcttgc
tacaacacacttggaagttacaagtgtgcctgcccatctggattttcttatgaccagttc
tccagtgcatgccatgacgtgaatgagtgttcttccaccaagaacccctgcaattatggt
tgctccaacactgaaggaggttatctttgtggctgtccacctggctattaccgagttgga
caaggccactgtgtctcagggatgggattcaacaaaggccagtacctaccactggatgga
gatgctgatgaagagaatgctttgtcccctgaagcatgttacgagtgcaaaatcaatgga
tattccaaaaaagacaacaggaagaagagaagtgctaatgacattatcaagcagattagc
ctggaaagtctagacatggatagtcctttgaagatgagagtcaacatctctagacttgac
aacaaggagcacatcctagaactcatgccagccattgagccccttaccaaccacgtgcgc
tatatcatctcacatggcaacaatgatggcatctttcaaatccatcagagggatggactg
agttatttgcacacagttaagaaaaagtcagtgcctggatctcacacactggaaatcacc
agcattccgctatataagaagaaggagctaaagaagctggaaaacagcagtgaggacaac
tacctcctaggagagcttggggaagctctcagaatgaggctgtggatagacctctactag
DBGET
integrated database retrieval system
