Contarinia nasturtii (swede midge): 116348125
Help
Entry
116348125 CDS
T08003
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC116348125
Organism
cns
Contarinia nasturtii (swede midge)
Brite
Polyketide biosynthesis proteins [BR:
cns01008
]
Nonribosomal peptide synthetase (NRPS)
Linear NRPS
ACV synthetase
116348125
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
Condensation
PP-binding
AMP-binding_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116348125
NCBI-ProteinID:
XP_031634856
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2048 aa
AA seq
DB search
MQQALVSLADALTYTPQQPIRSLTVMPKEERKMLLHTWNDTTVNYPSLRCLHEIFEAQVV
RDRDAIALECAEETLSYAELNARSNRLAHYLIAQSVKPDDRIALCVKRSSKLLVAILGIL
KAGGAYVPLDPVYSSQRLKNILQNANPLCLLVDSIGRKALGDHEVPMVNLDEALPDTLSA
HDNPDPIKLGLTPAHLSSVLYTSGTTGTPKGVMIEHRNITNYLNWCKEEFTTEDLEHTLF
STSIGFDLSVFECFAPLSVGKMIHIVEDALSITQIESKISLFNTVPSALTAILNVGTLPS
SLRILQMVGEPLNQRLINRIFMQTQIMKLYNLYGPTETNNVTCYTYKTGDVVIETIGRPI
ANTRIYLLDSQGEPVPLGAEGELYIGGAGVARGYLNRPELTAEFFLPDPFTGDPEARIYR
TGDLARYLSDGNLVFLGRIDHQLKVRGFRIEPGEIEACLVDHPLVREAVVLSWKNKPDAD
ARLVAYVVADPDISMIQNLRTYLATLLPDYMMPAAFVCLSSLPLTANGKLDRHALPTPDD
EAFARQSYEIPKGVMEVKLASIWSELLGIERISRHDNFFALGGHSLLIVRMLSQLQKSGL
VTKVREVFDAPSLAVLAETLSHHIAISTPPNQIIVESTVITPEMLPLIDLSQAEIDSLVE
LEPGGVANIQDIYGLAPLQEGILFHHLMAENGDPYLTVSLLQFNDRAALDRYASALDKVI
ARHDILRTVFVWEGLSAPAQVVLRHVPPLLSDIMLDGPVLEQLNDQFNPRHYRLNLEQAP
LLRLVAALTSEGIWIAVQLMHHIIGDHVSLQRLYEEIRTIIDGESDQLAKPIPFRNVVAQ
ARLGVSQAEHTQFFSDMLSDIDTPTLPFGLSDVHCDGNEFNEGYLKISQPLNNRLRALAR
HFHVSLASLCHLAWAKVLACTSGNESVVFGTVLLGRLQSGEDNDSAIGLLINTLPLRLDI
NDTTVENAVRNSHSRLSALMMHEHASLALAQRCSGVPAKLSLFNALLNYRHKSQTNRELP
AGLRILSNEGRTNYPITLSVDDDDNSLSLSAQVVSPISATRICDYMQQTLFSLALSLART
PQQFVRRLTVMPPEERDMLLHNWNRMTVNYPPVHCLHQLFEAQVACDGSTNAVKCEGETL
SYKELNTQSNQLAHYLIGKGVRPDDRVAVCIKRSTKMIVAILGILKAGGAYVPFDPAFSS
QRHINILHDASPLYLLADATGQAALGNVQVPVVNLDEALPCGLSIDNPDPTTLGLTPSHL
AYIIYTSGSTGTPKGVMIEHKQITRLFEVTRKQFDFDKQDQWCLFHSFSFDFSVWEIWGA
LLNGSQLAIVSYNTSRSADEFYKWLCINRITVLNQTPSAFKMFIKAKSNSSLSDRLRYVI
FGGEELDPFLARDWIEKYSKVHTKLVNMYGITETTVHATYQQLESSKHIYSIGRPLSDLC
VYLLDSHGEPVPLGAEGELYIGGACVARGYLNQPELTAERFLLNPFSENTRGRMYRTGDL
ARYLPDGNLVYLGRADQQVKIRGFRTEPGEIESHLMEHHLVREAVVLPWKYEIDSDTRLV
AYVVADPDTSLANNLRTYLVSLLPDYMVPAAYVCLSSLPLTPNGKLDRRALPAPDDEAFA
RQLYEEPRGEMEEKLAAIWSELLGIERISRNDNFFALGGHSLLIVRVLAQLRKAGLDTSV
KQIFDAPTLIALAETLGKHQSFSIPPNLITTKSTMITPDMLPLIDLSQAEIDTMVTQVPG
GVNNIQDIYALAPLQEGILYHHLMAQHGNPYLLILRLQFSDRVSLDNYATALQKVIERHD
ILRTSFFWEGLSEPAQVVLHQVPSILTEVTLDEIDDPELKQSSNRFNLRQYCLDLKQAPL
LRLLVSPTSEGLWIGVQLLHHIIGDHVTLQRLHAEVGAIINGESDQLTKPTPFRHVVAQA
RLGVSQAGHTQFFSDMLSDIDTPTLPFGLSDVHGDGTEFNEGYLKMPQPLNNRLRVLARH
FHVSLASLCHLAWAKVLACTSGNESVVFGTVLLGRLQSGEDNDSAIGLLINTLPLRLDIN
DTTVENAV
NT seq
6145 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaacaggctctcgtctcacttgccgatgcattaacctacacaccacagcaaccaatt
cggtcattaacagtgatgccaaaggaagaacgtaagatgctattgcatacctggaacgac
acgacggtcaattatccatctcttcgttgtcttcacgagatttttgaagcacaggttgtg
cgcgacagagatgcaattgccttggaatgtgcggaagaaactttgagctatgctgaactc
aatgcacgatcaaaccggctggcacattacttaattgcacaaagcgtcaagccagatgat
cgcatcgcactttgtgttaaacgcagctctaaattactcgtagctatattgggaattcta
aaagccggcggtgcctacgttccacttgatccagtttactccagtcaacgcctaaaaaat
attctacagaacgcgaatccattgtgtttgttggtggattctattggtcggaaagcactt
ggagatcatgaagtgccaatggtcaatttagatgaagcgttgcctgacacactttctgct
catgataaccccgatccgattaagctgggtctaacgccagcgcacttgtcctctgtactc
tacacttctggaacaactggaacaccgaaaggggtgatgatcgaacacaggaatatcaca
aattaccttaactggtgtaaagaagagttcacaacggaagatttggagcataccttattt
tcaacttctattggatttgatttgtctgttttcgaatgttttgcgccattgtctgtggga
aaaatgatacatatcgtggaggatgctctttctattacacaaattgagtcaaaaatatcc
ttattcaatacagtaccttctgccctgactgcaatactaaatgttggaactttaccttct
tcacttcgtattctccaaatggtaggcgagccattaaaccaacgcctaatcaaccgaatt
tttatgcaaactcaaattatgaaactatacaatctgtacggaccaacagagactaataac
gtaacttgttatacatataaaacaggcgatgttgtaattgaaacgattgggcgacccatt
gctaacacccgcatttacctgctggattcacaaggtgaaccggtgccattaggagccgaa
ggagaattgtatattggtggcgctggtgtcgctcgtggctacctcaatcgacctgaactt
accgcagaattttttcttcctgatccattcactggcgatccagaagcacgtatataccgc
accggcgatctggcacgctatttatctgatggtaatttagtctttttgggacgcatcgac
catcagttaaaagttcgtggtttccgaattgagcccggtgaaatcgaagcctgcctagtc
gaccaccctctagtaagagaggcggtagtattgtcgtggaaaaacaagccagatgcagat
gctcgactagtggcctatgtagtggctgatcccgacatatcaatgattcaaaacctacgc
acttatctagcaactttactgcctgactatatgatgccagcagcttttgtttgtttatca
tctctgccactcacagccaatggaaaactagatcgacatgcattgcctactccagacgat
gaagcctttgctcgtcagtcgtatgagattccgaaaggtgtaatggaagtgaaactagcc
tcaatatggagtgaactgttgggtattgagcgtattagtcggcatgataacttcttcgcg
cttggtggtcattctcttttaattgtaaggatgctgtcacaattgcaaaaaagtggactg
gtcaccaaagttcgggaagtatttgatgcaccctcattagctgttctagctgagactctg
agtcatcatatagcaattagtactccacccaatcagattatcgttgaaagcacagttatt
actccagaaatgttgccacttatcgatctgtctcaggcagagattgatagtttagtcgaa
ctggagccaggtggtgtggctaatattcaagatatttatggattggcaccattacaagaa
ggcatattgtttcatcatttgatggcggaaaatggcgatccgtacttgacagtaagtctt
ttacaatttaatgatcgagctgcacttgatcgctatgcgtccgccttggacaaagtgatt
gcacgacatgatattttacgcacagtgttcgtctgggaaggtctcagtgcaccggcacaa
gtcgtcttgcgacatgttccaccgttactcagcgacatcatgctagatgggccggtgctg
gaacaattaaatgaccaattcaatccacgtcactaccgtctaaacttagaacaagcaccg
ctgttgcgtttggtagctgcgctaacgtcggaaggtatttggatagcagtgcagttaatg
catcatataattggtgaccatgttagtttacagagactgtatgaagaaattcggactata
atcgatggagagagtgaccagttggcaaagcccatacccttccgcaatgtagtcgcccag
gctcgtctgggagttagtcaagctgagcacactcaattctttagcgacatgctcagtgat
attgatacaccgaccttgccgtttggcctgagcgatgttcattgcgacggaaatgagttt
aatgaaggatatctgaagatctcacaaccactcaataatcgattgcgagccctcgcacgt
catttccatgtcagtttggctagcctttgccatttagcgtgggcaaaagtactagcatgc
actagtggaaatgagtcggttgtctttggtacagtgctactcggtcgtttacagtccgga
gaagataatgacagtgccattggattattgatcaacactttgccgttacgattggatatc
aatgacactacagtcgaaaacgctgtgcgtaactctcattctcggttgagtgctttaatg
atgcatgaacatgcatcgcttgcattggcacaacgttgtagtggggttccagctaaacta
tcactttttaatgcgttactgaactatcgccataaatctcaaacaaatcgtgaattgccc
gctggattacgtattctcagtaatgagggacgaacaaattacccaataactctatcggtg
gacgacgatgacaattctttgagtctctcagcccaagtggtgtcaccaatatcagcaaca
cgaatctgtgattacatgcaacagaccctcttctcacttgccctttcattggcacgcaca
ccacagcaatttgtacgaagattgactgtgatgccaccagaagaacgtgacatgctattg
cataattggaatcgaatgactgtcaattatccacctgtccattgtcttcatcaattattt
gaagcccaagtagcgtgtgacggttcaacgaatgccgtcaaatgtgaaggagaaactttg
agctacaaagaacttaatacacagtccaatcaactagcacactacctgattggcaaaggt
gttaggccagatgatcgcgtcgcagtttgcattaaacgcagcacgaaaatgatcgtagct
atattaggcattttgaaagctggtggtgcttatgttcctttcgatccagccttttcaagt
caacgacatataaatattttgcatgacgccagtccgctatatctattagcagatgccact
ggtcaggcagcacttggaaatgttcaagtgccagtggtgaatttggatgaggcgttgcct
tgcggtctttcaatcgataatcctgacccgaccacactcggacttactccatcacatctg
gcctatataatttacacttctggctcgactggaacaccgaaaggagtgatgatcgaacac
aagcaaattacaagactcttcgaagttacacgcaaacaatttgactttgataaacaagac
caatggtgtttgttccattccttctcttttgacttttctgtatgggaaatatggggtgca
ttacttaatggaagtcaactggcaattgtatcttacaacaccagccgttctgctgatgaa
ttttataaatggctttgtattaatcgtattactgttctcaatcaaactccatccgctttt
aaaatgtttattaaagcaaaaagcaacagctcactgtctgatcgactgcggtatgtaatt
ttcggcggcgaggaattagatccattccttgcaagagactggattgaaaaatactccaaa
gtgcacacaaaactcgtcaatatgtatggcattacagaaacaacagtgcatgccacatat
cagcaattagaatcttcaaaacacatttattcaattggacgtccactctcagatctttgt
gtctatttgctggattcacatggtgaacctgtgccattgggagctgaaggggaattatat
attggtggcgcttgtgtggcccgtggttatctaaatcaacccgagcttacagcggaacgt
tttcttctcaatccatttagtgaaaatacaagaggacgcatgtatcgcactggtgatctg
gcacgctatctacctgatgggaatttagtatatctcggacgcgctgatcaacaggttaaa
atccgtggttttcgaactgagcccggcgaaattgagtcccatttaatggaacatcatttg
gtgcgcgaggcggttgtactgccatggaagtacgagattgatagtgatacccgcctggtc
gcatatgtagtagccgatccagatacatcactcgctaacaatctacgtacatatctggta
tctctattgcctgattatatggtaccagcagcatatgtttgtctatcatcattaccactc
acaccaaatggcaaattagaccgacgtgcacttccagcaccggacgatgaagcatttgct
cgtcaactatacgaagaaccgcggggtgaaatggaagaaaaactggctgcaatctggagt
gaactgttgggtattgagcgaatcagccgaaatgataatttctttgcgttgggtggacat
tctttgctgattgtacgagtgctagcacaattacgaaaggccggattagatactagtgtc
aagcaaatatttgatgctccaactttaatcgcgctagctgaaactctcggcaaacaccaa
tcgttcagtattccacccaatctgattactacaaagagcacgatgattactccggacatg
ttgccgcttatcgatctatctcaggccgagattgatacgatggtcacacaggtgccaggt
ggtgtgaacaatattcaagatatttacgcattagcaccattacaggaaggcatattgtac
catcatctaatggcacaacatggaaatccttacttgctaattcttcgtttgcaatttagt
gaccgagtatcacttgataattatgccactgccttgcaaaaggtgattgaacgacatgac
attctgcgcacctcttttttctgggaaggactgagcgaaccggctcaagtcgttttgcac
caagttccttcgatactcaccgaagtcacactggatgaaatcgatgatcctgaattaaaa
caatcaagtaatcgctttaatctgcgtcaatactgtttagatctaaaacaagcaccgctg
ttgcgtctgttagtctcgccaacatcggaaggtctttggataggagtgcagttattgcat
catataattggtgaccatgttactttgcagagactgcatgcagaagttggagctataatc
aatggagagagcgaccaattgacaaagcccacaccattccgccatgtagtcgcccaagct
cgcctgggagttagtcaagctgggcacactcaattctttagcgacatgcttagtgatatt
gatacaccgaccttgccgtttggcctgagcgatgttcatggcgacggaaccgagtttaat
gaaggatatctgaagatgccacaacctctcaataatcgattgcgagtcctcgcacgtcat
ttccatgtcagtttggctagcctttgccatttagcgtgggcaaaagtactagcatgcact
agtggaaatgagtcggttgtctttggtacagtgctactcggtcgtttacagtccggggaa
gataatgacagtgcaattggattattgatcaacactttgccgttgcgattggatatcaat
gacactacagtcgaaaacgctgtgc
DBGET
integrated database retrieval system
