Cardiocondyla obscurior: 139105541
Help
Entry
139105541 CDS
T10704
Symbol
Gaa1
Name
(RefSeq) glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein
KO
K05289
GPI-anchor transamidase subunit GAA1
Organism
cobs Cardiocondyla obscurior
Pathway
cobs00563
Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis
cobs01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cobs00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00563 Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis
139105541 (Gaa1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Gaa1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
139105541
NCBI-ProteinID:
XP_070517813
LinkDB
All DBs
Position
LG09:4401341..4404387
Genome browser
AA seq
634 aa
AA seq
DB search
MGLLTDPRAGTGKMIKLLLKWEKLLCFVLYVGGVVWLTLLALPMFNDSTYFSENALLPGL
VTKESNLEQTSKQYYHELIHEMKRYPDGMPYAWLSAKFSQLHLDVHVHNFSLIYPFQEQK
FAGQNIYGIVRAPRASSTEAIVVSVPYRPINSIYLDTAPSIALLLAFAKFCRKQKYWAKD
IIFLVTEHEQLGMQAWLDAYHGVTSGQEGILIAGDLSGRAGSIQAAINLEFHAIKVTSID
VKIEGLNGQLPNLDLFNLAQNMIAKEGIRQSFQRRFDVNYRDKFKSWWYHFNTLMSMVAT
QATGVPTGNHGLFHRFGIEAITLEGFKRSGKETEANFYQVGRIVESIVRSLNNLLERFHQ
SYFFYLLPSTDRYISIGLYMRPLVLIIASVFIKAFSIWQRLQTSNSSNKTEKDKQDLSNK
VEEFDIGSIASEVLWAHIFGILVMASPRFFTLIGSQIFNLRTEDSMYIGFALITILTLLW
RFYLRRSIKYENISLVCVIALIELATALMCIAMHNFSLALITAVVYVPITLLITPHHVSA
SRFRCCQYIAWIMLHPFISSAIVVMGYTYFNFSTDPILSLFFRGYRANKQALVFSIVDSM
IYGNWFYNVAAAVMLPIWLLFWNVMRSSVVIPSQ
NT seq
1905 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtctactcacagatcccagagctggaaccggcaaaatgataaaattattattgaaa
tgggaaaaattgctgtgctttgtattatatgtgggaggagttgtttggttaacgctcttg
gcgttaccgatgtttaatgacagtacttatttctccgagaatgctttacttcctggatta
gtcacgaaagagagtaacttggagcaaacgtccaaacagtactatcacgaattaattcac
gaaatgaaaagatacccagatggtatgccgtacgcctggctttcggcaaaattcagtcag
ctccatttagacgtacatgtacataacttttcgttgatttatccttttcaggaacaaaag
tttgcaggacagaatatttatggcattgttagagccccaagagcatcaagtactgaagcc
attgtagttagtgtgccatatagacctattaacagcatttatttagatactgcaccttca
atagccttattacttgcctttgcaaaattttgcagaaaacaaaaatattgggcaaaggat
ataatatttcttgtaacggagcatgaacaattaggtatgcaagcctggcttgatgcatat
catggtgttaccagtggccaggaaggaatcctgatagcgggagatttatcgggaagagcc
gggtctattcaggctgctatcaatctcgaatttcatgcgataaaagtcacatcaattgac
gtcaagatagaaggattaaatgggcaattgcccaacctagatctctttaatttagcacaa
aatatgatagctaaggaaggaattcgacaatctttccaacgtcgatttgatgtcaattat
agagacaagtttaaaagttggtggtatcattttaatacattaatgagtatggtagcaaca
caagccaccggagtgccaactggtaatcacggactttttcacaggtttggtatcgaagct
attacgttagaaggctttaaaaggtctggaaaagaaacggaagcgaatttttatcaagtc
ggacgcatagtagaaagtatagtgaggtcacttaataatttattagagcgtttccatcaa
tcgtattttttctatttattaccttccaccgatcgatatatttctattggattatatatg
cgacctttggtgctaataattgccagtgtatttattaaagcattttctatttggcaaaga
ctacagacatcaaatagttcaaataaaacggaaaaggataagcaagatttatcgaataaa
gtcgaagaatttgacatcggaagtatcgcttccgaagtattgtgggcacacatatttggt
atattagtaatggcttctccccgatttttcaccctaattggatcacagatatttaatttg
cgtacagaagattcaatgtatattggttttgctctaatcacgattctcacattgctgtgg
cgtttctatctaagaagatccatcaaatacgaaaatatatcgcttgtttgcgtcatcgcg
ctgatcgagctggccaccgcactgatgtgtatagccatgcataacttttcgttagcttta
ataacggctgttgtatacgttcccattacattattgataacacctcatcacgtatctgca
tcaagatttcgttgttgtcaatatattgcgtggattatgctccatccattcatttcgtcg
gcgattgtcgtgatgggttacacatattttaatttttctactgatcccattctatcttta
ttttttcgaggctatcgcgccaataagcaagcgctcgtattcagcatcgtcgattccatg
atatacggcaattggttttataacgttgctgccgctgttatgctaccgatttggctgtta
ttttggaacgttatgcgttccagcgtcgttattccttcacaataa
DBGET
integrated database retrieval system