Caldicellulosiruptor obsidiansis: COB47_1573
Help
Entry
COB47_1573 CDS
T01293
Name
(GenBank) ABC transporter related
KO
K06147
ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial
Organism
cob
Caldicellulosiruptor obsidiansis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cob00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cob02000
]
COB47_1573
Transporters [BR:
cob02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
COB47_1573
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC_membrane
AAA_21
AAA_22
AAA_29
SMC_N
AAA_19
DLIC
nSTAND3
NACHT
PIF1
AAA_30
cobW
PduV-EutP
T2SSE
RsgA_GTPase
AAA_24
FtsK_SpoIIIE
AAA_18
TsaE
ATP-synt_ab
NB-ARC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADL42858
UniProt:
D9TF88
LinkDB
All DBs
Position
complement(1680273..1681880)
Genome browser
AA seq
535 aa
AA seq
DB search
MNFKYYVRIVLLLPTIFIVFINLIEGIINIYISNTFAKLFSLAIQKDMEVFMCNVVTFLL
IYLIIISGKLFFSLLIEFFKENRIIELKKKLFMLFLNNKYSLIEKYGQGEILNRLEQDFN
DIVKCFYVHYSSVFSALICLAGYFIFLGLKNFFLSVIFFGLWILPIFPLFFTIKYMNKIV
EESHRADDELTGFIKQSFEGIEVIKAYNLYEWVSLRFLSLEEVSKKCANEMEKVGTIEDI
LYNLCNNIAKIGTYIMLGLFLYKKLITPDLVVVFISLFPIVIDNFKVAAKGFQNLRVEKS
SFERISEILNFDIENQYENMIQINEIENIVFKNVSFSYENSKSIFNKINFRINKGDKILI
MGSNGSGKTTLLKLIMGLYESFKGDILINGVPLSKVDFKSFNKHISFIPQNFTFFTQDID
NNLNMMIQDNLEDRKRSLLHLFGLDDILSKKINQLSDGQKQKISIIRGLLKKSSILIIDE
PTNYLDTKSIEILKDILCKSEKTIIIVSHNIELASCVNRIWRIENQSVNEIAEIY
NT seq
1608 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttaaatactatgtaagaatagtattattattacctactattttcattgttttt
ataaatttaattgagggtatcataaacatatatatttctaatacctttgctaaattattt
tcattagctatccaaaaagatatggaggtttttatgtgtaatgtagttacctttctttta
atttatcttattattatttctggcaaattatttttttcattgttaattgaattttttaaa
gagaatagaattattgaactaaagaaaaagttatttatgttgttcttgaataacaaatat
tcattaatagaaaaatatggacaaggtgagattttaaatagattagagcaggactttaat
gatatagtaaagtgtttttatgttcattattcttcagttttttcagccttaatatgttta
gcaggttattttatttttttgggtctaaaaaatttttttctttcagttattttttttggt
ctttggattttacctatatttccactgttttttacaataaaatatatgaataaaatagtt
gaggaaagtcatcgtgcagatgatgagttaacaggttttattaaacagtcttttgaagga
attgaggtaataaaagcttataatctttatgaatgggtctctttaagatttctttccttg
gaagaagtcagcaaaaaatgtgcaaatgaaatggaaaaagtaggaacaattgaagatata
ctttacaatttatgcaacaatatagcaaaaattggtacatatatcatgttaggtttattt
ttatataaaaaattaataactcctgatttggttgtagtgttcatatcactttttcctatt
gtaattgataattttaaagtagcagcaaaaggttttcaaaatttgagggttgaaaaaagt
tcttttgaaagaattagtgaaatactaaattttgatatagaaaatcaatatgagaatatg
atacaaataaatgaaattgaaaatattgtgtttaaaaatgtttcgttttcctatgaaaat
tctaagagtatcttcaacaaaataaattttcgtatcaacaaaggagataaaatattgatt
atgggttctaatggaagtggaaaaactactcttttgaagcttataatgggactttatgaa
tcttttaaaggtgatattcttattaatggtgtaccactttcaaaagtagattttaagagt
ttcaataaacacatttcttttattcctcaaaattttactttctttacacaggatatagat
aataaccttaatatgatgattcaagataatttggaagatagaaaaagaagtttactgcat
ttgtttggtttagatgatattttatcaaaaaaaattaatcaactttcagatgggcaaaaa
cagaaaatatcaataataagaggcttgttgaaaaagtcttcaatcttaataattgatgaa
ccgactaattatcttgatactaaaagtatagaaattttgaaagatattctttgtaaaagt
gaaaaaacaataataattgtttcacataatattgaattggcaagttgtgtaaatagaatt
tggagaatcgaaaaccaatcagtaaacgaaattgctgaaatttattaa
DBGET
integrated database retrieval system