Contarinia nasturtii (swede midge): 116338813
Help
Entry
116338813 CDS
T08003
Name
(RefSeq) regulator of MON1-CCZ1 complex isoform X1
KO
K24763
regulator of MON1-CCZ1 complex
Organism
cns
Contarinia nasturtii (swede midge)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cns00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
cns04131
]
116338813
Membrane trafficking [BR:
cns04131
]
Endosome - Lysosome transport
Others
Others
116338813
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RMC1_C
RMC1_N
Beta-prop_EML_2
DCB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116338813
NCBI-ProteinID:
XP_031620169
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
629 aa
AA seq
DB search
MEQSYYLELCSDPIRFDSVSQLTDVFFDDSNKQLFAVRSGGATGITVKGPTENQTLTFCM
DDKGPMRSIKFSPDKKLLAIQRTEKCIEFITFVNNQPNVNEIIVHQSKSTIVYGFVWIHN
REVVFISNTGVEIYTVNVEKKQLKSIKSMNLTVDWFSWCPTGNLAVLASNKGMLLTPILI
KQGGVITRLPKIEWKSEHGIPERDLTLAEIYGTLAILILKPTSTRLVEVIIYLLNGPGLA
PKKSHILQLGHSGRFAMNIVDDLIVVHHQASATSLLFDIKLTTGTVSNNDVTCHTPITLG
RPIKPFSLQVPSLSLDGKTKNCELYSPNWVLFQPNIVIDAKIGCLWYVKLRLESLCNLVT
DRVKLVELLLNRTNAKLVLLGTLKEMLSYQYNGNLLPVIENVFDKLNVVYSSWVTTELQN
ITAQPSSAKQVAKTTTVPRVLIDQNDLFVNIFSNLSDSTYIGKIIMLYITSLAKHNIAAQ
HDISKLVIVDLVRRKQFDTLQNLIKFSLINESKVLACFLLSLSHEHPSVTQMALDMLQKL
NAETIIIEVLLGQGKIVEALRLANSLTGAENLSARKYLEAAKKTNDSIVFYTVYTWFQQR
NIRQRGSPDFLKTELCEEYINHYQKLYCS
NT seq
1890 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagcaatcttattatttggaattatgtagtgatcccattcgctttgattcagttagc
caattaacagatgtattcttcgatgattcaaataaacagttgtttgctgtacgatctggt
ggtgcgactggaattactgttaaaggaccaactgaaaatcaaacgctcaccttttgtatg
gatgacaaaggaccgatgcgttcgataaaattttcacccgataaaaaattgctggccatt
caaagaacagagaaatgcattgaatttatcacatttgtaaataatcaaccaaatgttaac
gaaatcattgtgcatcaaagtaaaagtacaattgtctatggattcgtatggatacacaac
agagaagttgtatttatatcaaatactggtgttgaaatttatacggtcaatgtggagaaa
aaacaattaaaatcgataaaatcgatgaacttaacggtggattggttttcatggtgtcca
acgggaaatttagcggtgcttgcatcgaacaaaggaatgttactcacaccaattctcatc
aaacagggcggcgttatcactagactacccaaaattgaatggaaaagtgaacacggcatt
ccggagagagatttaacgttagcagaaatatatggcactttagccattttaatattgaaa
ccgacctccacacgattggttgaagttataatttatctattgaatggaccaggtcttgct
ccaaaaaaatcccatattcttcaattgggccacagtggtcgttttgctatgaatattgtg
gatgatttaattgtagtccatcatcaggcttcggctacttcattgctatttgacatcaaa
ttaactactggaacggtttcaaataatgatgttacgtgccacacacctataacactggga
agaccaattaaaccattttcactgcaagttccaagcttgtcgttggatggtaaaactaaa
aattgtgaattatattcaccgaattgggttttattccaaccaaatattgtaattgatgca
aaaattggttgtttgtggtatgtaaaacttcgtctggagtctctgtgtaatttggtcacc
gatcgagtcaaattggtagaactcttacttaaccggacaaatgcaaaactagtgttgctg
ggaacactgaaagagatgcttagctatcaatacaatggaaatctattgcctgtgattgaa
aatgtctttgacaaactgaatgtggtttattcgagttgggttacaaccgaattacaaaat
attacagcacaaccatcatctgccaaacaagtggccaaaacaacgaccgtgccgcgcgtt
ctaatcgatcaaaatgatttatttgtcaacattttttcgaatttaagcgattcgacctac
atcggcaaaataataatgttgtacattacctctttggccaaacataatattgctgcacaa
catgatattagcaagcttgtaatcgttgacttagtgcgacgcaaacaatttgatacatta
cagaatttaattaaattctccttgattaatgaatcgaaagtgcttgcatgttttctactt
tcattatcgcatgagcatccatctgttacgcaaatggccttggatatgctgcaaaaacta
aacgcagaaacgataataattgaggttcttttaggccagggaaaaatcgtcgaagctctg
cgattggccaattcattaacaggagccgaaaatttgtcagcccgtaaatacttagaagct
gcaaagaaaaccaatgattcaattgttttttatacggtttatacatggtttcagcagcgc
aatattcgtcagcgtggctcccctgacttccttaaaaccgaactctgtgaagaatacata
aaccactaccaaaaattatactgtagttga
DBGET
integrated database retrieval system