Cohnella abietis: KCTCHS21_20870
Help
Entry
KCTCHS21_20870 CDS
T05979
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cohn
Cohnella abietis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBI32688
UniProt:
A0A3T1D3S8
LinkDB
All DBs
Position
2428080..2432861
Genome browser
AA seq
1593 aa
AA seq
DB search
MTIQLQNRIINGSFETGILPWAEVNVVLSPISKVGIQSAELLGGITISALQQVVPGNPGE
GMFLSISLAKSQPGLSPQVTFTVEFLDAALGFLSTGLLLNVPVGFFSDAQGISWKVFEGI
TDVAPLNTAFARITINRTPLASSAGILVDEVIFMAAVATAGATGVTGATGVTGATGVTGV
TGATGVTGATGVTGATGTTGTTGATGDTGAAGVTGLTGSTGVSGATGVTGNTGATGATGV
TGATGATGATGETGATGATGATGVTGATGATGETGVTGDTGATGATGATGATGATGVTGD
TGATGATGDTGATGVTGEIGATGDTGATGVTGATGVTGATGDTGATGATGVTGATGDTGA
TGETGATGATGATGATGATGATGATGATGETGATGATGATGETGATGAVGATGATGVTGD
TGATGETGATGVTGETGATGATGATGATGATGETGATGVTGATGATGVTGATGDTGATGA
TGVTGATGDTGATGETGATGATGATGATGETGATGATGETGATGATGETGATGATGETGA
TGETGATGATGETGATGATGATGETGATGDTGAPGATGDTGATGITGATGATGVTGATGA
TGATGATGETGATGAIGATGATGVTGDTGATGETGATGVTGETGATGATGATGATGATGE
TGATGAIGATGDTGATGVTGTTGTTGATGETGATGVTGATGDTGATGDTGATGETGATGA
TGDTGATGATGDTGATGATGATGVTGATGATGVTGATGATGATGETGATGDTGAPGATGD
TGATGITGATGATGVTGATGATGATGATGETGATGAIGATGATGVTGDTGATGETGATGV
TGETGATGATGATGATGATGETGATGETGATGETGATGATGAIGATGDTGATGVTGTTGT
TGATGDTGATGDTGATGETGATGATGDTGATGATGDTGATGATGVTGATGATGETGDTGA
TGATGVTGEAGATGATGVTGVTGATGDTGATGETGATGVTGVTGVTGATGDTGATGATGA
TGATGATGATGATGATGATGTTGATGATGATGATGATGATGTTGATGATGETGATGVTGA
TGATGATGATGATGETGGTGATGATGATGTTGATGATGTTGETGATGETGATGATGATGA
TGTTGATGATGATGTTGETGATGATGATGATGTTGATGTTGATGATGATGGTGATGATGG
TGATGATGVTGVTGVTGVTGVTGATGATGATGATGATGATGATGATGITGETGATGATGV
TGATGATGVTGATGTTGATGETGATGATGGTGATGATGATGATGATGATGATGVTGVTGV
TGVTGVTGVTGVTGVTGATGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGV
TGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGPNFAVEGFSA
FIPSLVIAASTQLANWTVTSPYYSGPSFNATNGNYTVPTTGRYTILATINYSTTAAITVT
LGAGINPSFVVQRTSPTVTNLISGLFPILNVNVAVVLTLRAILGNSAVTLAGEVTLNAGD
VIGLFYVANGLTVSLDLGSSTSAGVVWSIHELT
NT seq
4782 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgacgatacaacttcagaatcggattattaacggtagttttgaaacggggatacttcct
tgggcagaagttaatgtggttctatctcctatatctaaggtgggtatacaaagtgcagag
ttgcttggtggaatcacgatcagtgctctgcagcaagttgttcctggaaatccaggggaa
gggatgtttctttctatatcgttagcaaagagtcaaccgggtttaagtccgcaagttaca
ttcacggttgagtttctagatgcagcattaggttttctttctactggacttttgctaaat
gttcctgtcggattttttagtgatgcacaaggaatttcttggaaagtgtttgagggtata
actgatgttgctcctttaaatacagcatttgctcgaataacgataaataggacgccttta
gcaagttcagcagggatacttgtggatgaagttatttttatggccgcagtagcgacagca
ggggcaactggtgtaacaggagcgactggggtaacaggggcgactggggtaactggagta
acgggagcgactggggtaacaggggcaactggggtaacgggagcaacaggaacaaccgga
acaacaggagcaacgggggacacgggagcagcaggtgttacaggattaactggatccacg
ggtgtttcaggagcaaccggagtcacaggaaacacaggagcaacaggagcaacaggtgta
acaggagcaaccggagcaacaggagcaacaggagagacaggagcgacaggagcaaccgga
gcaacaggagtaacaggagcaacaggagcaacaggagaaacgggagtaactggagacaca
ggagcgacaggagcgacaggagcaaccggagcaacaggtgcaactggggtaaccggagac
acaggagcaaccggagcaacaggagacacaggtgcaactggggtaacaggagaaatcgga
gcaacaggtgacacaggggcaactggagtaacgggagcgactggggtaaccggagcaacg
ggagacacaggtgcaaccggagcaactggagtaacaggcgcaacgggagacaccggagca
acaggagaaactggggcaacaggagcaacaggagcaacaggagcaacaggagcaacagga
gcaacaggagcaacgggagcaacaggagaaactggggcaacaggagcaacaggagcaaca
ggagaaacgggagcaaccggagcagtcggagcaaccggagcaacaggtgtaacaggagac
accggagcaacaggagaaacgggagcaaccggagtaacaggagaaacgggagccaccgga
gccaccggagccacaggagcgacaggagcaacaggagaaacgggagcgactggggtaacc
ggagcaacgggagcgactggggtaaccggagcaacgggagacacaggtgcaaccggagca
actggagtaacaggcgcaacgggagacaccggagcaacaggagaaactggggcaacagga
gcaacaggagcaacaggagcaacaggagaaacgggagcaacaggagcaacaggagaaacg
ggagcaacaggagcaacaggtgaaacgggagcaacaggagcaacaggagaaacgggagca
acaggtgaaacgggagcaacaggagcaacaggtgaaacgggagcaacaggagcaacagga
gcaacaggagaaacgggagcaacaggagacacaggggcacccggagcaacaggtgacaca
ggcgcaactggaataacgggagcaaccggagcaactggggtaacgggagcaaccggagca
acaggagcaacaggagcaacaggagaaacgggagcaaccggagcaatcggagcaaccgga
gcaacaggtgtaacaggagacaccggagcaacaggagaaacgggagcaaccggagtaaca
ggtgaaacgggagccaccggagccacaggagcgacaggagcaacaggagcaacaggagaa
accggagcaaccggagcaatcggagcaacgggagacaccggagcaactggggtaacggga
acaacaggtacaactggagcaacaggtgaaacgggagcgactggggtaaccggagcaacg
ggagacacaggtgcaaccggagacacaggcgcaacgggagaaaccggagcaaccggagca
acaggtgatacaggggcaacgggtgcaaccggagacacaggagcaacaggcgcaacaggc
gcaacaggtgtaactggagcaactggagcaactggagtaactggagcaacgggagcaaca
ggagcaacaggagaaacgggagcaacaggagacacaggggcacccggagcaacaggtgac
acaggcgcaactggaataacgggagcaaccggagcaactggggtaacgggagcaaccgga
gcaacaggagcaacaggagcaacaggagaaacgggagcaaccggagcaatcggagcaacc
ggagcaacaggtgtaacaggagacaccggagcaacaggagaaacgggagcaaccggagta
acaggtgaaacgggagccaccggagccacaggagcgacaggagcaacaggagccacagga
gaaacgggagcaacaggtgaaacgggagcaacaggagaaacgggagcaaccggagcaacc
ggagcaatcggagcaacgggagacaccggagcaactggggtaacgggaacaacaggtaca
accggagcaacgggagacacaggtgcaaccggagacacaggcgcaacgggagaaaccgga
gcaaccggagcaacaggtgatacaggggcaacgggtgcaaccggagacacaggagcaaca
ggcgcaacaggtgtaactggagcaactggagcaacaggagaaacgggagacacaggagca
accggagcaactggggtaacgggagaagcgggagcaaccggagcaacaggagtaactggg
gtaaccggagcaacaggagacacaggagcaacaggagaaaccggagcaacaggagtaact
ggagtaactggggtaaccggagcaacaggagacacaggagcaacgggagcaaccggagca
acaggagcaacaggagcaacaggagcaacaggagcaacaggagcaacgggagcaacaggt
acaacaggagcaacaggggcaacaggagcaacaggagcaacaggagcaacgggagcaaca
ggtacaacaggagcaacaggggcaacaggagaaactggggcaacaggagtaaccggagca
acgggagcaacaggagcaacgggagcaacaggagcaacaggagaaactggaggcaccgga
gcaacaggggcaacgggagctacagggacaacaggagcaacaggagccacagggacaacc
ggagaaactggagcaacaggagaaactggagcaacaggagccaccggagcaacaggggca
acagggacaaccggagcaacgggagcaaccggagcaacagggaccacgggagaaactggg
gcaacaggagccacaggagcaacaggagcaacagggaccacaggagcaacagggaccaca
ggagcaacaggagccacaggagcaacaggaggcaccggagccacaggagcaacaggaggc
accggagccaccggagccacaggagtcacaggagtcacaggagttacaggagttacagga
gttacaggagccaccggagcaacaggagccacaggagccaccggagcaacaggggcaacg
ggggcaacgggagcaacagggataactggagaaacaggagccacaggagccacaggagtc
acaggagccacaggagccacaggagtcacaggagccacaggaacgacaggagccacagga
gaaacaggagccacaggagccacaggaggcaccggagccacaggagccacaggagccaca
ggagccacaggagccacaggagccacaggagccacaggagtcacaggagtcacaggagtc
acaggagtcacaggagtcacaggagtcacaggagtcacaggagttacaggagcaacagga
gtaacaggagtaacaggagtaacaggagtaacaggagtaacaggagtaacaggagtaaca
ggagtaacaggagtaacaggagtaacaggagtaacaggagtaacaggagtaacaggagta
acaggagtaacaggagtaacaggagtaacaggagtaacaggagtaacaggagtaacagga
gtaacaggagtaacaggggtaacaggggtaacaggggtaacaggggtaacaggggtaaca
ggagtcacaggagttacaggggtaacaggccccaattttgctgtagaaggtttctcggcc
tttattccctctcttgtcattgctgctagcacacagctagctaactggaccgtaacaagc
ccttattatagcggtcctagctttaacgccactaatggaaattataccgtgccaacaaca
ggtagatatactattttagcaacaataaattattctactaccgcagcaataaccgttaca
cttggagctggaattaatccttcatttgttgtccaaagaacatcgcctacagttaccaat
ctaataagcggactgtttcctatcttaaatgtcaacgttgcagtagtattaacactaaga
gctatacttggaaattcggcagtaactttggcgggtgaagttaccctcaatgcaggagat
gtaattgggctcttttatgtagctaatgggctgacagtctcattagatttaggtagctca
acctcagctggggttgtctggtccatccatgaactgacttaa
DBGET
integrated database retrieval system
