Contarinia nasturtii (swede midge): 116341963
Help
Entry
116341963 CDS
T08003
Name
(RefSeq) RINT1-like protein
KO
K20474
RAD50-interacting protein 1
Organism
cns
Contarinia nasturtii (swede midge)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cns00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
cns04131
]
116341963
Membrane trafficking [BR:
cns04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Retrieval pathways
NRZ (DSL1) complex
116341963
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RINT1_TIP1
Med2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116341963
NCBI-ProteinID:
XP_031625269
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
723 aa
AA seq
DB search
MKDVAKSVIERINRDIGSDIKNLHNCKAISSEYAKRVGEIEAELLIEGNGIPSTIKSALA
QCRDSNEIIQLETAKIDQFQEKLIQKLDGYHSILDGVTKQLDKIRCLQLLVEYFKILNDI
QEIGKSLAANIKDDQKAIGLYLSLYGGTDSANSIIGRLESVEAVNLRSYAERTAIYWYEI
LKKKLSKDFESVLDVIKWPYLGSASTELINPTKDSLNKLMSAAEHLFLLQSPEEKNDSFI
SITPSILCQPLSTPVELLVKPFRQRFLYHFTGPRQTNRPDKPEWFFTQILNWAKDNHIFV
GTHIQPALNLAGHSDINIRLEFVRGLVQLAVEKLCNDIDEIVENDALFSHLIDETLAFEQ
EIRDTLGYPSSYCSAITVLTQAKYLTKWLAIEEQFTSDKMDLILSQSSAWLFIDPSNLEE
LKIPRCADQFIRLLDAICERYCNLPQPGHQLQFLNLQLELIENFRRRLVHLHSNPENGVT
TTCMVLNAINYINSVLREWGENVHYLHLYAALFGPHTDEINSVFDKVVDDLEQWQRILVK
ELTSKLVDDIKAKSMAYRHDNWISMSDHNALEPFMLSSTAGEMFQLMVTSLHNLETELSI
NIFNIALRLIAHQLDDFFIDSMIMNTKFSTGGASQFDFDMNRNLFALFGQYARRPDLLFK
KIHDACKLLVFPLGNAMLLTETLKNDIKSKSDSKGALAEIGVVNISNLMALDILERRNDI
CSY
NT seq
2172 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagatgttgcaaaaagtgtgattgaacgaataaatcgtgatattggtagcgatatt
aaaaatttacacaattgcaaagcaatcagtagcgaatatgcaaaacgtgttggcgaaatc
gaagcagaacttctgattgaaggcaatggaataccatcaactattaaatcggcattggca
caatgtcgtgattcgaacgaaattattcaattggaaaccgcaaaaattgatcaatttcaa
gagaaacttatccaaaaactagacggttatcatagcattcttgatggcgttaccaaacaa
ttagataaaatacgatgtttgcaactgttagtcgagtattttaaaattttaaatgacatt
caggaaattggcaaaagtttagcggccaatataaaagatgatcaaaaagcgatcggattg
tatttgtcactgtatggcggcaccgattcagccaacagtattattggccggcttgaaagt
gttgaagcagttaatttaagatcatacgcagaacgaacagctatttattggtatgaaatt
ctaaagaagaaattatccaaagactttgaatcggtattggatgttattaaatggccatac
cttggttcagcatctaccgagcttatcaatccaaccaaggattcgcttaataaattaatg
tcagcggcggaacatctatttttgctgcaatcgccagaagaaaagaatgattcatttata
tcgataacgccatcaattttgtgccagccattaagtacaccagtagaattgcttgtaaaa
ccatttcgacaaagatttttgtatcacttcactggtccacggcaaacaaatcgaccagat
aagccggaatggttttttacgcagattttaaattgggccaaagataatcatatttttgtt
ggaacacacattcaaccggctctaaatcttgccggtcattcggatatcaatattcggctg
gagtttgttcgtggtttggtgcaattggcggtagaaaaattatgtaacgatatcgatgaa
attgttgaaaatgatgctctattttcgcatttaatcgatgagacattggcatttgagcaa
gaaattcgtgatacacttggttatccaagcagctattgcagtgcaataactgttttaaca
caagcaaagtacctgactaaatggctggctatcgaagaacaatttacatcagataaaatg
gatttaattttatcacaatcgtcagcatggttgtttatcgatccaagtaatttggaagaa
ttaaaaataccacgatgtgccgatcaatttattcgtttgttagatgcaatatgtgaacgt
tactgtaatttaccacagccgggtcatcagttgcaatttttaaatttacaattggaattg
attgaaaactttcgccgtcggctagtccatttacacagtaatccagagaatggtgtgacc
acaacgtgtatggtcttgaatgcgattaactatataaattcggtgctacgtgaatggggt
gaaaatgttcattatcttcatttgtatgccgctttgtttggtccgcacaccgacgaaatc
aattcggtatttgataaagtggtcgatgacttggaacaatggcaacgaatactggtgaaa
gagcttacatcaaaattagttgatgacataaaagccaagtcaatggcctatcgtcatgat
aattggatttccatgtctgatcacaatgcactcgaaccgtttatgttatcatcaacagct
ggcgaaatgtttcagctaatggtgacaagtttgcacaacctcgaaactgaactttcgatc
aacatcttcaatatagcattgagattaatcgctcatcaattggacgactttttcatcgat
agcatgattatgaatacgaaattttcaactggcggtgcatcacaatttgattttgatatg
aatcgtaatctatttgcattatttggacaatatgccagacgacctgatttactattcaaa
aagatacacgatgcttgtaaattattagtttttccgttaggaaatgcaatgctacttacc
gaaactctgaaaaatgacatcaaaagtaaaagcgattcgaaaggtgcattggccgaaatt
ggtgtggttaacattagcaatttaatggcattggacattcttgagcgacgaaacgatata
tgttcgtactga
DBGET
integrated database retrieval system