Chryseobacterium nakagawai: EG343_22565
Help
Entry
EG343_22565 CDS
T06300
Name
(GenBank) gliding motility protein
Organism
cnk
Chryseobacterium nakagawai
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_7
CHU_C
PKD_4
Ig_3
BiPBP_C
Filamin
Ig_2
Reelin_subrepeat-B
Y_Y_Y
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZA93187
UniProt:
A0AAD0YNL5
LinkDB
All DBs
Position
4929301..4932885
Genome browser
AA seq
1194 aa
AA seq
DB search
MLNRRKGSLFLVLFFVFIGSFIFAQNRVVKKGVPSKNNSSTAKAGAFIDVNTSNYPESSY
SITQLVKDVLISGGGCASNNVSNVVVYPNLPPSNQSRSWGYFNKGTTNFPFNRGVILSTG
FAKNAGNSPLSDLNDDLGTGGDLDLATALGIPNDKLANATYIEFDFIAVSSEITFKYLFA
SKEYQDNFPCNITDGFALLLKKAGDPTYTNMAVLPGGAGPVSVTNIRPGYPNCGPKNEAY
YGGTNTAHIETNFNGRTIPLTAKATVIPGQSYHFKMVLADFQDANYDSAVFLDAGSFDLG
VSILGPGGVKLPSSVNMCDNTPQTFTASVQVPNVTYQWFLNNNPIAGATNASYTATQPGV
YTVKVYIQGSSCPGEATITVVGGTSPTVQNATLTACYAAGNATFNLPVAQPAISTTAGAV
FTYYTTLADANAGNANTIPNPTTYQSAGGTVYVRVRNGFCAKVAELTLVKAPQMTGSIVP
PSVLTCANSQITLDASASVYPTGATFNWTTTGGNIVSGGNTLNPVINAPGTYTLTISQVY
QPGNINCTATATVTVTGNSAPPNPSLTAPKLKICKGESITLTASGGATYNWGGGLPGNGN
TQTVSPTVTTTYTVTAIGANGCASATPATLTIEVSEPFTAQNAILHKCYQPGLTYNLKES
EGQITTATGVTFTYYVIQADANAGNANSIAAPTTYSPTSANQTIYVRVSNGGCSYVVSLQ
LLRTAETTLTIAPPQTVTCTTPQITLNASASVVPAGSTITWTTVGGNIVSGANTLTPVVS
AGGTYTLTVANVFQPGNLNCSYNSTVTVTQDKVAPVAALVSSHSRICEGESVVLTASGGA
TYAWGNGLTGTGNTQTVSPTVTTTYTVTAIGANGCPSATPATVIVQVGPPIAGVSADKMK
ICAGESVTLTATGGITYNWVGLAGNGDTQVVTPTITTEYSVFALGGNGCSSLVAAKVKIE
VVPAIVSTLENVYVCAGDNGILDAGAGPNYTYLWNTGATTQTITTKVAGTYSVTISNGVC
SKVFTAQLINPDLPEIINVVYDKNILTLTASNPTGGTLEYSINNGVTWQSSNVFNGVLDN
TMYHLMVRVKNAKCGTSIDYFTFVLSNAITPNMDGINDTIDFSGISGYKDFAASIFDRYG
AEVFKATKGDVIWRGSLKGINLPTGTYWYRVQWENPANKKLEQRSGWILLKNRN
NT seq
3585 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaataggaggaaaggaagtttatttttagtgttattttttgtttttatagggagc
tttatttttgcccaaaatagggtggtaaaaaaaggagtgccttcaaaaaataatagttct
actgcaaaagctggagcttttatagatgtaaacacttccaattatcctgagtcttcttac
agtattactcagttagtaaaagatgtccttatatcaggcggaggatgtgctagtaataat
gtaagtaatgtagtggtatatccaaatttacctccatctaatcagagccgaagctgggga
tacttcaataaaggaactacgaattttccattcaatagaggagttattctttctaccgga
tttgccaaaaatgcaggaaattcccctctttcagatctcaatgatgatctgggaacaggc
ggagatttggatctggcaactgctttgggtattcctaatgacaaactggctaatgctact
tatatagaatttgattttattgctgtttcctctgaaataacctttaaatatttatttgcc
tcgaaagaatatcaggataattttccatgtaatattacggatggttttgctttattattg
aaaaaggcaggtgatcctacttataccaatatggcagtgcttccaggtggagcaggacca
gtgagtgtaacaaatattcgcccagggtatcctaattgcggacctaaaaatgaagcttac
tatggaggaacaaatacagctcacatagaaactaattttaatggacgtaccattccattg
acagcgaaagcaacagtgattcccgggcagtcttatcattttaaaatggtattggctgat
ttccaggatgctaattatgattcggcggtttttttagatgctggatcgtttgatttaggg
gtaagcattctgggaccaggtggcgtgaagcttccaagctcagtaaatatgtgtgataat
acaccacaaacttttacagcttctgttcaggtgcctaatgtaacctatcaatggttttta
aataataatcctattgctggagctactaatgccagttatacggcaactcaacccggagtg
tataccgttaaagtatatatacagggaagctcgtgtccgggagaggcaaccatcactgtt
gtgggaggaacttcccctacagtacagaatgctacattaacagcttgttatgcagctgga
aatgctacatttaatttacctgtagcacagcccgcaataagtactacagcaggagcggtc
tttacttattatacaacactggctgatgctaatgcaggaaatgccaatacaattcctaat
cccactacttatcaaagtgcgggggggactgtatatgtaagagtcagaaatggtttctgt
gctaaagtggctgagttgactttggtaaaagctccgcaaatgacaggatctattgtacct
ccttcagtattgacttgtgctaactctcagattaccttggatgcttcggcttcagtttat
cctacgggggctacatttaactggactactacaggaggaaatatagtttcaggaggaaat
acgctaaatcctgtaattaatgcacctggaacatatacattaacgatatcacaggtatat
cagcctggaaatatcaactgtacagcgactgcaacagtaacggtgacgggaaacagtgca
ccacccaatccatcccttacagctcctaaattaaagatttgtaaaggagaatctataacg
ttaacggcttcaggaggagcaacatataattggggaggaggtcttccgggaaatggaaat
acacaaaccgtatctccaacagttactacaacatatactgtgactgctattggtgctaac
ggatgtgcttctgctacacctgcaacgctcactatagaagtgtcagaaccgtttactgca
caaaatgcaattctgcataagtgttatcagccagggttaacctataaccttaaagaatca
gaagggcaaattactacagctacaggggtaacatttacctattatgtaattcaggctgat
gctaatgccggtaatgctaattctattgcagctcctacaacatattcacctacttcagca
aatcagacaatctatgtaagggttagcaatggcggttgtagctatgtagtttctctacag
ttattgagaacagcagaaactaccttgacaattgcaccaccacaaacggtcacctgtaca
actcctcaaattacgcttaatgcatcagcttctgtagtgccagctggatctacgattacc
tggactactgttggtggtaatattgtatcaggggctaatacacttactcctgtagtaagt
gcgggagggacttatacattgactgttgccaatgtgttccagcctggaaatttgaattgt
tcttataactcaacagtaacagtaactcaggataaagtagcaccggttgcagcacttgta
tcttctcattctcgtatatgtgaaggggaatcagtagttttaactgcttctggtggagct
acctatgcttggggaaatgggcttacaggtaccggaaatacacaaactgtatcaccaaca
gttactacgacatataccgtaactgctataggagctaatggatgcccctctgctacaccg
gcaactgttatagttcaggtaggacctccaatagcgggagtttcagcggacaaaatgaaa
atatgtgccggtgaatctgttactcttaccgctacaggtggaattacttataattgggta
ggtcttgccggaaacggagatacgcaggtagtaactcctacaatcactacagagtattct
gtatttgcattgggaggaaatggatgtagttctcttgttgctgctaaagtgaaaattgaa
gtagttcctgctattgtgtctacattagaaaatgtatatgtgtgtgctggagataatgga
attcttgatgcaggagcaggacctaattatacctatctgtggaatacgggagctactaca
cagacgattactacaaaagttgcaggaacttattccgtaacaattagtaacggagtatgt
tctaaagtctttacggcgcagcttatcaatcctgatcttcctgaaattatcaacgttgta
tatgataaaaatatattaacacttacagcaagtaacccaacaggaggcaccttagaatac
tctattaataatggagtgacctggcaaagctcaaacgtgtttaatggggtcctggataat
acaatgtaccatttaatggttagagtaaaaaatgcaaaatgtggaacttcaatagattat
ttcaccttcgtactcagcaatgccattactcctaatatggatggaataaatgacactata
gattttagtggaatcagtggatataaagattttgcagcttctatttttgataggtatgga
gctgaagttttcaaggcaacaaaaggagatgttatatggcgaggatctctaaaaggaatc
aatttgcctacagggacttactggtatagagttcagtgggaaaaccctgccaataagaaa
ttagaacaacgctcaggttggattttactgaaaaatagaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
