Chryseobacterium nepalense: M0D58_10315
Help
Entry
M0D58_10315 CDS
T08142
Name
(GenBank) alpha-amylase family glycosyl hydrolase
KO
K01214
isoamylase [EC:
3.2.1.68
]
Organism
cnp
Chryseobacterium nepalense
Pathway
cnp00500
Starch and sucrose metabolism
cnp01100
Metabolic pathways
cnp01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cnp00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
M0D58_10315
Enzymes [BR:
cnp01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.68 isoamylase
M0D58_10315
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Por_Secre_tail
CBM_48
FG-GAP
IMP2_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPQ74445
LinkDB
All DBs
Position
complement(2364665..2367505)
Genome browser
AA seq
946 aa
AA seq
DB search
MKKFYSGILLLMVALVFGQISYTITPNPFNETDAITLTVPGNQIDESAWGVANNAVYIWS
WSLDTNYQNSQDCPTNGSWTNSNELNRLNYNSATDTYSLTFTPTAFYGRTGIGRFGFLLK
NKTGTSQTSPDIFVNVGILNLSMTNPAVNSLTSVPAGNSINVTATTNVNATFQLKANGSV
VHSTSTPSTSYSYSYTVTGDANMELIATDANSNTKNATFILQVPRNVVSEAIPSWIKQGI
NYHPTDQTKVGLALYAPFKNFVHVIGSFNNWTVNDTYLMKRDTTNPDLYWIELSGLTPQQ
LYTFQYRTNDLRKVADPYSPQILSSYDDQWITSSTYPNLPAFPTGQGFEVSMFKTGQSPY
NWQVTNFQRPAKDNLVIYELLLRDFTQEKTWQSLINKITYLKNLKINAIELMPIMEFEGN
LSWGYNTSFHYALDKAYGTPEKFKEFVDICHQNGIAVILDVAFNHATGRSPLVRLWNVDP
DGDGYGDVATNNPYFNTVPKHSYNVFNDFNHSSSSTKYYVERCLQQWLTEYKIDGFRWDL
TKGFTQNCSENDETCTNAYQQDRVDILKYYADRQWTIDPNSYMIFEHLGTDAEEQQWANY
RVAEGKGVMLWNKQTDPYNQNTMGYKENSSYDRMNHALHGFTNMHAVGFGESHDEERLMF
KNLAYGAVNGSYDVKNLNTALERMKTFGATFFTIPGPKMIWQFGELGYEFSINRCGDGSI
NPGCRTDEKPIAFTLGYDTNVNRKAVYDTWAKIIDIRNAYPVFRSKTYTVESNNLTNDPN
GLITRIYVYDNTLTNGVKNIVVVANYNTTAQNVVPYFPYTGQWQNLMDNSISNITSTTAA
ITLQPGEFRIFGNYVGNLSTIDETAAYKLSLQIADNPVKNGLAILMYHKAKNGEILIYDM
SGKRVDSFKLKNEDGTYELNANYAPGTYLVHLKSDSGVAIQKMIIQ
NT seq
2841 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaattttattctggtattttattgcttatggtggccctggtcttcgggcagata
agctataccatcaccccgaacccctttaacgagacagatgctattaccttgacggttcct
ggaaatcagatagatgaatccgcttggggagttgccaacaacgccgtttatatctggtcc
tggtctctggacacaaactatcagaacagccaggattgccctacgaatggaagctggaca
aactctaatgaattgaacaggctgaattacaattcagcaacagacacgtattctctaacg
tttacacccactgctttttatggcagaacgggaatcggaagattcgggtttttattgaaa
aataaaacaggtacaagccagacttctccggatatctttgtgaatgttggaattctaaat
ttaagcatgaccaatccggctgtcaacagtcttacgtctgttcctgcaggaaattctata
aatgttacggccacaaccaatgttaatgcaacattccagctaaaagccaatggaagtgta
gttcattctacttcaacaccttcaacttcttattcgtacagctatacggtaacgggagat
gcgaatatggaattgatcgcaacggatgccaattcaaatacgaaaaatgctacatttatt
cttcaggttccgcgaaacgttgtttcggaggctattccgagctggattaagcagggaata
aactatcatcctaccgatcagacaaaagtaggactggcgttatatgctccttttaaaaat
tttgtacacgttatcggaagttttaataactggacggtaaacgatacctacttaatgaag
agagacacaacaaacccggacttgtactggattgaactgagtggccttactccacaacag
ctctatacattccaatacagaacaaacgaccttagaaaggtggcagatccatattctcca
cagattttatcttcttatgatgatcagtggattacctcttccacttacccgaatttaccg
gcattccctacaggtcagggctttgaagtttccatgtttaaaactggccagtctccttat
aactggcaggttaccaacttccagcgaccagctaaagataatcttgtgatttatgaatta
ttattaagggatttcacgcaggaaaaaacatggcagtcattaattaacaagattacttat
ttaaaaaatttaaagattaatgcgattgaattaatgcctatcatggaatttgaagggaat
ctctcctggggatataatacctctttccattatgcattagataaagcgtacggaacccct
gaaaagttcaaagaatttgttgatatctgtcatcagaacggtattgccgtaattttggat
gtcgcttttaatcatgctaccggccgttcgccattggttaggctttggaatgtagatccg
gatggtgacggatatggtgatgttgccactaataatccttacttcaatacggttccgaaa
cattcttataatgtttttaatgattttaaccattcaagttcttcaactaaatattacgtt
gaaagatgccttcaacaatggcttaccgaatataaaattgatggtttccgatgggatctt
accaaaggatttacccaaaactgctctgaaaatgatgaaacctgcaccaatgcctaccag
caggacagagtagatattttaaaatattatgcagacagacaatggacaatagatccgaat
tcttacatgatttttgagcacttaggaacggatgccgaagagcagcaatgggccaattac
agagttgcggaaggaaaaggtgtgatgctttggaataaacaaactgatccttacaaccaa
aatacaatgggctataaggaaaacagcagttacgatagaatgaatcatgcacttcatggc
tttacaaatatgcatgcggtaggttttggtgaaagtcatgatgaagaaagattaatgttt
aagaacctggcttatggagctgtaaacggaagctatgatgtgaaaaatcttaataccgct
ttagaaagaatgaaaacgttcggagctactttcttcactattccggggcctaaaatgata
tggcagtttggcgagctgggctacgaattcagtatcaacagatgtggcgacggctctatt
aaccctggatgcagaacggatgaaaaaccaattgcgtttacacttggatatgataccaac
gttaatagaaaagctgtatatgatacctgggctaaaattattgatatcagaaatgcatat
cctgttttcagatcgaagacatatactgtagaatctaataatcttaccaacgatccgaac
ggattgattacaagaatctatgtttacgataatacccttaccaacggtgtgaaaaatatt
gtcgtagtggcaaactacaacacaacagcacagaatgtagttccatatttcccttataca
gggcagtggcagaatcttatggataattcaatctcaaacatcacttctaccacggcagcc
atcactttacagccgggagagttcagaattttcggaaactatgtaggaaatttgtcaaca
attgatgaaaccgcagcctataaactgtcattgcagatcgcagataatccggtgaaaaac
ggtttggcaatattaatgtatcacaaagccaaaaacggagaaattttaatctacgatatg
agtggtaagagagttgatagctttaaacttaaaaatgaagacgggacatatgaattaaac
gctaattatgcgccgggtacctatctggttcatttaaaatcagattctggagttgctatt
cagaaaatgattatacaataa
DBGET
integrated database retrieval system