Chryseobacterium nakagawai: EG343_08050
Help
Entry
EG343_08050 CDS
T06300
Name
(GenBank) type IV secretion protein Rhs
Organism
cnk
Chryseobacterium nakagawai
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
SpvB
FG-GAP_3
FG-GAP
DUF5887
Ail_Lom
DUF6443
AlcCBM31
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZA90576
UniProt:
A0AAD1DQC3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1795596..1802261)
Genome browser
AA seq
2221 aa
AA seq
DB search
MKYYNKKIKLFSTFILSCISILGLSQTSSPQKFHDTKGNIEVTQAGQLQYTLPIDLPPGV
KNTAPNMSLVYVSGAGNGLAGYGWNISGITSISRVGKNLEKDGVKKAVKLDYYDHFSFNG
QRLILKSGEYGKDGAEYVTEKYSNIKIKSFGTLIGQIQGPFYWEVTFEDGSQAWFGETSA
ESATARTFIDYNIVKSKDANGNTVKYNYQLEDNVAVIKSVEWGGNEDQNTPHFNKIEFTY
TTRPIPETAYVAGMLFSQSKLLASITISTNSQQYKKYNVSYKKDLQETGYRYLDKITILN
GKNEEANPVTFTYEKSMDLPNPNIRTWETSSSLRPKEGEDLVGDFDGDGNLDLLRYHSAT
SQTIQQIGLYLYSNLYNAKYNAIVPSYLGNIITLTDFKGATAVNLKKGNLIHNRQGFVTN
KSVTNPSTSKKDLELSFYSLTGSNQLNLDYKKVIPSASWDHTSGTSQNGTKTEVRGLTGV
DFNGDGLSELVLKLSDKVCSSIPANNSDKLPFECNYYMRYHVIDPDESIPNNEWFYLLNL
YPDFEKRDKDVFTTHRVGDFNGDGIFDFLKLDQNKKPFLITFQKNLQGKYTSEVAPYPIN
SVNNQSLLGLWEDCVVGDYNGDGLSDIMVPSSDDSPLWYLYTSKGNGFIDNTVNFEKPRK
NRVVTKDPNDRIDVLNPRTYVAYDINNDGKAELIRLTSDRMYLKDHIQDSNQGVRYLRVR
GTTVNVFSTFGGGGNPPASDSQPYPNNTILYLNSSNIDAELAVNETDKVGLSVDQWTGAM
LRQFLLVSMVPAVGYAAGVEQLISYHSYYDISKEARIQSISQGGITTNITYKQLDRSINP
GLYDVSQTENYPYVQVSQSVGMYVVSGLTQSTATDKKVKQDFRYRGLTSNILGRGMIGFR
KTALSSWYADGFENTKVWSGVEIDPTNEGIPIKEWSIRTNDETKIFPADISENNTQLLSF
KSTTYQVDKLLNGQLITTVSNADRAKVVTVILPKINKGKDFLTGITAESTITYGEYYLPV
QNTSNINAGFSLKTSAYDYNNNPTGAGKDYYIGRLKSKTDVVQAYNDTKSGKEEYTYENT
NLKTIKKWNTDNTGYLLDTFQYDGFGNVLQKVTANSVDSQTETSKTEFDAKGRFVIKKTD
NLGLETQLTYNDWGQLLTQTDPMGNTVSSTYDAWGKLLTSKTNLTGMTTYAYDRDSNSNT
TVTQNKPDGDVSKTFTNRLGQEYKVSAKASMQGQYISKETQYDILGRKVIESEPYFEREN
ASQWNVMEYDDSVFPAKVKVTAFTGMRSETVVSGLTTTVTELSGYGRVTSKIKDALGNVK
SSTDKGGTIQFSYNASGDQTQAKYAENVVTTKYDAWGRKSEFNDPSNGIYKYEYTGFGLP
KKTISPKGSKEYTYNTLGQLISQKEFSTIDNGQTTNKTISFTYNGKGQITGKSGTVKGQT
FSTVLTYDPQGRLISSTENSNGKTYTEKGITFDDKGKVVSYEKEVQSGGILTKVAIENIY
NAWNGELHQIKDKNSGKILWELKDANAKGQVLKAKLGESEIYNRYDPTGFLQETKQGASL
QQPILNIQYAFDAVKNELMFRKTMGDFYIEESFDYDDNNRLVNWTDPVTGIKPSASRNLY
DVKGRITENDAVGTMKFDNSAKIYQPTGMTLNSAGTQNYKGDLIQTILYNENNDPVYVHG
EKTRLNFGYGLGNMRQRVDIERLKSTGGVSELDKNGDGIWDPNVPQWQLAISKFYSEDGS
FEVVRDQSTGLEKHILHIEGGPYESNIIYLKNFGETSGSYKFLHKDYIGSVLAISDEAGN
KLEQRHYDAWGNFTHLKLGNAPVITDKATIQGNYWLIDRGYTGHEHFMEVGIIHMNGRLY
DPLLRRFLNADENIQDPMNTQNYNKYGYVMNNPLMYNDPDGEFLWWAAGALVGRYLNGVA
ANGGNWNPGKWDWERTWSAVLGGAIGGAAVSGALGNIVNNGGAIKNFLPGIVSGGLNSAF
SGGNFLGGAIGGLSYSASVFTNNITSTNGISTSYKYIISPGYEYSGDDWEGLTKSILLGY
VRSNFCEDCSYGQLQQKAGTKFEEAFHSIMRIKLSNLNYTSNKNKFQGMYKDRPRNTIPD
GVFDIVDMQFDSRFKFKTYYGAAFAEVKAMDGTLYSSSNQGQISSMLNYMGFSNAVQKAG
RGNLMIGTTSDTYVAPSLYELSSKMNISIIHYRAYYRMVSGTMHIRFSYRWTDTTDSVIL
K
NT seq
6666 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatattacaacaagaaaataaaattattttctacttttatcttgtcctgtatatcc
attttaggattatcgcagacttcatcccctcaaaaatttcacgacaccaaaggaaatata
gaagtaacccaggcgggacagcttcaatatacattacctattgatcttcctcccggagta
aaaaatacagcacccaatatgagccttgtttatgtgagcggggccggcaacggactggca
ggttatggatggaatatttcgggaattacatcaatctcgagagttgggaaaaatttggag
aaagatggcgttaaaaaagctgtaaagctcgattattatgaccacttcagctttaacgga
cagcgtttaattttgaaatcaggtgaatacggtaaagatggggcagagtatgtgactgaa
aaatattcgaatataaagataaaatcatttgggactctgatcggacagatacaggggccc
ttttattgggaagttacttttgaagacggctcccaggcctggtttggagaaacgtctgct
gaatcggcaacggcacgaacttttattgattataatattgtaaagtcaaaagatgcaaat
ggtaataccgttaaatacaactatcagctagaggacaatgttgctgttatcaaaagtgtt
gaatggggcggaaatgaggatcagaatacgccacattttaataagattgaatttacttat
actacaagaccgatacctgagactgcctatgttgcaggaatgctcttttcacagtccaag
ctgctagcatctattaccatatcgacaaacagccagcagtacaaaaagtataatgtttct
tataaaaaagaccttcaggaaacaggctacaggtatctggataaaataacaattttaaac
ggcaaaaatgaagaagccaatcctgtgactttcacttatgaaaaatcaatggatcttccc
aatcccaatataagaacatgggaaaccagttcttcattaaggcctaaggaaggggaagac
cttgtaggcgattttgatggtgatggtaatcttgatttattaagatatcattctgcaaca
tcacagaccatacaacagatcggtttatacctgtacagtaacctctataatgcgaaatat
aatgcaatagttccaagttatttaggaaacatcattacgctaacggattttaagggtgcc
acagccgttaatttaaaaaagggtaacctgattcataaccggcagggatttgttaccaat
aaatctgttactaatccttctacatcgaaaaaagatctggagttatctttttatagcctt
acagggagtaatcaattgaatctggattataaaaaggttattccctctgcaagttgggac
cacacttccggaacgagccaaaatggaacaaaaacagaagttagggggttaacaggtgtt
gatttcaatggtgatggtttaagtgaattggttttaaagcttagtgataaggtgtgtagc
tcaatacctgcaaacaattctgacaaacttccttttgagtgtaattattatatgaggtac
cacgttattgaccctgatgaatcgatcccgaataacgaatggttttaccttttaaatctt
tatcctgattttgaaaagagggataaggatgtatttactactcacagagtcggtgacttt
aacggagatgggatatttgacttcctgaaattggatcagaataagaaaccattccttatt
acttttcagaaaaaccttcagggaaagtatacttctgaagtagctccttatccaataaac
tcagtgaacaatcaaagcttgctcggtctttgggaagactgtgtggttggagattataat
ggggatggtcttagtgatatcatggtacccagttcagatgattcgcctctttggtatctc
tatacttcaaaagggaatggtttcatagataatactgtaaattttgagaaaccgagaaaa
aacagggtagtgactaaggacccaaatgatagaatagatgtattgaaccctagaacttat
gttgcctatgatattaataatgatggaaaagcagaacttattcgccttacttcggataga
atgtatctgaaagaccatattcaggatagtaaccaaggggtaagatacctgagggttcgt
ggcacgacggtaaatgtattctcaacttttggaggtgggggaaaccctcctgccagcgat
agccaaccttatccaaataatactattctgtatttaaattccagcaatattgatgcagag
ctggcagtcaatgaaactgataaagtaggtctgtctgtggaccaatggacaggagcgatg
cttcggcaatttttattagtttcaatggttcctgctgttggatatgcagctggtgtagag
cagctaatatcctatcattcttattatgatatttctaaagaagcccgtatccaaagtatc
tcacaaggagggataacgacgaatattacgtataagcagttggatagaagcataaacccg
ggattatatgatgtttctcaaacagaaaactatccgtatgttcaggttagccaatccgtg
ggaatgtacgttgtttcgggtcttacccagtctacggcgacggataaaaaggtgaagcag
gatttcaggtatagagggcttacctcaaacatccttggaagaggaatgattggattcaga
aaaacagccctcagctcatggtacgcagatggatttgaaaatactaaagtatggtccggc
gttgaaattgatcctacaaatgaaggtatcccgattaaagaatggtcaattagaaccaat
gatgaaactaagatatttccggccgatatttctgaaaataatacccagttattaagcttt
aagtctaccacctatcaagttgataaactcttgaacggacagctgataaccactgtttcg
aatgctgatagagctaaggtggttactgtaattcttcctaaaatcaataaaggaaaggac
tttttaacaggtattaccgctgaaagtacaatcacttatggagaatattatcttccggtg
caaaatacttcgaatatcaatgctggattttctttaaagacttctgcttatgattataat
aataaccctacaggagcaggtaaagattattatatcgggcgcttgaaatctaaaacggac
gttgttcaggcatataatgataccaaatcgggtaaggaggaatatacctatgaaaatacg
aatctgaaaacgataaaaaaatggaacactgacaatacaggatatcttctggataccttt
cagtacgacgggtttggaaatgtacttcaaaaagtgactgccaatagtgtggattcccag
acagaaacttcaaaaaccgaatttgacgcaaaaggaaggtttgttataaagaagaccgat
aatttgggtctggagactcaattaacttataatgattgggggcagctccttacccaaaca
gatccgatgggaaatactgtaagtagcacctatgatgcatgggggaaattattgacctct
aaaaccaatttaaccggaatgacgacgtatgcctatgatagggatagtaattccaatacc
actgtaactcaaaacaaaccggatggtgatgtatcaaaaactttcactaacagattgggg
caagagtacaaagtttctgctaaagcttcgatgcagggacagtacatttccaaagaaacc
caatatgatatcttgggtagaaaagtcatagaatcggaaccctattttgaaagggaaaat
gcgagccaatggaatgtgatggagtatgacgattctgttttccctgccaaagtaaaggtt
acagcatttaccggtatgcggtctgagactgttgtttcaggtcttacaacaactgttacg
gaattaagcgggtatggaagggtcacatccaaaatcaaggatgctttaggtaacgtaaaa
tcttccactgacaaaggaggaacaatacagttttcctataatgcttcaggggaccagacg
caagcgaaatatgcagaaaatgttgtgactacgaaatatgacgcatgggggcgaaagtct
gaatttaatgatccgtcaaatggcatctataaatatgagtatacaggttttggcctgcct
aagaaaacgataagtccgaaaggaagtaaagaatatacttataatactttagggcagcta
atttcgcagaaagaattttctacgatagataacggacagacaaccaataaaactatttct
tttacttataatggaaaaggacagattactggcaaatcaggtacggttaaaggccagacc
tttagcactgttttaacctatgatccgcagggaagattaatttcctcaactgaaaatagc
aatggaaaaacctatactgaaaaagggattacctttgatgataagggaaaggtcgtttct
tacgaaaaagaagtacagtctggcggaatcttaactaaggttgctatagaaaacatctac
aacgcctggaacggagaactccatcagattaaagacaagaattctggtaagattctttgg
gagctgaaagacgcaaatgcaaaaggacaggttttaaaagctaaactaggggaatctgag
atttacaatagatatgatccaactggttttcttcaggaaactaaacaaggggcttctctc
cagcagccaattctgaatatccagtatgcttttgatgcggtcaaaaatgaattgatgttc
agaaaaaccatgggtgatttttatattgaagaatcttttgattatgatgataataaccgt
cttgttaactggacagatccggtaacgggaattaaaccctctgcaagcaggaacctatat
gatgtaaaaggaaggattacagaaaatgacgctgtaggaacaatgaagtttgacaattct
gcgaaaatatatcagcccaccggtatgaccttaaattcagcgggaacgcaaaactataag
ggagatctgattcagactattctttataatgaaaataatgatccggtgtatgttcatgga
gaaaagacacgtctcaactttgggtatggattagggaatatgagacagagggttgatatc
gaaagactaaaaagcacagggggagtttctgagttagataaaaatggagacgggatttgg
gatcctaatgtacctcaatggcagctggcaatctctaagttttacagtgaagatggaagc
tttgaagtggtgagagatcagtctacggggctggaaaagcatattctgcatattgaagga
gggccgtatgaatctaatatcatatatttgaagaactttggtgagacttccggttcttat
aagtttttgcataaagactatataggaagtgtccttgccattagtgatgaagccggaaac
aagctggaacaaaggcattatgatgcgtgggggaattttacccatctaaaattaggtaac
gcacccgtcattacagataaggcaactattcagggaaattattggcttattgaccgtggg
tataccggccatgaacattttatggaagtgggcattatccatatgaacgggaggttatat
gatcctttgctcagaaggtttttaaatgctgatgaaaatattcaggatcctatgaatacc
cagaattacaataagtatgggtatgtgatgaataacccgctgatgtataacgatcctgat
ggagaatttttgtggtgggcagccggagctttagtaggtagatatttaaatggcgtagct
gctaatggtggaaactggaaccccggaaaatgggattgggaaagaacatggagtgcagtt
ttgggaggtgctattggtggagccgctgtttcaggagcattggggaatatagtaaataat
ggcggtgccattaaaaacttcttaccaggaattgtttcaggaggtttgaattctgctttt
agtggtggcaattttttgggtggtgctattggtgggttatcttattctgctagtgtattt
accaacaatattacttctacaaatggaattagtactagctacaaatatattatttctcca
ggatatgagtattcaggagatgattgggaaggtttaacaaaaagcatactgttaggctat
gttagatctaatttctgtgaagattgttcttatggacaactacaacaaaaggctggaact
aagtttgaagaagcatttcatagtataatgagaattaaattatctaacttgaattatact
agtaataaaaataaatttcaaggaatgtataaagataggcccagaaatacaatacctgat
ggggtatttgatattgtcgatatgcaatttgatagtagatttaagttcaagacatattat
ggggcagcatttgcagaagtcaaagcgatggatggtactttgtatagcagttcaaatcaa
ggacaaatttcctcaatgctaaattatatgggatttagtaatgcagtacaaaaagcagga
agaggaaatcttatgataggaacaacttcagatacttatgttgcgcctagcttatatgaa
ctttctagtaaaatgaatatcagtattattcattatagggcatattatagaatggtttct
ggcacaatgcacatccggtttagttatagatggacagacactacggattcagtcatccta
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system