Cohnella abietis: KCTCHS21_51930
Help
Entry
KCTCHS21_51930 CDS
T05979
Name
(GenBank) helicase SNF
Organism
cohn
Cohnella abietis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
SWIM
DEAD
Gp3-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBI35794
UniProt:
A0A3T1DCN8
LinkDB
All DBs
Position
5855437..5858775
Genome browser
AA seq
1112 aa
AA seq
DB search
MSFQLTKRVIKLLCGPFSYERGEVYYHAKKVKIINYDPDASIYEATIKGNMDYAVKAEID
SNGDVTAECTCPAYASYSRKYCKHIAAVLLNIHDLQNAGRSPMRSYSYKLTPDEHLSSEA
GRLTPRSTISTARSAIESSAVDTGLTDGMLGLFGSKPLRPSRNRFLADTRELLEVEITCS
PFPYGYRKYMFGVELKVGSKRLYIVQKIREFLDRVDRSEPHVFSKHFTYDPTIHSFSKEN
DEIIRQLIQIYHSEKMYRETSSIYSAHASPLSGERLLLIPPYSWESLYPLLTRAPEVKLE
QDNRTYVGIATSDELVPLHFDFDQAKDDSYQLDVQGLDRITVMEPYGIVIAEGKLLKLPA
DQCKRLSELKQMLEASHKQNVTIARDQMEPFMEQVIPGLMKLGSVRIAQAVSERIVHTPL
KANLYLDRVRDRLLAGLEFQYGDIIINPLEATGHRHQTDRILMRDGDKENQILELMDQGN
FAKTESGYFMEDEDSEYDFLYHIVPLLEKLLQVYATTAVKARLYVGNAPPKIKVDVDERT
DWLEFRFEMEGIPENEIRYLIRSLEEKRKYHKLANGALMPLEGVDYEEINRFMNEMGILK
GEIQGPEFRLPVFRGLHLMDVEKQGNAIQLSKSFRKLLDNMRNPDNLDFPLPDNLAPILR
DYQKYGFQWLKTLAHYRFGGILADDMGLGKTLQSIAFLVSVLPEIREQQLPAIIVCPASL
MYNWRNELKKFAPEIRVVIADGSKTERSHALNQASGADVIITSYPLLRRDVEMYVEPSFH
TLILDEAQAFKNYATQTAQAVKIIQARYRFALTGTPVENAIEELWSIFDAVFPELFHNRR
AFNELTREAVAKRVRPFILRRLKTDVLKELPDKIESVQASELLPEQKKLYMAYLAKLRKE
TLKHLDEEGFNKSRIKILAGLTRLRQLCCHPALFVEGYSGSSAKFEQLLEIVEECRSSGK
RMLIFSQFTEMLGLIGRELSNQGVSYFYLDGKTPAFERVELCNRFNEGQRDLFLISLKAG
GTGLNLTGADTVILYDLWWNPAVEQQAADRAHRMGQKNVVQVLRLVTQGTVEDKMYLLQQ
RKKNLIDEVIQPGQESLSTLTEQEIREILMIQ
NT seq
3339 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagctttcaactgaccaagcgggtcattaagctgttatgcggccctttctcctatgaa
cggggagaggtctattatcatgccaaaaaagtgaaaatcattaattatgatcccgacgct
tctatctacgaagctacgatcaaaggaaacatggattatgcggttaaagcggaaatagat
agcaacggagatgtaactgccgaatgcacctgccctgcttatgcctcctactcccgtaag
tactgcaagcacatcgctgctgttctattgaatatacacgatctgcagaatgcaggtcga
tcaccaatgcgttcctactcctataagctaactcccgatgaacacctatcaagtgaagct
ggacgtctcactccccgttccacgatttcaacagcccgatctgcaattgaaagttcagct
gtagatacaggactgacggatgggatgctagggctgttcggaagcaaaccccttcgccca
agccgcaataggtttttagctgataccagagagcttctagaagtagaaattacatgcagt
ccctttccatacggctataggaagtacatgttcggcgttgagcttaaggttggttccaag
cgactgtacattgtgcagaaaattagggagtttcttgatcgagtggatcgaagcgaacca
catgtattttctaagcatttcacatatgatccaaccattcatagctttagtaaagagaac
gatgagatcattcgacagctcatccaaatctatcatagcgagaagatgtacagagaaacc
tccagcatctattcggcccatgccagccctttaagcggggagcgcttactgcttattccc
ccctattcctgggagtctctttatccattgcttactcgtgcgccagaagtaaagctggaa
caggataatcgcacgtatgttgggattgctacatccgatgaattggtaccgctccacttc
gactttgatcaagctaaggacgatagctatcaattggatgtccaaggcttggaccgaatt
accgttatggagccctatggtatcgttattgccgagggcaagctgcttaagctaccagca
gatcaatgcaagcgcctgtctgagctcaagcaaatgcttgaagcctcccataagcaaaac
gttacaattgcacgagatcagatggagccattcatggaacaggttattcctggactaatg
aagctaggcagtgtccgtatcgcccaagcggtatctgagcgcattgttcacacaccacta
aaagctaatctttatttggaccgagtgagggatcgcctacttgccggactggaatttcaa
tacggtgatattatcattaatcccttagaagcgacgggtcataggcaccaaaccgaccgt
attcttatgagagatggagataaagaaaatcaaatattagaactcatggaccaaggaaac
tttgccaaaacggaaagcggatatttcatggaggatgaggattcggaatacgattttctg
tatcatatcgttccactgctggagaagctgcttcaggtgtatgctacaacggcggtaaag
gcgaggctctatgtcggaaacgccccgcctaaaataaaggtagatgtcgatgagcgcaca
gattggctggagttccgatttgaaatggaaggtattccagaaaatgaaattcgttattta
atcaggtcactcgaggaaaagcggaagtaccataagctagctaatggagcacttatgcct
cttgaaggtgttgattatgaagaaatcaatcgcttcatgaacgaaatgggcattctcaaa
ggcgagatccaaggaccggagttccgccttcccgtattcagaggacttcatctaatggac
gtcgagaagcaaggaaatgctatccagctaagtaaatcgtttcgtaagctactggataac
atgcgtaatccggataatcttgatttccctcttccagacaatctcgctcctatcctacgg
gattaccagaaatacgggttccaatggctgaagacacttgctcactatcgcttcggtggc
attctagcggatgatatggggcttggaaagacgttgcaaagcattgctttccttgtatcc
gttcttcccgagataagagaacaacagctgccagcgatcattgtctgccctgcttccctt
atgtacaattggcggaatgagctgaagaagttcgctccagaaattcgggtcgtcatcgct
gatgggagcaaaacagaacgaagtcacgcgttgaatcaagcctctggagccgatgtaatc
atcacctcttaccccctcttacgcagggatgttgagatgtatgttgagccttcctttcat
acgcttattttggacgaggctcaagctttcaagaactatgccactcagacggcacaagca
gttaagattattcaggccagataccgtttcgctctcaccggaactcctgtagagaatgcc
attgaggagctttggtccatattcgacgccgtgtttcctgagctgtttcataatagaaga
gcatttaatgagttaacgagagaagctgttgctaaaagggtccgtccgtttattttacgt
agattgaagactgacgtcctgaaggaattgccggataagatcgaatccgttcaagcatcc
gagctgcttcccgagcagaaaaagctttatatggcctacttggctaagcttcgcaaagaa
acgctgaagcatctggacgaagaaggctttaataagagccggatcaaaattttagccgga
ttaacgagattgcgccagctctgctgtcaccctgctctattcgtagaaggctattctgga
agctcagccaaattcgagcagctactcgagattgtggaggaatgccgcagctcagggaaa
cgtatgcttattttctcgcagtttacagagatgcttggccttattggacgagagctcagt
aatcaaggcgtatcgtatttctacttggatggtaaaaccccggctttcgagcgtgtcgag
ctatgcaacaggtttaatgaaggacaacgagacttattcctcatctcgctaaaggccgga
ggaaccggactcaacctgacaggagcagacaccgtcatactctatgatctgtggtggaac
cctgccgtggagcagcaagcggctgacagggcccatcgtatgggacagaaaaatgtcgtt
caggtccttcgactcgttacgcaaggcaccgttgaagataaaatgtacctgctccaacaa
agaaagaagaatctgatcgacgaagtgattcagccaggtcaggagtctttatctacccta
acagagcaagaaattcgagaaattctaatgatccaataa
DBGET
integrated database retrieval system
