Clostridium neonatale: CNEO_2483
Help
Entry
CNEO_2483 CDS
T08280
Name
(GenBank) Putative transcriptional regulator, LysR-type
Organism
cnn
Clostridium neonatale
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysR_substrate
HTH_1
HTH_24
HTH_30
MarR_2
HTH_5
HTH_41
MarR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAH0437105
LinkDB
All DBs
Position
CNEO:2430946..2431848
Genome browser
AA seq
300 aa
AA seq
DB search
MNINLEYYKIFYTVAKCNNISDAADKLFISQPAVSKSIKKLEEMLSIKLFYRKSRGVALT
KEGAYLLEYVEKALTSLNDGEKLIDKLKTRETGNIKIGVSTTLGKHYLVPRLKNFISLYP
NIKIIIINKSAQETLKLIENNIIDIGIVSNLVSYEKFNYKRLYEIHDIFVSGPEFSKYKN
INTFNDLTKLSSLILLEKHNISRMYLDSFFKINSVELNPTMEIDNMDLLIELTKLNLGVS
CTIEEFVSKEVKTGALVKIDSLPTLPKRHIIMISNKNFSLSLAAQSFWDCLSNNCFNFLI
NT seq
903 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacattaatttagaatactataaaattttctatacagttgcaaaatgcaacaatatc
tctgatgcagctgacaagctttttataagtcagcctgcagttagtaaaagtattaaaaaa
cttgaagaaatgctttctataaaactgttttaccgcaagtcacgaggtgttgccttaaca
aaagaaggagcatatctcttagaatatgtagaaaaagctttaacaagcttaaatgatggt
gaaaaattaattgataaattaaaaactcgagaaactggaaatataaaaattggcgtcagt
actactcttggaaaacattatttagttccaagattaaagaattttataagtttatatcct
aatataaaaataattataataaacaaaagtgctcaagaaacattaaaattaattgaaaac
aatataatagacattggaatagtaagcaatttagtttcatatgagaaatttaattataaa
agattatatgaaattcatgatatatttgtctctggtccagaattttcaaaatataagaat
attaatacatttaacgatttaactaaattatcatcacttattttattagaaaaacataat
atttcaagaatgtatttagatagtttctttaaaataaattctgtagaattgaatcctaca
atggaaattgacaatatggatttattaattgagcttaccaaattaaacttaggcgtttca
tgtacaattgaagaatttgtctctaaagaggttaagacaggtgcattagtgaaaattgat
tcacttcctacgcttcctaaaagacatataattatgatttcaaataaaaatttttcttta
tctttagcagcacaaagtttttgggattgtttgtctaataactgttttaactttttaata
taa
DBGET
integrated database retrieval system
