Caldicellulosiruptor obsidiansis: COB47_0820
Help
Entry
COB47_0820 CDS
T01293
Name
(GenBank) MmpL domain protein
KO
K06994
putative drug exporter of the RND superfamily
Organism
cob
Caldicellulosiruptor obsidiansis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cob00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99996 General function prediction only
COB47_0820
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MMPL
DUF1664
COG3_N
MCPsignal
IFT57
ATG17_like
Glycoprot_B_PH2
Myosin_tail_1
UPF0542
FPP
Laminin_II
Laminin_I
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADL42132
UniProt:
D9TJF0
LinkDB
All DBs
Position
952198..955278
Genome browser
AA seq
1026 aa
AA seq
DB search
MKQVLRRPWISVIIWAVLTAIFLITMPDINKIVRLKGEPKIGKAYPSQVATILEKEFQGV
PKDKKLSTIAMVFYNKNGLTKDDISAAKKIIDELDKNKEKYNIQSISTHFKNPELKSYYV
SPNNKVILTSIQADKTKREIIEIRDEMYRLINSTQKPKSLEIYLTGGDLITQDFVKASED
GVKKTDVITIVFIIVVLILVFRSPVTPIVSLLTVGVSFLISLSVVGHLADKFNFPINTFT
RTFIVVSLFGIGTDYNLLIISRFREELANGKDVDKAIMTTFKTAGKTVIFSCLAVFTGFA
AFAVASFNFFRAMSAIAVSVLILLLVLLTLVPAVLKIFGKNLLWPFNKEIQHTHSRLWEA
AARLSTRYPYVVLTTVILILIPFLLSVRSDLSFNTLNELSEKYKSVKGFNIISKNFSSGK
TFPVTIYLKSNKNLATSDALSDIEKITEILSKQKGIKDVYSITRPQGEIIKQFTLSDQAD
TVIKGIDSLRDGLLKVNNAIETINKNLNVSTKEFDVQKLVNGISQLENGIYELKISLDKL
NFGFEQGLEGSKKIYDGLNQLSNGSSKLSEGFKKFYSEYTKSINKIKSELQGFDINQVEL
LLTGINTANNNLKVLSNKYPEISKDINYIMASEILSKIEAETSNLAPKLKEFSSEYEKIS
TQINEADKALKLISTSIDSIASASKQLADAQGKVLNGYNQIDRGQKQIISGVNLMYSKLQ
EFDNQKEQILKKVNELQTGFTSLKSALFQISDALNKMINSIGSMKSYFEGYKNTDIFYVP
PEALKSSDFQKALDSYMSKDRRITKIILILDTNPYTNKAIDIVAEVEKVLNNSLEFVNTK
FVSVGVGGISSTNHDLRSIYFKDFRTLRLIMIISIFILMFLISRSIFNAAIMVIIVFTDY
YLALSITEMIFKGIFKYEALNWAVPFFTFVVFLALGIDYSVFLLIRFYEYKDLEINEALR
LTSANIGHVVTSAVIILAGTFAAMLPSGILTLMQVSICVVIGLVLLAFFLLPFLFNGLMR
IKRDIV
NT seq
3081 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaacaagttttaaggcgaccttggataagtgttataatatgggcagtcttgacagct
atatttttaattacaatgcctgatataaataaaatagtaagactcaaaggtgaacctaaa
attggcaaagcttatccatctcaggttgctactatattggaaaaagagtttcaaggtgta
ccaaaagataaaaaactttcaacaatagctatggtcttttataataaaaatggtttaaca
aaggatgatatatcagcagctaaaaagataattgatgaacttgacaagaacaaagaaaaa
tacaatattcaaagcatttcaactcatttcaagaaccccgagttaaaaagttattacgtc
tcacctaataataaggttattcttacaagcattcaggcagataaaacaaagagagaaatt
attgaaataagagatgagatgtatagattaataaactcgactcaaaaaccaaagagtctt
gaaatatatcttacaggtggagatttaatcacccaggattttgtgaaagcctctgaagat
ggcgtcaaaaagacagatgtaatcacaatagtgtttattatagttgttttaattcttgtg
ttcagatctcctgtcactccgatagtttcacttttgacagttggagtatcgtttttgatt
tcccttagtgtagttggacaccttgcagataagttcaactttcctataaatactttcaca
agaacatttatagttgtatctttatttggtattggaactgactataaccttttaattatt
tcaagattcagagaagaacttgcaaatgggaaagatgtcgataaagcaataatgacaaca
tttaaaacagcagggaagacagtgatatttagctgtcttgcagtttttacaggatttgca
gcttttgcagtagcatcttttaactttttcagggcaatgtcagctattgctgtaagtgta
cttatacttttgcttgtgcttttgacactggttccagcagtgttaaagatttttggtaaa
aatcttctctggccatttaataaagaaatacagcacacacatagcaggctttgggaggct
gcagcaagactttccactagatatccttatgtagtgttgacaacagtgatattaatctta
ataccttttctcttatcagtaagaagtgacttgtccttcaacacactaaatgagctttct
gaaaagtacaaatcggtaaaaggatttaacataatttcaaagaactttagcagcggaaaa
acatttcctgttacgatttatttaaaatccaataaaaacttagcaacttcagatgcacta
tctgatattgaaaaaataactgaaatattgagcaagcaaaaaggtataaaagatgtatat
tcaattacaagacctcaaggagagattataaaacaatttactttgtcagaccaagcagat
actgttattaaaggcattgatagtttgagagatggtcttttgaaagtaaacaatgcaatt
gagactataaacaaaaatttgaatgtgtcaacaaaagagtttgatgttcaaaaacttgta
aatggtatttcacagcttgagaatggcatatatgaattaaaaatatccctggataaacta
aattttgggtttgaacaaggattagaaggttctaagaagatttatgatggtcttaatcag
ctttcgaatggaagcagcaagctgtctgaaggatttaaaaagttttactctgaatacaca
aagtcaataaacaaaataaaaagtgaattacagggatttgatataaatcaagttgagctt
ttattgacaggtattaacactgctaataataatttaaaagtactttcaaataaatatccg
gaaatttcaaaggatataaattatattatggcatctgaaatcttgtcgaaaattgaagct
gaaacaagcaaccttgcaccaaagttgaaagagttttcatctgaatatgagaaaatttca
acacaaataaatgaagctgataaagctttaaagcttatttcaacatccattgatagcata
gcctcagcttcaaaacaacttgcggatgctcagggtaaggttctaaatggttacaatcaa
attgacagaggtcaaaaacaaataatctcaggtgtcaatcttatgtattcaaagcttcaa
gaatttgataatcaaaaagaacaaattctaaaaaaggtaaatgaacttcagacagggttt
acaagtttaaagtcagctcttttccagatttctgatgcacttaacaaaatgataaattct
attggtagtatgaagagttattttgaaggttacaaaaacacagacattttttacgtccct
ccagaagctttgaaaagcagtgatttccaaaaggctttggattcatatatgagcaaagat
agaagaataacaaaaataatcttgattcttgacacgaatccgtatacaaacaaagcaatt
gatattgttgctgaggtggaaaaggttttaaataattctttagaatttgtaaacacaaaa
tttgtatcggttggagttggtgggatatcgtctacaaaccacgatttgagaagcatatat
tttaaagattttagaactctaaggttaataatgataataagtattttcattttaatgttt
cttatttcaaggtcaattttcaatgcagcaataatggtcataatcgtttttactgactat
tatcttgcactatctatcacagagatgattttcaaaggtattttcaaatacgaagcactc
aactgggcagtgccatttttcacctttgttgtgttcttagctttgggtatagactacagt
gtatttttgctaataagattttatgagtataaagacttggaaataaacgaggcactcagg
cttacctcagcaaacattgggcatgttgtgacatcggcagtgataattttagcgggcaca
tttgcggcaatgctgccatctgggatactgacgcttatgcaggtttccatctgcgttgtg
ataggtcttgttttgcttgcatttttccttttgccgttcttgttcaatggtttgatgagg
ataaagagagatatagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
