Cohnella sp. LGH: J4772_18880
Help
Entry
J4772_18880 CDS
T10185
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
cohl Cohnella sp. LGH
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTH46647
LinkDB
All DBs
Position
complement(4365687..4369451)
Genome browser
AA seq
1254 aa
AA seq
DB search
MVQRAQQAQPEQPVRQEPGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGPTGATGSTGAT
GPTGATGPTGATGPTGPTGPTGATGTTGPTGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGPTGAT
GPTGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGATGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGAT
GPTGATGPTGATGPTGATGSTGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGAT
GPTGATGPTGGTGPTGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGPTGAT
GATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGPT
GATGPTGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGPTGPTGATGPT
GATGPTGATGATGPTGATGPTGATGPTGGTGPTGATGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPT
GATGPTGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGPT
GPTGATGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGPTGATGRTGATGPTGATGPT
GATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGPTGATGPTGATGATGAT
GPTGATGPTGATGPTGATGSTGATGSTGATGPTGPTGATGPTGATGATGATGATGPTGAT
GPTGATGPTGATGSTGATGPTGVTGPTGATGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPT
GATGPTGATGPTGATGPTGPTGATGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGAT
GATGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGATGPTGET
GATGPTGATGPTGATGPTGPTGATGPTGATGPTGATGPTGVTGPTGATGPTGATGPTGVT
GPTGATGPTGPTGATGPTGATGPTGATGATGPTGATGVTGPTGATGAAGPTGATGATGAT
GPTGATGPTGATGPTGATGSTGATGPTGVTGPTGATGPTGPTGATGSTGATGPTGVTGPT
GATGPTGPTGATGPTGATGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPMPELFATGAAGTLSLSNNT
PLSTMTVNNVPVTAADNVKIDYAIQINSVITIGIVNLTVTLVLQRNGTSIQTIQYASAGL
ATGSQIQPISYTFVDNPPSTAVVDYSVQVTYSATGIGAAAVTVSNRYMNVANFQ
NT seq
3765 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ctggtccaacgggcgcaacaggcccaaccggagcaaccggtccgacaggagcctggagcg
acaggcccaaccggcgcaacaggtccgacaggagcgacgggtgcgacaggtccaacgggc
gcaactggcccgacgggagcgacaggtccgacgggtgcaacaggctcaacaggagcaacg
ggtccaacgggagcaacaggtccaacaggagcaactggcccgacaggtccaaccggtcca
actggagcaacgggtacgacaggtccaacgggtgcaactggtccaacgggagccacgggt
ccaacgggagcaacaggtgctacgggtccgacaggagcgactggcccaacgggagcaact
ggtccgacaggagcgacaggcccaacaggagcaacgggagcaacaggcccaactggcgca
acaggtccgacgggcgcaactggagcgacgggagcaacaggcccaaccggtgcaactggc
ccgactggagcgacaggcccaaccggcgcaacaggtccgacaggagcgacgggtgcgaca
ggtccaacgggcgcaactggcccgacgggagcgacaggtccgacgggtgcaacaggctca
acaggagcaaccggtccaacaggagcgacgggtgcaactggtccgacgggagccaccggt
ccgacaggagcgacaggtccaacgggagcaaccggtccaacgggagcaacaggtgctacg
ggtccgacaggagcgacaggtccaaccggcggaactggcccaacaggagcaaccggtcca
acgggagcaaccggtccaaccggagcaacaggtgctacgggtccgacaggagcgacgggt
gcaactggcccgactggagcaacaggcccaaccggcgcaacaggtccgacaggagcgacg
ggtgcaactggtccgacgggagccaccggtccgacaggagcaacaggtccaaccggcgca
accggtccaacaggagccacgggtgcaacaggtccgacgggagcaacaggtccaaccggc
gcaacaggtccgacaggagcgacgggtgcaactggtccaacgggagccaccggtccaacc
ggagcaaccggcccaaccggcgcaaccggtccaacaggagcgacgggtgcaaccggtcca
acaggagccacgggtgcaacaggcccaacgggagccacgggtgcaacaggcccaacggga
gccacgggtccaacgggagcaacgggtccaacaggcccaacgggagcaacaggtccaacc
ggcgcaacaggtccgacaggagcgacgggtgcaactggtccgacgggagccaccggtccg
acaggagcgacaggtccaaccggcggaactggcccaacaggagcaaccggtccaacgggt
ccaacgggagcgactggcccaaccggcgcaacaggtccgacgggagcaacaggcccaact
ggagcaacgggtccaacaggagcaacaggcccaaccggcgcaaccggtccaacaggagcg
acgggtgcaactggtccgacgggagccaccggtccgacaggagcaacaggcccaacgggc
gcaacgggtccaacgggagcaacaggcccgacaggagcaaccggcccgacaggtccaacg
ggtccaacaggtgcaactggcccgacgggtgtaacaggtccaacaggtgcaactggcccg
acaggcgcaacaggcccaacgggagcaacaggcgcaacaggtccaacaggtgcaactggc
ccgacgggagcaacgggtcgaacaggtgcaactggcccgacaggcgcaacaggcccaacg
ggagcaacaggcccgacaggcgcaacaggcccaacgggagcaacaggcccgacaggggca
accggtccgacaggagcgactggcccaacgggtgcaactggtccaacgggtgcaaccggt
ccgacaggcccgacaggggcaaccggtccgacaggcgcaactggcgcaacaggcgcaaca
ggtccgacgggtgcaacgggtccaacaggtgcgactggtccaacgggagcaacaggctca
acaggagcaacaggctcaacaggagcaacaggcccaaccggtccaacaggagcaacgggt
ccgacaggcgcaactggcgcaacaggcgcaacaggtgcaacaggtccgacgggtgcaacg
ggtccaacaggtgcgactggtccaacgggagcaacaggctcaacaggagcaacaggtcca
acgggtgtaactggtcctacaggagccaccggtgcaactggcccgacaggcgcaacaggc
ccgacaggagcgactggcccaacgggtgcaacgggtccaactggagcaacaggcccaacg
ggagcaacaggcccaacgggagcaacgggtccaacaggagcaacaggcccaaccggtcca
acaggagcaacgggtccgacgggtgtgacaggtccgacaggagcaacaggcccaacagga
gcgacaggcccgacaggagcaacaggagcaacgggtccgacaggcgcaactggcgcaaca
ggcgcaacaggtgcaacaggtccgacgggcgcaacaggcccaacgggtgcaacaggccca
acgggagcaacaggcccaacgggagcaacaggcccaaccggagcaacaggtccgacagga
gcaactggccccacaggtgcgacaggtccaaccggagccaccggtccaacgggtgaaaca
ggagctacaggcccaacgggagcaacaggcccgacaggagcaacaggtccgacaggccca
acgggggcaaccggtccaacaggagcaacgggcccaacaggagcaacgggtccgacgggt
gtgacaggtccgacaggagcaacaggcccaacgggtgcaactggtccgacgggtgtgaca
ggcccgacaggagcaacaggcccaaccggtccgacaggagcgacaggtccaaccggagct
acgggtccaacgggcgcaacaggagcaactggcccgacgggagcaacgggtgtaacaggt
ccaacaggcgcaacaggtgctgctggtccgacaggcgcaactggcgcaacaggtgcaaca
ggtccgacgggtgcaacaggcccgacaggtgcgactggtccaacgggagcaacaggctca
acaggagcaacaggtccaacgggtgtaactggtcctacaggagccaccggcccaactggc
ccaacgggagcaacaggctcaacaggagcaacaggtccaacgggtgtaactggtcctaca
ggagccaccggcccaactggcccaacgggagcaaccggtccaaccggagcaacaggtccg
acaggtccgacaggcccaacaggcccaacaggcccaacaggtccaacgggtccaactgga
ccaatgccagaactgtttgcgaccggagctgccggaacgttgtcgttgtccaataatact
ccgttatcgactatgacagtgaacaacgtgcctgtaaccgccgcggataatgtgaaaatc
gattatgcgattcagataaactcggtcatcactatagggattgtgaacctgacagtcacg
ctggtattgcaaagaaacggcacgtctattcaaacgattcagtacgcaagcgcaggtctt
gccacaggcagccagatccaaccgatcagttacacctttgtcgataatccgccgagcact
gctgtcgttgattactccgttcaagtcacttactcggccacgggaattggggcggcagcc
gttacggtaagtaacagatatatgaacgtcgctaatttccagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
